Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 170023992

Identifier: 170023992

GI number: 170023992

Start: 1943786

End: 1946650

Strand: Direct

Name: 170023992

Synonym: YPK_1751

Alternate gene names: NA

Gene position: 1943786-1946650 (Clockwise)

Preceding gene: 170023991

Following gene: 170023993

Centisome position: 41.45

GC content: 51.1

Gene sequence:

>2865_bases
ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATTTTCTTGTTTGTTATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT
AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCCACTGTTG
AGGAAGAGAACACGCCAACGCATTTGGCAGATGAAGTGGCCGTGTCCAAGGTATGGACCCCTGATTACGCAACCTATCAG
AATTATCTACTCACCAAAAAGCAAAGCCAGATTAAAGAGAAGGCTCTTGCCGATTCAGTAAAAAAAGAACCCGCCCCGCC
AATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCTGGTGGTGCTTAAGCCACAGGATGAGGCCCCTCAAGAATCGCCGAAAATGGATG
CAGGCCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCCGATGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCCTTAAAATCACCG
GAGAGTTTCTGGAAACGCCTCGAGCAAGAGTTTGCCGCACGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTGTGATCATGGCACTGGG
TGTCATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAACCTTGCGGATTGGTACCGCCATTGTGCTGA
GTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGAGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCCGGTTATATCCCG
GCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTATTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGACATGTTCCCGAT
GCCCGTTCTCATGCTATTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGCCATTTATGGCGG
CCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGGCTGTTGGCCTAC
CTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGGGGCGATGGTCGG
AAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTATTCCTGCTAGCAA
CCACATACGGCTTCCTAGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCATAATGACTGGAAA
AACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTTAACGTTAAGCGC
AAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGACGCTCACCTTCAT
TGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTTGAGCCAGAAACC
GTCTGGACGAGTCTGCTTGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGTCACCCGGCCGGT
TTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGTAAGTACCTATTATGCCTGTCGCG
ATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGGAATGCATTCAGT
GATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGACCTTTGCATTATT
TATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGCAACGTTGGCGAC
AGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGCCTGTCAATGAACCCGTATATCCTT
GGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCCGATTCTCTGCCT
GTGGCTAAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATGCTATTTATCTGT
TGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTCGCTTCTCTTACC
GATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGCAGATTCGCTACA
ACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGGTTGTCTTTAACC
CCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGGCCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATCCCGATGGTGTTC
ATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGGTGCGATTGCGCT
ACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATATCGTGTACAGCG
GCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACACTGGCCTAACTAT
AAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTCTGGTCTTGAAGG
GCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGAAGTTTGTCGTTA
TGAAGGAAGTCATTGAGCAAAACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA
AACGCTGAGTTGGATACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGATGTGGGAAAATCAATATACAGCAAGGAGTCAGTGTGATTAATTTT
GTGAAGTTAATGTGTAATGT

Product: putative integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: MSF Permease

Number of amino acids: Translated: 954; Mature: 954

Protein sequence:

>954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Sequences:

>Translated_954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
>Mature_954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Specific function: Unknown

COG id: COG5373

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107125; Mature: 107125

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC
PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT
HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
VGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPAPPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEECCEEEEEC
PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT
HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
VGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA