Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 159901214

Identifier: 159901214

GI number: 159901214

Start: 6006995

End: 6009832

Strand: Reverse

Name: 159901214

Synonym: Haur_4702

Alternate gene names: NA

Gene position: 6009832-6006995 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159901216

Following gene: 159901197

Centisome position: 94.69

GC content: 52.26

Gene sequence:

>2838_bases
ATGCCAGCAGTTACCCTCGAATCTTTCAGCACGTTTGGAGCGCTGCTGCATTTTCTGCGACGCAGAGCACGCCTAACCCA
GCGCGATTTAGCGATTGCCACGGGCTATAGCGAGGCCCATATCTCGCGCTTGGAAAACGACCAGCGTTTGCCCGACCTCA
CAACCTTAGTAGCATTAATGGTTCCAGCGCTCGATCTCAGTGATGATCCCGCAAGCGTCGCGCGTTTGTTGGAGCTAGCA
GCGGCGGCTCGTGGCGAGTCATTGGTTGGCACGAGCGTCACGGTCACCAAAAAAATCGAGCAGCAACAACACAGCGAACT
TGGTTTGCTGGATTTGCCTCCACCCTTGCCCCCATTTTTAATCGAACGCCAGGCCACCAACCACGTGCAACAACGCTTAG
CCAACGAACGATGTTTGTGCATCAATGGGCTAGCTGGAGTTGGCAAAACCGTGATCGCCAGCCAAATCGCCCAAAGTTGG
GGCGAGCGCTGCTTTTGGCTGAGTTTTACGCCCACGCTGAGCCTTTCGAGCGAAATTTTGATTCGCCAGTTGGCGCTATT
TTTGTTGAGCCACGGCGACGATCAGGTTGAGCCGTTATTGCACTTGCCGCGTGATGGCGAAGCTGGTTTGAGTTTTGAAC
GTCAGCTAGGCTTGTTGATCAACGGTTTGCAGCACATTCCGGCTTTGCTCTGTTTTGATAATGCCCAATTGCTGATTGAT
CAACCGCAACTGCGTTTGATGCTTGAACAGCTAGCCCAAAAAACCACCAGCCAAATCTTGCTACTGAGCCGCGAACAATT
CAATTTACAAGGCTTTAGTTATTGGTCGTTGCATGGATTAGAATTAATTGAAGCTCAACGCTTGCTCAAGCATTATGGAA
CGCAACTTAGCCCAACCCACAGCCAACAATTAATCGAACGCACTCAAGCGAATCCGGCATTATTGCGCTTAACTATTGGT
TTATTGGGCGATCGCGGAGCCGATGAAGCTTTGATGCAGCATTTGATCGACGAGCCACATATTGCCAGTTTTGTGCTCGA
CCAGATGCTTGGTCAATTGCCGAGCAGCAGCGAACGCTTGCTAGCCTTGTTGGCGGTTGCTGCTCAGCCACTAAACTTGC
ATGCTGAATGGCCGATGGAATGTAGTTTTGCCGTCGATGGGCCATATCAATGGCAACAGGCCATGAGCGAACTGACCCGC
CGCCAGTTGATTGATGCCCCCAGCCATGCCTATGTGCTGCCGCTGGTACAAGAATATATTTATGCCCAATTGCGCAGTCA
GCCCAGTCGCCGCAAAGCACTGCACCAGCAACTTGCGAGAGTTTTCGAAGATCAACGAATTGACCCAATTCGGGCCGCCC
AGCATTATCTTGCGGCGGGCGATGTGCCTGCGGCGCTCAACAGCCTGCAACAACAACTTGATCCCTTGATGAATCAGGGT
TTATCGAGCGCGGCGGCGGCAATTTTGCAAAGCATTCGCCCAACGATTGAGCAACAGCATCCTGAATTGTTGTTTGCGTG
GTTGCAAAGTTATGGTGAATTTTTGATGGCTACCAGCCAAGCTAGCGAAGCCGAAGCCATGTATCGCGAAGCGTTGGCTT
TGGCCTGGCAACCAAATCAACGGGCACATTTGGTCTGGCGCTTAACTGGGGCCATGTTGCATCGTAATCAAGCTACTGCC
GCCCAAAGCTTGCTCGAACAAACCATTGCCACGCTTGATTCGCGTGAGGTGCGCTTGCATGGCTTGTTACAAATGGCACT
GAGCAAAGCGATTTTGATGCAATCGCAATTTGCGCTTGCTCGTCAAGCCGCCGAACAAGCGATTGCCCTGACCAGCCAAC
TTGATCCTGAGGCAATTATGACGATCGCTGAAATTCGGGCGCGGGCTGGCGGAACCTTGGCAATTGTGCAGCAATATACT
GGCGAAGTCGATGCCAGCATTCAAACATGGCTCGATGTGATTGCCCAAACCCGCATTGCCCGCTTGGAGCGGGTGCGACC
ACGGGCCTTTGTAAATTTGGCTAATCTCTATTACACCAAAGGCGATTTAAACCGCGCCGAAGCCACGATTAACGATGCGG
TTACAGGCTTGCGTCGAATTGGTGATGTCTATGCTCAAGCCCGCATGCAACACACCCAAGCGATTATTCAAATGATGCGC
GGCCAGCCCCAAGCGGCGTTACAAACCCTCGAACAAGCCTGCGCGATCAAACAACAGATCGACGATCAGCAAGGTTGGTA
CAATTCGCGCAACCAAATTGCCATGACCTTGTTGGCCTTGGGTCAAACCGAGCAAGCTGAAGCCATCGCCCAAAATTTAT
TGCATATGCTTGGCGAGGGTGGCGAGCCATTTTTCCGAGGCGTAATTTTGGATACTTTGGCGATTGGGCAGTTGTTGCGT
GGAGATCTACGGGCAGCGCGGCAAAGCCTTGATCGGATTGCAGCCATGCCCATTGCCCAAAGCAACAATTTATTGCGCAT
GGCTTGGGAGCGGCGTTCAGTCTTGTTGATGTTGCTCACTGAAGGGGCTGAGCATGCTCGCACGGTGTTTAGCCATAGTT
TGCCGCTCGCCGGCAACGGCGAAATTGCCCTCGATCATGCATGCCTTGATGCCTTGATTACGCAAGCTGCTGGTGATGAG
CTAGCTGCCCAACGCCAATGGCAACAACTGGCCCAACGGGCAGCCAGCAATGGCTACGAATATTATCGAATTGTGGCCGA
AGCACAGTTACAAGCACCAAGCCATGTTAGCTTGCAACAACGCGTGCTCCAAATGCACCAACCATTCGCTCCCAATTGTT
GGTATCAACCAGCCTTGGCACAGGCAGTCAATGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCAACCTGTTTTGGGTGCAACACGTACCCCCAACGATGCTATCCGCTTGCATGACGATTCACGGCCACCAATAATTTCC
ACTCACCTAGGAGGCTTGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGCAGGACTAACGGCGTTCAACCAGCAGCACTTGGGGCACACGCACCAGCGAATCAAGGTTAAAGGAACGATTTTCGCT
AGCAACAACCAACCCTGTTG

Product: XRE family transcriptional regulator

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 944

Protein sequence:

>945_residues
MPAVTLESFSTFGALLHFLRRRARLTQRDLAIATGYSEAHISRLENDQRLPDLTTLVALMVPALDLSDDPASVARLLELA
AAARGESLVGTSVTVTKKIEQQQHSELGLLDLPPPLPPFLIERQATNHVQQRLANERCLCINGLAGVGKTVIASQIAQSW
GERCFWLSFTPTLSLSSEILIRQLALFLLSHGDDQVEPLLHLPRDGEAGLSFERQLGLLINGLQHIPALLCFDNAQLLID
QPQLRLMLEQLAQKTTSQILLLSREQFNLQGFSYWSLHGLELIEAQRLLKHYGTQLSPTHSQQLIERTQANPALLRLTIG
LLGDRGADEALMQHLIDEPHIASFVLDQMLGQLPSSSERLLALLAVAAQPLNLHAEWPMECSFAVDGPYQWQQAMSELTR
RQLIDAPSHAYVLPLVQEYIYAQLRSQPSRRKALHQQLARVFEDQRIDPIRAAQHYLAAGDVPAALNSLQQQLDPLMNQG
LSSAAAAILQSIRPTIEQQHPELLFAWLQSYGEFLMATSQASEAEAMYREALALAWQPNQRAHLVWRLTGAMLHRNQATA
AQSLLEQTIATLDSREVRLHGLLQMALSKAILMQSQFALARQAAEQAIALTSQLDPEAIMTIAEIRARAGGTLAIVQQYT
GEVDASIQTWLDVIAQTRIARLERVRPRAFVNLANLYYTKGDLNRAEATINDAVTGLRRIGDVYAQARMQHTQAIIQMMR
GQPQAALQTLEQACAIKQQIDDQQGWYNSRNQIAMTLLALGQTEQAEAIAQNLLHMLGEGGEPFFRGVILDTLAIGQLLR
GDLRAARQSLDRIAAMPIAQSNNLLRMAWERRSVLLMLLTEGAEHARTVFSHSLPLAGNGEIALDHACLDALITQAAGDE
LAAQRQWQQLAQRAASNGYEYYRIVAEAQLQAPSHVSLQQRVLQMHQPFAPNCWYQPALAQAVND

Sequences:

>Translated_945_residues
MPAVTLESFSTFGALLHFLRRRARLTQRDLAIATGYSEAHISRLENDQRLPDLTTLVALMVPALDLSDDPASVARLLELA
AAARGESLVGTSVTVTKKIEQQQHSELGLLDLPPPLPPFLIERQATNHVQQRLANERCLCINGLAGVGKTVIASQIAQSW
GERCFWLSFTPTLSLSSEILIRQLALFLLSHGDDQVEPLLHLPRDGEAGLSFERQLGLLINGLQHIPALLCFDNAQLLID
QPQLRLMLEQLAQKTTSQILLLSREQFNLQGFSYWSLHGLELIEAQRLLKHYGTQLSPTHSQQLIERTQANPALLRLTIG
LLGDRGADEALMQHLIDEPHIASFVLDQMLGQLPSSSERLLALLAVAAQPLNLHAEWPMECSFAVDGPYQWQQAMSELTR
RQLIDAPSHAYVLPLVQEYIYAQLRSQPSRRKALHQQLARVFEDQRIDPIRAAQHYLAAGDVPAALNSLQQQLDPLMNQG
LSSAAAAILQSIRPTIEQQHPELLFAWLQSYGEFLMATSQASEAEAMYREALALAWQPNQRAHLVWRLTGAMLHRNQATA
AQSLLEQTIATLDSREVRLHGLLQMALSKAILMQSQFALARQAAEQAIALTSQLDPEAIMTIAEIRARAGGTLAIVQQYT
GEVDASIQTWLDVIAQTRIARLERVRPRAFVNLANLYYTKGDLNRAEATINDAVTGLRRIGDVYAQARMQHTQAIIQMMR
GQPQAALQTLEQACAIKQQIDDQQGWYNSRNQIAMTLLALGQTEQAEAIAQNLLHMLGEGGEPFFRGVILDTLAIGQLLR
GDLRAARQSLDRIAAMPIAQSNNLLRMAWERRSVLLMLLTEGAEHARTVFSHSLPLAGNGEIALDHACLDALITQAAGDE
LAAQRQWQQLAQRAASNGYEYYRIVAEAQLQAPSHVSLQQRVLQMHQPFAPNCWYQPALAQAVND
>Mature_944_residues
PAVTLESFSTFGALLHFLRRRARLTQRDLAIATGYSEAHISRLENDQRLPDLTTLVALMVPALDLSDDPASVARLLELAA
AARGESLVGTSVTVTKKIEQQQHSELGLLDLPPPLPPFLIERQATNHVQQRLANERCLCINGLAGVGKTVIASQIAQSWG
ERCFWLSFTPTLSLSSEILIRQLALFLLSHGDDQVEPLLHLPRDGEAGLSFERQLGLLINGLQHIPALLCFDNAQLLIDQ
PQLRLMLEQLAQKTTSQILLLSREQFNLQGFSYWSLHGLELIEAQRLLKHYGTQLSPTHSQQLIERTQANPALLRLTIGL
LGDRGADEALMQHLIDEPHIASFVLDQMLGQLPSSSERLLALLAVAAQPLNLHAEWPMECSFAVDGPYQWQQAMSELTRR
QLIDAPSHAYVLPLVQEYIYAQLRSQPSRRKALHQQLARVFEDQRIDPIRAAQHYLAAGDVPAALNSLQQQLDPLMNQGL
SSAAAAILQSIRPTIEQQHPELLFAWLQSYGEFLMATSQASEAEAMYREALALAWQPNQRAHLVWRLTGAMLHRNQATAA
QSLLEQTIATLDSREVRLHGLLQMALSKAILMQSQFALARQAAEQAIALTSQLDPEAIMTIAEIRARAGGTLAIVQQYTG
EVDASIQTWLDVIAQTRIARLERVRPRAFVNLANLYYTKGDLNRAEATINDAVTGLRRIGDVYAQARMQHTQAIIQMMRG
QPQAALQTLEQACAIKQQIDDQQGWYNSRNQIAMTLLALGQTEQAEAIAQNLLHMLGEGGEPFFRGVILDTLAIGQLLRG
DLRAARQSLDRIAAMPIAQSNNLLRMAWERRSVLLMLLTEGAEHARTVFSHSLPLAGNGEIALDHACLDALITQAAGDEL
AAQRQWQQLAQRAASNGYEYYRIVAEAQLQAPSHVSLQQRVLQMHQPFAPNCWYQPALAQAVND

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104959; Mature: 104828

Theoretical pI: Translated: 6.30; Mature: 6.30

Prosite motif: PS50943 HTH_CROC1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPAVTLESFSTFGALLHFLRRRARLTQRDLAIATGYSEAHISRLENDQRLPDLTTLVALM
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
VPALDLSDDPASVARLLELAAAARGESLVGTSVTVTKKIEQQQHSELGLLDLPPPLPPFL
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
IERQATNHVQQRLANERCLCINGLAGVGKTVIASQIAQSWGERCFWLSFTPTLSLSSEIL
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHH
IRQLALFLLSHGDDQVEPLLHLPRDGEAGLSFERQLGLLINGLQHIPALLCFDNAQLLID
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEC
QPQLRLMLEQLAQKTTSQILLLSREQFNLQGFSYWSLHGLELIEAQRLLKHYGTQLSPTH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SQQLIERTQANPALLRLTIGLLGDRGADEALMQHLIDEPHIASFVLDQMLGQLPSSSERL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LALLAVAAQPLNLHAEWPMECSFAVDGPYQWQQAMSELTRRQLIDAPSHAYVLPLVQEYI
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
YAQLRSQPSRRKALHQQLARVFEDQRIDPIRAAQHYLAAGDVPAALNSLQQQLDPLMNQG
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSSAAAAILQSIRPTIEQQHPELLFAWLQSYGEFLMATSQASEAEAMYREALALAWQPNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RAHLVWRLTGAMLHRNQATAAQSLLEQTIATLDSREVRLHGLLQMALSKAILMQSQFALA
CCEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RQAAEQAIALTSQLDPEAIMTIAEIRARAGGTLAIVQQYTGEVDASIQTWLDVIAQTRIA
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RLERVRPRAFVNLANLYYTKGDLNRAEATINDAVTGLRRIGDVYAQARMQHTQAIIQMMR
HHHHHCHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GQPQAALQTLEQACAIKQQIDDQQGWYNSRNQIAMTLLALGQTEQAEAIAQNLLHMLGEG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
GEPFFRGVILDTLAIGQLLRGDLRAARQSLDRIAAMPIAQSNNLLRMAWERRSVLLMLLT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEHHHH
EGAEHARTVFSHSLPLAGNGEIALDHACLDALITQAAGDELAAQRQWQQLAQRAASNGYE
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
YYRIVAEAQLQAPSHVSLQQRVLQMHQPFAPNCWYQPALAQAVND
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PAVTLESFSTFGALLHFLRRRARLTQRDLAIATGYSEAHISRLENDQRLPDLTTLVALM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
VPALDLSDDPASVARLLELAAAARGESLVGTSVTVTKKIEQQQHSELGLLDLPPPLPPFL
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHH
IERQATNHVQQRLANERCLCINGLAGVGKTVIASQIAQSWGERCFWLSFTPTLSLSSEIL
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHH
IRQLALFLLSHGDDQVEPLLHLPRDGEAGLSFERQLGLLINGLQHIPALLCFDNAQLLID
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEC
QPQLRLMLEQLAQKTTSQILLLSREQFNLQGFSYWSLHGLELIEAQRLLKHYGTQLSPTH
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
SQQLIERTQANPALLRLTIGLLGDRGADEALMQHLIDEPHIASFVLDQMLGQLPSSSERL
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LALLAVAAQPLNLHAEWPMECSFAVDGPYQWQQAMSELTRRQLIDAPSHAYVLPLVQEYI
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
YAQLRSQPSRRKALHQQLARVFEDQRIDPIRAAQHYLAAGDVPAALNSLQQQLDPLMNQG
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSSAAAAILQSIRPTIEQQHPELLFAWLQSYGEFLMATSQASEAEAMYREALALAWQPNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
RAHLVWRLTGAMLHRNQATAAQSLLEQTIATLDSREVRLHGLLQMALSKAILMQSQFALA
CCEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RQAAEQAIALTSQLDPEAIMTIAEIRARAGGTLAIVQQYTGEVDASIQTWLDVIAQTRIA
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RLERVRPRAFVNLANLYYTKGDLNRAEATINDAVTGLRRIGDVYAQARMQHTQAIIQMMR
HHHHHCHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GQPQAALQTLEQACAIKQQIDDQQGWYNSRNQIAMTLLALGQTEQAEAIAQNLLHMLGEG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
GEPFFRGVILDTLAIGQLLRGDLRAARQSLDRIAAMPIAQSNNLLRMAWERRSVLLMLLT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEHHHH
EGAEHARTVFSHSLPLAGNGEIALDHACLDALITQAAGDELAAQRQWQQLAQRAASNGYE
CCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
YYRIVAEAQLQAPSHVSLQQRVLQMHQPFAPNCWYQPALAQAVND
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA