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The map label for this gene is 16272504

Identifier: 16272504

GI number: 16272504

Start: 579736

End: 581637

Strand: Reverse

Name: 16272504

Synonym: HI0561

Alternate gene names: NA

Gene position: 581637-579736 (Counterclockwise)

Preceding gene: 16272506

Following gene: 16272503

Centisome position: 31.78

GC content: 41.11

Gene sequence:

>1902_bases
GTGTATCTCGGTCTAAAAGTGGGGGTGACATTTGCGTCATCTATTCCAGCGGCCGTCATTTCTATGGCAGTACTCAAATT
TTTCAAAGATTCTAGCATTCTTGAAAATAATATGGTGCAAACTCAAGCATCTTCAGCAGGTACGCTTTCTTCTGTGATCT
TCGTCTTGCCTGGTTTATTAATGATGGGCTACTGGCAAGATTTCCCATTCTGGCAAACGATGTTGATTTGTGCAGCTGGT
GGTACATTGGGCGTGTTATTCACTATTCCATTACGCCGTGCAATGGTGGTAAATAGTAATTTACCTTATCCTGAAGGGGT
AGCCGCTGCAGAAATTTTGAAAGCAGGTAATCATGCAGATGGCGACAGCGGTGTGAAAGATATTGCTTACGGTGGTGTTT
TAGCAGGATTAGTGGCATTTTTAACTAATGGTTTACGCGTGATGGCTGATGGTGCAAGTGCTTGGATTCAAACAGGAAAA
GCGGCGTTCCAATTACCAATGGGCTTTTCACTTGCCTTACTCGGTGCTGGTTATTTAATTGGTATCGTGGGCGGTATCGC
AATGTTGATCGGTGTTATTTTGACTTGGGGTGTGGCAGTGCCATATTTCACAATGTCAGAAGATATTGCCGCGGATGCAA
GTTTAATTGATTCTGCGATGACTGTTTGGAAAACCAAAGTGCGTTATATTGGTGTGGGTACAATTGGCATTGCTGCGATT
TGGACATTGCTGATTTTAATGAAACCAATGATTGAAGGAATGGTTCATTCTTTCCGTATGCTGAAAGGTGGGCAAGAGGC
ATCAGAACATCGTATTGATATTGACCTTTCTCCAAAAACAATGATTTATATCTTAATTGCGACGGTTGCGTTAATTGTTA
TTTCATTACATCACTTTATTGCGGCGGCACCAATTTCGCCTGAGCTTTCCATTTTATTAGTGGTAGTTTGTACTTTCTTA
GCGGTATTTATCGGCTTCTTTGTGGCAGCGGCTTCTGGTTATATGGCTGGTTTAGTGGGTTCATCTTCAAGCCCAATTTC
TGGTATCGGAATTATTTCTGTTATCGTGATTTCATTAGTATTGGTGTCAATCGGTAATGCCTCGGGCTTATTTGAAACTG
TAGATGGTCAGAAATTTTTAACCGCACTTACATTGTTTACGGCATCTATCGTAATCACTACAGCCTGTATTTCTAATGAT
AATCTACAAGATTTAAAAACGGGTTTATTAGTTGAAGCAACACCTTGGCGACAACAAGTTGCATTAATTATCGGCTGCTT
TGTCGGTGCACTTGTTATCGCGCCAGTGTTAGAAATCTTATATCACGCGTATGGTTTCAGTGGTGCATTGCCACGTCCAG
ATATGGATCCTTCACAAGCCTTATCTGCACCACAAGCAACGTTAATGACCGCCATTTCTCAAGGTATTTTCACAAATAAA
TTGGAATGGACTTACATCTTAACTGGTGTGGGTTTAGGTGCTGTGTTAATTACGATTGATGCATTTTTGAAAAAAGTCAG
CAACAAAGTCTTTAGCTTGCCAGTTATTGCTGTGGGGATTGGTATTTACTTACCACCATCAATTAATACGCCTGTGATTG
TTGGTGCATTCCTAGCGTGGATTATGGCTCGCCATATTGCAAAACTTGGTAACAAAGAAGTGTCAGCTAAAGCAGAACGT
TTCGGTACGCTTTTCTCTGCAGGTTTAATTGTAGGCGAAAGTTTAATGGGTGTCATTTTAGCATTCATTATTGCGGCTTC
TGTTACCACTGGTGGTTCTGAAGCGCCATTATCCTTAAATCTTGAAAACTGGGATACAATTGGCGAGTGGTTCGGTTTAA
TCGTATTTATCGTGGGCATTGTGATTTTTGCATCTCGCGTATTACGTGCGAAAAAAATCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTCAAGGAACAATTTATGTATAACGAAAACTTAAAAGAATTGACCGTTTGAGGAATTATCCTCGGTGCATTGATTACGG
TAATTTTCACTGCATCCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATCCTTAAATTTATTTTAGAATAGGTTATCTTCTGGATAGCCTATTTTTCACTATGAAATCTTACTTAAAAACACTT
ATTTTTTTCCCTCTGATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 633; Mature: 633

Protein sequence:

>633_residues
MYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAG
GTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGK
AAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAADASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAI
WTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFL
AVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISND
NLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPRPDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNK
LEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAER
FGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWFGLIVFIVGIVIFASRVLRAKKI

Sequences:

>Translated_633_residues
MYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAG
GTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGK
AAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAADASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAI
WTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFL
AVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISND
NLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPRPDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNK
LEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAER
FGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWFGLIVFIVGIVIFASRVLRAKKI
>Mature_633_residues
MYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLLMMGYWQDFPFWQTMLICAAG
GTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHADGDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGK
AAFQLPMGFSLALLGAGYLIGIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAADASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAI
WTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFIAAAPISPELSILLVVVCTFL
AVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLVLVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISND
NLQDLKTGLLVEATPWRQQVALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPRPDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNK
LEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAWIMARHIAKLGNKEVSAKAER
FGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLNLENWDTIGEWFGLIVFIVGIVIFASRVLRAKKI

Specific function: Unknown

COG id: COG1297

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y561_HAEIN (P44016)

Other databases:

- EMBL:   L42023
- PIR:   G64009
- RefSeq:   NP_438718.1
- GeneID:   950224
- GenomeReviews:   L42023_GR
- KEGG:   hin:HI0561
- NMPDR:   fig|71421.1.peg.531
- TIGR:   HI_0561
- HOGENOM:   HBG346616
- OMA:   PREGMDA
- ProtClustDB:   CLSK877379
- BioCyc:   HINF71421:HI_0561-MONOMER
- InterPro:   IPR004814
- InterPro:   IPR004813
- TIGRFAMs:   TIGR00733
- TIGRFAMs:   TIGR00728

Pfam domain/function: PF03169 OPT

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 66617; Mature: 66617

Theoretical pI: Translated: 6.88; Mature: 6.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xc176e74)-; HASH(0xc5f0a0c)-; HASH(0xd0883cc)-; HASH(0xd264540)-; HASH(0xc46a748)-; HASH(0xd279060)-; HASH(0xc5c56dc)-; HASH(0xd077aa8)-; HASH(0xcf939a0)-; HASH(0xc82a1dc)-; HASH(0xc7e31fc)-; HASH(0xd099194)-; HASH(0xc691d98)-; HASH(0xc8425c0)-; HASH(0xcffdee4)-;

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLL
CEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHAD
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
GDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHH
GIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAADASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHH
WTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLV
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQV
HHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHH
ALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPRPDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCC
LEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAW
CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHH
IMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLN
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LENWDTIGEWFGLIVFIVGIVIFASRVLRAKKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
>Mature Secondary Structure
MYLGLKVGVTFASSIPAAVISMAVLKFFKDSSILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVLPGLL
CEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MMGYWQDFPFWQTMLICAAGGTLGVLFTIPLRRAMVVNSNLPYPEGVAAAEILKAGNHAD
HHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
GDSGVKDIAYGGVLAGLVAFLTNGLRVMADGASAWIQTGKAAFQLPMGFSLALLGAGYLI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHCCCHHEECCCCHHHHHHHHHHHH
GIVGGIAMLIGVILTWGVAVPYFTMSEDIAADASLIDSAMTVWKTKVRYIGVGTIGIAAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHH
WTLLILMKPMIEGMVHSFRMLKGGQEASEHRIDIDLSPKTMIYILIATVALIVISLHHFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAAPISPELSILLVVVCTFLAVFIGFFVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISVIVISLV
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LVSIGNASGLFETVDGQKFLTALTLFTASIVITTACISNDNLQDLKTGLLVEATPWRQQV
HHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCEEECCCHHHHH
ALIIGCFVGALVIAPVLEILYHAYGFSGALPRPDMDPSQALSAPQATLMTAISQGIFTNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHCCC
LEWTYILTGVGLGAVLITIDAFLKKVSNKVFSLPVIAVGIGIYLPPSINTPVIVGAFLAW
CEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCEEECCCCCCHHHHHHHHHH
IMARHIAKLGNKEVSAKAERFGTLFSAGLIVGESLMGVILAFIIAASVTTGGSEAPLSLN
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEE
LENWDTIGEWFGLIVFIVGIVIFASRVLRAKKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800