| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876131
Identifier: 160876131
GI number: 160876131
Start: 3591770
End: 3593026
Strand: Reverse
Name: 160876131
Synonym: Sbal195_3022
Alternate gene names: NA
Gene position: 3593026-3591770 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160876132
Following gene: 160876130
Centisome position: 67.19
GC content: 29.51
Gene sequence:
>1257_bases ATGAAAACACTGTATTTTATTGTTATTGTCTTCTTATATATTTTTTCTTTTTATGTTCCTTTAGCTGGTAATTCTATTTA CATTGCATTTTTATTATCTGTGCCTCTTTATAATAAGAGAACTTCATTTTATTTTTTAAAGTTTACGCGAGCGAGTTTTT TCTTGTCAGCAATGATTTTATTGCTGATGGTTTTTTCTTACTATGCTGTAGCTACAGTTGCTGTAGGTGTAAATGATTTT TCATTGCTAAAAATATACGCAGGCATCTTAGTCTATGGTGGAATAGGGGCTTTTATTGCATTAGTTATATTTTCTAACAC AGAAGATGAATTTATTATTCACAAACTATTGTATTTTTGTTTGCTCATCCAAGCTTTTATTATTTTACTTTCATTTGCAA ACTCTTCAATAAAAGAATTTTTTGATATATTTCGCACTGAAAATAGTATTGAAGTGGCTAATAGATATTATGGTGGGGGT ATTCGAGGGCTAGCTCTTTCCGGTAGTCAGTTCTTTGGATTATCAGTTCTCTTGTCATCAATGACTTATTTTTGCTGTGT TTTAGAGTTTCAGCTAAAAAATCGAACATGGTTTTATGTAACCATATTATTTTGTTCTATTGTTTTTCTTTCTGTTGGTC GCACTGCCATTTTTGGCTTGATATTTGGCTTTTTATTTTTGGTACTCAATTTTACTAAAAATTATGCGTTTTTTTTAAAG TTTTTAGTTTCATGTGCGTCAATTGTTGCAGTGTTAATTATGTTGTATCCTATTATAGATCCTGCAATTGCTAGTAAATT AAACAATTTTATTGCTTTTGCTTTTGAGGCAGTAATTAATTATATGGAATATGGTAAATTTCACACAAGTTCCACAGATG TTTTATCGAACATGTATTACTCATTGCCAATAGATACATTAATACATGGTGATGTTCAATATACAAATTCAGATGGTTTA TATTATGGGGATACAGATGCTGGTTATATGAGGCATGTACTAGCTTTGGGTTTGCCTATGACATGTATTTTAATGTTTTC TTTTTATATCATTTCGAGTTATACTAGATTTTTATTTGATGTGAATAATAGGAAAGTAGCATTTGGACTTTTTTTTGTAA TGTTGATTATATTACATTACAAAGGAGAGGTTTTTTGGACGCTACTAAGTGAAACTGGATTGGTTATATTTCTTTCTGTA TATGGATATGCATTTAGAATGGCCGGTTTGAAATCTAATTCATGTACTATGAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTATCTTTCCAGATGAAAAAAATAAAACATAAGCTTGGGTTTTAACCGAACGCTTAATTTTTTAATTAAGAATAATCAG CATTAATTAAGAAAGGTTAC
Downstream 100 bases:
>100_bases CACTTTTATATTGGGAGTGTTTTTATGTTAACCATTGCAATATCTACCTTTAATAAAAGGATTGATTTTTTAAATGATTA TTGTTTTGATGATAGAGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 418; Mature: 418
Protein sequence:
>418_residues MKTLYFIVIVFLYIFSFYVPLAGNSIYIAFLLSVPLYNKRTSFYFLKFTRASFFLSAMILLLMVFSYYAVATVAVGVNDF SLLKIYAGILVYGGIGAFIALVIFSNTEDEFIIHKLLYFCLLIQAFIILLSFANSSIKEFFDIFRTENSIEVANRYYGGG IRGLALSGSQFFGLSVLLSSMTYFCCVLEFQLKNRTWFYVTILFCSIVFLSVGRTAIFGLIFGFLFLVLNFTKNYAFFLK FLVSCASIVAVLIMLYPIIDPAIASKLNNFIAFAFEAVINYMEYGKFHTSSTDVLSNMYYSLPIDTLIHGDVQYTNSDGL YYGDTDAGYMRHVLALGLPMTCILMFSFYIISSYTRFLFDVNNRKVAFGLFFVMLIILHYKGEVFWTLLSETGLVIFLSV YGYAFRMAGLKSNSCTMK
Sequences:
>Translated_418_residues MKTLYFIVIVFLYIFSFYVPLAGNSIYIAFLLSVPLYNKRTSFYFLKFTRASFFLSAMILLLMVFSYYAVATVAVGVNDF SLLKIYAGILVYGGIGAFIALVIFSNTEDEFIIHKLLYFCLLIQAFIILLSFANSSIKEFFDIFRTENSIEVANRYYGGG IRGLALSGSQFFGLSVLLSSMTYFCCVLEFQLKNRTWFYVTILFCSIVFLSVGRTAIFGLIFGFLFLVLNFTKNYAFFLK FLVSCASIVAVLIMLYPIIDPAIASKLNNFIAFAFEAVINYMEYGKFHTSSTDVLSNMYYSLPIDTLIHGDVQYTNSDGL YYGDTDAGYMRHVLALGLPMTCILMFSFYIISSYTRFLFDVNNRKVAFGLFFVMLIILHYKGEVFWTLLSETGLVIFLSV YGYAFRMAGLKSNSCTMK >Mature_418_residues MKTLYFIVIVFLYIFSFYVPLAGNSIYIAFLLSVPLYNKRTSFYFLKFTRASFFLSAMILLLMVFSYYAVATVAVGVNDF SLLKIYAGILVYGGIGAFIALVIFSNTEDEFIIHKLLYFCLLIQAFIILLSFANSSIKEFFDIFRTENSIEVANRYYGGG IRGLALSGSQFFGLSVLLSSMTYFCCVLEFQLKNRTWFYVTILFCSIVFLSVGRTAIFGLIFGFLFLVLNFTKNYAFFLK FLVSCASIVAVLIMLYPIIDPAIASKLNNFIAFAFEAVINYMEYGKFHTSSTDVLSNMYYSLPIDTLIHGDVQYTNSDGL YYGDTDAGYMRHVLALGLPMTCILMFSFYIISSYTRFLFDVNNRKVAFGLFFVMLIILHYKGEVFWTLLSETGLVIFLSV YGYAFRMAGLKSNSCTMK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47573; Mature: 47573
Theoretical pI: Translated: 8.54; Mature: 8.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTLYFIVIVFLYIFSFYVPLAGNSIYIAFLLSVPLYNKRTSFYFLKFTRASFFLSAMIL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH LLMVFSYYAVATVAVGVNDFSLLKIYAGILVYGGIGAFIALVIFSNTEDEFIIHKLLYFC HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LLIQAFIILLSFANSSIKEFFDIFRTENSIEVANRYYGGGIRGLALSGSQFFGLSVLLSS HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH MTYFCCVLEFQLKNRTWFYVTILFCSIVFLSVGRTAIFGLIFGFLFLVLNFTKNYAFFLK HHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLVSCASIVAVLIMLYPIIDPAIASKLNNFIAFAFEAVINYMEYGKFHTSSTDVLSNMYY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH SLPIDTLIHGDVQYTNSDGLYYGDTDAGYMRHVLALGLPMTCILMFSFYIISSYTRFLFD HCCHHHHEECCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE VNNRKVAFGLFFVMLIILHYKGEVFWTLLSETGLVIFLSVYGYAFRMAGLKSNSCTMK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKTLYFIVIVFLYIFSFYVPLAGNSIYIAFLLSVPLYNKRTSFYFLKFTRASFFLSAMIL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH LLMVFSYYAVATVAVGVNDFSLLKIYAGILVYGGIGAFIALVIFSNTEDEFIIHKLLYFC HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LLIQAFIILLSFANSSIKEFFDIFRTENSIEVANRYYGGGIRGLALSGSQFFGLSVLLSS HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH MTYFCCVLEFQLKNRTWFYVTILFCSIVFLSVGRTAIFGLIFGFLFLVLNFTKNYAFFLK HHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLVSCASIVAVLIMLYPIIDPAIASKLNNFIAFAFEAVINYMEYGKFHTSSTDVLSNMYY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH SLPIDTLIHGDVQYTNSDGLYYGDTDAGYMRHVLALGLPMTCILMFSFYIISSYTRFLFD HCCHHHHEECCEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE VNNRKVAFGLFFVMLIILHYKGEVFWTLLSETGLVIFLSVYGYAFRMAGLKSNSCTMK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA