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The map label for this gene is 159900256

Identifier: 159900256

GI number: 159900256

Start: 4699281

End: 4702013

Strand: Reverse

Name: 159900256

Synonym: Haur_3739

Alternate gene names: NA

Gene position: 4702013-4699281 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159900257

Following gene: 159900255

Centisome position: 74.09

GC content: 51.04

Gene sequence:

>2733_bases
ATGACTAAGCTTGATGCCTCTTTTGGAATGTGGCTTAAACAACGCCGAAAGACCCTCGATCTGACCCAAGACGAGTTGGC
TCATTTGGTTGGCTGTGCCACGGTCACGATTCGTAAAATTGAAGCTAATACGCTTAAGCCTTCAACCCAGATTGCTCAGC
GCTTAGCCCAATGTTGTAATGTTCCTGAAGCTGAACATACAGCATTTGTTCATTTTGCGCGTTCGGAAACAACCACTGGG
CCAGTATGGTCTGACCAAACGCCAGGTGCTGCACGGGTCAATTTTGTGGTCGATCAACCACCCCACAATTTGGTTGATTT
ACCCAATCCATTGATTGGTCGTGATGCTGATGTTGCGACCATCAATGAGCGTTTGGCCAACGAGCATGTGCGTTTATTAA
CTTTGGTTGGCCCGCCCGGGGTTGGCAAAACTCGTTTAGCGTTGCAAGTAGCCCAACAACAACTTGAGCGCTTCCGCCAT
GGGGTGTTTGTCGTAGCCCTCGCTCCCGTAACCAATCCTCAAGATGTGTTGAGCGTGATCGCGCAAACCCTAGGAATCAA
AGAAACTGGCATTCGTCGCAGCTTCGAAGATCTCAAAAATTTTTTGTACGACCGTGAATTATTATTGGTGCTGGATAATT
TCGAGCAGGTGTTGCCCGCCGCTAGCTCAATCGATCAGCTGATTCAGGCTTGTTATGGGCTGAAGGTGTTGGTCACTAGC
CGCGAGGCTTTGCGCTTACGCCGTGAACGCCGTTTTGCGGTTGCGCCGTTGGCTATCGCAACTCCCGTCAGCGATGAGCC
AAGCGCCACGTTCTCGCCAGCTGTAGCACTGTTTATTGAGCGAGCACAGGCCGTCAATCCCGATTTTGAGATTAACGAAA
CCAGTCTGCACGATATTAGTGCCGTTTGTCGCCAGCTTGATGGCCTGCCGTTGAGTATTGAGTTGATTGCTGCCCGCAGT
ATGTTGCTGGCACCCAAAGCGATGTTGCGCCATCTTGAGCATCAATTAACCGTCTTAACTAGCCGATCGTCTGATCATCC
GCCGCGCCAACGCACCCTGCGTGATGCAATTCGTTGGAGTGTCGATCTGCTTGAGCCAAGCGATCAGCAGATGTTTATGC
ATGTCGGGGTTTTTCCACAAAGCTGTACGCTTGAGTCACTTGCCGCCGTCGGGGCTGAGCAAGCTTGGGCACTCGATTTG
CTCGATGGCTTAAATACCCTCGCCGATAAAAGTTTGCTCTACGCCAAGGCTGATCAACAGGGCGAAACGCGCTTTGAGAT
GTTGAATGTGTTGCGCGAATATGCCCGCGAGATGTTGCAACACGCTGGTTTGTTGATCCAAGCTGCCCAACGCCATGCCC
AATATTATTTGCAGTTGGCGCAAATCCTCCAAGCCGATCTCAGTCAGCATAACCAACATGTGACCGCTGGCGATCGTTTT
GAGCGCGATTTATTCAATTTTCGGGCGGCCTTAGAATTTTTCTTTACCCAACGCCAAATCGAACAAAATGTTCAGCTTGC
TACCAGTTTGGCCGATTTGTGGTATTTGCGCGGCTATGCTGGTGAGGGTCGGCGTTGGCTGGCTCAAGCAATTGAGCAAG
CCCAAACCACCCAAACTACGCTTGAGCCAACCCTCTGGATCGAGGCACTCAATGCTGCGGGCTACTTGGCCTATCATCAA
GGCGATTATGGCGATGCCGCCCAAACCTTCTCGCAAAGCCGCCAGCTGATCGAAACTGCCAATGATCAGGTTGGCATGGC
GCGGGTCTACAATAATTTGGGCTTAATTGCTCATTGGCAAGGCCAATATGCCCAATCTGAGGCTTTGCTCAACGATAGTT
TGCAAATTTGGCGCAAACTTGATCTATCGATGGCGATTAGTAGTTTGGTCTGTAATCTTGGGGCGCTTCAGCTTGATCGT
GGTGAATTGAGCCAAGCTGCCGAGTTGCTTGAACAAAGCAAAGTGCTCTGTCAGCAACAGCATTATGAAAATCGCATCTC
AATGGTTCTGCAACATCAAGGTAAATTGGCGCTCTACCGTGGCGATTATGCCACCGCCCAGCGTTGTTTCAGCGAAAGTC
AGGCCATCGCCGAGCAGATGAGCAATAAAACCGTGATTGGTTTTGCCCTGATGTACCAAGGCTATGCCACGCTGGCCGCA
GGCGAATTGGAGCAAGCCGCCTGTTATTTGAGCAAAGCTGCCCAGATGAGCCAAGATCTTGGTAGCAAGCATATGGTGTG
TATGGTGTTGGCGGTGCAGGCACAGTTGGCTGTCGAACAAGCCCAATACGTGGTAGCCCGCCAGTTATTTACCCAAGCCT
TGGAGTTAGGCCGCAGCATGCAATTTGGCACAGGTATTGCCAATGCCTTGCGTGGTTTGGCGCTGGTCGATGCGATTCAA
GGCCACTATAGCCCAGCGTTAGAGCAAATTAACCAAGCAATTCAAGGCTATCGTACCATCGGCAACCCCGAAGGCTTAAT
TCAATCGCTTGAAACCTTGGCATTTTGTTTGACAACCATGGGCTATGGCAAGACAATCGCGCCTGTTGTCGCTGCGCTCG
AACAGTTGCGCCACGAATATGGCTTGCGGCGCTGGAACAATCAACAAGCTCGTTGGCAACAGATTCAACAGGCTCTAGCA
CAGCCTGATCAATCAAACTTGCCAGCCGAGCCAATTGTTGCCCAATTACTCGACCAGATGCCTAGCCTGAAACTGCGTGA
GCTGCGCACATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAGTGCGGTTCCCTGCGCCGTTAACACCGACGAACAGTAAGCTGGCAATTACCAAATGTCCTTACTTTCCTGACTTCCA
CAGCACACTGGACAGCGTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTGGTTGGCAAGCCTGAATCTACGCGAGCGCCGATCGCTTGGTTTGAGCGAGCTTGGCGCTCGAACCAGCTCGCGTTAC
CAACGTTGGCGCAAGCAAGC

Product: XRE family transcriptional regulator

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 910; Mature: 909

Protein sequence:

>910_residues
MTKLDASFGMWLKQRRKTLDLTQDELAHLVGCATVTIRKIEANTLKPSTQIAQRLAQCCNVPEAEHTAFVHFARSETTTG
PVWSDQTPGAARVNFVVDQPPHNLVDLPNPLIGRDADVATINERLANEHVRLLTLVGPPGVGKTRLALQVAQQQLERFRH
GVFVVALAPVTNPQDVLSVIAQTLGIKETGIRRSFEDLKNFLYDRELLLVLDNFEQVLPAASSIDQLIQACYGLKVLVTS
REALRLRRERRFAVAPLAIATPVSDEPSATFSPAVALFIERAQAVNPDFEINETSLHDISAVCRQLDGLPLSIELIAARS
MLLAPKAMLRHLEHQLTVLTSRSSDHPPRQRTLRDAIRWSVDLLEPSDQQMFMHVGVFPQSCTLESLAAVGAEQAWALDL
LDGLNTLADKSLLYAKADQQGETRFEMLNVLREYAREMLQHAGLLIQAAQRHAQYYLQLAQILQADLSQHNQHVTAGDRF
ERDLFNFRAALEFFFTQRQIEQNVQLATSLADLWYLRGYAGEGRRWLAQAIEQAQTTQTTLEPTLWIEALNAAGYLAYHQ
GDYGDAAQTFSQSRQLIETANDQVGMARVYNNLGLIAHWQGQYAQSEALLNDSLQIWRKLDLSMAISSLVCNLGALQLDR
GELSQAAELLEQSKVLCQQQHYENRISMVLQHQGKLALYRGDYATAQRCFSESQAIAEQMSNKTVIGFALMYQGYATLAA
GELEQAACYLSKAAQMSQDLGSKHMVCMVLAVQAQLAVEQAQYVVARQLFTQALELGRSMQFGTGIANALRGLALVDAIQ
GHYSPALEQINQAIQGYRTIGNPEGLIQSLETLAFCLTTMGYGKTIAPVVAALEQLRHEYGLRRWNNQQARWQQIQQALA
QPDQSNLPAEPIVAQLLDQMPSLKLRELRT

Sequences:

>Translated_910_residues
MTKLDASFGMWLKQRRKTLDLTQDELAHLVGCATVTIRKIEANTLKPSTQIAQRLAQCCNVPEAEHTAFVHFARSETTTG
PVWSDQTPGAARVNFVVDQPPHNLVDLPNPLIGRDADVATINERLANEHVRLLTLVGPPGVGKTRLALQVAQQQLERFRH
GVFVVALAPVTNPQDVLSVIAQTLGIKETGIRRSFEDLKNFLYDRELLLVLDNFEQVLPAASSIDQLIQACYGLKVLVTS
REALRLRRERRFAVAPLAIATPVSDEPSATFSPAVALFIERAQAVNPDFEINETSLHDISAVCRQLDGLPLSIELIAARS
MLLAPKAMLRHLEHQLTVLTSRSSDHPPRQRTLRDAIRWSVDLLEPSDQQMFMHVGVFPQSCTLESLAAVGAEQAWALDL
LDGLNTLADKSLLYAKADQQGETRFEMLNVLREYAREMLQHAGLLIQAAQRHAQYYLQLAQILQADLSQHNQHVTAGDRF
ERDLFNFRAALEFFFTQRQIEQNVQLATSLADLWYLRGYAGEGRRWLAQAIEQAQTTQTTLEPTLWIEALNAAGYLAYHQ
GDYGDAAQTFSQSRQLIETANDQVGMARVYNNLGLIAHWQGQYAQSEALLNDSLQIWRKLDLSMAISSLVCNLGALQLDR
GELSQAAELLEQSKVLCQQQHYENRISMVLQHQGKLALYRGDYATAQRCFSESQAIAEQMSNKTVIGFALMYQGYATLAA
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GHYSPALEQINQAIQGYRTIGNPEGLIQSLETLAFCLTTMGYGKTIAPVVAALEQLRHEYGLRRWNNQQARWQQIQQALA
QPDQSNLPAEPIVAQLLDQMPSLKLRELRT
>Mature_909_residues
TKLDASFGMWLKQRRKTLDLTQDELAHLVGCATVTIRKIEANTLKPSTQIAQRLAQCCNVPEAEHTAFVHFARSETTTGP
VWSDQTPGAARVNFVVDQPPHNLVDLPNPLIGRDADVATINERLANEHVRLLTLVGPPGVGKTRLALQVAQQQLERFRHG
VFVVALAPVTNPQDVLSVIAQTLGIKETGIRRSFEDLKNFLYDRELLLVLDNFEQVLPAASSIDQLIQACYGLKVLVTSR
EALRLRRERRFAVAPLAIATPVSDEPSATFSPAVALFIERAQAVNPDFEINETSLHDISAVCRQLDGLPLSIELIAARSM
LLAPKAMLRHLEHQLTVLTSRSSDHPPRQRTLRDAIRWSVDLLEPSDQQMFMHVGVFPQSCTLESLAAVGAEQAWALDLL
DGLNTLADKSLLYAKADQQGETRFEMLNVLREYAREMLQHAGLLIQAAQRHAQYYLQLAQILQADLSQHNQHVTAGDRFE
RDLFNFRAALEFFFTQRQIEQNVQLATSLADLWYLRGYAGEGRRWLAQAIEQAQTTQTTLEPTLWIEALNAAGYLAYHQG
DYGDAAQTFSQSRQLIETANDQVGMARVYNNLGLIAHWQGQYAQSEALLNDSLQIWRKLDLSMAISSLVCNLGALQLDRG
ELSQAAELLEQSKVLCQQQHYENRISMVLQHQGKLALYRGDYATAQRCFSESQAIAEQMSNKTVIGFALMYQGYATLAAG
ELEQAACYLSKAAQMSQDLGSKHMVCMVLAVQAQLAVEQAQYVVARQLFTQALELGRSMQFGTGIANALRGLALVDAIQG
HYSPALEQINQAIQGYRTIGNPEGLIQSLETLAFCLTTMGYGKTIAPVVAALEQLRHEYGLRRWNNQQARWQQIQQALAQ
PDQSNLPAEPIVAQLLDQMPSLKLRELRT

Specific function: Unknown

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101415; Mature: 101284

Theoretical pI: Translated: 6.22; Mature: 6.22

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION ; PS50943 HTH_CROC1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKLDASFGMWLKQRRKTLDLTQDELAHLVGCATVTIRKIEANTLKPSTQIAQRLAQCCN
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC
VPEAEHTAFVHFARSETTTGPVWSDQTPGAARVNFVVDQPPHNLVDLPNPLIGRDADVAT
CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
INERLANEHVRLLTLVGPPGVGKTRLALQVAQQQLERFRHGVFVVALAPVTNPQDVLSVI
HHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHH
AQTLGIKETGIRRSFEDLKNFLYDRELLLVLDNFEQVLPAASSIDQLIQACYGLKVLVTS
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
REALRLRRERRFAVAPLAIATPVSDEPSATFSPAVALFIERAQAVNPDFEINETSLHDIS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
AVCRQLDGLPLSIELIAARSMLLAPKAMLRHLEHQLTVLTSRSSDHPPRQRTLRDAIRWS
HHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
VDLLEPSDQQMFMHVGVFPQSCTLESLAAVGAEQAWALDLLDGLNTLADKSLLYAKADQQ
HHCCCCCCHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
GETRFEMLNVLREYAREMLQHAGLLIQAAQRHAQYYLQLAQILQADLSQHNQHVTAGDRF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
ERDLFNFRAALEFFFTQRQIEQNVQLATSLADLWYLRGYAGEGRRWLAQAIEQAQTTQTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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GQYAQSEALLNDSLQIWRKLDLSMAISSLVCNLGALQLDRGELSQAAELLEQSKVLCQQQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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GYGKTIAPVVAALEQLRHEYGLRRWNNQQARWQQIQQALAQPDQSNLPAEPIVAQLLDQM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
PSLKLRELRT
CCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TKLDASFGMWLKQRRKTLDLTQDELAHLVGCATVTIRKIEANTLKPSTQIAQRLAQCCN
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC
VPEAEHTAFVHFARSETTTGPVWSDQTPGAARVNFVVDQPPHNLVDLPNPLIGRDADVAT
CCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
INERLANEHVRLLTLVGPPGVGKTRLALQVAQQQLERFRHGVFVVALAPVTNPQDVLSVI
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AQTLGIKETGIRRSFEDLKNFLYDRELLLVLDNFEQVLPAASSIDQLIQACYGLKVLVTS
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REALRLRRERRFAVAPLAIATPVSDEPSATFSPAVALFIERAQAVNPDFEINETSLHDIS
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GYGKTIAPVVAALEQLRHEYGLRRWNNQQARWQQIQQALAQPDQSNLPAEPIVAQLLDQM
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
PSLKLRELRT
CCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]