| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is 167039277
Identifier: 167039277
GI number: 167039277
Start: 640956
End: 642227
Strand: Direct
Name: 167039277
Synonym: Teth514_0618
Alternate gene names: NA
Gene position: 640956-642227 (Clockwise)
Preceding gene: 167039275
Following gene: 167039283
Centisome position: 26.08
GC content: 31.21
Gene sequence:
>1272_bases ATGTCGTTCATCGCACAGATTAGATTTTTGCCCAAAGAAGTAAAACGTTTTATAGCAACTGAAGCTTTATTGGGAATAGG GATGGGGATTTTTGGCTTAGTATTAAATTTGCACTTGCTTGCTTTAAACATATCTCCTGAACAAATAGGGGTTCTCAATT CTGTCGGGACTTTAGTGATGGGAGCAGCTGCTATTCCGGCAGGTTTTTTTGCTAATTATATTGGAAGAAAACGCGTTTTT ATATCAGGAATAACACTTATAGGGATAGGATATGGGCTTTTTGGATTAGGGGAATCCATGGGAATTTTTTACTTGGCACA GATTATACAATTTATAGGAATTTCCTTTTTGATTACAACAGAAATACAGCTTTTGTTTTCGTATGCTAAAATAAATGAAT TAGAAACTGTAAGTTATAGCCTTTTATTTGCTGTTTTCACTTTATTTAGTGGTATGGGAACTTTGTTAGGAGGTTTTATA CCTAATTGGCTGCCTTTTGGCAATACAAAGTATCAATGGGCAGTCTATATATCTGCTATTTTTATTTTACTGGCGGCTTT ATTAAGGGGAATTTTATTGCCATGTTTAAATAATAGTTTTGATAAAGGTAAGAGCAAGTTATTATTGTCAAATATTAGGA TTTCCCAAGTTTTTGATAAAAAAATTATTTTAATTACTTTTTATCTTTTTTTGGCGGGGATGGCTTTTTCTATGATAGTT CCTTTCCAAAATGTGATTGTGAAATTTCGGATGGGCTGGAGCGATGAATATATCTCATATTTTCTGACAGTAAATGGGTT AATTTTGTTTTTTGCTTCTATGGTGATGCCTTGGGTAATTAACAAATTTGGAACCATTAAAGCTTTTTACTATGTGTATT GGATGAATTTATTTTTTGCACTTATATTAAGTTTTAATGATATTTCTGTAATGATGTTTTCAACAATATTTTTATTGAGA AGTGGGTGTTTTACTCTTTTAAATAATATGATAGAAAGTCAAACAATGTCTGTGATAGAGGAAGAAAAGAGGGACTTTTT TGCTGGAGAAAAGTCACTTTTAAGGAGTATAGGATCAGCAATAGCCAGCTATTTAGCTGGCTATATATTGGAAAATAAGA ATTATACATATCCTTTCTTGATTACTTTTATAATACTTTTAGCAAGTCTTTTGTATTTTGTTGTATTCATTAAACCTATT TTTGTTGAGAAGCTAAACAATGACAAATTTTCTTTTGAAGAAGAAATTCAAAAGGATGCGGAAGGTATGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CCTTCTTTTAAGAAGACATGGATAACTTTTGAGTACTTCTAAAGCCGCTTTTTATAGCGGCTTTTTTGGAAGATATATAC GAGAGGAAAGGAGAAAATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATACCAAATGGCAAGCGACAAAAATGTTCTCCATCTTTGTAGTTCATTTTTGTAGTTTATTAATGATAAATGAGCTAC AGAACGTATGTTGAAAAGAG
Product: major facilitator transporter
Products: NA
Alternate protein names: MFS Transporter; Transporter Facilitator Family
Number of amino acids: Translated: 423; Mature: 422
Protein sequence:
>423_residues MSFIAQIRFLPKEVKRFIATEALLGIGMGIFGLVLNLHLLALNISPEQIGVLNSVGTLVMGAAAIPAGFFANYIGRKRVF ISGITLIGIGYGLFGLGESMGIFYLAQIIQFIGISFLITTEIQLLFSYAKINELETVSYSLLFAVFTLFSGMGTLLGGFI PNWLPFGNTKYQWAVYISAIFILLAALLRGILLPCLNNSFDKGKSKLLLSNIRISQVFDKKIILITFYLFLAGMAFSMIV PFQNVIVKFRMGWSDEYISYFLTVNGLILFFASMVMPWVINKFGTIKAFYYVYWMNLFFALILSFNDISVMMFSTIFLLR SGCFTLLNNMIESQTMSVIEEEKRDFFAGEKSLLRSIGSAIASYLAGYILENKNYTYPFLITFIILLASLLYFVVFIKPI FVEKLNNDKFSFEEEIQKDAEGM
Sequences:
>Translated_423_residues MSFIAQIRFLPKEVKRFIATEALLGIGMGIFGLVLNLHLLALNISPEQIGVLNSVGTLVMGAAAIPAGFFANYIGRKRVF ISGITLIGIGYGLFGLGESMGIFYLAQIIQFIGISFLITTEIQLLFSYAKINELETVSYSLLFAVFTLFSGMGTLLGGFI PNWLPFGNTKYQWAVYISAIFILLAALLRGILLPCLNNSFDKGKSKLLLSNIRISQVFDKKIILITFYLFLAGMAFSMIV PFQNVIVKFRMGWSDEYISYFLTVNGLILFFASMVMPWVINKFGTIKAFYYVYWMNLFFALILSFNDISVMMFSTIFLLR SGCFTLLNNMIESQTMSVIEEEKRDFFAGEKSLLRSIGSAIASYLAGYILENKNYTYPFLITFIILLASLLYFVVFIKPI FVEKLNNDKFSFEEEIQKDAEGM >Mature_422_residues SFIAQIRFLPKEVKRFIATEALLGIGMGIFGLVLNLHLLALNISPEQIGVLNSVGTLVMGAAAIPAGFFANYIGRKRVFI SGITLIGIGYGLFGLGESMGIFYLAQIIQFIGISFLITTEIQLLFSYAKINELETVSYSLLFAVFTLFSGMGTLLGGFIP NWLPFGNTKYQWAVYISAIFILLAALLRGILLPCLNNSFDKGKSKLLLSNIRISQVFDKKIILITFYLFLAGMAFSMIVP FQNVIVKFRMGWSDEYISYFLTVNGLILFFASMVMPWVINKFGTIKAFYYVYWMNLFFALILSFNDISVMMFSTIFLLRS GCFTLLNNMIESQTMSVIEEEKRDFFAGEKSLLRSIGSAIASYLAGYILENKNYTYPFLITFIILLASLLYFVVFIKPIF VEKLNNDKFSFEEEIQKDAEGM
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47721; Mature: 47589
Theoretical pI: Translated: 9.03; Mature: 9.03
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFIAQIRFLPKEVKRFIATEALLGIGMGIFGLVLNLHLLALNISPEQIGVLNSVGTLVM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHH GAAAIPAGFFANYIGRKRVFISGITLIGIGYGLFGLGESMGIFYLAQIIQFIGISFLITT HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIQLLFSYAKINELETVSYSLLFAVFTLFSGMGTLLGGFIPNWLPFGNTKYQWAVYISAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH FILLAALLRGILLPCLNNSFDKGKSKLLLSNIRISQVFDKKIILITFYLFLAGMAFSMIV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFQNVIVKFRMGWSDEYISYFLTVNGLILFFASMVMPWVINKFGTIKAFYYVYWMNLFFA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSFNDISVMMFSTIFLLRSGCFTLLNNMIESQTMSVIEEEKRDFFAGEKSLLRSIGSA HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IASYLAGYILENKNYTYPFLITFIILLASLLYFVVFIKPIFVEKLNNDKFSFEEEIQKDA HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHC EGM CCC >Mature Secondary Structure SFIAQIRFLPKEVKRFIATEALLGIGMGIFGLVLNLHLLALNISPEQIGVLNSVGTLVM CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHH GAAAIPAGFFANYIGRKRVFISGITLIGIGYGLFGLGESMGIFYLAQIIQFIGISFLITT HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIQLLFSYAKINELETVSYSLLFAVFTLFSGMGTLLGGFIPNWLPFGNTKYQWAVYISAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH FILLAALLRGILLPCLNNSFDKGKSKLLLSNIRISQVFDKKIILITFYLFLAGMAFSMIV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PFQNVIVKFRMGWSDEYISYFLTVNGLILFFASMVMPWVINKFGTIKAFYYVYWMNLFFA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSFNDISVMMFSTIFLLRSGCFTLLNNMIESQTMSVIEEEKRDFFAGEKSLLRSIGSA HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IASYLAGYILENKNYTYPFLITFIILLASLLYFVVFIKPIFVEKLNNDKFSFEEEIQKDA HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHC EGM CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA