| Definition | Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010376 |
| Length | 1,797,577 |
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The map label for this gene is 169825005
Identifier: 169825005
GI number: 169825005
Start: 1419444
End: 1421030
Strand: Direct
Name: 169825005
Synonym: FMG_1308
Alternate gene names: NA
Gene position: 1419444-1421030 (Clockwise)
Preceding gene: 169825004
Following gene: 169825016
Centisome position: 78.96
GC content: 32.83
Gene sequence:
>1587_bases ATGAGGTTCCAAATGAACAAAACTAAATTAAAAGAATTGATGAAAATCGACTTACTGAATATCAATCCTATGCTCACAGG TCAAATCAGACAGAAGACCAAGCCTGCGGATAATAAAAGTATTTACAAGAAAATTATCAGACAATATATAATGTCTGCTG TGATGATGATTGTAATTTACGGGCTTATGTTCGGACTTATATTCGATTACAGCAAGGCACCGAAGGCGTATGATTTGTTC GTGTTTTACTTGGTGATTTTGGGAACTTTGCAAAACTTTATCAGCGTATTCAATCTTTTTTATGAAAACAAGGATTCGTT GAAGATGTCCTATTTCCCAATTAGCCAGAAGGAAATGTTCATATCCAAGACTTTCTTGACAATGTTGAGTTCGCTGACAG TTTTAAGTCCGATATTATTGTTGTCTATAAAATTTTTCATTGATTTTAAATTCAATATATTCTTGGCGATTTTGTACGGA ATTTTGAATTTCGTAGTTTTATTCGTTTTTACAATAATTTTGAATATCGTCGTTGCAGAACTTTTGGTGAGAACATCTGC ATTGTACAAATTCAACACGCAAATAATGGTTGGGCTTAATATTTTTATTCAAGTCGTTGCCATTGTATTTGTAATTTTTA TTCAAAATTCAAAAATCATGAAGAACGCCACAGGACTTGGCCCTATTTCAGGATTACTTCACAATCCAGTTTCAGCGATT ATTTTCATCGCTATATTGGCAGTTGTTGAAGTGATTTTAGGAAAAGCGATTCTAGAATTTGCATCGAAGAACTTGTACGA ACACATGAGCGACATTCAAAACAGGAAAAATTCTATTAGACGAACAAAAGTCGACAAAGAGCCTAGCAACATTGGCAAAG AAATGTTCAAATACAACAAAATGCTTTTGAGTGATGCTACAACTATCACATCTTGTATTTTATTCCCAGTAATGTTTCCA ATAATAATGACATTTACTAACGTGACTAATATGAGAAGTGACATTGGGACAAGTATTTCCGATGTGCAATCACTTGCAGT AGCGCTTAGCATTTCATTTATGTACAGTGTGTTCATCGGGCTATTCCCTATGAATTTGCAATCGATAATAGTTTCATTGG ACGGGCAAAACCACGATTATTTGATGAGTCTGCCAATGAGTAAGAAAACTTATTTGAATGAAAAAGTTAAATTCTCATTT ATAATAATGGGAGTATTTTCTGCACTTGCAATATTAGGATTTTCCTTATTCTTCAGAGTAAAAATCCATTTCATAATACT TGCAATTGTGTTGAATTTAATATCGATATTCGTATTTTGCAGATTCAAAGTTGCAGGCGATTACAAACACAAATACGTGA ATTGGTCTAGCATTTCAGATATTATGAACAGACAATCGAAGTTTGCTTATGTAATTAAAATGATGGGACTTACATTCTTG ACAATAGCAATATTCTCTGCCGTAATGTTTAGCATACAATCAGTTCCAATTAAATGGATTCTTATGGGAATATCAATCCC ATGGGCATTAATAGTAATAGGAATCGAACTTTACAACCAATTTGGTTTTTGGAGAAAAATAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAGGAAAACTCATATTCTTGGGTACTGTTCAAGAATTAAAAGACTTGCATCCAAATCAATCCTTGGAAGAAATTTATCT TGAAATGATAAAATCACACG
Downstream 100 bases:
>100_bases ACAAACTAAAATCATCCTCTTTTTAAATAGAGGATGATTTTTTAGTGTGTTGTTTTTAATTATTTTGGTTGAATGTAGTC TACTAAGAAAAGTTCTTCTG
Product: antibiotic ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Protein; Ypothetical Protein SMU.; Antibiotic ABC Transporter Permease Protein
Number of amino acids: Translated: 528; Mature: 528
Protein sequence:
>528_residues MRFQMNKTKLKELMKIDLLNINPMLTGQIRQKTKPADNKSIYKKIIRQYIMSAVMMIVIYGLMFGLIFDYSKAPKAYDLF VFYLVILGTLQNFISVFNLFYENKDSLKMSYFPISQKEMFISKTFLTMLSSLTVLSPILLLSIKFFIDFKFNIFLAILYG ILNFVVLFVFTIILNIVVAELLVRTSALYKFNTQIMVGLNIFIQVVAIVFVIFIQNSKIMKNATGLGPISGLLHNPVSAI IFIAILAVVEVILGKAILEFASKNLYEHMSDIQNRKNSIRRTKVDKEPSNIGKEMFKYNKMLLSDATTITSCILFPVMFP IIMTFTNVTNMRSDIGTSISDVQSLAVALSISFMYSVFIGLFPMNLQSIIVSLDGQNHDYLMSLPMSKKTYLNEKVKFSF IIMGVFSALAILGFSLFFRVKIHFIILAIVLNLISIFVFCRFKVAGDYKHKYVNWSSISDIMNRQSKFAYVIKMMGLTFL TIAIFSAVMFSIQSVPIKWILMGISIPWALIVIGIELYNQFGFWRKIK
Sequences:
>Translated_528_residues MRFQMNKTKLKELMKIDLLNINPMLTGQIRQKTKPADNKSIYKKIIRQYIMSAVMMIVIYGLMFGLIFDYSKAPKAYDLF VFYLVILGTLQNFISVFNLFYENKDSLKMSYFPISQKEMFISKTFLTMLSSLTVLSPILLLSIKFFIDFKFNIFLAILYG ILNFVVLFVFTIILNIVVAELLVRTSALYKFNTQIMVGLNIFIQVVAIVFVIFIQNSKIMKNATGLGPISGLLHNPVSAI IFIAILAVVEVILGKAILEFASKNLYEHMSDIQNRKNSIRRTKVDKEPSNIGKEMFKYNKMLLSDATTITSCILFPVMFP IIMTFTNVTNMRSDIGTSISDVQSLAVALSISFMYSVFIGLFPMNLQSIIVSLDGQNHDYLMSLPMSKKTYLNEKVKFSF IIMGVFSALAILGFSLFFRVKIHFIILAIVLNLISIFVFCRFKVAGDYKHKYVNWSSISDIMNRQSKFAYVIKMMGLTFL TIAIFSAVMFSIQSVPIKWILMGISIPWALIVIGIELYNQFGFWRKIK >Mature_528_residues MRFQMNKTKLKELMKIDLLNINPMLTGQIRQKTKPADNKSIYKKIIRQYIMSAVMMIVIYGLMFGLIFDYSKAPKAYDLF VFYLVILGTLQNFISVFNLFYENKDSLKMSYFPISQKEMFISKTFLTMLSSLTVLSPILLLSIKFFIDFKFNIFLAILYG ILNFVVLFVFTIILNIVVAELLVRTSALYKFNTQIMVGLNIFIQVVAIVFVIFIQNSKIMKNATGLGPISGLLHNPVSAI IFIAILAVVEVILGKAILEFASKNLYEHMSDIQNRKNSIRRTKVDKEPSNIGKEMFKYNKMLLSDATTITSCILFPVMFP IIMTFTNVTNMRSDIGTSISDVQSLAVALSISFMYSVFIGLFPMNLQSIIVSLDGQNHDYLMSLPMSKKTYLNEKVKFSF IIMGVFSALAILGFSLFFRVKIHFIILAIVLNLISIFVFCRFKVAGDYKHKYVNWSSISDIMNRQSKFAYVIKMMGLTFL TIAIFSAVMFSIQSVPIKWILMGISIPWALIVIGIELYNQFGFWRKIK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60428; Mature: 60428
Theoretical pI: Translated: 10.39; Mature: 10.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 5.5 %Met (Translated Protein) 5.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 5.5 %Met (Mature Protein) 5.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRFQMNKTKLKELMKIDLLNINPMLTGQIRQKTKPADNKSIYKKIIRQYIMSAVMMIVIY CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLMFGLIFDYSKAPKAYDLFVFYLVILGTLQNFISVFNLFYENKDSLKMSYFPISQKEMF HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHH ISKTFLTMLSSLTVLSPILLLSIKFFIDFKFNIFLAILYGILNFVVLFVFTIILNIVVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVRTSALYKFNTQIMVGLNIFIQVVAIVFVIFIQNSKIMKNATGLGPISGLLHNPVSAI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IFIAILAVVEVILGKAILEFASKNLYEHMSDIQNRKNSIRRTKVDKEPSNIGKEMFKYNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH MLLSDATTITSCILFPVMFPIIMTFTNVTNMRSDIGTSISDVQSLAVALSISFMYSVFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFPMNLQSIIVSLDGQNHDYLMSLPMSKKTYLNEKVKFSFIIMGVFSALAILGFSLFFRV HHCCCHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIHFIILAIVLNLISIFVFCRFKVAGDYKHKYVNWSSISDIMNRQSKFAYVIKMMGLTFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIAIFSAVMFSIQSVPIKWILMGISIPWALIVIGIELYNQFGFWRKIK HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCC >Mature Secondary Structure MRFQMNKTKLKELMKIDLLNINPMLTGQIRQKTKPADNKSIYKKIIRQYIMSAVMMIVIY CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLMFGLIFDYSKAPKAYDLFVFYLVILGTLQNFISVFNLFYENKDSLKMSYFPISQKEMF HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHH ISKTFLTMLSSLTVLSPILLLSIKFFIDFKFNIFLAILYGILNFVVLFVFTIILNIVVAE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVRTSALYKFNTQIMVGLNIFIQVVAIVFVIFIQNSKIMKNATGLGPISGLLHNPVSAI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IFIAILAVVEVILGKAILEFASKNLYEHMSDIQNRKNSIRRTKVDKEPSNIGKEMFKYNK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH MLLSDATTITSCILFPVMFPIIMTFTNVTNMRSDIGTSISDVQSLAVALSISFMYSVFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFPMNLQSIIVSLDGQNHDYLMSLPMSKKTYLNEKVKFSFIIMGVFSALAILGFSLFFRV HHCCCHHHHHEEECCCCCCEEEECCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIHFIILAIVLNLISIFVFCRFKVAGDYKHKYVNWSSISDIMNRQSKFAYVIKMMGLTFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TIAIFSAVMFSIQSVPIKWILMGISIPWALIVIGIELYNQFGFWRKIK HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA