Definition Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome, complete genome.
Accession NC_010376
Length 1,797,577

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The map label for this gene is 169824399

Identifier: 169824399

GI number: 169824399

Start: 765024

End: 767276

Strand: Direct

Name: 169824399

Synonym: FMG_0702

Alternate gene names: NA

Gene position: 765024-767276 (Clockwise)

Preceding gene: 169824398

Following gene: 169824400

Centisome position: 42.56

GC content: 24.23

Gene sequence:

>2253_bases
ATGAAAATTATTAGATTAGATTTGATATCGTTTGGCAGATTTAATAATTACACAATAGAATTTGGAGACAAATTTAATCT
AATTTACGGGTTAAATGAATCAGGGAAAACCACTATATCCAAATTTATTGAAGGTGTATTTTATGGATTTGTTAAACCTT
ATTTAAAGAGAACTGTTTATACTGAAGATTACGAGAAATACCGCCCTTGGAATAACGAAAACTATGAGGGCAGTATTTTA
GTGGAGAAAGATGATAAAAGATATGTAATATATCGAAATTTCAAAGAAAAATATTTTAATATTTTTAACGAAACTACAGG
TAACAATGAAACTGATTTAGATGGGTTTAACAGAGATAATTTGTCTTTTCCTGGTGAATATTTTTTCAAAATGCCTTCGG
ATATTTTTACATCAACTGTTTTTTCTAACTTAAAAGAACTAGATTCAGAAAATAAGAATGTGAATTCTATTGTAGATATG
CTATTGAATTCATCAGATAGTAATAATGATTCAGTTTCGTTTAAAAAAGCTCTCGATAATTTAGAGAAGATGAAGTCGAG
TATAGGAACAAAACAATCTAAATCCAAACCCTTGGGTAGTTTGTATCAAAAAAAGTTTGATTTAGAGGATGAAATCAAAA
ATATTAACAATGATAAAAAAGAGTACGAAGATAGTTTAAACAAATTAAATGAGTACAAATTTAAACATGAAAGTCTGATT
TTAAATAAAGAAAAATTAGTTAGTTTGCATAAGAAAAATGATATTGAAAAAATAGAAGATGCAAAAAATTATAAAATGCA
GATTTTAAAAGAAAAAGCAAGCTTACTAGATACAATATCAAAGATAAAATACATCAATGATATTAATGAAAATGATGTTA
ATAGTTTGGAACATGAGAATAAAATATTAAATGAAAACAGAATTAAATTTAATGAGTTATCGAAGAAGAAAAAATTATTA
AATAAGGATTACTACCAATTAAAAGCAAAATTAAGTAACTATGAAACAATTAGTAAGTATATTGAAGAAATTAATAATTT
AAATGGAAAGTTAAATGGAATTGCTAAATTAAACATTAAATTAATTGTTATTGGACTTATATTTACAATTATTGCTTCTG
CAATGATTTATATGATGGGAAAAACAAAAGAATTTGTTATTGCTCCTATTTTATTTGTTCTGTATTATATTGTGGTTATT
TTTTTGAGTAAACTTAGGAAATTATCTTTTACTCGTCAATTAAATAAAATTGTGCAAAAAATTAATCAAATTACAAATAT
GAGATATAAAAGCCACAATGAAGTAATTAATGATTTTAGATACGATTCAAATATGGATAAAAGTATTGATTATTTGAACA
CTTTGGAAGAGCAAATTAAAGGTATTGACTTAAGACTAGATTCTATTATTAATGAAGATGAAAACTCTAAGTCTAAAATT
AACAGTATTTTATCTTCATCAAAAAACTTGAAGAATATCGATGTTGAAGATTATAGAAGAAAAAGGATAGAGTACGATCA
ATTGATTCATAGAATTTCAGATAAAGATGATCAACTTCAAAAGATATCATCTGAGTATGATTTTAGTATTTTATTGGATA
ATGTGGATTCGGATTCAATAAAACTAGATGATAATGATATAAAAGATATCAATGTACTTAATAAAGAAATTGATGAATCT
ATCGAGAAAAATGCGAAATTATATGAAAGGACTAAAATCCTTGAAAAATCAGTAAATCTATTACTAGAAAAAGAAGAAAA
ATTATCAGATATCAATGAGAATATTCAAAAATATGAAAATGAAATTATATCTATAGAATTAGCTATGGATTTAATTAATA
AAAGTATAAATAAACTACACAAAAATTTTATTCCAAGAATTAACAAGAAAGTCTCAGAAATGATGGCATATTCAACTAAA
GACAAGGACAGATTCAGAGTTGATGAAAATTTAGATGTTAGTATTTATGATGGAGTAAAGTTTTACGAACAAAAACATTT
AAGCTCCGGAACATTTGACTTGCTTTCTGTTTTTATCAGAATAAGTGTACTCGAAGAATTAATGGGTCTTGATTATTTGA
TGATATTAGATGATTGTTTTGTTCAATTAGATGATGTAAGATATAAGAAATGTCTTGATTTGTTATTTAAAATTTCAAAT
AATAATCAAATAATACTTTTTTCTTGCCAAAACAGAGATGAGCAATTGTTGAATGAACTAGACATAATATATAAGAAAAT
TGAGTTAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGGTTACTTTATTGAAGAGACAAAGAACTTGGATTCAAATGATCCTATAGTTAAAAGAGCAATTGATTTAGGAATTCAT
TCTTTGATGGAGAATAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATGATATATGCAATAGGTGATTTACATCTGGATTATACAAAAGAAAAATCGATGGATGTGTTTGGTGATAATTGGGAT
AATTATGAAGAAAAGATATT

Product: putative DNA double-strand break repair rad50 ATPase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 750; Mature: 750

Protein sequence:

>750_residues
MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL
VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM
LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI
LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL
NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI
FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI
NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES
IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK
DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN
NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK

Sequences:

>Translated_750_residues
MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL
VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM
LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI
LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL
NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI
FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI
NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES
IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK
DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN
NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK
>Mature_750_residues
MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL
VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM
LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI
LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL
NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI
FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI
NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES
IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK
DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN
NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK

Specific function: Unknown

COG id: COG4717

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88352; Mature: 88352

Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVY
CEEEEEEHHHCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TEDYEKYRPWNNENYEGSILVEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDN
CCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
LSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDMLLNSSDSNNDSVSFKKALDN
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHEN
ECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
KILNENRIKFNELSKKKKLLNKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIK
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH
LIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVIFLSKLRKLSFTRQLNKIVQK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHH
NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSI
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCE
KLDDNDIKDINVLNKEIDESIEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYEN
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTKDKDRFRVDENLDVSIYDGVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEECCHH
FYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK
CCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVY
CEEEEEEHHHCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TEDYEKYRPWNNENYEGSILVEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDN
CCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
LSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDMLLNSSDSNNDSVSFKKALDN
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE
LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHEN
ECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
KILNENRIKFNELSKKKKLLNKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIK
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH
LIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVIFLSKLRKLSFTRQLNKIVQK
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INQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI
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KLDDNDIKDINVLNKEIDESIEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYEN
EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTKDKDRFRVDENLDVSIYDGVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEECCHH
FYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK
CCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA