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The map label for this gene is yfiS [H]

Identifier: 162447174

GI number: 162447174

Start: 317624

End: 318829

Strand: Direct

Name: yfiS [H]

Synonym: ACL_0308

Alternate gene names: 162447174

Gene position: 317624-318829 (Clockwise)

Preceding gene: 162447173

Following gene: 162447176

Centisome position: 21.22

GC content: 31.92

Gene sequence:

>1206_bases
ATGCAAAACTGGAAAAAGATGATTGTTTTATTTATGGTGAGTCAAACAATATCACTATTAGGTTCTATGCTTGTAATGTA
TGCGATTATGTGGCATATTACTTTAAGCACATCATCTGGTTTAATGATGACTATCTATGTGCTTTGTTCATTCATTCCAG
GTATTATAATGATGCCGTTTGCTGGTGTTTGGGCTGATAGGTTAGATAGAAAGAAATTGATGATCTATGCAGATTTATTA
ATTGCTTTTGTAACACTTATCATAGCTATTGTATTTATTATAGGCATCAGAGATTTATGGATTGTTTTTATAGTTGCAGT
CATCAGAGCATTTGGCCAAGCCATTCATCAACCAGCAGTTTTAGCAGTGTATCCATCAATTGTACCTAAAGATAAACTAC
TCAAAGTACAAGGGATATCTCAAGGTATACAGTCGGCATCTTTAATTATTATGCCTTTATTAGCAGGGTTACTACTTTCT
TTATTTGAGATTGAATTCATCTTATTTATAGATGTTGTTACAGCGTTAATTGCAGTGGTCATGTTACTTACCGTGATTCA
TATACCTAAAAATGTTAATAAACAACATATGAATGAAATCAAATATATGGAAGATATTAAAAATGGGATTAAATACGCTA
GACAACATAAACTTATTTTTAGTATATTAATGTTTGCTTTTGTGTATATGATACTTGTTGCCGCACCTTCTTTTTTAACA
TACCTTCAAGTTGCTAGAGTATTTGGCCCTGAGGCATGGCGTTTATCTATACTAGAAACATTATTTGGTGTAGGTATGTT
GTTAGGTTCAATCGTGATTGCGCTTTGGGGTGGGTTTAAAAATAGAATGGTTACTTTCTTTTTAAGTTACATGATGATTG
GTATAGGGACAATGGGATTGGGGTTACCATTTAACTTTTGGGTTTATGTATCTATGTGGTCTTTTGTAGGATTTTTTATA
TCGATAAGTAGCCCAATTATGACTACACTTATACAAGAAAAAGTAGACCCTGAATATATTGGGAGAATATTTTCTGTGTT
TGGTTTAATTAATACGGTAAGTTTACCACTGGGTATGTTATTATTTGGACCCCTATCAGATGTTGTAGATATATCTTTAA
TTATATTACTTAGTGGATTAGGCATGGTAGTTCTATCATCAATAATGATGTTTAACAAAACACTCATTAAAGAAGGGTTT
AAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGTTCAAATATTAACTCTTTTTTTATGGTGTAAATTGTAATAAAATTTAATCATATTTTTTTATAATGTAACTATATTA
AGTGAAAGTAGATAAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGCGAAAAAAAAGATGACGGTAGTCATCTTTTTTGAACTATATATTCATAATAATTGGTAAAATCATTGGTTTTC
TTAAAGTGATATCATATATT

Product: major facilitator superfamily transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 401; Mature: 401

Protein sequence:

>401_residues
MQNWKKMIVLFMVSQTISLLGSMLVMYAIMWHITLSTSSGLMMTIYVLCSFIPGIIMMPFAGVWADRLDRKKLMIYADLL
IAFVTLIIAIVFIIGIRDLWIVFIVAVIRAFGQAIHQPAVLAVYPSIVPKDKLLKVQGISQGIQSASLIIMPLLAGLLLS
LFEIEFILFIDVVTALIAVVMLLTVIHIPKNVNKQHMNEIKYMEDIKNGIKYARQHKLIFSILMFAFVYMILVAAPSFLT
YLQVARVFGPEAWRLSILETLFGVGMLLGSIVIALWGGFKNRMVTFFLSYMMIGIGTMGLGLPFNFWVYVSMWSFVGFFI
SISSPIMTTLIQEKVDPEYIGRIFSVFGLINTVSLPLGMLLFGPLSDVVDISLIILLSGLGMVVLSSIMMFNKTLIKEGF
K

Sequences:

>Translated_401_residues
MQNWKKMIVLFMVSQTISLLGSMLVMYAIMWHITLSTSSGLMMTIYVLCSFIPGIIMMPFAGVWADRLDRKKLMIYADLL
IAFVTLIIAIVFIIGIRDLWIVFIVAVIRAFGQAIHQPAVLAVYPSIVPKDKLLKVQGISQGIQSASLIIMPLLAGLLLS
LFEIEFILFIDVVTALIAVVMLLTVIHIPKNVNKQHMNEIKYMEDIKNGIKYARQHKLIFSILMFAFVYMILVAAPSFLT
YLQVARVFGPEAWRLSILETLFGVGMLLGSIVIALWGGFKNRMVTFFLSYMMIGIGTMGLGLPFNFWVYVSMWSFVGFFI
SISSPIMTTLIQEKVDPEYIGRIFSVFGLINTVSLPLGMLLFGPLSDVVDISLIILLSGLGMVVLSSIMMFNKTLIKEGF
K
>Mature_401_residues
MQNWKKMIVLFMVSQTISLLGSMLVMYAIMWHITLSTSSGLMMTIYVLCSFIPGIIMMPFAGVWADRLDRKKLMIYADLL
IAFVTLIIAIVFIIGIRDLWIVFIVAVIRAFGQAIHQPAVLAVYPSIVPKDKLLKVQGISQGIQSASLIIMPLLAGLLLS
LFEIEFILFIDVVTALIAVVMLLTVIHIPKNVNKQHMNEIKYMEDIKNGIKYARQHKLIFSILMFAFVYMILVAAPSFLT
YLQVARVFGPEAWRLSILETLFGVGMLLGSIVIALWGGFKNRMVTFFLSYMMIGIGTMGLGLPFNFWVYVSMWSFVGFFI
SISSPIMTTLIQEKVDPEYIGRIFSVFGLINTVSLPLGMLLFGPLSDVVDISLIILLSGLGMVVLSSIMMFNKTLIKEGF
K

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TCR/tet family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44948; Mature: 44948

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
7.0 %Met     (Translated Protein)
7.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
7.0 %Met     (Mature Protein)
7.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]