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The map label for this gene is yiaN [C]

Identifier: 16273630

GI number: 16273630

Start: 50812

End: 52068

Strand: Reverse

Name: yiaN [C]

Synonym: HI0050m

Alternate gene names: 16273630

Gene position: 52068-50812 (Counterclockwise)

Preceding gene: 16272025

Following gene: 16272024

Centisome position: 2.85

GC content: 34.29

Gene sequence:

>1257_bases
TTGTGTAGTTTATTCTTATTGTTATTTCTTGGTGTACCTGTAGCACTATCAATGCTGTTGAGTGCGAGTATTATGCTATA
TCATCTTGATATGTTTGATACGCAATTAATTACAGAAAACTTTGTGATGGGAACGAATAATTTTCCTTTGATGGCTATTC
CTTTCTTTATGCTTACTGGAGAAATAATGAAGCATGGTGGAATTTCTGAGCGAATCATTAATTTTGCAACAAGTATGGTT
GGTCATATTAAAGGTGGTTTAGGTTATGTTGCGATCATTTCTGGGTTGATATTTGCAGGGTTATCTGGTTCTGCGGTAGC
GGATACGGCCGCGTTAGGTGCAATACTAATTCCTATGATGATTTCTAAAAAATATGATGGTGCTCGTTCCACAGGATTAA
TTTGTGCTGCAGGTATTATTTCAGTTGTTATTCCTCCAAGCATTCCTATGATCATTTACGGTATTACTGCTGGAGCATCC
ATCACTAAATTATTTATGGGGGGAACTGTACCAGGCTTATTAATGGTCGTTGGATTATGGGTTACTTGGAAAATTTTGTA
TAGAAATAATGATACAAGTCTAGAAAGAAAACAAACTGGCAAAGAAAGATGGGTTGCTTTTAAAAAAGCATTTTGGCCTT
TATTATTACCTATCATTATTATTGTGGGATTAAGAGGAGGGATTTTTACTCCAACAGAAGCGGGAGTTGTTGCTGCAATT
TATGCTGGCATAGTAAGTATTGCTTATAAAGGCTTAACATTTTCTAAATTAAAAGACGTCTTCATTGGTACCATCAAAAC
AACATCAATGGTAATGTTTGTTGCTGCATCAGCAATGATATCTGCTTTTGCGATTACAGTTGCTCAAATTCCAACAGAAT
TAGTCCAAACGATTAAAGGATTAACTGATAGTCCGACAATTTTAATGTTTATTATAATGCTATTTTTATTACTTGTTGGA
TGTGTAATGGATTTAATTCCTGCGGTATTAATCTTTGTTCCAGTCTTATTACCAGTGTTAAGAGCATATAATATTGATAT
TGCGTATTTTGGAATCATGATGGTGATTAATTTATCTATAGGATTAATAACACCGCCTGTGGGAACAGTTTTGTATGTAG
GCTCAGGGATATCAAAATTAGGGATAGGAGCATTATCCAAAGGAATTGCTCCATTCTTATTTGTGTACGCAATTATTATG
ATGTTGATCGTATTTTTTCCTGAAATTGTAATTGTTCCAATGAATTGGTTATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATATCTGCCGTATCTTACTTTTTTATTGTCATGTTTAGCATGATTAAAGACTATAAAGAATCCTCTGATAAATAGGAG
CTTATAATGTTACTATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTAGGAAGTTACATCATGAAAAAAATAGCATTTATCGGCGAGTGTATGATTGAACTCAATGGGAAACCCTTTGCGG
AAATGTGGCAAAGTTATGGT

Product: integral membrane protein transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 418; Mature: 418

Protein sequence:

>418_residues
MCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINFATSMV
GHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGAS
ITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAGVVAAI
YAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLFLLLVG
CVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIM
MLIVFFPEIVIVPMNWLS

Sequences:

>Translated_418_residues
MCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINFATSMV
GHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGAS
ITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAGVVAAI
YAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLFLLLVG
CVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIM
MLIVFFPEIVIVPMNWLS
>Mature_418_residues
MCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTGEIMKHGGISERIINFATSMV
GHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMMISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGAS
ITKLFMGGTVPGLLMVVGLWVTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAGVVAAI
YAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKGLTDSPTILMFIIMLFLLLVG
CVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSIGLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIM
MLIVFFPEIVIVPMNWLS

Specific function: Unknown

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the TRAP transporter large permease family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994950, Length=410, Percent_Identity=47.5609756097561, Blast_Score=338, Evalue=4e-94,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010656
- InterPro:   IPR004681 [H]

Pfam domain/function: PF06808 DctM [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44797; Mature: 44797

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
6.0 %Met     (Translated Protein)
6.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
6.0 %Met     (Mature Protein)
6.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHH
EIMKHGGISERIINFATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGASITKLFMGGTVPGLLMVVGLW
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAGVVAAI
HHHEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH
YAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKG
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTDSPTILMFIIMLFLLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIMMLIVFFPEIVIVPMNWLS
HCCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHCC
>Mature Secondary Structure
MCSLFLLLFLGVPVALSMLLSASIMLYHLDMFDTQLITENFVMGTNNFPLMAIPFFMLTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHH
EIMKHGGISERIINFATSMVGHIKGGLGYVAIISGLIFAGLSGSAVADTAALGAILIPMM
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ISKKYDGARSTGLICAAGIISVVIPPSIPMIIYGITAGASITKLFMGGTVPGLLMVVGLW
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VTWKILYRNNDTSLERKQTGKERWVAFKKAFWPLLLPIIIIVGLRGGIFTPTEAGVVAAI
HHHEEEEECCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHH
YAGIVSIAYKGLTFSKLKDVFIGTIKTTSMVMFVAASAMISAFAITVAQIPTELVQTIKG
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTDSPTILMFIIMLFLLLVGCVMDLIPAVLIFVPVLLPVLRAYNIDIAYFGIMMVINLSI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
GLITPPVGTVLYVGSGISKLGIGALSKGIAPFLFVYAIIMMLIVFFPEIVIVPMNWLS
HCCCCCHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]