| Definition | Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010334 |
| Length | 5,226,917 |
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The map label for this gene is 167624060
Identifier: 167624060
GI number: 167624060
Start: 2572138
End: 2574375
Strand: Direct
Name: 167624060
Synonym: Shal_2136
Alternate gene names: NA
Gene position: 2572138-2574375 (Clockwise)
Preceding gene: 167624058
Following gene: 167624063
Centisome position: 49.21
GC content: 35.7
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGATTTTGAATAAATGAAGATATTTTTTCTAATCTGAACCATCCGCGTTAGAGCAAATAACCTAACGCGTTATTGTCCAA AAATGAGTTTTAAATACGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 745; Mature: 745
Protein sequence:
>745_residues MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN
Sequences:
>Translated_745_residues MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN >Mature_745_residues MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEASSLLNGEVPVDQLKAISLTIG GGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVLGYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFT FLLIFSYKRAIQLIDPIEQVRLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNYALERVGQSTSDAISADDKEW IQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSGVKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLD KSLLLLGSLSISKGDITVINDVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFHYLYSLSDTMLKILLTLTSEI TEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMNSLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHG LLVKAICAAAIISVNNNEQSLYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 84367; Mature: 84367
Theoretical pI: Translated: 6.87; Mature: 6.87
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEAS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHH SLLNGEVPVDQLKAISLTIGGGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVL HHCCCCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFTFLLIFSYKRAIQLIDPIEQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH RLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH ALERVGQSTSDAISADDKEWIQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSG HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLDKSLLLLGSLSISKGDITVIN HHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH DVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG HHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCC ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFH CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHH YLYSLSDTMLKILLTLTSEITEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHGLLVKAICAAAIISVNNNEQS HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN HHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MLRCKDFVDSKKKEVGRIVSLAKTSAISFFYSLRNYCLKQKGVLLVLMSLITFKASMEAS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHH SLLNGEVPVDQLKAISLTIGGGLLGFTAIVFSLLLFSLQINLQRLRYLDFYRFSADRHVL HHCCCCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GYLLSCLIVSISIIAASLFIVESSSGQHAALMFWAVVLFTFLLIFSYKRAIQLIDPIEQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH RLIESEVDSSLERWGKVIERQILADKIAPIESLTNKDFDSLRWQLCRRYPTHQQAVFNSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH DSLCSMTKVYTELNDYIVARNTLTKIIFIIDRYMRFRQNTFIEGSPFMSTSVESEPVFNY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH ALERVGQSTSDAISADDKEWIQICFEVFSHLAQNSNFYKVQHGYQLGQQITSIIYYLTSG HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC VKETIPLKNNDVMINASRSVGGLATALLKTASYDNLQQLDKSLLLLGSLSISKGDITVIN HHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH DVMQRYGDIVFLLLFSEGTDAESEAQSISTSIHFLGKLHLQQGGKTSFNLGYVNGVYGFG HHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCCC ETSLSVKLSQQAQILLSDTERFKSEITSLIEGICLWLKVSFNDRYELYQLDQEADLDLFH CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHH YLYSLSDTMLKILLTLTSEITEHQLRHDAYTVINREIIALCEIREDKEVFRRIDSYDFMN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SLFNLHRLIGSLDTQSCSSVLTINILKLGFKAASINSDHGLLVKAICAAAIISVNNNEQS HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH LYRGLIDKNLNEFSGHQKVCFNALPKLEYLGRLGRFEKGRTMTSYPRCTIERFCHKSLTN HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH ELREEIKYSIEAIKLNAIDKEVGTN HHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA