| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160875262
Identifier: 160875262
GI number: 160875262
Start: 2552329
End: 2556255
Strand: Direct
Name: 160875262
Synonym: Sbal195_2149
Alternate gene names: NA
Gene position: 2552329-2556255 (Clockwise)
Preceding gene: 160875261
Following gene: 160875263
Centisome position: 47.73
GC content: 51.34
Gene sequence:
>3927_bases ATGGCTGATAAAACCTTAGAACTCGCCCTGCGGATCGTGGCAGAAGCCACGGGCAAGCAACACATTGCGGCTTTAGTCGA TGAGCTTAAGCGCATCGGCACTGAGTCGGATGCGGCGAATCCTAAGACGCAGGCGCTCGCTGATGAACTCGATGGCGTGA GTGATGCCAGCCAAGCGGGTGCGAATCAAGTTGATGAACTCAAAAATAGCCTTGATCCGTTAAGTGACCAGTTAGACCAA GTGGCCCAAAGCGGCCGCAATACCAGCAACCAAACAGAGCAGCTCACTAATGACCTCAAGCCTTTAGCAACTGGGCTTGA TGACGTAGGCGATAGCAGCCAATCGACCAGCCAAAAAGCCAATACCTTAGCCAATAAGCTCGATGAACTGGCTAACCAGC AAGACCTGATCAACACCTTTAAGCGGTCACGTAATGAGCTTGAACAACAAGAGCTTGCTGTCACTGCTGCTGCCCTAGCA CTGCAGGACTTAAAGCAACGTGCCAGCCAAACGGATGCGCCTTTTGTGCAGCTGGCACGCTCTATTGATGTGGCCGAAAA AGAGCTGGAGCAAATGCAGCGAGAGTTAGCGCAGCAATCATCCAGCCACACTAAGCTACAAAATGCCCTGTCAAAATCGG GCATTGATTACAACAACCTGACCACAGCGCAACGCAAGTTAAGCGCCGAATTTGACGGCACTGGCCGCAATGTCGATAAG TTTGCTAATCAGTTAGATAAGGGCAATGCCAGCGCCCGTGAACATGCCAGTTCCCTACGTGGCGTGATCGGCCAAGTGAC CGCCTTAGCGGGTGCCTATTTGGGCTTTGACCGCGTGGCCCAAGCGGTGAAGGATGTCTTTGCCACGGGCGATCAATTTG AACGTCTTGGCGTGCAAATGAATGCCGTGATGGGCGGTTTTGAATCTGGCAAACAAGCCACCGCTTGGGTAAAGCAATTC GCCATCGATGTGCCACTGCAACTGAACGAAGTCAATCAAGCGTTTGTGAAGGCCAAAGCCTTTGGCCTTGATCCGATGAA CGGCACCATGAAGGCGATTGTGGATCAAGCCTTTAAACTCGGTGGCGGTTTTCAAGAGGTTGAGGGGATCACCTTGGCAC TCGGCCAAGCCTGGGCAAAACAAAAGCTACAGGGCGAAGAGATCCTGCAGTTGATTGAGCGCGGCGTGCCCGTATGGGAC ATGCTGGCTAAGGTCACGGGAAAGAACACCTTAGAGCTGCAAAAGCTCAGTGAGCAAGGCAAGCTTGGCCGCGATGTGAT TCAAGGCTTGATTGATGAAATGGGCCGAGCCGCTAATGGCAGCGCAGCAGCGCAGATGGCGTTGCTCAGTGGCCAAGTAT CAAACCTCAAAGACAACCTTTCATCCTTCTATGATCTCGTGGCTCAGTCCGGTGCACTTGATTGGCTTAAGGGCCAGATC AGTGAGTTGAATCTTGAGTTTGCCGCCATGGCCGCCGATGGCCGTTTAAAGGAATGGGCGCAGCAAGTCAGCGACACGAT CGTGAGCATTGGCTCAGCGGTGCAAGATGGCGCGGCTATGCTGTACCACTTCCGTGATGAAATTGGTTTTGTGGCTAAGG CATTTATAGCGTTAAAAGTCGGTAGCTATTTTAGTGATGTGATCACTGGAGCCAATGCCGCCATCGGCGTGATGCGTCTT TACACTGGCGCGATCATGGGTACCACTGCGGCGAGTGAGGGCGCGGCCTTAGCTGCTGGCAAACTTAAAACCGCCTTGGC AGCAGCGGCTAAAGCGGGTTTGTACTTAGCGCTGATTAGCGAGTTGATCGAGGTTGCTCGGGTATACCAAGAGTTATTGA TTGCTGAAGAAGCACTGGAAAAATCTAAACGGGCTGCGGCCGCAAGCGCCAAACAGTTGGAGTATTCACTTAAGGATCTC AGCGAGCAAACGGGCGTAGCCTTTACCACTATGGCCGAGTTCAACAAGGCGGTAGACGAAGGCAAACTGATTTATGACGA CGCCACTGGTAAGTGGAAGAACGCCGCTAAAGCCATGGAAGAAGTCAAACAGGCTGCGGTTGACGTTGTTGAGCCAATAA AGCTGACGGTTGAAGAAGCGCTGCGCCTGACCTTTACCTTAAGCGAACAGACTAAAACGCTCGATGGCGTTAAAGGTGGT ATGGGCGGTTTCATTCGCCAAATTGACGCCGCCTTAGTGCCGTTAAAGGCGGCGGGGGATCAATACGAAGGCCACGTTAA GTTACTCACAATATTGCGCGCCAAGTTTGAAGAGCAGCAAACCTACCTTGATGCCACTGCTAAGGGCGCAGAGGCATTGG AACAAGCCTATAAGGACTTAGGGCTTACCAGTAGCCATGCCTTAGAGCAGGTGAATACGAAAGCCGAAGCAGCATTTAAT CTGATTAAGAACAACCGTGAACCGATTGAGCAACAAAAGGATGCGTTTTTAGCCTGGGCTAAAGCGGCATTAACGGCCGC CGAAGCGACGGGCGCTGCGGTACCCGAAACCTTGAAAGCGCAAGCCGCCACCCTTGGACTAACCAAGGAACTGAGCGATC TGACTGCAAAGCAATACGGCTATACAGATAGCGTGAAGGAACTTTCACCCGAGCAAGCCAAACTAAGCCGCGCAGTGGCA GAAACTGAAGCCCGTTTGAAGCAATGCCGTGATGTGATGAACAGCTCGACGGTATCGAGTAAAGCCAAAGCAAAAGCTCA GCAAGATCTGATTAGTTTACAGGGCAAGTTGAGTGACCAAACTAAGCAACTGAGTGAGGTCCAGGCACTCGAAGCGGCGA ATTATGAACAGATAAAAAGTAAGTATGCCGCGGTATCTGACGAGATGTTAAGGCTCGAACAAGCCTATAAAGACGGCGGC ATCACGGCGGAAGAATACCTGCGACAAAAAGAGCGCCTGGTCGAAGTGCTCAGAATATTGCAACGCTTAATGGGCGGCTT GGAAGAGGGTGAGCAAGAGACTGACGAACAGGTAAAAAAGACCACTAAAACCTTAATTGAGCAACGCGAAGAACTTGAAC AGTTAGAGGAAACCACTGGCCGCGCCACTGAGTATGTAAACCTATTCGCGGGTGCTTATGCCCACTTAAACAAACAGTTC AATTTTAACGAAGATAGCACCGAAAAACTCAACGCCCGCGTCGATCAGTTGACTAACAGCATCATGAATAATATGCGGGT GAATACCGGCTTTTGGGGTGTGCTGGCGCAGCTTAGTAACCAAGCCTTTATTCGCGAAAAGCAGATCATCAATGAAACCT TACTGACCCGCAAATGGACTGAAGAACTTGAAAGCTCCAGCATTAGCCTCGATCGCGTCAATCAAATTAGCCGCGAGGCA AAGTGGAATATACGCGAGTTAGGCGACGAAGATCTTAAGCCACTGCAAGCGGCCATTGATGCTACCCGCGATCGTATTCT CGGCCTGCGTGACGATATCAACGCGACCTTGGGCAGTCTCAAAGATGAGATGGATCAGCTTAATAATAACCAAGCCGCTA TCGAGAAGCGCCGCTATGAACAGCAACAAGCTGAGCTTAAGGCGCAGCTCGATGCTGCCCGCACGGCCCAGGATAAAGAG TCCATCGCCAGTGCGGCAGAAGCCCTGCAACTCAGTCAGCAAATCTACAGCACTAAGCTGAAACAAATCGAGGCCGAATC GGCAGAACGTAACTCACAGGCGATCGAGCGTGCATCGAGCAGTGCAAGCACCGCGACGAATTCCACTCGCAGTACTACAA GCCAAACCACTTCGCCATCGGTGAGTAATCAGAACACAGGCGGCAGTGTACAAATTTATCGGTTAGAGCTGGCAATGCCG TCGGGTAATGTGATGAAAGCCGATTTGCTTGATGAGTTTAAGCAGCTGTTTTTGCGCGAACTAGAACAGATTAAGGCCAC CTCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGGCATGGCCGTACTCAATTGCCATGCCCTTTAATCCCCATTTAACCGCCGTTTAAACACCGATTATTTAGATACTAACG AGAGCATTAACGAGATAGCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCACCTTAGACACGCTTCAATTACCGCACTTTATTTGGCTTAACCGCTTTGGTTATACGCCCTTTGTGAGTAGCACTGAG TTTGCCCTCGATGGCTCACA
Product: phage tape measure protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1308; Mature: 1307
Protein sequence:
>1308_residues MADKTLELALRIVAEATGKQHIAALVDELKRIGTESDAANPKTQALADELDGVSDASQAGANQVDELKNSLDPLSDQLDQ VAQSGRNTSNQTEQLTNDLKPLATGLDDVGDSSQSTSQKANTLANKLDELANQQDLINTFKRSRNELEQQELAVTAAALA LQDLKQRASQTDAPFVQLARSIDVAEKELEQMQRELAQQSSSHTKLQNALSKSGIDYNNLTTAQRKLSAEFDGTGRNVDK FANQLDKGNASAREHASSLRGVIGQVTALAGAYLGFDRVAQAVKDVFATGDQFERLGVQMNAVMGGFESGKQATAWVKQF AIDVPLQLNEVNQAFVKAKAFGLDPMNGTMKAIVDQAFKLGGGFQEVEGITLALGQAWAKQKLQGEEILQLIERGVPVWD MLAKVTGKNTLELQKLSEQGKLGRDVIQGLIDEMGRAANGSAAAQMALLSGQVSNLKDNLSSFYDLVAQSGALDWLKGQI SELNLEFAAMAADGRLKEWAQQVSDTIVSIGSAVQDGAAMLYHFRDEIGFVAKAFIALKVGSYFSDVITGANAAIGVMRL YTGAIMGTTAASEGAALAAGKLKTALAAAAKAGLYLALISELIEVARVYQELLIAEEALEKSKRAAAASAKQLEYSLKDL SEQTGVAFTTMAEFNKAVDEGKLIYDDATGKWKNAAKAMEEVKQAAVDVVEPIKLTVEEALRLTFTLSEQTKTLDGVKGG MGGFIRQIDAALVPLKAAGDQYEGHVKLLTILRAKFEEQQTYLDATAKGAEALEQAYKDLGLTSSHALEQVNTKAEAAFN LIKNNREPIEQQKDAFLAWAKAALTAAEATGAAVPETLKAQAATLGLTKELSDLTAKQYGYTDSVKELSPEQAKLSRAVA ETEARLKQCRDVMNSSTVSSKAKAKAQQDLISLQGKLSDQTKQLSEVQALEAANYEQIKSKYAAVSDEMLRLEQAYKDGG ITAEEYLRQKERLVEVLRILQRLMGGLEEGEQETDEQVKKTTKTLIEQREELEQLEETTGRATEYVNLFAGAYAHLNKQF NFNEDSTEKLNARVDQLTNSIMNNMRVNTGFWGVLAQLSNQAFIREKQIINETLLTRKWTEELESSSISLDRVNQISREA KWNIRELGDEDLKPLQAAIDATRDRILGLRDDINATLGSLKDEMDQLNNNQAAIEKRRYEQQQAELKAQLDAARTAQDKE SIASAAEALQLSQQIYSTKLKQIEAESAERNSQAIERASSSASTATNSTRSTTSQTTSPSVSNQNTGGSVQIYRLELAMP SGNVMKADLLDEFKQLFLRELEQIKATS
Sequences:
>Translated_1308_residues MADKTLELALRIVAEATGKQHIAALVDELKRIGTESDAANPKTQALADELDGVSDASQAGANQVDELKNSLDPLSDQLDQ VAQSGRNTSNQTEQLTNDLKPLATGLDDVGDSSQSTSQKANTLANKLDELANQQDLINTFKRSRNELEQQELAVTAAALA LQDLKQRASQTDAPFVQLARSIDVAEKELEQMQRELAQQSSSHTKLQNALSKSGIDYNNLTTAQRKLSAEFDGTGRNVDK FANQLDKGNASAREHASSLRGVIGQVTALAGAYLGFDRVAQAVKDVFATGDQFERLGVQMNAVMGGFESGKQATAWVKQF AIDVPLQLNEVNQAFVKAKAFGLDPMNGTMKAIVDQAFKLGGGFQEVEGITLALGQAWAKQKLQGEEILQLIERGVPVWD MLAKVTGKNTLELQKLSEQGKLGRDVIQGLIDEMGRAANGSAAAQMALLSGQVSNLKDNLSSFYDLVAQSGALDWLKGQI SELNLEFAAMAADGRLKEWAQQVSDTIVSIGSAVQDGAAMLYHFRDEIGFVAKAFIALKVGSYFSDVITGANAAIGVMRL YTGAIMGTTAASEGAALAAGKLKTALAAAAKAGLYLALISELIEVARVYQELLIAEEALEKSKRAAAASAKQLEYSLKDL SEQTGVAFTTMAEFNKAVDEGKLIYDDATGKWKNAAKAMEEVKQAAVDVVEPIKLTVEEALRLTFTLSEQTKTLDGVKGG MGGFIRQIDAALVPLKAAGDQYEGHVKLLTILRAKFEEQQTYLDATAKGAEALEQAYKDLGLTSSHALEQVNTKAEAAFN LIKNNREPIEQQKDAFLAWAKAALTAAEATGAAVPETLKAQAATLGLTKELSDLTAKQYGYTDSVKELSPEQAKLSRAVA ETEARLKQCRDVMNSSTVSSKAKAKAQQDLISLQGKLSDQTKQLSEVQALEAANYEQIKSKYAAVSDEMLRLEQAYKDGG ITAEEYLRQKERLVEVLRILQRLMGGLEEGEQETDEQVKKTTKTLIEQREELEQLEETTGRATEYVNLFAGAYAHLNKQF NFNEDSTEKLNARVDQLTNSIMNNMRVNTGFWGVLAQLSNQAFIREKQIINETLLTRKWTEELESSSISLDRVNQISREA KWNIRELGDEDLKPLQAAIDATRDRILGLRDDINATLGSLKDEMDQLNNNQAAIEKRRYEQQQAELKAQLDAARTAQDKE SIASAAEALQLSQQIYSTKLKQIEAESAERNSQAIERASSSASTATNSTRSTTSQTTSPSVSNQNTGGSVQIYRLELAMP SGNVMKADLLDEFKQLFLRELEQIKATS >Mature_1307_residues ADKTLELALRIVAEATGKQHIAALVDELKRIGTESDAANPKTQALADELDGVSDASQAGANQVDELKNSLDPLSDQLDQV AQSGRNTSNQTEQLTNDLKPLATGLDDVGDSSQSTSQKANTLANKLDELANQQDLINTFKRSRNELEQQELAVTAAALAL QDLKQRASQTDAPFVQLARSIDVAEKELEQMQRELAQQSSSHTKLQNALSKSGIDYNNLTTAQRKLSAEFDGTGRNVDKF ANQLDKGNASAREHASSLRGVIGQVTALAGAYLGFDRVAQAVKDVFATGDQFERLGVQMNAVMGGFESGKQATAWVKQFA IDVPLQLNEVNQAFVKAKAFGLDPMNGTMKAIVDQAFKLGGGFQEVEGITLALGQAWAKQKLQGEEILQLIERGVPVWDM LAKVTGKNTLELQKLSEQGKLGRDVIQGLIDEMGRAANGSAAAQMALLSGQVSNLKDNLSSFYDLVAQSGALDWLKGQIS ELNLEFAAMAADGRLKEWAQQVSDTIVSIGSAVQDGAAMLYHFRDEIGFVAKAFIALKVGSYFSDVITGANAAIGVMRLY TGAIMGTTAASEGAALAAGKLKTALAAAAKAGLYLALISELIEVARVYQELLIAEEALEKSKRAAAASAKQLEYSLKDLS EQTGVAFTTMAEFNKAVDEGKLIYDDATGKWKNAAKAMEEVKQAAVDVVEPIKLTVEEALRLTFTLSEQTKTLDGVKGGM GGFIRQIDAALVPLKAAGDQYEGHVKLLTILRAKFEEQQTYLDATAKGAEALEQAYKDLGLTSSHALEQVNTKAEAAFNL IKNNREPIEQQKDAFLAWAKAALTAAEATGAAVPETLKAQAATLGLTKELSDLTAKQYGYTDSVKELSPEQAKLSRAVAE TEARLKQCRDVMNSSTVSSKAKAKAQQDLISLQGKLSDQTKQLSEVQALEAANYEQIKSKYAAVSDEMLRLEQAYKDGGI TAEEYLRQKERLVEVLRILQRLMGGLEEGEQETDEQVKKTTKTLIEQREELEQLEETTGRATEYVNLFAGAYAHLNKQFN FNEDSTEKLNARVDQLTNSIMNNMRVNTGFWGVLAQLSNQAFIREKQIINETLLTRKWTEELESSSISLDRVNQISREAK WNIRELGDEDLKPLQAAIDATRDRILGLRDDINATLGSLKDEMDQLNNNQAAIEKRRYEQQQAELKAQLDAARTAQDKES IASAAEALQLSQQIYSTKLKQIEAESAERNSQAIERASSSASTATNSTRSTTSQTTSPSVSNQNTGGSVQIYRLELAMPS GNVMKADLLDEFKQLFLRELEQIKATS
Specific function: Unknown
COG id: COG3941
COG function: function code R; Mu-like prophage protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To phage Mu protein gp42 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013491 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 142275; Mature: 142144
Theoretical pI: Translated: 4.72; Mature: 4.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADKTLELALRIVAEATGKQHIAALVDELKRIGTESDAANPKTQALADELDGVSDASQAG CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHCC ANQVDELKNSLDPLSDQLDQVAQSGRNTSNQTEQLTNDLKPLATGLDDVGDSSQSTSQKA CHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCHHHHHH NTLANKLDELANQQDLINTFKRSRNELEQQELAVTAAALALQDLKQRASQTDAPFVQLAR HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH SIDVAEKELEQMQRELAQQSSSHTKLQNALSKSGIDYNNLTTAQRKLSAEFDGTGRNVDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH FANQLDKGNASAREHASSLRGVIGQVTALAGAYLGFDRVAQAVKDVFATGDQFERLGVQM HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH NAVMGGFESGKQATAWVKQFAIDVPLQLNEVNQAFVKAKAFGLDPMNGTMKAIVDQAFKL HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH GGGFQEVEGITLALGQAWAKQKLQGEEILQLIERGVPVWDMLAKVTGKNTLELQKLSEQG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC KLGRDVIQGLIDEMGRAANGSAAAQMALLSGQVSNLKDNLSSFYDLVAQSGALDWLKGQI 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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH QAFIREKQIINETLLTRKWTEELESSSISLDRVNQISREAKWNIRELGDEDLKPLQAAID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHH ATRDRILGLRDDINATLGSLKDEMDQLNNNQAAIEKRRYEQQQAELKAQLDAARTAQDKE HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SIASAAEALQLSQQIYSTKLKQIEAESAERNSQAIERASSSASTATNSTRSTTSQTTSPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCC VSNQNTGGSVQIYRLELAMPSGNVMKADLLDEFKQLFLRELEQIKATS CCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]