Definition Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome.
Accession NC_010334
Length 5,226,917

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The map label for this gene is 167624060

Identifier: 167624060

GI number: 167624060

Start: 2572138

End: 2574375

Strand: Direct

Name: 167624060

Synonym: Shal_2136

Alternate gene names: NA

Gene position: 2572138-2574375 (Clockwise)

Preceding gene: 167624058

Following gene: 167624063

Centisome position: 49.21

GC content: 35.7

Gene sequence:

>2238_bases
ATGTTAAGATGCAAAGATTTTGTTGATAGTAAAAAGAAGGAAGTGGGTCGGATAGTTAGTCTCGCAAAGACAAGTGCTAT
AAGCTTTTTCTACTCATTAAGAAACTACTGCCTGAAGCAAAAGGGAGTGCTTTTAGTTTTAATGTCCTTGATTACTTTTA
AGGCTTCAATGGAAGCATCGTCGTTGCTAAATGGTGAGGTTCCAGTTGATCAATTAAAAGCTATATCACTTACTATCGGT
GGAGGACTGCTTGGCTTCACTGCAATTGTTTTTTCCTTACTTTTATTTTCTCTTCAGATCAACCTTCAAAGATTGAGGTA
TCTAGATTTTTATAGGTTTAGTGCTGATAGGCATGTATTGGGGTATCTTTTATCTTGCCTTATTGTCTCCATTTCTATCA
TAGCTGCTTCACTGTTTATTGTGGAAAGTTCATCTGGTCAACATGCGGCACTCATGTTTTGGGCTGTGGTGTTATTTACT
TTTCTTTTGATTTTTTCGTATAAACGGGCAATACAGCTCATTGACCCTATAGAGCAAGTAAGACTAATCGAATCGGAGGT
TGACTCATCTCTTGAACGCTGGGGTAAAGTTATTGAAAGACAAATTCTAGCTGACAAGATAGCGCCTATTGAAAGCCTTA
CTAATAAAGATTTTGATTCGCTGAGATGGCAGCTATGTAGAAGGTACCCTACGCATCAGCAAGCAGTTTTTAACTCTATC
GATAGCTTATGTTCAATGACGAAAGTTTACACTGAGTTAAATGATTACATTGTAGCTAGAAATACACTTACTAAAATCAT
ATTTATTATAGATAGGTACATGCGATTTAGACAAAATACGTTTATTGAAGGTTCACCTTTTATGAGTACTAGTGTCGAGT
CTGAGCCAGTTTTTAATTATGCGCTAGAGAGGGTTGGGCAGAGTACATCTGATGCAATAAGTGCGGATGATAAAGAATGG
ATTCAAATATGTTTTGAAGTCTTTTCACATTTAGCTCAGAACTCTAATTTTTATAAAGTTCAACATGGATACCAGTTGGG
GCAGCAGATTACCTCTATTATTTATTATTTGACCTCTGGTGTTAAAGAAACAATTCCATTAAAAAATAATGATGTGATGA
TAAATGCTTCAAGATCGGTTGGCGGGTTAGCTACGGCGTTACTAAAAACTGCGTCGTATGACAACTTACAACAACTTGAC
AAATCACTGCTGTTACTAGGAAGTTTAAGTATAAGTAAAGGTGATATAACAGTAATAAACGATGTCATGCAGAGATACGG
TGACATAGTGTTTTTATTACTTTTTAGCGAAGGAACTGATGCAGAATCAGAAGCTCAGAGCATATCCACAAGCATTCACT
TTTTAGGTAAACTTCATTTGCAGCAAGGGGGGAAGACGTCTTTTAACCTAGGATATGTAAATGGAGTTTATGGATTTGGA
GAAACATCATTGTCCGTGAAATTATCACAACAAGCACAAATACTGCTTAGTGATACAGAGCGGTTTAAGAGTGAAATAAC
ATCGCTAATTGAAGGTATTTGCTTGTGGCTGAAAGTATCGTTTAATGACCGATATGAGCTTTATCAACTTGATCAAGAAG
CAGATTTAGACCTATTTCATTATTTATATTCTTTATCAGACACTATGCTGAAAATATTGTTGACACTAACTAGTGAGATA
ACTGAACATCAATTAAGGCATGATGCATATACGGTGATAAATAGAGAGATCATAGCCTTGTGTGAGATAAGAGAAGATAA
AGAAGTTTTCCGCAGAATTGATTCCTATGATTTTATGAATTCACTGTTTAATTTACATAGATTAATAGGCTCTTTAGATA
CCCAATCATGCTCTTCGGTTTTGACTATTAACATTTTGAAGTTGGGGTTTAAGGCCGCATCTATAAATAGTGATCATGGA
TTGTTAGTTAAAGCTATCTGTGCTGCTGCGATAATTTCAGTTAATAACAATGAGCAATCTCTATATAGGGGGTTAATTGA
TAAAAATCTCAATGAATTCTCTGGTCATCAGAAGGTTTGCTTTAACGCTTTACCAAAACTTGAGTATTTAGGAAGGTTGG
GGCGCTTCGAAAAAGGAAGAACAATGACCAGTTATCCTCGTTGTACTATTGAACGCTTTTGTCATAAATCCCTTACTAAT
GAGCTTAGGGAGGAAATTAAGTACTCAATTGAAGCCATTAAGCTAAATGCTATTGATAAAGAGGTCGGTACAAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTATTATTTTTATACGCTTAGATTAGGAGTGAAAACCTATGCATTTTGTTGTAAGTTATTGTAAGGAAAAGGAGTCA
ATATAACAGTGACCTTACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATTTTGAATAAATGAAGATATTTTTTCTAATCTGAACCATCCGCGTTAGAGCAAATAACCTAACGCGTTATTGTCCAA
AAATGAGTTTTAAATACGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 745; Mature: 745

Protein sequence:

>745_residues
MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG
GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT
FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI
DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW
IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD
KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG
ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI
TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG
LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN
ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN

Sequences:

>Translated_745_residues
MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG
GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT
FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI
DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW
IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD
KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG
ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI
TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG
LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN
ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN
>Mature_745_residues
MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG
GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT
FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI
DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW
IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD
KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG
ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI
TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG
LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN
ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84367; Mature: 84367

Theoretical pI: Translated: 6.87; Mature: 6.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEAS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHH
SLLNGEVPVDQLKAISLTIGGGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVL
HHCCCCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
GYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFTFLLIFSYKRAIQLIDPIEQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
RLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
ALERVGQSTSDAISADDKEWIQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSG
HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLDKSLLLLGSLSISKGDITVIN
HHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
DVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG
HHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCC
ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFH
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHH
YLYSLSDTMLKILLTLTSEITEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHGLLVKAICAAAIISVNNNEQS
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN
HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN
HHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEAS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHH
SLLNGEVPVDQLKAISLTIGGGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVL
HHCCCCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
GYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFTFLLIFSYKRAIQLIDPIEQV
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RLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI
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VKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLDKSLLLLGSLSISKGDITVIN
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CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHH
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LYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN
HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN
HHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA