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The map label for this gene is 160876760

Identifier: 160876760

GI number: 160876760

Start: 4310658

End: 4312127

Strand: Reverse

Name: 160876760

Synonym: Sbal195_3654

Alternate gene names: NA

Gene position: 4312127-4310658 (Counterclockwise)

Preceding gene: 160876761

Following gene: 160876759

Centisome position: 80.64

GC content: 50.2

Gene sequence:

>1470_bases
ATGAAATTACAGCGGTTGTTTAAAGGCAGTGGAATGGCGTTGTGGAGTCTATTCTGCGTTGCAATATTGAGCGGATTCTC
ACCTGCAGCATGGGCTATGACAGAAGGGGCAGATCGGCTTAATTTAACCGCCGCGAGCGTGGGTTATGTCGCCGTCTGTG
TGTTTGTGCTGGCTTATGTACTTGTGATGGCTGAGGAGACATTACACTTACGCAAGTCGAAACCTGTGCTCGTTGCGGCA
GGGATCATCTGGGGCATGATAGGTTTTGTCTATATGCAAAACGGCATGTCCGAAGTGTCGGAAGCGGCATTCAAGCAAAA
CTTGCTCGAATACGCCGAGCTATTGCTCTTCTTACTGGTGGCGATGACCTATATCAATGCCATGGAAGAACGTAATCTGT
TCGATGCGATCCGCGGCTGGCTAGTGGGCCGTGGTTTTAGCCTGCGAACTGTGTTTTGGTTAACGGGCTTTATGGCGTTT
TTCATCTCGCCAGTAGCCGATAACTTAACCACTGCTTTACTGATGTGCGCTGTGGTGATGAAGGTTGGGGCAGGGCAACG
CAAGTTTATTACCCTTGCCTGTATCAACATTGTCGTAGCCGCCAACGCGGGTGGTGCATTCAGTCCCTTTGGTGACATCA
CGACCTTAATGGTATGGCAAAAGGGCCTAGTGCACTTTGGCGATTTCTTTAATCTGTTCATTCCCGCCCTCGTTAACTTT
GCCTTACCCGCCGCCATTATGAGTGTGTTCATCCCGCATTTTGTGCCCGAGCCTGAAAAAGAGCATGTGTACACTAAGCC
CGGTGCTAAACGTATTGTAGGGCTGTTTTTACTTACCATTGCTACGGCAGTGTGTGCCCATTCCTTCTTAGGTATGCCGC
CAGTACTGGGCATGATGACGGGATTAGGCTTCCTGCAATTCTTTGGTTTTTACCTGCGCAAAACCTTCAATCGTTCCGTT
GCCCGCGAACGTGAAAAGGCGGAATTAAGACAAGACAAATTACGCCTGCAGCAACTTGGCAGTGTGGTGCCATTTGATGT
GTTCAGCCGCATTTCCCGCGCCGAGTGGGATACTTTGTTGTTCTTTTATGGCGTGGTGTTATGCGTCGGCGGCCTAGGTT
TTATGGGATATTTGAGCTTAGTGTCTGAGGCCATGTACTCGCACTGGGATGTCACCTATGCCAACGTTGCCGTGGGTTTA
CTCTCGTCAGTGATTGATAATATTCCTGTGATGTTTGCGGTATTGACCATGAATCCCGATATGGCATTGGGACAGTGGTT
ATTAGTTACCCTGACAGCGGGTGTGGGCGGCAGTTTGCTCTCGATTGGCAGTGCGGCAGGGGTTGCTCTAATGGGGCAAG
CGCGCGGCATTTACACCTTTGGGGCACATCTGCGGTGGACACCTGTGATTGCCTTCGGTTATGTGGCGAGCATTTTAGTG
CACATGTGGTTAAACGCCGCGATGTTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTATAGGGTAATGCATAGAAAGTTGCGTTTTATCAACATTTGCTATGCCGAAGCTATGGTAATTTTCGACTAATTTC
CTACGTAGAGATGAACTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTGCGTTAGCTTGATTATCGTTTATCGAGACAGGCTTGCGGCTTGTCTCACGAAAATTAACTATTTGCTGGCTTGGGT
TAGCAAGATCACATTAATCA

Product: citrate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 489

Protein sequence:

>489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVCAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIAFGYVASILV
HMWLNAAMF

Sequences:

>Translated_489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVCAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIAFGYVASILV
HMWLNAAMF
>Mature_489_residues
MKLQRLFKGSGMALWSLFCVAILSGFSPAAWAMTEGADRLNLTAASVGYVAVCVFVLAYVLVMAEETLHLRKSKPVLVAA
GIIWGMIGFVYMQNGMSEVSEAAFKQNLLEYAELLLFLLVAMTYINAMEERNLFDAIRGWLVGRGFSLRTVFWLTGFMAF
FISPVADNLTTALLMCAVVMKVGAGQRKFITLACINIVVAANAGGAFSPFGDITTLMVWQKGLVHFGDFFNLFIPALVNF
ALPAAIMSVFIPHFVPEPEKEHVYTKPGAKRIVGLFLLTIATAVCAHSFLGMPPVLGMMTGLGFLQFFGFYLRKTFNRSV
AREREKAELRQDKLRLQQLGSVVPFDVFSRISRAEWDTLLFFYGVVLCVGGLGFMGYLSLVSEAMYSHWDVTYANVAVGL
LSSVIDNIPVMFAVLTMNPDMALGQWLLVTLTAGVGGSLLSIGSAAGVALMGQARGIYTFGAHLRWTPVIAFGYVASILV
HMWLNAAMF

Specific function: Unknown

COG id: COG1055

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CitM (TC 2.A.11) transporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000802
- InterPro:   IPR004680 [H]

Pfam domain/function: PF03600 CitMHS [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53519; Mature: 53519

Theoretical pI: Translated: 8.74; Mature: 8.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
5.1 %Met     (Translated Protein)
6.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
5.1 %Met     (Mature Protein)
6.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]