| Definition | Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010380 |
| Length | 2,245,615 |
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The map label for this gene is 169833780
Identifier: 169833780
GI number: 169833780
Start: 413668
End: 415092
Strand: Direct
Name: 169833780
Synonym: SPH_0464
Alternate gene names: NA
Gene position: 413668-415092 (Clockwise)
Preceding gene: 169832643
Following gene: 169834375
Centisome position: 18.42
GC content: 32.98
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTGGAATTTGGATTTCCACAGAGGAAAACTAGTAATTAAACTCTCTGACACAAGTATTAAATCGGAAAACTGAAAACAAT AAAAATAGAGAGGATAGTTG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATTATATAATGATTAAGTGGTAGATTCTATTTCTACCGTTTTAGATATTCGGGAGGTAATGATGAAAAAAATTATGT TAGTATTCGGTACACGTCCG
Product: flippase Wzx
Products: NA
Alternate protein names: Polysaccharide Transporter; Flippase Wzx; Integral Membrane Protein
Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 474
Protein sequence:
>474_residues MNSKIKNILTNFSYVISSNLLTVLTSSLVVLIFPKLMGVTEYSYWQLYIFYLTYIGFFHLGWIDGIYLKYGGLEYNNLDR KQFYSQMILFSSFLMIISLLLFGLNVLAVTDSNARYIYNMTIISMIITNLRTLYVYVLQMTNRLKDSSIILLSDRVLYVL LLFLFIVFGWHEYKVMILADILGRSFSLILSFWICKDIVFQPLSKFIFNIKESFDNIRVGINLMLSNIASSLIIGIVRLG IQWNWNIETFGKVSLTLSVSNLLMTFINAIGLVVFPLLRRTKAENLPKIYSNLRNVLMLIMFAILLIYYPLKIVLDLWLP AYQDALIFMTLIFPMSVYEGKMALVINTYLKALRMERDILRVNALVMLISMGVTLVTTYLLNSLELTVVSIVVLLALRSI IAELILSKKLDVSVKKDIVLEFLLTLVFISSSWYLPIGLAVIVYTIAYGLYLYLKHEDIKTYLAYFKASKKTSN
Sequences:
>Translated_474_residues MNSKIKNILTNFSYVISSNLLTVLTSSLVVLIFPKLMGVTEYSYWQLYIFYLTYIGFFHLGWIDGIYLKYGGLEYNNLDR KQFYSQMILFSSFLMIISLLLFGLNVLAVTDSNARYIYNMTIISMIITNLRTLYVYVLQMTNRLKDSSIILLSDRVLYVL LLFLFIVFGWHEYKVMILADILGRSFSLILSFWICKDIVFQPLSKFIFNIKESFDNIRVGINLMLSNIASSLIIGIVRLG IQWNWNIETFGKVSLTLSVSNLLMTFINAIGLVVFPLLRRTKAENLPKIYSNLRNVLMLIMFAILLIYYPLKIVLDLWLP AYQDALIFMTLIFPMSVYEGKMALVINTYLKALRMERDILRVNALVMLISMGVTLVTTYLLNSLELTVVSIVVLLALRSI IAELILSKKLDVSVKKDIVLEFLLTLVFISSSWYLPIGLAVIVYTIAYGLYLYLKHEDIKTYLAYFKASKKTSN >Mature_474_residues MNSKIKNILTNFSYVISSNLLTVLTSSLVVLIFPKLMGVTEYSYWQLYIFYLTYIGFFHLGWIDGIYLKYGGLEYNNLDR KQFYSQMILFSSFLMIISLLLFGLNVLAVTDSNARYIYNMTIISMIITNLRTLYVYVLQMTNRLKDSSIILLSDRVLYVL LLFLFIVFGWHEYKVMILADILGRSFSLILSFWICKDIVFQPLSKFIFNIKESFDNIRVGINLMLSNIASSLIIGIVRLG IQWNWNIETFGKVSLTLSVSNLLMTFINAIGLVVFPLLRRTKAENLPKIYSNLRNVLMLIMFAILLIYYPLKIVLDLWLP AYQDALIFMTLIFPMSVYEGKMALVINTYLKALRMERDILRVNALVMLISMGVTLVTTYLLNSLELTVVSIVVLLALRSI IAELILSKKLDVSVKKDIVLEFLLTLVFISSSWYLPIGLAVIVYTIAYGLYLYLKHEDIKTYLAYFKASKKTSN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54654; Mature: 54654
Theoretical pI: Translated: 9.79; Mature: 9.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.8 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNSKIKNILTNFSYVISSNLLTVLTSSLVVLIFPKLMGVTEYSYWQLYIFYLTYIGFFHL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GWIDGIYLKYGGLEYNNLDRKQFYSQMILFSSFLMIISLLLFGLNVLAVTDSNARYIYNM HHHCCHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHH TIISMIITNLRTLYVYVLQMTNRLKDSSIILLSDRVLYVLLLFLFIVFGWHEYKVMILAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH ILGRSFSLILSFWICKDIVFQPLSKFIFNIKESFDNIRVGINLMLSNIASSLIIGIVRLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IQWNWNIETFGKVSLTLSVSNLLMTFINAIGLVVFPLLRRTKAENLPKIYSNLRNVLMLI CEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH MFAILLIYYPLKIVLDLWLPAYQDALIFMTLIFPMSVYEGKMALVINTYLKALRMERDIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVNALVMLISMGVTLVTTYLLNSLELTVVSIVVLLALRSIIAELILSKKLDVSVKKDIVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH EFLLTLVFISSSWYLPIGLAVIVYTIAYGLYLYLKHEDIKTYLAYFKASKKTSN HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MNSKIKNILTNFSYVISSNLLTVLTSSLVVLIFPKLMGVTEYSYWQLYIFYLTYIGFFHL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GWIDGIYLKYGGLEYNNLDRKQFYSQMILFSSFLMIISLLLFGLNVLAVTDSNARYIYNM HHHCCHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEHH TIISMIITNLRTLYVYVLQMTNRLKDSSIILLSDRVLYVLLLFLFIVFGWHEYKVMILAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH ILGRSFSLILSFWICKDIVFQPLSKFIFNIKESFDNIRVGINLMLSNIASSLIIGIVRLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IQWNWNIETFGKVSLTLSVSNLLMTFINAIGLVVFPLLRRTKAENLPKIYSNLRNVLMLI CEEECCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH MFAILLIYYPLKIVLDLWLPAYQDALIFMTLIFPMSVYEGKMALVINTYLKALRMERDIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RVNALVMLISMGVTLVTTYLLNSLELTVVSIVVLLALRSIIAELILSKKLDVSVKKDIVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH EFLLTLVFISSSWYLPIGLAVIVYTIAYGLYLYLKHEDIKTYLAYFKASKKTSN HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA