| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is ndvB [H]
Identifier: 167039632
GI number: 167039632
Start: 1002214
End: 1010877
Strand: Direct
Name: ndvB [H]
Synonym: Teth514_0980
Alternate gene names: 167039632
Gene position: 1002214-1010877 (Clockwise)
Preceding gene: 167039631
Following gene: 167039633
Centisome position: 40.79
GC content: 34.38
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: putative carbohydrate-binding protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2887; Mature: 2887
Protein sequence:
>2887_residues MWYIVALVLLLIATSIVHISKNQRLSREDSIRDFDDIILNSEEMEKHAAEIAQNHNIMKRTKLSYLLIPRMNKNYNYIKN VYRNLNSILKEEDVYISQEEEWLLDNFYIIEEQVKEIRKSLSKSYYSGLPGLKNGLFKGYPRIYAIAFELVLHTDGKIDE KAIINFIKAYQTKALLSSSELWALSLMIRIALVEKIKKICEKIVETRHQREKAEKILTLLLEKEMKYEEVKKLIRNNINV ADRFPLQFIEHLVSRLRKEGSNSVNVIQSIEKILMEYDTSINDVAEKAHQIQAKRQISIGNAITSLKTVSSLDWAQIFES LSSVEQVLRQDPDGTYPKMDFESRDYYRHEIEKIAKYYNTSETYVAKKAIECAKEVTEQEGKLGYINHVGFYLVGKGRSI LENKLSNKSKRTISWRKIAKKSPETLYVGLILIFLLVEEFFALKYIANFSNKWGLLFISGVILLIPFSEMSVQLVNWILV HIFKPVVLPKIELKEGIPEDAKTMVVISSLLPDEKRTKELIENLEVYYHANREKNLYFGLLGDFKDAPFEVMSEDEKIVK CALEQIEKLNEKYSKNGEKIFYYFHRKRKYNQMQKSWMGWERKRGALVEFNELLRGKEDTSFYVVSGDVAKLNIKYVITL DADTNLPIDTAKKLVGTMLHPLNKAVIDRDYGVVVEGYGLLQPRIGIDIESANATLFSKIYAGEGGIDPYTTAVSDVYQD LFGEGIYTGKGIYDVDVFRELLRDTIPDNSILSHDLLEGSFVRTGLVSDIELIDGYPAKYNSYIMRLHRWVRGDWQLLPY LKSKIKNRKGEMVKNPLSLITKWKIIDNLRRSVVSVALMLMLFLGFSLLPGSSFLWLGVAILTVFFPILPALVDTIFKGQ FRHYWEKRHKAVITSIEAAFYQSLLNFAFLPYQAYMMADAIVRTLTRLYITRKNLLEWVTAADMEKRLRNDFASFFKRMW IVLVEGLALVALVMYFKPQDLIGAIVLFFLWAISPYIAFYISQPIISKEKTVSQEEMEELRLIARKTWRFFEDFVTESQN YLPPDNFQEDPPNGIAERTSPTNIGLYLVSVVGARDLGYITTTEMVERIKKTLTTIGKMEKWNGHLYNWYNTRTLEPLRP YYVSTVDSGNLVGYLITVKEAIGEFLNKPLIDIELAKGLKDTIKMLNIEGITEDIFRNILNKKTLMPSDWEVFLSKISEK LSSTEDEVGNIERLKNIIGALKREMKEFLAWTEFDERQKEQEIFKRYKEVFEEHSSPKELEKVYKNYLLEIEEVFEKATE EEKALLKSQKDKVARALEKIKNLEAEIENIKSIIENLVEKTEFRHLYDEKRQLFSIGYNVEEEKLTKSYYDLLASEARQA SFIAIAKREIDKKHWFKLGRMLAIENRYKGLVSWSGTMFEYFMPLLIMKNYQNTLLDETYAFAVRVQKNYAKELGIPWGI SESGFYAFDINLNYQYKAFGVPSLGLKRGLSHDKVVAPYGSLLAIGVDVEGVLQNIRFLKKEGVEGKYGFYEAIDYTPER FPFGKKSAIVKSFMAHHQGMVFVALDNFINNNVMQKRFHKDPRIKAAQILLQEKMPMYLDITREEREEARKIQKVRKEDG DFVRILGESKTWLPEVHILSSGRYFVMLTEKGTGYSKNSRGIFLTRWRKDLAQDFGTFIFVQNINSNTVWSVTYAPFYEK GQNYRVVFSADKAEYFKRVGNIDTHLEIVISPEDDVEIRRLTLKNHSKHPRILEVTSFGEISLIDLPTDVAHPAFNKLFV KTEFLKEEDAILVCRKPREQGKNKLWAVHKVAVLSGEIVGDTQFETDRAKFIGRGRSLKNPIALEADQPLSNTEGAVLDP IVSLRKRVKVMPGEVAKVVYISAITETKEEAIKIAAKYKEENVVERDFEMSWTRSRVELDYLNLKPRELGLLQRMLAHIL FVSPQRRYREEMILKNVKGQSGLWAYGISGDLPIVLVEIEKMEEIEMVKWFLKAYEYWKMKGINIDLVILNKDKSGYLQP LHDKIKELINTTFSYDIFGKYGGVYLLQQNNLKEEDVYLLNTVVALKFEGGNESIYDQIMIKETKNAPKLKNWVKKVQNF EEIKLEELPLDYYNGFGGFSYDGKEYIIKWEGKSTPAPWINVISNPSFGFQVSETGAGYTWAENSREYKLTPWYNDPVLD PHGEVIYLTDEETGDRWSITPLPAGKAKVHYIKHGFGYTSFETICCGLSQHLKMFVAKEDSIKINLVTIKNLGNENRKLT VSYYIRPVLGVTDEITSPYLFTKYDEKIGALMIKNVYNEDFTNRLAFLSASEKINSFTCDRSEFIGVASSLTSPQALEYE TLSNSTGISLDPCAAIQFHVEVKAYEEKQFAILLGHGKNEEEVARLISKYTNVENCKNELQRVKEFWQYLLGRIQVKTPD RSMDLLVNGWLPYQTIACRLWARSAFYQSGGAYGFRDQLQDAMNMVYLEPEFTKNQIVNACQHQFVEGDVQHWWHPVLNK GIRTKFADDLLWLPYVTADYIEKTGDWPILDIEVNYLEDLRLKEEEEERYSTPRISETKGTVYEHCIRAIDYSLKFGEHG LPLMGAGDWNDGMNKVGNKGKGESVWLGWFLYTILQKFSPICQTKKDEEHAKKYQEIANKLIKAIEENAWDGSWYRRAYF DDGTPLGSVDNSECKIDSISQSWSVISKAGKEVRVKEAMKAVVNYLVNEEEGIIKLLTPPFDNGDLNPGYIKGYVPGVRE NGGQYTHAAAWVILAFAELGEGDRAWQLYNMVNPINHTRTPIECMKYKVEPYVMAADVYAVEPHVGRGGWTWYTGAAGWM YRIAIENLLGLKKYGEKLIIDPCIPKNWDKYVIEYNYKNTKYLIEVRNPEGVNKGVKEVYIDGELVTDKTIDLTKEGNGH QVLVIMG
Sequences:
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FVSPQRRYREEMILKNVKGQSGLWAYGISGDLPIVLVEIEKMEEIEMVKWFLKAYEYWKMKGINIDLVILNKDKSGYLQP LHDKIKELINTTFSYDIFGKYGGVYLLQQNNLKEEDVYLLNTVVALKFEGGNESIYDQIMIKETKNAPKLKNWVKKVQNF EEIKLEELPLDYYNGFGGFSYDGKEYIIKWEGKSTPAPWINVISNPSFGFQVSETGAGYTWAENSREYKLTPWYNDPVLD PHGEVIYLTDEETGDRWSITPLPAGKAKVHYIKHGFGYTSFETICCGLSQHLKMFVAKEDSIKINLVTIKNLGNENRKLT VSYYIRPVLGVTDEITSPYLFTKYDEKIGALMIKNVYNEDFTNRLAFLSASEKINSFTCDRSEFIGVASSLTSPQALEYE TLSNSTGISLDPCAAIQFHVEVKAYEEKQFAILLGHGKNEEEVARLISKYTNVENCKNELQRVKEFWQYLLGRIQVKTPD RSMDLLVNGWLPYQTIACRLWARSAFYQSGGAYGFRDQLQDAMNMVYLEPEFTKNQIVNACQHQFVEGDVQHWWHPVLNK GIRTKFADDLLWLPYVTADYIEKTGDWPILDIEVNYLEDLRLKEEEEERYSTPRISETKGTVYEHCIRAIDYSLKFGEHG LPLMGAGDWNDGMNKVGNKGKGESVWLGWFLYTILQKFSPICQTKKDEEHAKKYQEIANKLIKAIEENAWDGSWYRRAYF DDGTPLGSVDNSECKIDSISQSWSVISKAGKEVRVKEAMKAVVNYLVNEEEGIIKLLTPPFDNGDLNPGYIKGYVPGVRE NGGQYTHAAAWVILAFAELGEGDRAWQLYNMVNPINHTRTPIECMKYKVEPYVMAADVYAVEPHVGRGGWTWYTGAAGWM YRIAIENLLGLKKYGEKLIIDPCIPKNWDKYVIEYNYKNTKYLIEVRNPEGVNKGVKEVYIDGELVTDKTIDLTKEGNGH QVLVIMG
Specific function: Involved in the production of beta-(1,2)-glucan. It is involved not only in invasion but also in bacteroid development [H]
COG id: COG3459
COG function: function code G; Cellobiose phosphorylase
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To A.tumefaciens ChvB [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR008928 - InterPro: IPR009342 - InterPro: IPR019282 - InterPro: IPR021478 - InterPro: IPR011013 - InterPro: IPR010383 - InterPro: IPR010403 [H]
Pfam domain/function: PF06204 CBM_X; PF10091 DUF2329; PF11329 DUF3131; PF06165 Glyco_transf_36; PF06205 GT36_AF [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 333535; Mature: 333535
Theoretical pI: Translated: 7.17; Mature: 7.17
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MWYIVALVLLLIATSIVHISKNQRLSREDSIRDFDDIILNSEEMEKHAAEIAQNHNIMKR CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH TKLSYLLIPRMNKNYNYIKNVYRNLNSILKEEDVYISQEEEWLLDNFYIIEEQVKEIRKS HCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSKSYYSGLPGLKNGLFKGYPRIYAIAFELVLHTDGKIDEKAIINFIKAYQTKALLSSSE HHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH LWALSLMIRIALVEKIKKICEKIVETRHQREKAEKILTLLLEKEMKYEEVKKLIRNNINV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCC ADRFPLQFIEHLVSRLRKEGSNSVNVIQSIEKILMEYDTSINDVAEKAHQIQAKRQISIG CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NAITSLKTVSSLDWAQIFESLSSVEQVLRQDPDGTYPKMDFESRDYYRHEIEKIAKYYNT HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC SETYVAKKAIECAKEVTEQEGKLGYINHVGFYLVGKGRSILENKLSNKSKRTISWRKIAK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC KSPETLYVGLILIFLLVEEFFALKYIANFSNKWGLLFISGVILLIPFSEMSVQLVNWILV 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YQSLLNFAFLPYQAYMMADAIVRTLTRLYITRKNLLEWVTAADMEKRLRNDFASFFKRMW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVLVEGLALVALVMYFKPQDLIGAIVLFFLWAISPYIAFYISQPIISKEKTVSQEEMEEL HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCHHHHHHH RLIARKTWRFFEDFVTESQNYLPPDNFQEDPPNGIAERTSPTNIGLYLVSVVGARDLGYI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCE TTTEMVERIKKTLTTIGKMEKWNGHLYNWYNTRTLEPLRPYYVSTVDSGNLVGYLITVKE EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEHHH AIGEFLNKPLIDIELAKGLKDTIKMLNIEGITEDIFRNILNKKTLMPSDWEVFLSKISEK HHHHHHCCCCEEHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH LSSTEDEVGNIERLKNIIGALKREMKEFLAWTEFDERQKEQEIFKRYKEVFEEHSSPKEL HCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH EKVYKNYLLEIEEVFEKATEEEKALLKSQKDKVARALEKIKNLEAEIENIKSIIENLVEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEFRHLYDEKRQLFSIGYNVEEEKLTKSYYDLLASEARQASFIAIAKREIDKKHWFKLGR HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MLAIENRYKGLVSWSGTMFEYFMPLLIMKNYQNTLLDETYAFAVRVQKNYAKELGIPWGI HHEEHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCC SESGFYAFDINLNYQYKAFGVPSLGLKRGLSHDKVVAPYGSLLAIGVDVEGVLQNIRFLK CCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCEECCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHH KEGVEGKYGFYEAIDYTPERFPFGKKSAIVKSFMAHHQGMVFVALDNFINNNVMQKRFHK HCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECHHHCCHHHHHHHCC DPRIKAAQILLQEKMPMYLDITREEREEARKIQKVRKEDGDFVRILGESKTWLPEVHILS CCCHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEE SGRYFVMLTEKGTGYSKNSRGIFLTRWRKDLAQDFGTFIFVQNINSNTVWSVTYAPFYEK CCCEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCHHHC GQNYRVVFSADKAEYFKRVGNIDTHLEIVISPEDDVEIRRLTLKNHSKHPRILEVTSFGE CCCEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCC ISLIDLPTDVAHPAFNKLFVKTEFLKEEDAILVCRKPREQGKNKLWAVHKVAVLSGEIVG EEEEECCCHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHCCCCCEEHHHHHHHHCCCEEC DTQFETDRAKFIGRGRSLKNPIALEADQPLSNTEGAVLDPIVSLRKRVKVMPGEVAKVVY CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEE 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References: 2154461; 11481430 [H]