Definition Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome, complete genome.
Accession NC_010465
Length 4,689,441

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The map label for this gene is yuaQ [H]

Identifier: 170022992

GI number: 170022992

Start: 804249

End: 817187

Strand: Direct

Name: yuaQ [H]

Synonym: YPK_0743

Alternate gene names: 170022992

Gene position: 804249-817187 (Clockwise)

Preceding gene: 170022991

Following gene: 170022997

Centisome position: 17.15

GC content: 53.28

Gene sequence:

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AGACCGGACGGGGTCGACTGGAGACCTGACCAGTACCGGTGTTAATGCCTTTGCCTATACTTTTGCTGATGGTGCTAGCT
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GATGGCTTTGGTTCCGGGGTGAAAATAGTTCTGCAATCTCGCTCCGATGGTTCAATTATTTCAGGTAATGGGATTGATAA
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TTTTAAAGGCCACGAATACTGGGATTTTAGCGACAAAAAATGCGAATAATGCCAGTGATATTTATATTCGCTCTGCGGGT
GGCATCACTGCTGCAACGGGTATTTCTGCAACACATAACGGAACCGGCACCGTTAAAATCAAGAATGATGGCACCATCAC
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CGACTGCCGGTACAGGCGTTAACGTACTGGCCAGTGCCATATTAAATCTGTTCGGTGGCACCATTAATACCTCGGCGACG
GCCAACGGTATTACGTTTGCGGGCACGGAGGGTGGACATACCCTGACTGATTTGACGATTAATCTGTTGGGTACGGGTAT
TGCTTTGTCAAACGTGGCTGGCGTCAATTTGACGTTAAGTAACGTAACTTTAAACACACTTAATGGGACGGCGCTAAATA
GCCTGACAGGGTTAACGTTAGTCGATAGCCTTAATGGGCGTAACACCATTAATATTGAAGGTGCCGGCATCGGAATTGCG
GCGACAAATACCGAATTGAATACCTTCGATGCAGAGGCATTAGATATTAATGTTAATGGTGCCGGGATCGGCATTCAAGC
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GGCTCCTCCAGTAAAACGTTAAACAACAATGGCACCATTAAAGGCAGTGTGATATTCGCGGGTGTTGCTGACCATATCAT
TAATAACAATGGAACACTGGATGGCACATTAACCACCGGTGCCGGTAATGACACGTTAGTGCTAGACAGTAGCTCGCAAA
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GCTCAATACCCTAAATTTCAATGCCTCAACCGACGAACTAGCGGCAGCCACGTCACTTCAGGGCTTCACCAATATTAATC
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ACCGGGAACGGCACACTGAATGTGGCGAAGAACCTTGCCACCACCGCGTTTGACTTTGGTTCGACGGTGGGCGGGGCGTT
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AGCTGTCGGATGACAGTGTGACCACCGTGGGCACCACTGACCGCACCCTGCACGGGCTGGATTTGAGTGGCGGGACGCTG
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CCTGACCAGCAGTAACAGCAATGGTGACAGCGGCCTGTATGTGAATTACACCCTGAGTGCGCTGGAGTTGTTAGCCGATG
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AGTGGCCTGCTGACCAATGGCGGAGTCCTTGATTTAACGGGGGGCGCACTCAATCTGACTGCGGGCGGGACGTCTACCGT
GGCAGGCGGCTTGACCGGTGCCGGAACCCTGAATATTAATGGTGGTAATTTGGCGGTCAGTGCCGCCAACAGTGGCTTGA
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CTGGGTACGCTGAACCTGAACGGTGCCAATGCAGCCATGACCAACGTACTCAGTGGTGACGGGACGATTAATACCAACGC
GGCAGTCACGCTGAGCGGGAATAACAGCTTTAGTGGTGCACATCAGATCGGTGCCAGTGGCGCACTGACCGTCGGTCAGG
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AGCATTGCCAACGTTCTGAGCGGTGTAGCGGGTTCAACGGTAGATATTATCGGCGGGGCAGATACCGCACTGACGGCCAA
TAACAGCGGTTTCCTCGGCCAATATGCCTTGGCGGGTAACAGCAAACTGACGGTTGGGTCAACGAACAATCTGGGGGCGT
CATCCAGCGTGACGCTGGCCGGGGCGGACGATACTCTGTCGCTGAGCGGTTTTAACGGCACCTTTGGTAACAGCGTCACC
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CGATATCGCTGATGCGACGTTGAATCTGGACGATATTGCTCTGTTCGACCATGTACTGACCGGGAACGGCACACTGAATG
TAGCGAAGAGCCTTGCCACCACCGCGTTTGACTTTGGTTCGACGGTAGGCGGGGCCTTTAGTGGGATCGTCAATCTGACC
AATACCACCTTTGCCTTAAGTGCGGATAACGCGGCGGCACTGGCCAGTGCCACCTTAAAGCTGTCGGATGACAGTGTGAC
CACCGTCGGCACCACTGACCGCACCCTGCACGGGCTGGATTTAACTGGCGGGACGCTGATCTTTGACGGTTCGCCGCCAC
AGTCTCAGGCCAATGGGGTCGTCACGGTCACTGATCTGGCACTGAACAGCGGAACGGTCAGCATTACCGGGGTGGGCAAC
TGGGAGAATGAATCTCCAGTGACGTCACCGAATGTATCGATCCTTGAACAGGATCGTGCTGGCACGACGCTGGAGCTAAT
TAATGCGACTAATGTGACCGGAGATGTTGATGCTCTGGGTCTGATGATTAATGGCACCGCCATTACTGCCGATTCACAAG
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AATGGTGACAGCGGCCTGTATGTGAATTACACCCTGAGTGCGCTGGAGTTGTTAGCCGATGGCGCTGATGCGTTGTTGTT
GGCAACCGAAAGCGGTTTGACGGCCAACAGAGTACTGAATGCCGAGCTATTCGGTGTTGGCGGTTTGGTGGTGGATGCCC
AAAATGGTGCCTTAACCTTGGCTAACGGCAATAACAGTTACGAGGGAACGACCACCGTCAATTTCGGTGAGCTGATCCTC
GGGGCGAATGGGGCCTTCGGCCAGACGTCATTACTGGATATCGCCAGTGGGGCCAGTGCGAATATTAATGGCTACCGCCA
GACAGTGGGGGCAGTGTCCAATACCGGTACGGTAACGTTGGGCAGCGGCGGGGTGTTAACCAGTGGCCTGCTGACCAATG
GCGGAGTCCTTGATTTAACGGGGGGCGCACTCAATCTGACTGCGGGCGGGACGTCTACCGTGGCAGGCGGCTTGACCGGT
GCCGGAACCCTGAATATTAATGGTGGTAATTTGGCGGTCAGTGCCGCCAACAGTGGCTTGAGTGGCCAGACCCATATTGC
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AATAACAGCTTTAGTGGTGCACATCAGATCGGTGCCAGTGGCGCACTGACCGTGGGTCAGGCCAGTAATCTGGGGGCCAG
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CACCGCGTTTGACTTTGGTTCGACGGTGGGCGGGGCCTTTAGTGGGATCGTCAATCTGACCAATACCACCTTTGCCTTAA
GTGCGGATAACGCAGCGGCACTGGCCAGTGCCACCTTAAAATTGTCGGATGACAGTGTGACCACGGTAGGCACCACTGAC
CGCACCCTGCACGGGCTGGATTTAAATGGCGGGACGCTGATCTTTGATGGTTCGCCGCCACAATCTCAGGCTAACGGGGT
CGTCACGGTTACTGATCTGGCACTGAACAGCGGGACGGTCAGCATTACCGGGGCGGGCAACTGGGAGAATGAACATCCGG
TGACGCCACCGAATGTGTCGCTCCTTGAGCAGGATCGGGGTGACATTTTACTGGAGCTGATTAATGCCGCGAATGTCACC
GGAGATGCCAATGATTTGGATCTGATGGTTGATGGCACCGCCATTACTGCCGATTCAAGCGGGGTGCAGTCTGCTGTCCA
GCAGGGCGGTAGCACGGTGGCCAATGCCATCCATAATTATGGCCTGACCAGCAGTAACGGCAATGGCGGCAGTGGCCTGT
ATGTGAATTACACCCTGAGTGCGCTGGAGTTATTAGCCGATGGCGCTAATGCGTTGTTGCTGGCAACCGAAAGCGGTTTG
ACGGCCAACAGAGTACTGAATGCCGAGCTATTCGGTGTTGGTGGTTTGGTGGTGGATGCCCAAAATGGTGCCTTAACCTT
GGCTAACGGCAATAACAGTTACGAGGGAACGACCACCGTCAATTTCGGTGAGTTGATCCTCGGGGCGAATGGGGCTTTCG
GCCAGACGTCATTACTGGATATCGCCAGTGGGGCCAGTGCGAATATTAATGGCTACCGCCAGACGGTGGGGGCGGTGACC
AATACCGGTACGGTAACGTTGGGCAGCGGCGGGGTGTTAACCAGTGGCCTGCTGACCAATGGCGGGGTCCTTGATTTAAC
GGGGGGCGCACTCAATCTGACTGCGGGCGGGGCGTCTACCGTGGCAGGCGGCTTGACCGGTGCCGGAACCCTGAATATTA
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Product: outer membrane autotransporter

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Alternate protein names: NA

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Protein sequence:

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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell outer membrane; Peripheral membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788565, Length=498, Percent_Identity=29.718875502008, Blast_Score=196, Evalue=3e-50,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005546
- InterPro:   IPR013425
- InterPro:   IPR006315
- InterPro:   IPR012332
- InterPro:   IPR011050
- InterPro:   IPR004899 [H]

Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter; PF03212 Pertactin [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 429150; Mature: 429150

Theoretical pI: Translated: 3.84; Mature: 3.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
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0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
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EEECCCCCEEHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
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EEEEECCCCCCCCHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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