Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yddG [H]

Identifier: 161508872

GI number: 161508872

Start: 684312

End: 686159

Strand: Reverse

Name: yddG [H]

Synonym: USA300HOU_0629

Alternate gene names: 161508872

Gene position: 686159-684312 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161508873

Following gene: 161508871

Centisome position: 23.88

GC content: 29.44

Gene sequence:

>1848_bases
ATGAAGCATAAAAGTGTGTATCTTTTATGCTTTTTAATTTTGCCTATTCTGCTTTTAACATCTGTGAGTGCTTATGCTGT
TTCTAATCCAGTTGGAGAGCCCTCACATGCAGTTAAGCCAAAAATTGAAAAGTATGATTTATCACATTATCGTTCAATAT
ATAGTGAAAAAGGCGACTGGAATCCGTTTGGTCAAGAAGAAATTTCACGTCAAATTAATAATGTGTCAGATTTTTTCTTT
TCTATGACTAAGATTTTAGCAGGTGTTACAGATTATGCGATTGAAAATTTATTTCAATTAGATGTTATTAATGATTTTGC
GGATAAAATCGGCGATTTTGTTGGCGATATATATCAAAAGTTATTGAGTAATTTAGCATTAACATTATTTATTATTGTTT
GTTTTAACGCATTTATTATTTTTAGTGTACAAGGTAATGCAAGAGAAGCATTAAAACGAGCGTTTTTAATTATGTGTTTA
ATTGGTTTTGGTGTTGGTATACTTGCGAATGCAGGTAATATTATACGTGGTACAAACAATATTGGTAAGGACTTAAATAA
TATAATTATGAATAGTACATCTTCTATTGATGGTAATATTGATTATATTCATGAGAATTCAGGTATGAATCATATACGTA
ATCAATTATTTGATATGACGATATATAGAACATATTTAGTAATGAATTATGGAACTGTCGACGAAAAAGAGATAAAAGCA
AAAGGTAAAGACCGTATTGATAACATTTTAAAACTTGATTATGATAAAAAATCAGAAAAAGAATTAGATGATATTGTTAA
AGATGAGGTTGAAAAGAAAAATAATAAATATATGACGCAAGGTTATGTATTTCAAAAGTTGGCTATTTCAGTGATTGGTT
TTATTATTACACTTTTTATGTCGATAGTATTTTTATCAATAAGTTTTGCGAAGTTGATTTTTTCTACATTTGCTTTATTT
TTATTCTTATTTTTAGTATTCAGTTGGATAGTGAGTTTTATACCAGGATTTGAATTATCTGTTTTCTCTGCGTTTGCAAA
AACGTTAGGCTATATTATTTTAAGTGCTTGTATGACATTCTTATTTGTGATAGTTGGTTTGTGTATCAAGCTTGCAAATA
GTTTTATTGAACCGGATAGTCAAAATGCTTATTTTTTAAATTCAATATTTATAATTGTAATATTGTTTGTAATGTATAAA
AAACGGGCTCAAATTATCAATTTTGTAAGTCGTGGTAATATTAGTTTTTCTCCTAGTGCAATTGGTGCTGGTGTGATGAA
TCGAACACAAGAACGTTTTAATAAGATTCGTCATGAACAAGCGCAAAATAAGAAAGCTAAACGAGAAAATCAAAGAGATG
AACCCGCCCCACCACTTCAAAATGATAATGATTTAAGAAGAAGACAACAGGATAAACCAATGCCTTTATTTATAAATAAA
GATAATCAAAAAAATGGTAATAAGCGCAGAGAACAACAAGAGTCAATGAATGGTAACGATGTAAAATCTGCTTCTGTTGA
ATCAAATGCAAATAATTATTCTAAACAACCACAAAAAGCATCACAGCAAGAACATCAAGTACGAGAAACAAGACAGCGAA
AAGATATACAAAGGTCGCCACAAGTGGTTAATCAGCCATTAAATAATGAGAATCATTCAATAAATCGTAAAGAACAGAAG
TCAGTTCAAACTGCTTATGATACTGATGTTCAAAAACGACAAATACAAAATGCGACACAGAATCAACAAAGTAGACAATC
TGGAAATCGTAATCAACCTATTACGCGTAATTCTCAGTCAAAAGACCGTTTAAAAGAGCAAAAGGATATCAATAAGCATG
GTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTGGACAATATAATGAACCAATTTTATTTGATGCACCTTTAATGGAACAATATGATTTTGTGGAAGATGTGAAACAAAT
ATTAAATAAGGAGTGATTTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGATATTGCTAAAAAAGTAATAGGTAAAACGCCAATAGGCGTTAAATTGAAATTAGCGAAAGTCATCATCATTTTAT
GTGTGGTGGCTTTTTTTATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 615; Mature: 615

Protein sequence:

>615_residues
MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF
SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLALTLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL
IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA
KGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF
LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK
KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK
DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK
SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK

Sequences:

>Translated_615_residues
MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF
SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLALTLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL
IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA
KGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF
LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK
KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK
DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK
SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK
>Mature_615_residues
MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFF
SMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLALTLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCL
IGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA
KGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFMSIVFLSISFAKLIFSTFALF
LFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYK
KRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK
DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQK
SVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70418; Mature: 70418

Theoretical pI: Translated: 9.87; Mature: 9.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDW
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NPFGQEEISRQINNVSDFFFSMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSNLALTLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCLIGFGVGILANAGNIIRGTNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCH
IGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
KGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFM
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIVFLSISFAKLIFSTFALFLFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYKKRAQIINFVSRGNISFSPSA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
IGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEC
DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSP
CCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QVVNQPLNNENHSINRKEQKSVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQS
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH
KDRLKEQKDINKHGK
HHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDW
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NPFGQEEISRQINNVSDFFFSMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLSNLALTLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCLIGFGVGILANAGNIIRGTNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCH
IGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKA
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
KGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFM
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIVFLSISFAKLIFSTFALFLFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFVIVGLCIKLANSFIEPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYKKRAQIINFVSRGNISFSPSA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
IGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQDKPMPLFINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEC
DNQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSP
CCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QVVNQPLNNENHSINRKEQKSVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQS
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH
KDRLKEQKDINKHGK
HHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]