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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 161508373

GI number: 161508373

Start: 118945

End: 120612

Strand: Reverse

Name: yjbB [H]

Synonym: USA300HOU_0116

Alternate gene names: 161508373

Gene position: 120612-118945 (Counterclockwise)

Preceding gene: 161508374

Following gene: 161508360

Centisome position: 4.2

GC content: 36.09

Gene sequence:

>1668_bases
ATGGAAATGTCGGTTACAGAAGTCATTTTCTCCTTTTTAGGTGGTTTAGGTATTTTCCTTTACGGCTTAAAAATCATGGG
AGACGGGCTTCAAGCATCAGCAGGAGACAGGCTACGAGATATTTTAAACAAATTTACATCAAATCCAGTATTAGGTGTTA
TTGCAGGTATCGTTGTAACTATTTTAATACAAAGTAGTTCAGGTACGACAGTTATCACAATCGGACTGGTAACAGCTGGA
TTTATGACATTGAAACAAGCCATTGGAGTGATAATGGGTGCTAATATCGGAACAACGGTAACTGCATTTATTATCGGTAT
AGATTTAGGCGAATATGCAATGCCAATTTTAGCATTAGGTGCATTCTTAATCTTTTTCTTTAAACGCTCTAAAATCAATA
ACATTGGCCGCATACTATTCGGTTTCGGTTCACTATTCTTCGGTCTAGAATTTATGGGTGATGCCGTTAAACCTTTAGCA
TCATTAGATGGATTTAAGCAATTAATGCTTGATATGTCTACAAATCCAATACTCGCTGTCATTGTCGGCGCAGGGTTAAC
AGCACTAGTTCAAAGTTCAAGTGCGACGATTGGTATTTTACAAGAATTTTATCAACAAGATTTAATTAGCTTAAACGCAG
CAATCCCTGTGTTACTAGGCGATAACATTGGTACCACGATTACAGCTATCTTAGCTAGTTTAGCCGGCTCAATCGCTGCA
AAACGTGCGGCGCTTGTACACGTCATCTTTAACTTAATCGGGGTAATTATCTTCACAATTTTCTTGCCAGTTGTGATTCA
TTTGATTAGTTTGTTACAAGATTTATGGCACTTAAAACCAGCGATGACGATTGCAGTATCACATGGTATCTTCAACATAA
CAAATACTTTGATTCAATTACCATTTGTAGCAGGTTTAGCATGGATTGTTACAAAGCTTGTCCCAGGTAAAGATATTGCT
GATGACTATAAACCTCAGCACTTAAACAAAGATCTTGTTTATCACGCACCTGGTGTTGCATTACAAGAAACTCAAAAAGA
ATTACAAAATGTGGGTCAGATTGTCTTATCAATGTTTGAAGACATTCGCGAAATTACAAAAGACGATAAAAAATTGATCA
AAAAGCTTGAACAAAAGCATCAAGCTGTTGAAACAATCAATGATAGCATTCGAAATTATTTAGTTAGAATTTCTACAAAA
GCCATTACGAAGGCAGACGTTGAGCGTTTAGCAGTTATGTTTGATGTCAATCGCTCTATTTTAAAAGTAGCAGAGCTAAC
AGAAGAGTATGTCGCTCAATTAAAACGCCAACATGATGAAGATATTCGCATTACAGAAGATGCACAACGCGGTATGGATA
AATTATTCAACCATGTTGCTGAGTCATTTGATAAAGCCATCGACATGTTAGATGTTTATGACAAAACGAAAAAAGATGAA
ATTGTAGAACGTAGTAGAGAATCATTTAATATTGAACATAAACTACGCAAAGGTCATATTAAACGCCTTAATCGTGGTGA
ATGTACAACAAAAGGCGGATTACTATATATCGATATGATTGGTGTTCTTGAACGTATCGGTTATCATTCACGAAATGTTT
CTGAAGCACTTGTTGGCCTTAACGATGATGTACCTACAGATGAAGAAATTGCAACAACTGAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACAAATAACATATATTGTTAAATAATTTTACCTAATCTTAACATTAAATTTACAATTATAAGCGATAATCTAAATATAA
AGCTTATTTGAGGTGAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTACTGTCTTATTTATATTCATATTTTTTTAAAATTAGAGATTCAGATGCATGTAAAAAGCCAATCCAACATTCATG
GGTTGGCTTTTTTGTTTAGC

Product: PnaS family phosphate:sodium (Na+) symporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 555; Mature: 555

Protein sequence:

>555_residues
MEMSVTEVIFSFLGGLGIFLYGLKIMGDGLQASAGDRLRDILNKFTSNPVLGVIAGIVVTILIQSSSGTTVITIGLVTAG
FMTLKQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYAMPILALGAFLIFFFKRSKINNIGRILFGFGSLFFGLEFMGDAVKPLA
SLDGFKQLMLDMSTNPILAVIVGAGLTALVQSSSATIGILQEFYQQDLISLNAAIPVLLGDNIGTTITAILASLAGSIAA
KRAALVHVIFNLIGVIIFTIFLPVVIHLISLLQDLWHLKPAMTIAVSHGIFNITNTLIQLPFVAGLAWIVTKLVPGKDIA
DDYKPQHLNKDLVYHAPGVALQETQKELQNVGQIVLSMFEDIREITKDDKKLIKKLEQKHQAVETINDSIRNYLVRISTK
AITKADVERLAVMFDVNRSILKVAELTEEYVAQLKRQHDEDIRITEDAQRGMDKLFNHVAESFDKAIDMLDVYDKTKKDE
IVERSRESFNIEHKLRKGHIKRLNRGECTTKGGLLYIDMIGVLERIGYHSRNVSEALVGLNDDVPTDEEIATTEI

Sequences:

>Translated_555_residues
MEMSVTEVIFSFLGGLGIFLYGLKIMGDGLQASAGDRLRDILNKFTSNPVLGVIAGIVVTILIQSSSGTTVITIGLVTAG
FMTLKQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYAMPILALGAFLIFFFKRSKINNIGRILFGFGSLFFGLEFMGDAVKPLA
SLDGFKQLMLDMSTNPILAVIVGAGLTALVQSSSATIGILQEFYQQDLISLNAAIPVLLGDNIGTTITAILASLAGSIAA
KRAALVHVIFNLIGVIIFTIFLPVVIHLISLLQDLWHLKPAMTIAVSHGIFNITNTLIQLPFVAGLAWIVTKLVPGKDIA
DDYKPQHLNKDLVYHAPGVALQETQKELQNVGQIVLSMFEDIREITKDDKKLIKKLEQKHQAVETINDSIRNYLVRISTK
AITKADVERLAVMFDVNRSILKVAELTEEYVAQLKRQHDEDIRITEDAQRGMDKLFNHVAESFDKAIDMLDVYDKTKKDE
IVERSRESFNIEHKLRKGHIKRLNRGECTTKGGLLYIDMIGVLERIGYHSRNVSEALVGLNDDVPTDEEIATTEI
>Mature_555_residues
MEMSVTEVIFSFLGGLGIFLYGLKIMGDGLQASAGDRLRDILNKFTSNPVLGVIAGIVVTILIQSSSGTTVITIGLVTAG
FMTLKQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYAMPILALGAFLIFFFKRSKINNIGRILFGFGSLFFGLEFMGDAVKPLA
SLDGFKQLMLDMSTNPILAVIVGAGLTALVQSSSATIGILQEFYQQDLISLNAAIPVLLGDNIGTTITAILASLAGSIAA
KRAALVHVIFNLIGVIIFTIFLPVVIHLISLLQDLWHLKPAMTIAVSHGIFNITNTLIQLPFVAGLAWIVTKLVPGKDIA
DDYKPQHLNKDLVYHAPGVALQETQKELQNVGQIVLSMFEDIREITKDDKKLIKKLEQKHQAVETINDSIRNYLVRISTK
AITKADVERLAVMFDVNRSILKVAELTEEYVAQLKRQHDEDIRITEDAQRGMDKLFNHVAESFDKAIDMLDVYDKTKKDE
IVERSRESFNIEHKLRKGHIKRLNRGECTTKGGLLYIDMIGVLERIGYHSRNVSEALVGLNDDVPTDEEIATTEI

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI110611906, Length=105, Percent_Identity=40, Blast_Score=66, Evalue=8e-11,
Organism=Homo sapiens, GI295789160, Length=105, Percent_Identity=40, Blast_Score=66, Evalue=8e-11,
Organism=Homo sapiens, GI295789158, Length=105, Percent_Identity=40, Blast_Score=66, Evalue=8e-11,
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=522, Percent_Identity=22.7969348659004, Blast_Score=148, Evalue=1e-36,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60909; Mature: 60909

Theoretical pI: Translated: 6.25; Mature: 6.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEMSVTEVIFSFLGGLGIFLYGLKIMGDGLQASAGDRLRDILNKFTSNPVLGVIAGIVVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ILIQSSSGTTVITIGLVTAGFMTLKQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYAMPILALG
HHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFLIFFFKRSKINNIGRILFGFGSLFFGLEFMGDAVKPLASLDGFKQLMLDMSTNPILAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
IVGAGLTALVQSSSATIGILQEFYQQDLISLNAAIPVLLGDNIGTTITAILASLAGSIAA
HHHCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRAALVHVIFNLIGVIIFTIFLPVVIHLISLLQDLWHLKPAMTIAVSHGIFNITNTLIQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
PFVAGLAWIVTKLVPGKDIADDYKPQHLNKDLVYHAPGVALQETQKELQNVGQIVLSMFE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIREITKDDKKLIKKLEQKHQAVETINDSIRNYLVRISTKAITKADVERLAVMFDVNRSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
LKVAELTEEYVAQLKRQHDEDIRITEDAQRGMDKLFNHVAESFDKAIDMLDVYDKTKKDE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IVERSRESFNIEHKLRKGHIKRLNRGECTTKGGLLYIDMIGVLERIGYHSRNVSEALVGL
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCC
NDDVPTDEEIATTEI
CCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MEMSVTEVIFSFLGGLGIFLYGLKIMGDGLQASAGDRLRDILNKFTSNPVLGVIAGIVVT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
ILIQSSSGTTVITIGLVTAGFMTLKQAIGVIMGANIGTTVTAFIIGIDLGEYAMPILALG
HHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFLIFFFKRSKINNIGRILFGFGSLFFGLEFMGDAVKPLASLDGFKQLMLDMSTNPILAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
IVGAGLTALVQSSSATIGILQEFYQQDLISLNAAIPVLLGDNIGTTITAILASLAGSIAA
HHHCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRAALVHVIFNLIGVIIFTIFLPVVIHLISLLQDLWHLKPAMTIAVSHGIFNITNTLIQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
PFVAGLAWIVTKLVPGKDIADDYKPQHLNKDLVYHAPGVALQETQKELQNVGQIVLSMFE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DIREITKDDKKLIKKLEQKHQAVETINDSIRNYLVRISTKAITKADVERLAVMFDVNRSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
LKVAELTEEYVAQLKRQHDEDIRITEDAQRGMDKLFNHVAESFDKAIDMLDVYDKTKKDE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IVERSRESFNIEHKLRKGHIKRLNRGECTTKGGLLYIDMIGVLERIGYHSRNVSEALVGL
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCC
NDDVPTDEEIATTEI
CCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]