Definition Acholeplasma laidlawii PG-8A chromosome, complete genome.
Accession NC_010163
Length 1,496,992

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The map label for this gene is polC [H]

Identifier: 162447117

GI number: 162447117

Start: 242425

End: 246939

Strand: Direct

Name: polC [H]

Synonym: ACL_0247

Alternate gene names: 162447117

Gene position: 242425-246939 (Clockwise)

Preceding gene: 162447116

Following gene: 162447118

Centisome position: 16.19

GC content: 33.24

Gene sequence:

>4515_bases
ATGTCAACCAAGTTTGATCTATTCTTACAACAAGCACAATTAAATACACACCCATTATCTACTGCATATTTAAATTCAGT
TACTGTAAAGGTACGAGAAAAAACCTTAATATTTGATATAACATTTGATGAATTGATGTTACCAAGTGAAATGAGTTTAT
TTACCAATCAACTACAAACATTGTTTTTAAAAAAGGATGTTGTTTCACGTGTAGACTACCAGTTCACATTTAAACAAGCA
GATTTATCAGCACACTATAAAACTTATTATGAAGCTTTAATTCATAAAGCTTCTGAAATTTTTCAACCCGTACTTATTTT
TAAAAATTACACAGTTGAATATGAAAATAACATCTATACAATTTTAATTGAAAAAGATAGTAGAGGGTTAAAAAAATATC
TACCAGAATTAAAGAAATACTTTAAAAAACATGGTTTAGATGTTGATTTTACACTGAAGGTTAATGAGGATTTAATCCCG
GTTGCTGAACAAGTAAGACAAACCATTGAATCTCAAAAAGAGAGTATGGAGCGTCTAGTTAAAACAGCTGATGCTGTCAT
TTTAGATAAAAAGACAACATTTAATAGAAAATCTAGTCCATCTGCTGTAGCTATTAGTGAAATACCTAAGAGTGCCTATG
AACTTGATAAATACCAAAATGAAAAAGGCGATGTAAACTTTTTAATTGAAGGTGAAGTGTTTAAAACTGAGGTTAGAGAA
CTTAAGAATACAAACCTTTTAACGATGTCTATTTTTGACAAGGATGATGCAATTACAGTCAAAAGATTTGTAAGAGCACC
TAAAGATGTTGCTTTAGCCAAAGAAGTTAAAGTTGGAGATATTATCCAAGTATCTGGTCGTGCAGAATATGACACTTTCC
AAAAAGAAGTCACAATCATGGCAACAGCCTTTTATCAAATCGAGCGACCTAAAAAGTTTGAACGTATCGATAAAGCAAAA
GAAAAGCGTGTCGAGTTTCATATCCATACCAAAGCATCACCTATGGATGCAGTCACCTCAATTACCGATTATGTAGAAAC
CCTAGAAAGTTGGGGACATAAAGCTTTTGCGATTACTGATAGAAATGGTTTATATGCTTATCCTGAACTACATAAAGCAA
TTAAAGGTAAAAAGATTAAACCAATATATGGTGTTCAACTAGATTATGTTGACGATGAAGCTTTTTGGGTTGCTAAAGAC
TATCATGAAGATATTTTACTTAAAGAAGCAGTCTACACGGTTTTTGATATTGAAACCACAGGTTTTTCATTTACAAGAGA
TAAAATCATAGAAATTGCTGCATATAAAGTCAGAGGTGGATTTATTGCAGAACGTTTTGAAGTCTTAATTAATCCTGAAG
AGCAGTTAAGTGAAACTACAAAACGTATTACAAATATTACAGATGAAATGGTTGAAAACGAAAAAACCATTGAAGAAGTA
TTACCGACCTTCTTAGAATTTATTAAGGGCACTGTATTAGTTGCTCATAATGCATCCTTTGATATCGGCTTTATCTATGA
AAAATCTAGATTACTTGGTCTACAACATGAACCGTTTGCAGTTATAGATACTTTAAATATTGCAAGATACTTTTATAACA
ACACGAATAAAGAAAAGAACCATGCAAGATTCTATGTCAATGATGCTGGCAATATTCCCGATCTAAAAAGATTTAACTTA
AAAGCTTTAACGAAGTTCTTTAAAGTCAATCTAGAAGCACATCACCGTGCTATCTATGATGCCTATGCAACTGCAGAAGT
GTTTTTAAACATGCTACAAGATTTCTATAAAGAAGAAATATATAGTTATTTTGAATTACAAGCATCCCTTGATATGAATG
AAGTATGGCGTCATCCAATTCCCAAATACGCCACTGTTCTAGCTCAAACTCAAGAAGGTTATAAAAACTTATTCAAATTG
GTATCTGATGCCTTAACTACACACTTTGACGGTGGCCCAAGATTATTAAAATCTGCCTTTCTAAAATATAGAGAAGGTTT
ATTAATTGGTAGTGGAACCGAACATAGTGAAGTATTTGAAGCTGCACTTAATTTAAATGATGAACAATTAAAAGAAGCAA
TCTCATTTTATGACTATATTGAGGTACAACCACTTAATGCATACCTGCATCTAGAAAAAGAAATCGGTGCACTCGGTAGA
GAAGTCATTCAAGCAGCAATTAAAAAGATTATTACCTATGCAAAAGAGCAAAATAAAATAGTGATCGCATCTTCTAATGC
CCACTATTTAAATCCAGAGGATAAAAAATATAGAGAAATATACATTCAAACAAAATCTGTTGGTGGTGGACTACACCCAC
TTGCAAACTATGAAACTTCACCAGACCAACATCTTCTAACAACCACTGAAATGTTGGATGCATTCTCATTTTTAGATCAA
CAAACAGCTTATGAGATAGTAGTTACGAATACGAACAAGTTAAGTGATATGTTTGAGAATGTACGAGCTTTTCCTAAAGA
ACTGTACTCTATTAAAGATCACGCATTTAAAGATACATTAGGTATTCCTTCAATTAAAGAACATGTTGAAGAAATGGTTA
TGAATGAAGCTAAAAGATTATATGGTGATCCAATACATCCATATGTATTAGGTAGAGTTCAAAGAGAATTAACCAATATT
ATTGATAACCAATTTGCACCCATTTACTTTATTTCTCATTTATTAGTTAAAAAATCATTAGATGATGGCTACTTAGTAGG
TTCTAGAGGATCTGTTGGATCTTCACTTGTAGCAACCTTAATGAATATTACAGAAGTCAACCCTTTAAGACCGCATTTCC
GTTGTAAGAAGGGTGAATATGCAGTTTTTAAATTAACCGATGAAGAAATCTATGAACAAGGTGTAGATGCTAGAGATGAA
CCGTTCATCGAAGTATTAAAACATGTCAAATCAGGTTATGACCTACCAGATATGAAGTGTCCTATTTGTGGGGAACTCAT
GCATAAAGATGGTCATGATATTCCGTTTGAAACCTTCTTAGGTTTTGATGGGGATAAAATTCCTGATATCGACTTAAACT
TTAGTGGAGATTATCAATCTAAAGCACATGATTATGTTAGAGAACTATTAGGTGAAGAATATACCTTTAGAGCAGGAACC
ATTCAAACAGTTGCTGAACGTAACGCATTTGGTTATGTTAAAGGTTATTTAGAATACCTAGGTAAAGATGCAAGAAGTGC
ATATATTGAGCGTCTAGCTAAAGGTATTGAAGGTGTGAAACGTTCAACTGGTCAGCACCCTGGTGGGATTGTTGTTGTAC
CAAAGGATAAATCTATTTATGATGTCACACCAATTCAATATCCAGCAGATGATGTCAATAGTGCATGGAAGACAACACAT
TTTGATTACCATGCCTTTGAAGATAACTTACTAAAACTAGATATTCTAGGTCACGATGATCCAACCATGATCAAATTCTT
AATGGACTATGTTAAAGAGCATCCAGAGGATTTCCCTTTTGATAATGCACAAGACATTCCACTGGATGATCCAAATGTCT
ACCGTTTATTCCAAGATACCTCGGTGATTGGATTAAAAGATAAAGATGATGTTTATGGTGATATTGCAAGTTATGCAATT
CCAGAATTTGGTACACCATTTACAAGACAAATGTTACAACAAACAAGACCTTCAACATTTGCAGGTTTGGTTAAAATATC
TGGTCTATCACACGGTACAGACGTGTGGTTAAAAAACTCACAAGAACTTGTATTAGGTTCAACCCAATTTGGGAAAATTT
CATTCGATGACATTATTGGTTGTCGAGACGATATTATGGTGGAGTTATCTGACCGTGGTATGAAAGAAGCTAAAGCATTT
GAAATTATGGAGTTTGTCAGAAAGGGTAAACCTTCATCAAACCCTAAAAAATGGGCTGAATATGAAAATGAGATGAAAGC
AAGTAAGATACCTGATTGGTATATATGGAGTGCATCTCAAATTAAGTATATGTTCCCTAAAGCGCATGCGACTGCATATG
TGATTATGGCAATGCGTATTGCATGGTTTAAGGTCTATAGTCCATTGTTATTCTATTCAAGTTTCTTTAGTAAACGTGCT
GTGCAATTTGAGCATGACATTATGGTTGCAGGTACAAATGCAATTAGAAACAGAATTAATACTTTAAGAAATGACAATAA
CATTACTGCAAAAGACCAGGATGTGATTGTGACACTTTTAGTCGCACTTGAAATGACTAAGCGTGGATTTAAGTTTTTAC
CGGTCAACATTAAAAAATCACACGCTAAAGAGTTTGTGATGGAAAAAAATGGATTACGTATGCCTTTTTCAAGTATTGAT
GGCCTTGGGTTACAAGCTGCAATCAATATTGTTGAAAATAGAGAAGAAAAACCTTATAATTCAAAAGAAGATGCAAGAGT
ACGTGGAAAGTTAAACAAGACAGTATTTGAAAGATTAGATTTAGCTGGCGCATTTGATGACTTAGCAGATGTAAGTAGTG
AACTTGATCATGGGTTATTTGCTCATAAATACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAGGTAGTGGATTATTTATATTTTTAGGAATCATTTTAATGATGATTTATATGCGTATAGCTTTTTCAAAGCTTAA
AATGATATAGGAGTGAAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGTATAAAATTACACATATTAAAGACTTATTTATTTAAAATGTTAAAATAAAGTTATAATAATCTTGAAAAATGATGAA
GAGGTGAAACGAATATGCGT

Product: DNA polymerase III subunit alpha

Products: NA

Alternate protein names: PolIII [H]

Number of amino acids: Translated: 1504; Mature: 1503

Protein sequence:

>1504_residues
MSTKFDLFLQQAQLNTHPLSTAYLNSVTVKVREKTLIFDITFDELMLPSEMSLFTNQLQTLFLKKDVVSRVDYQFTFKQA
DLSAHYKTYYEALIHKASEIFQPVLIFKNYTVEYENNIYTILIEKDSRGLKKYLPELKKYFKKHGLDVDFTLKVNEDLIP
VAEQVRQTIESQKESMERLVKTADAVILDKKTTFNRKSSPSAVAISEIPKSAYELDKYQNEKGDVNFLIEGEVFKTEVRE
LKNTNLLTMSIFDKDDAITVKRFVRAPKDVALAKEVKVGDIIQVSGRAEYDTFQKEVTIMATAFYQIERPKKFERIDKAK
EKRVEFHIHTKASPMDAVTSITDYVETLESWGHKAFAITDRNGLYAYPELHKAIKGKKIKPIYGVQLDYVDDEAFWVAKD
YHEDILLKEAVYTVFDIETTGFSFTRDKIIEIAAYKVRGGFIAERFEVLINPEEQLSETTKRITNITDEMVENEKTIEEV
LPTFLEFIKGTVLVAHNASFDIGFIYEKSRLLGLQHEPFAVIDTLNIARYFYNNTNKEKNHARFYVNDAGNIPDLKRFNL
KALTKFFKVNLEAHHRAIYDAYATAEVFLNMLQDFYKEEIYSYFELQASLDMNEVWRHPIPKYATVLAQTQEGYKNLFKL
VSDALTTHFDGGPRLLKSAFLKYREGLLIGSGTEHSEVFEAALNLNDEQLKEAISFYDYIEVQPLNAYLHLEKEIGALGR
EVIQAAIKKIITYAKEQNKIVIASSNAHYLNPEDKKYREIYIQTKSVGGGLHPLANYETSPDQHLLTTTEMLDAFSFLDQ
QTAYEIVVTNTNKLSDMFENVRAFPKELYSIKDHAFKDTLGIPSIKEHVEEMVMNEAKRLYGDPIHPYVLGRVQRELTNI
IDNQFAPIYFISHLLVKKSLDDGYLVGSRGSVGSSLVATLMNITEVNPLRPHFRCKKGEYAVFKLTDEEIYEQGVDARDE
PFIEVLKHVKSGYDLPDMKCPICGELMHKDGHDIPFETFLGFDGDKIPDIDLNFSGDYQSKAHDYVRELLGEEYTFRAGT
IQTVAERNAFGYVKGYLEYLGKDARSAYIERLAKGIEGVKRSTGQHPGGIVVVPKDKSIYDVTPIQYPADDVNSAWKTTH
FDYHAFEDNLLKLDILGHDDPTMIKFLMDYVKEHPEDFPFDNAQDIPLDDPNVYRLFQDTSVIGLKDKDDVYGDIASYAI
PEFGTPFTRQMLQQTRPSTFAGLVKISGLSHGTDVWLKNSQELVLGSTQFGKISFDDIIGCRDDIMVELSDRGMKEAKAF
EIMEFVRKGKPSSNPKKWAEYENEMKASKIPDWYIWSASQIKYMFPKAHATAYVIMAMRIAWFKVYSPLLFYSSFFSKRA
VQFEHDIMVAGTNAIRNRINTLRNDNNITAKDQDVIVTLLVALEMTKRGFKFLPVNIKKSHAKEFVMEKNGLRMPFSSID
GLGLQAAINIVENREEKPYNSKEDARVRGKLNKTVFERLDLAGAFDDLADVSSELDHGLFAHKY

Sequences:

>Translated_1504_residues
MSTKFDLFLQQAQLNTHPLSTAYLNSVTVKVREKTLIFDITFDELMLPSEMSLFTNQLQTLFLKKDVVSRVDYQFTFKQA
DLSAHYKTYYEALIHKASEIFQPVLIFKNYTVEYENNIYTILIEKDSRGLKKYLPELKKYFKKHGLDVDFTLKVNEDLIP
VAEQVRQTIESQKESMERLVKTADAVILDKKTTFNRKSSPSAVAISEIPKSAYELDKYQNEKGDVNFLIEGEVFKTEVRE
LKNTNLLTMSIFDKDDAITVKRFVRAPKDVALAKEVKVGDIIQVSGRAEYDTFQKEVTIMATAFYQIERPKKFERIDKAK
EKRVEFHIHTKASPMDAVTSITDYVETLESWGHKAFAITDRNGLYAYPELHKAIKGKKIKPIYGVQLDYVDDEAFWVAKD
YHEDILLKEAVYTVFDIETTGFSFTRDKIIEIAAYKVRGGFIAERFEVLINPEEQLSETTKRITNITDEMVENEKTIEEV
LPTFLEFIKGTVLVAHNASFDIGFIYEKSRLLGLQHEPFAVIDTLNIARYFYNNTNKEKNHARFYVNDAGNIPDLKRFNL
KALTKFFKVNLEAHHRAIYDAYATAEVFLNMLQDFYKEEIYSYFELQASLDMNEVWRHPIPKYATVLAQTQEGYKNLFKL
VSDALTTHFDGGPRLLKSAFLKYREGLLIGSGTEHSEVFEAALNLNDEQLKEAISFYDYIEVQPLNAYLHLEKEIGALGR
EVIQAAIKKIITYAKEQNKIVIASSNAHYLNPEDKKYREIYIQTKSVGGGLHPLANYETSPDQHLLTTTEMLDAFSFLDQ
QTAYEIVVTNTNKLSDMFENVRAFPKELYSIKDHAFKDTLGIPSIKEHVEEMVMNEAKRLYGDPIHPYVLGRVQRELTNI
IDNQFAPIYFISHLLVKKSLDDGYLVGSRGSVGSSLVATLMNITEVNPLRPHFRCKKGEYAVFKLTDEEIYEQGVDARDE
PFIEVLKHVKSGYDLPDMKCPICGELMHKDGHDIPFETFLGFDGDKIPDIDLNFSGDYQSKAHDYVRELLGEEYTFRAGT
IQTVAERNAFGYVKGYLEYLGKDARSAYIERLAKGIEGVKRSTGQHPGGIVVVPKDKSIYDVTPIQYPADDVNSAWKTTH
FDYHAFEDNLLKLDILGHDDPTMIKFLMDYVKEHPEDFPFDNAQDIPLDDPNVYRLFQDTSVIGLKDKDDVYGDIASYAI
PEFGTPFTRQMLQQTRPSTFAGLVKISGLSHGTDVWLKNSQELVLGSTQFGKISFDDIIGCRDDIMVELSDRGMKEAKAF
EIMEFVRKGKPSSNPKKWAEYENEMKASKIPDWYIWSASQIKYMFPKAHATAYVIMAMRIAWFKVYSPLLFYSSFFSKRA
VQFEHDIMVAGTNAIRNRINTLRNDNNITAKDQDVIVTLLVALEMTKRGFKFLPVNIKKSHAKEFVMEKNGLRMPFSSID
GLGLQAAINIVENREEKPYNSKEDARVRGKLNKTVFERLDLAGAFDDLADVSSELDHGLFAHKY
>Mature_1503_residues
STKFDLFLQQAQLNTHPLSTAYLNSVTVKVREKTLIFDITFDELMLPSEMSLFTNQLQTLFLKKDVVSRVDYQFTFKQAD
LSAHYKTYYEALIHKASEIFQPVLIFKNYTVEYENNIYTILIEKDSRGLKKYLPELKKYFKKHGLDVDFTLKVNEDLIPV
AEQVRQTIESQKESMERLVKTADAVILDKKTTFNRKSSPSAVAISEIPKSAYELDKYQNEKGDVNFLIEGEVFKTEVREL
KNTNLLTMSIFDKDDAITVKRFVRAPKDVALAKEVKVGDIIQVSGRAEYDTFQKEVTIMATAFYQIERPKKFERIDKAKE
KRVEFHIHTKASPMDAVTSITDYVETLESWGHKAFAITDRNGLYAYPELHKAIKGKKIKPIYGVQLDYVDDEAFWVAKDY
HEDILLKEAVYTVFDIETTGFSFTRDKIIEIAAYKVRGGFIAERFEVLINPEEQLSETTKRITNITDEMVENEKTIEEVL
PTFLEFIKGTVLVAHNASFDIGFIYEKSRLLGLQHEPFAVIDTLNIARYFYNNTNKEKNHARFYVNDAGNIPDLKRFNLK
ALTKFFKVNLEAHHRAIYDAYATAEVFLNMLQDFYKEEIYSYFELQASLDMNEVWRHPIPKYATVLAQTQEGYKNLFKLV
SDALTTHFDGGPRLLKSAFLKYREGLLIGSGTEHSEVFEAALNLNDEQLKEAISFYDYIEVQPLNAYLHLEKEIGALGRE
VIQAAIKKIITYAKEQNKIVIASSNAHYLNPEDKKYREIYIQTKSVGGGLHPLANYETSPDQHLLTTTEMLDAFSFLDQQ
TAYEIVVTNTNKLSDMFENVRAFPKELYSIKDHAFKDTLGIPSIKEHVEEMVMNEAKRLYGDPIHPYVLGRVQRELTNII
DNQFAPIYFISHLLVKKSLDDGYLVGSRGSVGSSLVATLMNITEVNPLRPHFRCKKGEYAVFKLTDEEIYEQGVDARDEP
FIEVLKHVKSGYDLPDMKCPICGELMHKDGHDIPFETFLGFDGDKIPDIDLNFSGDYQSKAHDYVRELLGEEYTFRAGTI
QTVAERNAFGYVKGYLEYLGKDARSAYIERLAKGIEGVKRSTGQHPGGIVVVPKDKSIYDVTPIQYPADDVNSAWKTTHF
DYHAFEDNLLKLDILGHDDPTMIKFLMDYVKEHPEDFPFDNAQDIPLDDPNVYRLFQDTSVIGLKDKDDVYGDIASYAIP
EFGTPFTRQMLQQTRPSTFAGLVKISGLSHGTDVWLKNSQELVLGSTQFGKISFDDIIGCRDDIMVELSDRGMKEAKAFE
IMEFVRKGKPSSNPKKWAEYENEMKASKIPDWYIWSASQIKYMFPKAHATAYVIMAMRIAWFKVYSPLLFYSSFFSKRAV
QFEHDIMVAGTNAIRNRINTLRNDNNITAKDQDVIVTLLVALEMTKRGFKFLPVNIKKSHAKEFVMEKNGLRMPFSSIDG
LGLQAAINIVENREEKPYNSKEDARVRGKLNKTVFERLDLAGAFDDLADVSSELDHGLFAHKY

Specific function: Required for replicative DNA synthesis. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity [H]

COG id: COG2176

COG function: function code L; DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 exonuclease domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786381, Length=336, Percent_Identity=25.5952380952381, Blast_Score=77, Evalue=1e-14,
Organism=Escherichia coli, GI1786409, Length=190, Percent_Identity=30.5263157894737, Blast_Score=64, Evalue=7e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011708
- InterPro:   IPR006054
- InterPro:   IPR006055
- InterPro:   IPR013520
- InterPro:   IPR016027
- InterPro:   IPR004365
- InterPro:   IPR004013
- InterPro:   IPR003141
- InterPro:   IPR006308
- InterPro:   IPR012337 [H]

Pfam domain/function: PF07733 DNA_pol3_alpha; PF00929 Exonuc_X-T; PF02811 PHP; PF01336 tRNA_anti [H]

EC number: =2.7.7.7 [H]

Molecular weight: Translated: 172515; Mature: 172384

Theoretical pI: Translated: 5.93; Mature: 5.93

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTKFDLFLQQAQLNTHPLSTAYLNSVTVKVREKTLIFDITFDELMLPSEMSLFTNQLQT
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LFLKKDVVSRVDYQFTFKQADLSAHYKTYYEALIHKASEIFQPVLIFKNYTVEYENNIYT
HHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEE
ILIEKDSRGLKKYLPELKKYFKKHGLDVDFTLKVNEDLIPVAEQVRQTIESQKESMERLV
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTADAVILDKKTTFNRKSSPSAVAISEIPKSAYELDKYQNEKGDVNFLIEGEVFKTEVRE
HHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHH
LKNTNLLTMSIFDKDDAITVKRFVRAPKDVALAKEVKVGDIIQVSGRAEYDTFQKEVTIM
HCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
ATAFYQIERPKKFERIDKAKEKRVEFHIHTKASPMDAVTSITDYVETLESWGHKAFAITD
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
RNGLYAYPELHKAIKGKKIKPIYGVQLDYVDDEAFWVAKDYHEDILLKEAVYTVFDIETT
CCCEEECHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHEEEEECC
GFSFTRDKIIEIAAYKVRGGFIAERFEVLINPEEQLSETTKRITNITDEMVENEKTIEEV
CCCCHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
LPTFLEFIKGTVLVAHNASFDIGFIYEKSRLLGLQHEPFAVIDTLNIARYFYNNTNKEKN
HHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
HARFYVNDAGNIPDLKRFNLKALTKFFKVNLEAHHRAIYDAYATAEVFLNMLQDFYKEEI
CCEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSYFELQASLDMNEVWRHPIPKYATVLAQTQEGYKNLFKLVSDALTTHFDGGPRLLKSAF
HHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LKYREGLLIGSGTEHSEVFEAALNLNDEQLKEAISFYDYIEVQPLNAYLHLEKEIGALGR
HHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHH
EVIQAAIKKIITYAKEQNKIVIASSNAHYLNPEDKKYREIYIQTKSVGGGLHPLANYETS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
PDQHLLTTTEMLDAFSFLDQQTAYEIVVTNTNKLSDMFENVRAFPKELYSIKDHAFKDTL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GIPSIKEHVEEMVMNEAKRLYGDPIHPYVLGRVQRELTNIIDNQFAPIYFISHLLVKKSL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
DDGYLVGSRGSVGSSLVATLMNITEVNPLRPHFRCKKGEYAVFKLTDEEIYEQGVDARDE
CCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCCCCC
PFIEVLKHVKSGYDLPDMKCPICGELMHKDGHDIPFETFLGFDGDKIPDIDLNFSGDYQS
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCHH
KAHDYVRELLGEEYTFRAGTIQTVAERNAFGYVKGYLEYLGKDARSAYIERLAKGIEGVK
HHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSTGQHPGGIVVVPKDKSIYDVTPIQYPADDVNSAWKTTHFDYHAFEDNLLKLDILGHDD
HHCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCHHHCCCHHCCCCEEEECCCCEEEEEEECCCC
PTMIKFLMDYVKEHPEDFPFDNAQDIPLDDPNVYRLFQDTSVIGLKDKDDVYGDIASYAI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHCC
PEFGTPFTRQMLQQTRPSTFAGLVKISGLSHGTDVWLKNSQELVLGSTQFGKISFDDIIG
CCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHHHCC
CRDDIMVELSDRGMKEAKAFEIMEFVRKGKPSSNPKKWAEYENEMKASKIPDWYIWSASQ
CCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC
IKYMFPKAHATAYVIMAMRIAWFKVYSPLLFYSSFFSKRAVQFEHDIMVAGTNAIRNRIN
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCEEEECCHHHHHHHH
TLRNDNNITAKDQDVIVTLLVALEMTKRGFKFLPVNIKKSHAKEFVMEKNGLRMPFSSID
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCC
GLGLQAAINIVENREEKPYNSKEDARVRGKLNKTVFERLDLAGAFDDLADVSSELDHGLF
CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCC
AHKY
CCCC
>Mature Secondary Structure 
STKFDLFLQQAQLNTHPLSTAYLNSVTVKVREKTLIFDITFDELMLPSEMSLFTNQLQT
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LFLKKDVVSRVDYQFTFKQADLSAHYKTYYEALIHKASEIFQPVLIFKNYTVEYENNIYT
HHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEE
ILIEKDSRGLKKYLPELKKYFKKHGLDVDFTLKVNEDLIPVAEQVRQTIESQKESMERLV
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTADAVILDKKTTFNRKSSPSAVAISEIPKSAYELDKYQNEKGDVNFLIEGEVFKTEVRE
HHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHH
LKNTNLLTMSIFDKDDAITVKRFVRAPKDVALAKEVKVGDIIQVSGRAEYDTFQKEVTIM
HCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH
ATAFYQIERPKKFERIDKAKEKRVEFHIHTKASPMDAVTSITDYVETLESWGHKAFAITD
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
RNGLYAYPELHKAIKGKKIKPIYGVQLDYVDDEAFWVAKDYHEDILLKEAVYTVFDIETT
CCCEEECHHHHHHHCCCCCCEEECEEEEEECCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHEEEEECC
GFSFTRDKIIEIAAYKVRGGFIAERFEVLINPEEQLSETTKRITNITDEMVENEKTIEEV
CCCCHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
LPTFLEFIKGTVLVAHNASFDIGFIYEKSRLLGLQHEPFAVIDTLNIARYFYNNTNKEKN
HHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
HARFYVNDAGNIPDLKRFNLKALTKFFKVNLEAHHRAIYDAYATAEVFLNMLQDFYKEEI
CCEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSYFELQASLDMNEVWRHPIPKYATVLAQTQEGYKNLFKLVSDALTTHFDGGPRLLKSAF
HHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LKYREGLLIGSGTEHSEVFEAALNLNDEQLKEAISFYDYIEVQPLNAYLHLEKEIGALGR
HHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEEEHHHHHHHHH
EVIQAAIKKIITYAKEQNKIVIASSNAHYLNPEDKKYREIYIQTKSVGGGLHPLANYETS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
PDQHLLTTTEMLDAFSFLDQQTAYEIVVTNTNKLSDMFENVRAFPKELYSIKDHAFKDTL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GIPSIKEHVEEMVMNEAKRLYGDPIHPYVLGRVQRELTNIIDNQFAPIYFISHLLVKKSL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
DDGYLVGSRGSVGSSLVATLMNITEVNPLRPHFRCKKGEYAVFKLTDEEIYEQGVDARDE
CCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCCCCC
PFIEVLKHVKSGYDLPDMKCPICGELMHKDGHDIPFETFLGFDGDKIPDIDLNFSGDYQS
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCHH
KAHDYVRELLGEEYTFRAGTIQTVAERNAFGYVKGYLEYLGKDARSAYIERLAKGIEGVK
HHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSTGQHPGGIVVVPKDKSIYDVTPIQYPADDVNSAWKTTHFDYHAFEDNLLKLDILGHDD
HHCCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCHHHCCCHHCCCCEEEECCCCEEEEEEECCCC
PTMIKFLMDYVKEHPEDFPFDNAQDIPLDDPNVYRLFQDTSVIGLKDKDDVYGDIASYAI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHCC
PEFGTPFTRQMLQQTRPSTFAGLVKISGLSHGTDVWLKNSQELVLGSTQFGKISFDDIIG
CCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHEECCCCCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHHHCC
CRDDIMVELSDRGMKEAKAFEIMEFVRKGKPSSNPKKWAEYENEMKASKIPDWYIWSASQ
CCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC
IKYMFPKAHATAYVIMAMRIAWFKVYSPLLFYSSFFSKRAVQFEHDIMVAGTNAIRNRIN
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCEEEECCHHHHHHHH
TLRNDNNITAKDQDVIVTLLVALEMTKRGFKFLPVNIKKSHAKEFVMEKNGLRMPFSSID
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AHKY
CCCC

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References: 11058132 [H]