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The map label for this gene is 159898899

Identifier: 159898899

GI number: 159898899

Start: 3029937

End: 3032039

Strand: Reverse

Name: 159898899

Synonym: Haur_2378

Alternate gene names: NA

Gene position: 3032039-3029937 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159898900

Following gene: 159898898

Centisome position: 47.77

GC content: 54.3

Gene sequence:

>2103_bases
ATGTGGAAAGATCGTTGTATGGCTCAATCACGCCAGTTTGATCGGGTATTGGCTTTGCTCGTGCTTGGCCTCAGCTGCTG
GACATTATTCTTACCAATGCCAGCCTTATCGAATGCCAACGCTCCAGCGGCTTTGGTGCAGGCCAGCCTTGCCACGCTTG
ATCAACAGGCTGAGCAACGCCAAATTGCCGTCATTGCTGCTAGCGTGCTTGATGGCGAACGTGGCGATTTTGAGCGCCGT
GGCGTGCAATTGGCCCAACTTAGCCCCGAACAACAAAGCCAAGTGCGGCGTGAATTGGCGGTTGATATTGAATTATTGGC
CCAAACCTCACGCGCTGCTGAGCATGAACGTCAAGCCTTGCAAGCCTACGATACGGCTTTGATGGGTCAAACCCGCGATT
TAGGCGCATTGGCTGAGCAACTACGTTCAGCCACATGGCCAATCGTCGAACACCTCAAACTGTATCCACCACCACTCGGA
ACCCGCAGCGATTGGCTAGCCCCGAACAGCAACTATTTTCAAACCCGCGCAATTACGATTAGCAATGGCACACTTGAACA
AGCGACCCAAGCAGCGATTGAGGTTGGTCGGGCCAGTTATAGCCAACGCCAACTGCGCGAGCTTGATCAAACCTATCGAC
AGGTGCTTGACCAATATGCCCAAACCTTGCAACAAACAATCACCAGCCAAACTAATGTGCGGCCATGGTGGCGTTGGGTT
TTGGCAAGTGGTTTAGCCTTGGGTTTTGCAGGTTTGTTGTGGTGGGTTTTACGCGCTATATTAGCCAAAGATTGGCTGTT
GTTGGCGGCGGGCGTGGCGTTGGCGGCATGGTTTGGGCTGCCATGGCCTGTGGCGTCGATTGGACTGCTAGCATTAGTTG
GCTTAATTGGGTTGCGCCCAAGTTTAGCGGCTTGTCTGCCATTGCTCGCAATTCCGCTGTATTATCGCGCTCGCTTGGTT
GGCAACTTGAGTTTTCCGCTCAACGAAACCTTGTTTGGCATCAGTGCTGCTGGCTTGCTATTGCATGTGATTTGGCGTTG
GTGGCGTGGTCAACGGCCTGATGTTGCTTGGTTCAAAACTAGTTGGTATTGGCCAATTGGGGCAGTAGCGCTGGGTTTGG
TGCTGGCGGCTGGGTTGAGCCTCGGGTCTAGTGGCTTGGTCGAGCCTGCGACAGCCTTGCGAGAATTGCGGCGCACGATC
ATCGAGCCAGCGATTTGGGCTTGTTTGGCCTTGCTATTACTGGCAACTCAGCGAGTTAAAGCGCAAAGCATGCTCTGGAG
CTATATTGTAATGGCGGCTTGGATCGCTGGTGATGGCTTGGTGCGCTTTGCCTTGGGCGAAGGCGTTTGGGCCACAACTG
GCGTGCCACGCTTGATCGGCCTGTTGCCAAGCTCGACCGCCTTGGGTGTTTACTTGGGCGCTGGTTTGGCTGGTAGTTTA
GCCTTGGCCTTGAGCGCCGAATCGGCCAAACAGCGTCAATTGGCGTGGTTACTCAGCCTACCACTGAGTTTGGGTGTTTT
GTTGACCTTCACCCGTGGCGCATGGCTGGGCGTGGTTGGCGCTGTTGCTCTGGTTTTGCTGCTACAACGGCGTTGGCGTT
TGTTGCTTGGCGCTGCTGGCTTAGCTGGTGTTGGTTTAGCGGGCTTTGGCTTGATTCAGCCCAGCTTGCTGGCCCGCGTG
TTGCGGCTTGGCGAGGGCACTGGCTCAGCTCGCCAAGAAATTTGGGCTTCAGCCTGGCGAGCGGTGCAGGATCAACCACT
GCTTGGATTTGGGCTTGATCAATTTGCCCAGCTTGAGCCAAGCCGCTATGGAATTCCACAGATTCGTTTTTTGACCTTGG
CGCATCCGCATAATCTGCTGCTTGATGTCTGGTTACAATTAGGCTTGCTCGGTTTGCTGGTAGTTTTGGCCATGCTTGGC
TGGCAGGTTTGGCGTTGGTGGGGCAGCAAACAGGCTTTGGGGTTGGTGGGGCTGGCAATCTTGGCAGATTTAGTGATTCA
TGGCATGCTTGACCAAACCATGCTTGGCGGTGATATGATATATCTCTGGTGGAGCTTGCTCCTTATCAGTGTTTGGCGGC
CATCCGCAACGGAGGAATCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCCCTCTAGGCAGGATTCGGGCGCAGGATGTTTGCTCCCACATTCATCAATCCTTAACTTGCTTGAAGTGGGATATCAA
CCCCATGATCTGGTATAGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCGACGGTTTCTTTACTTTGCCTTGTCGAGTTGTCTTACCTGCTGAACAACGCGATCGTTTAGAGCGGCTTTGTCGTGCC
CGTTCGATGGAAGTCAGCGA

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 700; Mature: 700

Protein sequence:

>700_residues
MWKDRCMAQSRQFDRVLALLVLGLSCWTLFLPMPALSNANAPAALVQASLATLDQQAEQRQIAVIAASVLDGERGDFERR
GVQLAQLSPEQQSQVRRELAVDIELLAQTSRAAEHERQALQAYDTALMGQTRDLGALAEQLRSATWPIVEHLKLYPPPLG
TRSDWLAPNSNYFQTRAITISNGTLEQATQAAIEVGRASYSQRQLRELDQTYRQVLDQYAQTLQQTITSQTNVRPWWRWV
LASGLALGFAGLLWWVLRAILAKDWLLLAAGVALAAWFGLPWPVASIGLLALVGLIGLRPSLAACLPLLAIPLYYRARLV
GNLSFPLNETLFGISAAGLLLHVIWRWWRGQRPDVAWFKTSWYWPIGAVALGLVLAAGLSLGSSGLVEPATALRELRRTI
IEPAIWACLALLLLATQRVKAQSMLWSYIVMAAWIAGDGLVRFALGEGVWATTGVPRLIGLLPSSTALGVYLGAGLAGSL
ALALSAESAKQRQLAWLLSLPLSLGVLLTFTRGAWLGVVGAVALVLLLQRRWRLLLGAAGLAGVGLAGFGLIQPSLLARV
LRLGEGTGSARQEIWASAWRAVQDQPLLGFGLDQFAQLEPSRYGIPQIRFLTLAHPHNLLLDVWLQLGLLGLLVVLAMLG
WQVWRWWGSKQALGLVGLAILADLVIHGMLDQTMLGGDMIYLWWSLLLISVWRPSATEES

Sequences:

>Translated_700_residues
MWKDRCMAQSRQFDRVLALLVLGLSCWTLFLPMPALSNANAPAALVQASLATLDQQAEQRQIAVIAASVLDGERGDFERR
GVQLAQLSPEQQSQVRRELAVDIELLAQTSRAAEHERQALQAYDTALMGQTRDLGALAEQLRSATWPIVEHLKLYPPPLG
TRSDWLAPNSNYFQTRAITISNGTLEQATQAAIEVGRASYSQRQLRELDQTYRQVLDQYAQTLQQTITSQTNVRPWWRWV
LASGLALGFAGLLWWVLRAILAKDWLLLAAGVALAAWFGLPWPVASIGLLALVGLIGLRPSLAACLPLLAIPLYYRARLV
GNLSFPLNETLFGISAAGLLLHVIWRWWRGQRPDVAWFKTSWYWPIGAVALGLVLAAGLSLGSSGLVEPATALRELRRTI
IEPAIWACLALLLLATQRVKAQSMLWSYIVMAAWIAGDGLVRFALGEGVWATTGVPRLIGLLPSSTALGVYLGAGLAGSL
ALALSAESAKQRQLAWLLSLPLSLGVLLTFTRGAWLGVVGAVALVLLLQRRWRLLLGAAGLAGVGLAGFGLIQPSLLARV
LRLGEGTGSARQEIWASAWRAVQDQPLLGFGLDQFAQLEPSRYGIPQIRFLTLAHPHNLLLDVWLQLGLLGLLVVLAMLG
WQVWRWWGSKQALGLVGLAILADLVIHGMLDQTMLGGDMIYLWWSLLLISVWRPSATEES
>Mature_700_residues
MWKDRCMAQSRQFDRVLALLVLGLSCWTLFLPMPALSNANAPAALVQASLATLDQQAEQRQIAVIAASVLDGERGDFERR
GVQLAQLSPEQQSQVRRELAVDIELLAQTSRAAEHERQALQAYDTALMGQTRDLGALAEQLRSATWPIVEHLKLYPPPLG
TRSDWLAPNSNYFQTRAITISNGTLEQATQAAIEVGRASYSQRQLRELDQTYRQVLDQYAQTLQQTITSQTNVRPWWRWV
LASGLALGFAGLLWWVLRAILAKDWLLLAAGVALAAWFGLPWPVASIGLLALVGLIGLRPSLAACLPLLAIPLYYRARLV
GNLSFPLNETLFGISAAGLLLHVIWRWWRGQRPDVAWFKTSWYWPIGAVALGLVLAAGLSLGSSGLVEPATALRELRRTI
IEPAIWACLALLLLATQRVKAQSMLWSYIVMAAWIAGDGLVRFALGEGVWATTGVPRLIGLLPSSTALGVYLGAGLAGSL
ALALSAESAKQRQLAWLLSLPLSLGVLLTFTRGAWLGVVGAVALVLLLQRRWRLLLGAAGLAGVGLAGFGLIQPSLLARV
LRLGEGTGSARQEIWASAWRAVQDQPLLGFGLDQFAQLEPSRYGIPQIRFLTLAHPHNLLLDVWLQLGLLGLLVVLAMLG
WQVWRWWGSKQALGLVGLAILADLVIHGMLDQTMLGGDMIYLWWSLLLISVWRPSATEES

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76603; Mature: 76603

Theoretical pI: Translated: 9.82; Mature: 9.82

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MWKDRCMAQSRQFDRVLALLVLGLSCWTLFLPMPALSNANAPAALVQASLATLDQQAEQR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIAVIAASVLDGERGDFERRGVQLAQLSPEQQSQVRRELAVDIELLAQTSRAAEHERQAL
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAYDTALMGQTRDLGALAEQLRSATWPIVEHLKLYPPPLGTRSDWLAPNSNYFQTRAITI
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
SNGTLEQATQAAIEVGRASYSQRQLRELDQTYRQVLDQYAQTLQQTITSQTNVRPWWRWV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
LASGLALGFAGLLWWVLRAILAKDWLLLAAGVALAAWFGLPWPVASIGLLALVGLIGLRP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SLAACLPLLAIPLYYRARLVGNLSFPLNETLFGISAAGLLLHVIWRWWRGQRPDVAWFKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEC
SWYWPIGAVALGLVLAAGLSLGSSGLVEPATALRELRRTIIEPAIWACLALLLLATQRVK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQSMLWSYIVMAAWIAGDGLVRFALGEGVWATTGVPRLIGLLPSSTALGVYLGAGLAGSL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHH
ALALSAESAKQRQLAWLLSLPLSLGVLLTFTRGAWLGVVGAVALVLLLQRRWRLLLGAAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LAGVGLAGFGLIQPSLLARVLRLGEGTGSARQEIWASAWRAVQDQPLLGFGLDQFAQLEP
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCC
SRYGIPQIRFLTLAHPHNLLLDVWLQLGLLGLLVVLAMLGWQVWRWWGSKQALGLVGLAI
CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LADLVIHGMLDQTMLGGDMIYLWWSLLLISVWRPSATEES
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MWKDRCMAQSRQFDRVLALLVLGLSCWTLFLPMPALSNANAPAALVQASLATLDQQAEQR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIAVIAASVLDGERGDFERRGVQLAQLSPEQQSQVRRELAVDIELLAQTSRAAEHERQAL
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAYDTALMGQTRDLGALAEQLRSATWPIVEHLKLYPPPLGTRSDWLAPNSNYFQTRAITI
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
SNGTLEQATQAAIEVGRASYSQRQLRELDQTYRQVLDQYAQTLQQTITSQTNVRPWWRWV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
LASGLALGFAGLLWWVLRAILAKDWLLLAAGVALAAWFGLPWPVASIGLLALVGLIGLRP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SLAACLPLLAIPLYYRARLVGNLSFPLNETLFGISAAGLLLHVIWRWWRGQRPDVAWFKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEC
SWYWPIGAVALGLVLAAGLSLGSSGLVEPATALRELRRTIIEPAIWACLALLLLATQRVK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQSMLWSYIVMAAWIAGDGLVRFALGEGVWATTGVPRLIGLLPSSTALGVYLGAGLAGSL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHH
ALALSAESAKQRQLAWLLSLPLSLGVLLTFTRGAWLGVVGAVALVLLLQRRWRLLLGAAG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LAGVGLAGFGLIQPSLLARVLRLGEGTGSARQEIWASAWRAVQDQPLLGFGLDQFAQLEP
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCC
SRYGIPQIRFLTLAHPHNLLLDVWLQLGLLGLLVVLAMLGWQVWRWWGSKQALGLVGLAI
CCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
LADLVIHGMLDQTMLGGDMIYLWWSLLLISVWRPSATEES
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA