| Definition | Petrotoga mobilis SJ95 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010003 |
| Length | 2,169,548 |
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The map label for this gene is 160903365
Identifier: 160903365
GI number: 160903365
Start: 2141912
End: 2147647
Strand: Direct
Name: 160903365
Synonym: Pmob_1936
Alternate gene names: NA
Gene position: 2141912-2147647 (Clockwise)
Preceding gene: 160903364
Following gene: 160903366
Centisome position: 98.73
GC content: 38.2
Gene sequence:
>5736_bases ATGTTCAAGATTATTATAAAGCTTATTGGAATCAGATGGCCTATTTTTATTACACTAATTTTATCTATCCATAAAAGAAA TAAAAGGCTCAAAGCATTGGATAAGCTTGTGTGGAAAAAATCATCTTTGCTTAAGCCGGAAGAAATGTTGAAAGAGCGTC CATTTGATCCATACTATTATCAAAGAGAAGAAGACAAAATGATTAGTGAAAGTTTGAATATTAAGGAAAATATACTCATA AAGGGACCTCCATTAAGTGGTAAAACTAGAGCAGCCTATCAAGCTCTGATTAATTTAAAGGCTCCATATAGTGTAATAAT CGCAGGATGCAATGGCATAGACAAGGAGATCTCACTCCCCCACTCTCTAGCGTTTTGGAGACCAAAAATTCTGTTTATTG ATGATTTGCATAGATTTGTAGATCAAGAAAATTTTGAGCATTTTTTTAGAATCTCAAAAAAGAACAATGTGTTTATTATT GCTACTTGTCGCTCAGGATTAGAAGAAAAAAAAGTAAAACAGAAGATGCTAAGTAAGAATATAAATTCAGAAACTATATT CGAGAGGGAGATAGAGCTTAACAAAATACCAACGGCGGAAGGGAAAAAGATTGCCTCTGAAGTTAATAAAAAGTGGGAGG AAATTAAATTTGATGGAACTATAGGATCTATTTTCATGCCTTTGGATAAGTTGGAAAAAAGATTTGAAACTTTTGAATCA GTTGAGAAGAATATTTTAAAAGCGCTAAAAAAGCTATACATATGTGGATGTTATAAAGGAAACTTGCTCTTTCCTCTAGA ATGGGTGAAAATCGTCTCTAAAAAAGATGGTTTAAAAATAAAAGATTTTGAATGGACTGATCATATCAAGACTCTAGAAG AGAAAGGATTCGTTAAATTAATAAAAGATAATCAAATTTGGGTTGACGAGGCATATTTAGACTATGTAATTAAACTAGAA 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Upstream 100 bases:
>100_bases AAAACTTGATAGGCCTGGTTTATAACCGATCTCATCTAGCTTCATTTTCGTGTATTGAACGTTAAAAGACAGTTTGACTG GCGGTAGGGAGGAAGAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTAGTTTTAACTAAAATTCACATTTAGGGGCTGAAAACTAAAGAATACAATTACAGTTTACAAGGAAGCACAAAATAT ATAAAGATAAGCTTTTTTGG
Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Tetratricopeptide Domain Protein; Tetratricopeptide Repeat Domain Protein; Copper Amine Oxidase-Like Protein; Copper Amine Oxidase Domain Protein; Glycosyl Transferase Family Protein; TPR Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Repeat Family; SLEI Family; Sulfotransferase; Peptidase S1 And S6 Chymotrypsin/Hap; Clp Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 1911; Mature: 1911
Protein sequence:
>1911_residues MFKIIIKLIGIRWPIFITLILSIHKRNKRLKALDKLVWKKSSLLKPEEMLKERPFDPYYYQREEDKMISESLNIKENILI KGPPLSGKTRAAYQALINLKAPYSVIIAGCNGIDKEISLPHSLAFWRPKILFIDDLHRFVDQENFEHFFRISKKNNVFII ATCRSGLEEKKVKQKMLSKNINSETIFEREIELNKIPTAEGKKIASEVNKKWEEIKFDGTIGSIFMPLDKLEKRFETFES VEKNILKALKKLYICGCYKGNLLFPLEWVKIVSKKDGLKIKDFEWTDHIKTLEEKGFVKLIKDNQIWVDEAYLDYVIKLE TTITELNVFEIMVSAFSKVPDVLFKIKNRAQELADIQLEEEKSKYLKVVIKTYKETLKEYTLEHFPEEYAMVQKNLGDTY TKLAKIEATSENGENAIKAYEETLKVYTLERFPIDYAIVQKNLGDAYTKLAGLEKASENCKNSIKSYKKTLKVYTLERFP IDYAIVQKNLGDAYTRLAKTETTSENCKNAVKAYEEALKVYTLERFPEDYEMIQINLVDAYTKLAGVEATKGDWENVIKA YEEALKVRILKRFPEDYAITQKNLVDAYIKLAKIETTSRKWKNAIKTYEGALKVGILEQFPEKYAITQKNLVNAYTRLAK AETTSENCKNAVKACEEALKVEILERFPEEYEMIQINLVDSYTKLAEVEATKGNWENAIKAYEEALKVGILEQFPEKYAI TQKNLVDAYTRLAKIEAISGNSKNAIKAYEEALKVGVLEQFPEEYAITQKNLGDAYARLGWVDATSENCKNAIKAYEEAM KVGSLKGDTGEYAITQKNLVDAYTSLAKIEKASEDWKKAIKAYEDALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTP ENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNL GDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGILKLSSQEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVRIL KRFPEDYAMVQKGLVDAYIKLAKIETSSRNWKNAIKDYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGEAYNNLVKIEKTPENWER EIRAYEEALKVGILERSSEEYAMVQKNLGDAYIKLAGVKATKGNWGAAIKAYEGALRVGIPELSPEEYAITQKNLGDVYF QLAKLQTTSENWKKAIRVYEGVLKDGILERFPEEYAITQKNLVDAFTSLAKIEKASEDWKNAIKAYEDALKVGILERFPE EYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAY EEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNSLAKIEKTSENWENAIEAYEGALKVESLKRSSRWYAKAQKSLVDAYIKLAEV EVTKGNWGNAVKAYEGTLRVEILKLYSEEYTMVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEKYAKV QKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEEYAKVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALK VGILEGSPEEYAMVQKGLVDVYIKLAEVKATKGNWRAAIKAYEGALKVGILELSPEEYAITKKNLGDAYIKLVDVETTSE NCEKAIKAYEEALKVYIPQRYSSDYAMVKKNLGDAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAMVKKNLG DAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAIVQKNLGDAYIKLADVETTSENFENAIKAYEEALKVYTPQ QYQGDYATVKENLGDAYSQLAKLEAASENWKNALKAYKEALKIFKEEKFPWEIIDLIESKISKVQEILYEK
Sequences:
>Translated_1911_residues MFKIIIKLIGIRWPIFITLILSIHKRNKRLKALDKLVWKKSSLLKPEEMLKERPFDPYYYQREEDKMISESLNIKENILI KGPPLSGKTRAAYQALINLKAPYSVIIAGCNGIDKEISLPHSLAFWRPKILFIDDLHRFVDQENFEHFFRISKKNNVFII ATCRSGLEEKKVKQKMLSKNINSETIFEREIELNKIPTAEGKKIASEVNKKWEEIKFDGTIGSIFMPLDKLEKRFETFES VEKNILKALKKLYICGCYKGNLLFPLEWVKIVSKKDGLKIKDFEWTDHIKTLEEKGFVKLIKDNQIWVDEAYLDYVIKLE TTITELNVFEIMVSAFSKVPDVLFKIKNRAQELADIQLEEEKSKYLKVVIKTYKETLKEYTLEHFPEEYAMVQKNLGDTY TKLAKIEATSENGENAIKAYEETLKVYTLERFPIDYAIVQKNLGDAYTKLAGLEKASENCKNSIKSYKKTLKVYTLERFP IDYAIVQKNLGDAYTRLAKTETTSENCKNAVKAYEEALKVYTLERFPEDYEMIQINLVDAYTKLAGVEATKGDWENVIKA YEEALKVRILKRFPEDYAITQKNLVDAYIKLAKIETTSRKWKNAIKTYEGALKVGILEQFPEKYAITQKNLVNAYTRLAK AETTSENCKNAVKACEEALKVEILERFPEEYEMIQINLVDSYTKLAEVEATKGNWENAIKAYEEALKVGILEQFPEKYAI TQKNLVDAYTRLAKIEAISGNSKNAIKAYEEALKVGVLEQFPEEYAITQKNLGDAYARLGWVDATSENCKNAIKAYEEAM KVGSLKGDTGEYAITQKNLVDAYTSLAKIEKASEDWKKAIKAYEDALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTP ENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNL GDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGILKLSSQEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVRIL KRFPEDYAMVQKGLVDAYIKLAKIETSSRNWKNAIKDYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGEAYNNLVKIEKTPENWER EIRAYEEALKVGILERSSEEYAMVQKNLGDAYIKLAGVKATKGNWGAAIKAYEGALRVGIPELSPEEYAITQKNLGDVYF QLAKLQTTSENWKKAIRVYEGVLKDGILERFPEEYAITQKNLVDAFTSLAKIEKASEDWKNAIKAYEDALKVGILERFPE EYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAY EEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNSLAKIEKTSENWENAIEAYEGALKVESLKRSSRWYAKAQKSLVDAYIKLAEV EVTKGNWGNAVKAYEGTLRVEILKLYSEEYTMVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEKYAKV QKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEEYAKVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALK VGILEGSPEEYAMVQKGLVDVYIKLAEVKATKGNWRAAIKAYEGALKVGILELSPEEYAITKKNLGDAYIKLVDVETTSE NCEKAIKAYEEALKVYIPQRYSSDYAMVKKNLGDAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAMVKKNLG DAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAIVQKNLGDAYIKLADVETTSENFENAIKAYEEALKVYTPQ QYQGDYATVKENLGDAYSQLAKLEAASENWKNALKAYKEALKIFKEEKFPWEIIDLIESKISKVQEILYEK >Mature_1911_residues MFKIIIKLIGIRWPIFITLILSIHKRNKRLKALDKLVWKKSSLLKPEEMLKERPFDPYYYQREEDKMISESLNIKENILI KGPPLSGKTRAAYQALINLKAPYSVIIAGCNGIDKEISLPHSLAFWRPKILFIDDLHRFVDQENFEHFFRISKKNNVFII ATCRSGLEEKKVKQKMLSKNINSETIFEREIELNKIPTAEGKKIASEVNKKWEEIKFDGTIGSIFMPLDKLEKRFETFES VEKNILKALKKLYICGCYKGNLLFPLEWVKIVSKKDGLKIKDFEWTDHIKTLEEKGFVKLIKDNQIWVDEAYLDYVIKLE TTITELNVFEIMVSAFSKVPDVLFKIKNRAQELADIQLEEEKSKYLKVVIKTYKETLKEYTLEHFPEEYAMVQKNLGDTY TKLAKIEATSENGENAIKAYEETLKVYTLERFPIDYAIVQKNLGDAYTKLAGLEKASENCKNSIKSYKKTLKVYTLERFP IDYAIVQKNLGDAYTRLAKTETTSENCKNAVKAYEEALKVYTLERFPEDYEMIQINLVDAYTKLAGVEATKGDWENVIKA YEEALKVRILKRFPEDYAITQKNLVDAYIKLAKIETTSRKWKNAIKTYEGALKVGILEQFPEKYAITQKNLVNAYTRLAK AETTSENCKNAVKACEEALKVEILERFPEEYEMIQINLVDSYTKLAEVEATKGNWENAIKAYEEALKVGILEQFPEKYAI TQKNLVDAYTRLAKIEAISGNSKNAIKAYEEALKVGVLEQFPEEYAITQKNLGDAYARLGWVDATSENCKNAIKAYEEAM KVGSLKGDTGEYAITQKNLVDAYTSLAKIEKASEDWKKAIKAYEDALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTP ENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNL GDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGILKLSSQEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAYEEALKVRIL KRFPEDYAMVQKGLVDAYIKLAKIETSSRNWKNAIKDYEEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGEAYNNLVKIEKTPENWER EIRAYEEALKVGILERSSEEYAMVQKNLGDAYIKLAGVKATKGNWGAAIKAYEGALRVGIPELSPEEYAITQKNLGDVYF QLAKLQTTSENWKKAIRVYEGVLKDGILERFPEEYAITQKNLVDAFTSLAKIEKASEDWKNAIKAYEDALKVGILERFPE EYAMVQKNLGDVYNNLVKIEKTPENWEREIKAYEGALKVGSLKLSSLEYAMIQKNLGDAYSQLAKLRTTSRNWENAIKAY EEALKVGILERFPEEYAMVQKNLGDVYNSLAKIEKTSENWENAIEAYEGALKVESLKRSSRWYAKAQKSLVDAYIKLAEV EVTKGNWGNAVKAYEGTLRVEILKLYSEEYTMVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEKYAKV QKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALKVGILEGSPEEYAKVQKGLVDVYIKLAEVEVTKGNWGNAVKAYEGALK VGILEGSPEEYAMVQKGLVDVYIKLAEVKATKGNWRAAIKAYEGALKVGILELSPEEYAITKKNLGDAYIKLVDVETTSE NCEKAIKAYEEALKVYIPQRYSSDYAMVKKNLGDAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAMVKKNLG DAYSQLAKLQMTSGNWWNAIKAYEEALKVYIPQRDSRDYAIVQKNLGDAYIKLADVETTSENFENAIKAYEEALKVYTPQ QYQGDYATVKENLGDAYSQLAKLEAASENWKNALKAYKEALKIFKEEKFPWEIIDLIESKISKVQEILYEK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI32307148, Length=621, Percent_Identity=22.7053140096618, Blast_Score=91, Evalue=1e-17, Organism=Homo sapiens, GI32307150, Length=621, Percent_Identity=22.5442834138486, Blast_Score=91, Evalue=1e-17, Organism=Caenorhabditis elegans, GI115532692, Length=525, Percent_Identity=22.0952380952381, Blast_Score=74, Evalue=6e-13, Organism=Caenorhabditis elegans, GI115532690, Length=525, Percent_Identity=21.9047619047619, Blast_Score=73, Evalue=2e-12, Organism=Drosophila melanogaster, GI17647755, Length=520, Percent_Identity=22.8846153846154, Blast_Score=83, Evalue=2e-15, Organism=Drosophila melanogaster, GI24585827, Length=520, Percent_Identity=22.8846153846154, Blast_Score=83, Evalue=2e-15, Organism=Drosophila melanogaster, GI24585829, Length=520, Percent_Identity=22.8846153846154, Blast_Score=83, Evalue=2e-15,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 218467; Mature: 218467
Theoretical pI: Translated: 7.75; Mature: 7.75
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFKIIIKLIGIRWPIFITLILSIHKRNKRLKALDKLVWKKSSLLKPEEMLKERPFDPYYY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCC QREEDKMISESLNIKENILIKGPPLSGKTRAAYQALINLKAPYSVIIAGCNGIDKEISLP CCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCC HSLAFWRPKILFIDDLHRFVDQENFEHFFRISKKNNVFIIATCRSGLEEKKVKQKMLSKN CHHHHHCCCEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCC INSETIFEREIELNKIPTAEGKKIASEVNKKWEEIKFDGTIGSIFMPLDKLEKRFETFES CCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH VEKNILKALKKLYICGCYKGNLLFPLEWVKIVSKKDGLKIKDFEWTDHIKTLEEKGFVKL HHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEECHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEE IKDNQIWVDEAYLDYVIKLETTITELNVFEIMVSAFSKVPDVLFKIKNRAQELADIQLEE EECCCEEEEHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH EKSKYLKVVIKTYKETLKEYTLEHFPEEYAMVQKNLGDTYTKLAKIEATSENGENAIKAY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHH EETLKVYTLERFPIDYAIVQKNLGDAYTKLAGLEKASENCKNSIKSYKKTLKVYTLERFP 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