| Definition | Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010376 |
| Length | 1,797,577 |
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The map label for this gene is 169824399
Identifier: 169824399
GI number: 169824399
Start: 765024
End: 767276
Strand: Direct
Name: 169824399
Synonym: FMG_0702
Alternate gene names: NA
Gene position: 765024-767276 (Clockwise)
Preceding gene: 169824398
Following gene: 169824400
Centisome position: 42.56
GC content: 24.23
Gene sequence:
>2253_bases ATGAAAATTATTAGATTAGATTTGATATCGTTTGGCAGATTTAATAATTACACAATAGAATTTGGAGACAAATTTAATCT AATTTACGGGTTAAATGAATCAGGGAAAACCACTATATCCAAATTTATTGAAGGTGTATTTTATGGATTTGTTAAACCTT ATTTAAAGAGAACTGTTTATACTGAAGATTACGAGAAATACCGCCCTTGGAATAACGAAAACTATGAGGGCAGTATTTTA GTGGAGAAAGATGATAAAAGATATGTAATATATCGAAATTTCAAAGAAAAATATTTTAATATTTTTAACGAAACTACAGG TAACAATGAAACTGATTTAGATGGGTTTAACAGAGATAATTTGTCTTTTCCTGGTGAATATTTTTTCAAAATGCCTTCGG ATATTTTTACATCAACTGTTTTTTCTAACTTAAAAGAACTAGATTCAGAAAATAAGAATGTGAATTCTATTGTAGATATG CTATTGAATTCATCAGATAGTAATAATGATTCAGTTTCGTTTAAAAAAGCTCTCGATAATTTAGAGAAGATGAAGTCGAG TATAGGAACAAAACAATCTAAATCCAAACCCTTGGGTAGTTTGTATCAAAAAAAGTTTGATTTAGAGGATGAAATCAAAA ATATTAACAATGATAAAAAAGAGTACGAAGATAGTTTAAACAAATTAAATGAGTACAAATTTAAACATGAAAGTCTGATT TTAAATAAAGAAAAATTAGTTAGTTTGCATAAGAAAAATGATATTGAAAAAATAGAAGATGCAAAAAATTATAAAATGCA GATTTTAAAAGAAAAAGCAAGCTTACTAGATACAATATCAAAGATAAAATACATCAATGATATTAATGAAAATGATGTTA ATAGTTTGGAACATGAGAATAAAATATTAAATGAAAACAGAATTAAATTTAATGAGTTATCGAAGAAGAAAAAATTATTA AATAAGGATTACTACCAATTAAAAGCAAAATTAAGTAACTATGAAACAATTAGTAAGTATATTGAAGAAATTAATAATTT AAATGGAAAGTTAAATGGAATTGCTAAATTAAACATTAAATTAATTGTTATTGGACTTATATTTACAATTATTGCTTCTG CAATGATTTATATGATGGGAAAAACAAAAGAATTTGTTATTGCTCCTATTTTATTTGTTCTGTATTATATTGTGGTTATT TTTTTGAGTAAACTTAGGAAATTATCTTTTACTCGTCAATTAAATAAAATTGTGCAAAAAATTAATCAAATTACAAATAT GAGATATAAAAGCCACAATGAAGTAATTAATGATTTTAGATACGATTCAAATATGGATAAAAGTATTGATTATTTGAACA CTTTGGAAGAGCAAATTAAAGGTATTGACTTAAGACTAGATTCTATTATTAATGAAGATGAAAACTCTAAGTCTAAAATT AACAGTATTTTATCTTCATCAAAAAACTTGAAGAATATCGATGTTGAAGATTATAGAAGAAAAAGGATAGAGTACGATCA ATTGATTCATAGAATTTCAGATAAAGATGATCAACTTCAAAAGATATCATCTGAGTATGATTTTAGTATTTTATTGGATA ATGTGGATTCGGATTCAATAAAACTAGATGATAATGATATAAAAGATATCAATGTACTTAATAAAGAAATTGATGAATCT ATCGAGAAAAATGCGAAATTATATGAAAGGACTAAAATCCTTGAAAAATCAGTAAATCTATTACTAGAAAAAGAAGAAAA ATTATCAGATATCAATGAGAATATTCAAAAATATGAAAATGAAATTATATCTATAGAATTAGCTATGGATTTAATTAATA AAAGTATAAATAAACTACACAAAAATTTTATTCCAAGAATTAACAAGAAAGTCTCAGAAATGATGGCATATTCAACTAAA GACAAGGACAGATTCAGAGTTGATGAAAATTTAGATGTTAGTATTTATGATGGAGTAAAGTTTTACGAACAAAAACATTT AAGCTCCGGAACATTTGACTTGCTTTCTGTTTTTATCAGAATAAGTGTACTCGAAGAATTAATGGGTCTTGATTATTTGA TGATATTAGATGATTGTTTTGTTCAATTAGATGATGTAAGATATAAGAAATGTCTTGATTTGTTATTTAAAATTTCAAAT AATAATCAAATAATACTTTTTTCTTGCCAAAACAGAGATGAGCAATTGTTGAATGAACTAGACATAATATATAAGAAAAT TGAGTTAAAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGGTTACTTTATTGAAGAGACAAAGAACTTGGATTCAAATGATCCTATAGTTAAAAGAGCAATTGATTTAGGAATTCAT TCTTTGATGGAGAATAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATGATATATGCAATAGGTGATTTACATCTGGATTATACAAAAGAAAAATCGATGGATGTGTTTGGTGATAATTGGGAT AATTATGAAGAAAAGATATT
Product: putative DNA double-strand break repair rad50 ATPase
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 750; Mature: 750
Protein sequence:
>750_residues MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK
Sequences:
>Translated_750_residues MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK >Mature_750_residues MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVYTEDYEKYRPWNNENYEGSIL VEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDNLSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDM LLNSSDSNNDSVSFKKALDNLEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHENKILNENRIKFNELSKKKKLL NKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIKLIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVI FLSKLRKLSFTRQLNKIVQKINQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSIKLDDNDIKDINVLNKEIDES IEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYENEIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTK DKDRFRVDENLDVSIYDGVKFYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK
Specific function: Unknown
COG id: COG4717
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88352; Mature: 88352
Theoretical pI: Translated: 6.10; Mature: 6.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVY CEEEEEEHHHCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TEDYEKYRPWNNENYEGSILVEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDN CCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC LSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDMLLNSSDSNNDSVSFKKALDN CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH LEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHEN ECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH KILNENRIKFNELSKKKKLLNKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH LIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVIFLSKLRKLSFTRQLNKIVQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHH NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSI HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCE KLDDNDIKDINVLNKEIDESIEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYEN EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTKDKDRFRVDENLDVSIYDGVK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEECCHH FYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK CCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKIIRLDLISFGRFNNYTIEFGDKFNLIYGLNESGKTTISKFIEGVFYGFVKPYLKRTVY CEEEEEEHHHCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TEDYEKYRPWNNENYEGSILVEKDDKRYVIYRNFKEKYFNIFNETTGNNETDLDGFNRDN CCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC LSFPGEYFFKMPSDIFTSTVFSNLKELDSENKNVNSIVDMLLNSSDSNNDSVSFKKALDN CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH LEKMKSSIGTKQSKSKPLGSLYQKKFDLEDEIKNINNDKKEYEDSLNKLNEYKFKHESLI HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE LNKEKLVSLHKKNDIEKIEDAKNYKMQILKEKASLLDTISKIKYINDINENDVNSLEHEN ECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH KILNENRIKFNELSKKKKLLNKDYYQLKAKLSNYETISKYIEEINNLNGKLNGIAKLNIK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHH LIVIGLIFTIIASAMIYMMGKTKEFVIAPILFVLYYIVVIFLSKLRKLSFTRQLNKIVQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INQITNMRYKSHNEVINDFRYDSNMDKSIDYLNTLEEQIKGIDLRLDSIINEDENSKSKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHH NSILSSSKNLKNIDVEDYRRKRIEYDQLIHRISDKDDQLQKISSEYDFSILLDNVDSDSI HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCE KLDDNDIKDINVLNKEIDESIEKNAKLYERTKILEKSVNLLLEKEEKLSDINENIQKYEN EECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIISIELAMDLINKSINKLHKNFIPRINKKVSEMMAYSTKDKDRFRVDENLDVSIYDGVK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCEEEECCHH FYEQKHLSSGTFDLLSVFIRISVLEELMGLDYLMILDDCFVQLDDVRYKKCLDLLFKISN HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NNQIILFSCQNRDEQLLNELDIIYKKIELK CCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA