| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160875383
Identifier: 160875383
GI number: 160875383
Start: 2691311
End: 2695354
Strand: Direct
Name: 160875383
Synonym: Sbal195_2271
Alternate gene names: NA
Gene position: 2691311-2695354 (Clockwise)
Preceding gene: 160875382
Following gene: 160875384
Centisome position: 50.33
GC content: 45.7
Gene sequence:
>4044_bases ATGGCCTTAGATATCAGTGCATTTAGTCATGCGGCTAAGCTTGACGGCCGTCTTTCCTTAGTCGATACCCCCGAGGGTAT ACCGACGATTATAGTTGCCAAAGAAGGCTTTAAAGAAAAATTACTTAGCATGCTGAGCCATATTCCTTTACTCAAAAATA CCCAAGCGGTCCAAGATTATGTCAATGGCTTGTCACTCGATAATAAGCAAGTGTTGGGTGTGTTCTTGCAGACATTGGCG GTAAGATTTGGTCATGATATTGCACTGGATATGGTAGATGCTGTCGATTTGTCCGGACATACTCCATTAACTCTGCGCAC GATCGAGCAACTCACCGAGCGGTGTGAAGCATTTATGCCGCTCCCTCCTTTAAACATATGCGAGACTAATGAAGATACGC TCAAAGTTCTTGCTTTACCTTCCCAGAGCGGGATTGAGTCTAAATCGTCGGAGAAGCAAACACTCAGCCCATCAGTGCTT AAACCTTCAGCAGAACCTATATCCGTCGATAAAGACATCAGGGGAACGGCTTTTCATATTTTAAGCCAGCAGCTTATTAC GCCACAGGATATTTTACACACACAGAATCAATGCCTTAAGCAGTTGTTAACTACACCAGTACCTCAAAAATTAACTATGC CGACCACTCAAACTTGGCTGGCGTCTTGGGTGTATTCAGAACCTGAACCCATTAAAACCTTACAACAAGCTATTAAAAAT TATAATCAAGTACTTAGCGACACTCAGCTAGCGACATGTATACAGAACTTAAATCAGAGTCGAGATCCCTTGATTAGCAG CGATGAACTGACTGCAATACGTGATCATGTCAAATTTGGACTAGTGCAAATTAAGCAGGCTTTAACCCTAGTCGCTGAAT TGAAAGCTAATTTGTCGGTGGAGCAGAGCAGTGTTCTGTCGCCGCTACTGGCCGAAGTCAATCTGGGATTATCGCAATAT GATGTGTTAACTACGGCAATGCAGACATTTGAGCAAGCCTTATTAGCATCGACCCCGATGCGCCTAGCCTTATCTGAGTT TCATGCCAAGCTTCCCTATTCACTACAAAACAAACTGACAGCGGATACTTTAGTGAGTAGTTATCAACTGTTTTCCCCTT TAATGCAAAATGAACTCAGTCAGACAGAGAGAGTTGAATATATAGCGGCAAGCTTAGTTTCTATGCTCAATGAGGAGAAC ATCAGCGAAGTCTCAGGGCAAAAAAAAATAATTCCAGAGATCAAAAGCTTAGTATTACTTATTAACCAGTTTGTGCTAAA TCCCATACAAGAACCTCTAGCCATGAGTTCGTCATTTAAGACTCCATTTGAAGCGCAACAGGCCGAAGCCGAGCAACATC TAATCCAGCTAGAACAAGCACAAACCTTACTGGCCGACTGCCTTACTCGGGCCAGTAATCTTAGCGAACAAGCGCTAATC GCTGTCGGCAAGCAAGTGAAAATCGAAGATCATTTAGCTGCAGTGAAACAGGCTGGAACCCAACTCAGTACTATATTGTA TAAGGCTATCAACCCTTCTGGGGAAGAGGTTCATTTCGAAGATCTCACCGCAACATTACTGTATCTTGGCGGACAAGAAT ATGTCGAGAAAGGCAGTCGTTTACAGTTCGATGAGCCTGTTAACTTTGATGATCTCGACCTTGAGCAGACACTAATAAAT GAGCTCGATAGCTATACTTTACCTCCTCAAGTGGCAAGTTTAGCGCAGCAAGTTCTACAAACTCAGCATCATCTTAATTG GTTCGAGGGAGTGAGCTCCATCAGCTTTAGCCCAAATAATTCGCAAGATATTTCGTTGTTTGATGATGTTAACAACCTGC AACTAGTCTCACAGATTGAGCAAGATCAAGCTCGTTATCACAGTTTTCTGACCGAACGTCTTGCCTTGTGTAATGATTAT CACCGAGCCGTGACCGAGTTGCTGTCGGCTGTTCCCTCTGAGACGGTGCGCAATCAGCTAACCCAAGAGCTAGTGCAAAT TAGTGCGGATCAAGATGCGACCCGAACTTTAGTTGAGCGACTCAATCGACTGCAGAGTGCACAAGATGTGCTAGTGATAG CGGGAAATAATGTCGCTAAATTGTCGGCGTTAACCCAGCAACTCGCGCAAGTTAGGAGGGAAACAAATGCTGAACGTGCC GAGGTCAATTTAAGTTATTTTCTTAGCCATCTTCCTGAATTACAAACTAATAATGAAAAAGTGCGCGCCTTAACTCAAGA GCAGCATCTTTTATCGGCTAAACTGGAAAAATTGACCGCACATTTACAGCAGTTATATGGTGAAGGGCTAGTACTCACTT TAGCCGAACCTGAGGCAAGTTCCCCTGAACTGCGAGCTTTTCACACTGTGACTCGCCAGTTAGCCGAAGTTAATCGCTCT ATTGAAGATCTCGATGATGCCTACCAACATGGTTTGTTACAGCTGAAAAAGGCCACAATTGCAGCAAAAAATAATGGCGG CTATCCAGATCAGGGGGGGATGGCGAGTGGGCATGCATGGCAAAGTTGGTTAGTGCAAAAGTTTGTCGGCAATTGGTCTT CCCAATATCGTCCAAGTTTAGAAGAACTTATTTTATCTAGACAGCTGGCCAAAAATAACATGAGCAGTGTCGCGGAGGCT TATCTCGCTTTAGCATCAAGTGTTAAAGACTCGAAAGCTAGCGTAGCAAATGTGTCAGCTTTAACCTCGCCTCAAAACAT GATGGCTGCACTGGGCGACCTGCATAATTGGTCAATGGCACATCCGATCGAGGCACGTGAGCTCGCAGGTAATTTAACTC AAGCCTACAATATTATTTTGGCCAACCCAGGGACCTTTGGAATGGAACTGGTTAACACTGTCACCACAGTGTGGCAAACC GGGACGGTACAAAACCAAGTGCACGATATTCTGCAAGGTAAGAGAGAAGAGCTGCCGGATAAAACGAATTTCGCTATGAC ACCGCAAATGATTGCGTTATTACACATGGCACAGTTAGCACCGTATATTGCGGGTGGGGCGAAAGGGGCTGCTAATACAG GTATAGGTGGGCCTTTAGTAAGCGGTGTATTTGGGATGATGTTTCCTGGCGCAGGGATGGCAACACCTGTCGTCGGCTTA GTTGGCGGCGTCCTGCAAACTTGGTCAGAACGTCAGCTTGCCAATAACATGCGTGCGTATCGTAGCAGTGAAGTTATGGT GAATGCTTTAATTAAAGGCATGCAGGCAGAAGGCGGGCTTAGTGCTCGTGGTGAGGCCATCGCTGGCTATATGCTACAGC GGCAGGCCCTGCAAGATGTTGGTACAGTCTCCCGTGATTGTTTTGAAGTCGGTAAAGTCGGTGCAGTTAAGCGTGCACTC ACAGATATCGTTAATTGGTGGAAACATGCTTCAACGGGAGCCAAAGTCTTTGCTGTGGTGACGACACTTGTGGTTGCCTC TGTGGTATCGGCGGGAGCGATCGCGGCGGCATTGTTTACCTTAGGGACTGGTGGCGTCGGAATAGTGGCAGCTGTGGGGC TTGGATTGGGAGGATTAATGGCTGGCGCCTATTTTTCTAAGGCTGTGGTGTCGACATTGCAAGGGGCTAATTTTTTAGGC ATGGCCGATACTGCCCGCGCGGCCGAGGCTGAAATGACAGAAAAACGAATCGAGCAAGCGTTCGCGCAATTGGCTCATAC TTCCGTATCTCAAACTTCAATAATTAAGACAATTGCTCACAGCGTATCAGGCACCCCAGAAATCCCCAAATCGATGGCGG ATGTATTGGGGCTTGAACAACACCAAGCCGCGCTAAAAGCACATTTACTGCCGCAATTAGTCGGCCTCGATAGTGATGCG CAGCAGGCGATCTTTGTTCAGAGCATGCAACAATATGCTAATGATAAAAGTCACGAAATAGAAATTAATCAAGCAATAGA CAGGGAGACAACAGTCGAGCGGGCTATGAAATGGGTTGCTGAACTTGACATAGTACCAGCACAATTACAGCAATGTATGG AAGAAATCGATGCGGCCTTATTGATGGAGAACTCTTCTCGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTCGACACGTATCAAGCTCTGCAGAGCCATGTTGAAACCGAAATGACTGGGACAACCTCATCAATAAATACCATAAATCT TAGTGCGGGGGGACAATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCATAGTGGTTGAATCGCTGTTGACTTAGTACTTGCGGGTATTCAGGTGTTCACCTGATACCCGCTTTTTATTGTCTGG TAGATGATAAGACCGAGAGT
Product: SicP-binding domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1347; Mature: 1346
Protein sequence:
>1347_residues MALDISAFSHAAKLDGRLSLVDTPEGIPTIIVAKEGFKEKLLSMLSHIPLLKNTQAVQDYVNGLSLDNKQVLGVFLQTLA VRFGHDIALDMVDAVDLSGHTPLTLRTIEQLTERCEAFMPLPPLNICETNEDTLKVLALPSQSGIESKSSEKQTLSPSVL KPSAEPISVDKDIRGTAFHILSQQLITPQDILHTQNQCLKQLLTTPVPQKLTMPTTQTWLASWVYSEPEPIKTLQQAIKN YNQVLSDTQLATCIQNLNQSRDPLISSDELTAIRDHVKFGLVQIKQALTLVAELKANLSVEQSSVLSPLLAEVNLGLSQY DVLTTAMQTFEQALLASTPMRLALSEFHAKLPYSLQNKLTADTLVSSYQLFSPLMQNELSQTERVEYIAASLVSMLNEEN ISEVSGQKKIIPEIKSLVLLINQFVLNPIQEPLAMSSSFKTPFEAQQAEAEQHLIQLEQAQTLLADCLTRASNLSEQALI AVGKQVKIEDHLAAVKQAGTQLSTILYKAINPSGEEVHFEDLTATLLYLGGQEYVEKGSRLQFDEPVNFDDLDLEQTLIN ELDSYTLPPQVASLAQQVLQTQHHLNWFEGVSSISFSPNNSQDISLFDDVNNLQLVSQIEQDQARYHSFLTERLALCNDY HRAVTELLSAVPSETVRNQLTQELVQISADQDATRTLVERLNRLQSAQDVLVIAGNNVAKLSALTQQLAQVRRETNAERA EVNLSYFLSHLPELQTNNEKVRALTQEQHLLSAKLEKLTAHLQQLYGEGLVLTLAEPEASSPELRAFHTVTRQLAEVNRS IEDLDDAYQHGLLQLKKATIAAKNNGGYPDQGGMASGHAWQSWLVQKFVGNWSSQYRPSLEELILSRQLAKNNMSSVAEA YLALASSVKDSKASVANVSALTSPQNMMAALGDLHNWSMAHPIEARELAGNLTQAYNIILANPGTFGMELVNTVTTVWQT GTVQNQVHDILQGKREELPDKTNFAMTPQMIALLHMAQLAPYIAGGAKGAANTGIGGPLVSGVFGMMFPGAGMATPVVGL VGGVLQTWSERQLANNMRAYRSSEVMVNALIKGMQAEGGLSARGEAIAGYMLQRQALQDVGTVSRDCFEVGKVGAVKRAL TDIVNWWKHASTGAKVFAVVTTLVVASVVSAGAIAAALFTLGTGGVGIVAAVGLGLGGLMAGAYFSKAVVSTLQGANFLG MADTARAAEAEMTEKRIEQAFAQLAHTSVSQTSIIKTIAHSVSGTPEIPKSMADVLGLEQHQAALKAHLLPQLVGLDSDA QQAIFVQSMQQYANDKSHEIEINQAIDRETTVERAMKWVAELDIVPAQLQQCMEEIDAALLMENSSR
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146757; Mature: 146626
Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MALDISAFSHAAKLDGRLSLVDTPEGIPTIIVAKEGFKEKLLSMLSHIPLLKNTQAVQDY CCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH VNGLSLDNKQVLGVFLQTLAVRFGHDIALDMVDAVDLSGHTPLTLRTIEQLTERCEAFMP HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC LPPLNICETNEDTLKVLALPSQSGIESKSSEKQTLSPSVLKPSAEPISVDKDIRGTAFHI CCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH LSQQLITPQDILHTQNQCLKQLLTTPVPQKLTMPTTQTWLASWVYSEPEPIKTLQQAIKN HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH YNQVLSDTQLATCIQNLNQSRDPLISSDELTAIRDHVKFGLVQIKQALTLVAELKANLSV HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC EQSSVLSPLLAEVNLGLSQYDVLTTAMQTFEQALLASTPMRLALSEFHAKLPYSLQNKLT HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ADTLVSSYQLFSPLMQNELSQTERVEYIAASLVSMLNEENISEVSGQKKIIPEIKSLVLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH INQFVLNPIQEPLAMSSSFKTPFEAQQAEAEQHLIQLEQAQTLLADCLTRASNLSEQALI 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PDB accession: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA