| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159897983
Identifier: 159897983
GI number: 159897983
Start: 1697229
End: 1701044
Strand: Direct
Name: 159897983
Synonym: Haur_1458
Alternate gene names: NA
Gene position: 1697229-1701044 (Clockwise)
Preceding gene: 159897982
Following gene: 159897987
Centisome position: 26.74
GC content: 52.67
Gene sequence:
>3816_bases ATGCAAGCACGCTGGTTTGCTTATGTGCCGCCGTATCTTGTCCCACGATTGCTTGATCAACGGGCCTCTTCTGCAACCCA AACGACCAAACATGGCCAAGCTGTGGTGCTTTTCGCCGATATCGCGGGCTTTACGCCTCTCAGCGAGGCGCTTGGTCAAC ACGATTCGCATGGAACTGAAACCCTAACCCGCTTATTAAATCGCTGTTTTGCCCCATTAATTGATGTGATCGAGCGCTTT GGCGGCATGATCAGCACATTTGGCGGCGATGCCATTACGGCGTTGTTTCCGATTAATCAGCCGCAACGGACTCAACGGGT CGCTGCTCGCGCTGTTCGTTGTGCCCTCGAAATGCAAAGCCTGATGGAGCAATTGGGCGCAATCGAAATTCAAGCAACCA AATGGCGTTTGACCCTCAAAATTGGGATTGCCGCAGGCCATGTGCTCTATACCACGGTCGGCGATCCGACGAAGCGCTGT GTTGCGGTGGTGGGTGGCTCGGCGTTGTTACGCTCTGCCGAGGCCGAAAATCAGGCTCGTTCTGGCGATGTGATTATTGA TTATGCCTCGTTGGATTGCGAGCAGTTCAAGCGTGAAACGCTCGATCAGCGTTTTGCCAAGGTGCTTGGGCTTGAGCAAA GCGTGCGGGCGCAGCCAATTCGCTGGCCTGAACCAATCACCCCGCATCCACCTGCCCAATTCGATGCCTACTTGCACCCC ACAATTGCCCAACAAGTGCGTGAAGGTCGTACCGCGTTTATCAACGAGCGCCGCTCAGTTACGCTATTGTTTGTCAATTT CGATGCCCCCGATTATGATCGTGATCCATTTGCCGCCGAACGGCTCAACCATTACTTTCGCGAAGTGCTGCGGATCGTCG AGCGCTATGATGGCTATCTGAATAAAGTTGAAATTGGCGATAAAGGTAGTAGCTTTTTGGTGCTGTTTGGTGCACCAGTT GCCCACGAAAATGATAGTGATCGGGCGGCGCACTGTGCCTTAGAGCTTCGCGCCTTACCTGAGTTTGAGGCTCGTATCGG CATCAACACAGGATTTGTCTTTTGTGGCTTGATTGGCTCGGAGCGTCGCCAAGAATATACCGTGATTGGCGATACAGTCA ATTTGGCGGCGCGATTGATGCAGCAAGCTGGTCAAGGCCAAATTTTGCTGACCGAAGCTACCCAAGAAACCCTTAGCTCA ACCTTTTTAACTGCGCCTTTGCCAGCCGTTCGAGTCAAAGGCCGCAGCGAATTGGTCGAGTTACACGAATTAACCGATTT ACGCCAGACGGCGATTCGTGGCCAAGAGCCAATTTATGCTTTGCCAATGGTCGGGCGCAGCCAAGAGTTACAATCTGTCG GCGAATTGCTGAGTCGCATCAAGCAGGGCCATGGCCAAGTGTTGGGGATTACGGGCGAAGCTGGCATGGGCAAATCGCGG CTGGTGGCCGAAATTCGCCGGATTGCGCGGGCGCAACGAGTGGCGGTGTATAGCGGCGAGTGCCTTTCGTATGGCACAAC CATTAGCTATTTGTTGTGGCATAATTTGTGGCGCTCGTTTTTTAATGTTGATCCTGAGTGGCCGCTCGATTTGCAAATGT TGCAGTTGCGGGCGCAATTAGCCCTGATCGATCAAGATTTATTAGATTGGATGCCGCTGCTGGCGAGCGCTCTACGCCTG CCGATTCCCGATCAATCCTTGACCAAATTGCTGGATATTAAGTCGCGCAAGATGCTACTAGAATCGCTGCTGGTGGATTG TTTGCGCTACCGTGCCAATGAAACGCCGTTATTACTGGTGCTCGAAGATTGCCATTGGATCGATTCGCTCTCGAACGATT TGTTGGCGCGAATTACTAAGGCGATTCGCGATGTGCCCGTGCTGATTGTGCTGGCCTATCGACCTTCCGCCGAGCGTGAT CAAACGATGTGGCACGAGTTACGCCAGCTTGAACATTGGCACGAAATCGAATTACAAGAATTTACGCTCGACGAAACTGC TGAATTAGTGCGACTCAAAATCAAACAACTGCTCGGCAATCGCCAAGCACCATCAGAGCAGTTGGTTAGCAAACTGACCG ATCGGGCGCAGGGCAACCCATTTTATATTGAAGAATTGATTAATTTGGTGGTTGAACGCCAGCCCGATTTGAGCGATCCC AAGGCCGTGGCTCAACTGGAGTTGCCCGATAGCTTACACCGCTTGATTATCAGCCGGATCGACCAACTTGAAGAGGCGAC CAAGCATACGCTCAAAGTTGCCAGCGTGATTGGTCGTTTATTCAAAGCCAATTGGCTCTGGGGCGCGTACCCGCAATTGG GCAGTGCCGAGCAAGTTAAGCAGCAACTCAACACTCTGAGCCGCATGGATCTTACGCCACTTGATCGCGATGAGCCTGAG CTTGAATATCTGTTTAAACATGTGGTTACCCAAGAAGTTGCCTACCAAAGCTTGCCATTGGCCACGCGTGCCGCGCTCCA CGAGCAGGTTGGCGATTATTTGGTTGAAACCTATGGTGTGGAAGGTGCTGCCGATTTGTTGGCGCACCACTATGGCATGA GCAATAATCTTGATAAACAGCGCAACTATTTTCGCAAGGCTGGCGATGCGGCGGCGGCACGCTATGCCACCGATGTGGCC TTGAGCTATTACGAACGCTGTTTGCCCTTGCTCGCCGCCCATGAAACCATCGATATTTTCTTTGCAATGGGCGAAATCTA CAAACATACTGGGCGTTGGCACGAGGCCGATGCAATTTATCGGCGTTTGCTGAACCAAGCCCAACAGCAACAGCAACTTT CAGCGTTGGCTCGCGTCTGGTGTGAAATTGCCGATGTCCAAAGCAGTCAAGGTTTGCATAACGATGCACTGCAAAGCATT CAACCAGCCTTGGAATATGCCAAACAAGCCCATGACCAGCCGACCCATTGCAAAATTTTGATGCGCATGAGTTGGATTGC CAGCTATCAAGGCCAATTGCAGCAGGCTTGGCAAACCAGCCATGCGGCGGTGGCGATTGCCCGTGAAGCCAATGATGCCC ATAGTTTGGCTTTGGCACTGAAAACTCATGGCTATATGAATGTGCTGCAAGGCCAATTTGCTCTAGCCGAGCAGCTATTT TCCGAAGGCCTCGCCTTACACCGCCAACTCGGCCAGCGCGAAGATGAAGGGCGCATGTTGAATGTGATGGGCGAGGCTGC TCGTCATCGTGGCGATTTTCAGCATGCCGTCGAGCTATATCAACAAGCCTTGGTCATTGGCCGCGAGTTGCGCAATCCTG AACGGTTAATCATGTTTTTGAGTAATTTGGGCGGCGCATTGGTGGGGCTTGGCACGTATGAAACCGCGATTGCCACCTTG AACGAGGCTTTTGAACTCGCTCGTTCGACCACGTGGTATGGGATCGCGGAAACCTATCGTTTTCGGGCTGAGGCGGCGAT TGGTTTGGGCTATCCTGATGAGGCAATTCGCCATATTATCCAAGCGCATCATGCTGCTCGCGAACGCCAACAAACCCTCG AATTATGCGCGGCACTGCGGGTTTTGGGCAGTGCCTTGAGCCAATTGAATGTGCCAATCCTCTTGCCGCCAAGCTTGCCA ACTACCCCACTAAACTGCTTTGAACAGGCCTTGAGCATGGCCGAAGCTAGTGGTTCGCAAGCTGAAGTTGCGGCGATTCA GCTGGCCTTGGCCGAGCATTGGCAGCGCCAACAACAACCAACCAAAGCCCAAGCGGCTTGGCAGCAAGCCTACACCATCT ATGGTCAATTAGGCATGGATGCGCTGCAACAACGGGTAGCCCAGTGGTTGAGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CTAAAATACTGGCCTCAGCATTTGCGTAGGACTATGGTACGGGCTATACTAGGAGCAAGCGTAATTCGCGCGATGATTTC ACGGGCCTAGGAGTTGCTCC
Downstream 100 bases:
>100_bases CGCAAGCAGATGTTAACTATAACAGCCGAGGTTTTGCCTCGGCTGTTGATTTTTAGCTCCAACATGCCTATTCAGTGCCA TTAGTGAATAAATGTTGGCT
Product: adenylate/guanylate cyclase
Products: 3',5'-cyclic AMP; diphosphate
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1271; Mature: 1271
Protein sequence:
>1271_residues MQARWFAYVPPYLVPRLLDQRASSATQTTKHGQAVVLFADIAGFTPLSEALGQHDSHGTETLTRLLNRCFAPLIDVIERF GGMISTFGGDAITALFPINQPQRTQRVAARAVRCALEMQSLMEQLGAIEIQATKWRLTLKIGIAAGHVLYTTVGDPTKRC VAVVGGSALLRSAEAENQARSGDVIIDYASLDCEQFKRETLDQRFAKVLGLEQSVRAQPIRWPEPITPHPPAQFDAYLHP TIAQQVREGRTAFINERRSVTLLFVNFDAPDYDRDPFAAERLNHYFREVLRIVERYDGYLNKVEIGDKGSSFLVLFGAPV AHENDSDRAAHCALELRALPEFEARIGINTGFVFCGLIGSERRQEYTVIGDTVNLAARLMQQAGQGQILLTEATQETLSS TFLTAPLPAVRVKGRSELVELHELTDLRQTAIRGQEPIYALPMVGRSQELQSVGELLSRIKQGHGQVLGITGEAGMGKSR LVAEIRRIARAQRVAVYSGECLSYGTTISYLLWHNLWRSFFNVDPEWPLDLQMLQLRAQLALIDQDLLDWMPLLASALRL PIPDQSLTKLLDIKSRKMLLESLLVDCLRYRANETPLLLVLEDCHWIDSLSNDLLARITKAIRDVPVLIVLAYRPSAERD QTMWHELRQLEHWHEIELQEFTLDETAELVRLKIKQLLGNRQAPSEQLVSKLTDRAQGNPFYIEELINLVVERQPDLSDP KAVAQLELPDSLHRLIISRIDQLEEATKHTLKVASVIGRLFKANWLWGAYPQLGSAEQVKQQLNTLSRMDLTPLDRDEPE LEYLFKHVVTQEVAYQSLPLATRAALHEQVGDYLVETYGVEGAADLLAHHYGMSNNLDKQRNYFRKAGDAAAARYATDVA LSYYERCLPLLAAHETIDIFFAMGEIYKHTGRWHEADAIYRRLLNQAQQQQQLSALARVWCEIADVQSSQGLHNDALQSI QPALEYAKQAHDQPTHCKILMRMSWIASYQGQLQQAWQTSHAAVAIAREANDAHSLALALKTHGYMNVLQGQFALAEQLF SEGLALHRQLGQREDEGRMLNVMGEAARHRGDFQHAVELYQQALVIGRELRNPERLIMFLSNLGGALVGLGTYETAIATL NEAFELARSTTWYGIAETYRFRAEAAIGLGYPDEAIRHIIQAHHAARERQQTLELCAALRVLGSALSQLNVPILLPPSLP TTPLNCFEQALSMAEASGSQAEVAAIQLALAEHWQRQQQPTKAQAAWQQAYTIYGQLGMDALQQRVAQWLS
Sequences:
>Translated_1271_residues MQARWFAYVPPYLVPRLLDQRASSATQTTKHGQAVVLFADIAGFTPLSEALGQHDSHGTETLTRLLNRCFAPLIDVIERF GGMISTFGGDAITALFPINQPQRTQRVAARAVRCALEMQSLMEQLGAIEIQATKWRLTLKIGIAAGHVLYTTVGDPTKRC VAVVGGSALLRSAEAENQARSGDVIIDYASLDCEQFKRETLDQRFAKVLGLEQSVRAQPIRWPEPITPHPPAQFDAYLHP TIAQQVREGRTAFINERRSVTLLFVNFDAPDYDRDPFAAERLNHYFREVLRIVERYDGYLNKVEIGDKGSSFLVLFGAPV AHENDSDRAAHCALELRALPEFEARIGINTGFVFCGLIGSERRQEYTVIGDTVNLAARLMQQAGQGQILLTEATQETLSS TFLTAPLPAVRVKGRSELVELHELTDLRQTAIRGQEPIYALPMVGRSQELQSVGELLSRIKQGHGQVLGITGEAGMGKSR LVAEIRRIARAQRVAVYSGECLSYGTTISYLLWHNLWRSFFNVDPEWPLDLQMLQLRAQLALIDQDLLDWMPLLASALRL PIPDQSLTKLLDIKSRKMLLESLLVDCLRYRANETPLLLVLEDCHWIDSLSNDLLARITKAIRDVPVLIVLAYRPSAERD QTMWHELRQLEHWHEIELQEFTLDETAELVRLKIKQLLGNRQAPSEQLVSKLTDRAQGNPFYIEELINLVVERQPDLSDP KAVAQLELPDSLHRLIISRIDQLEEATKHTLKVASVIGRLFKANWLWGAYPQLGSAEQVKQQLNTLSRMDLTPLDRDEPE LEYLFKHVVTQEVAYQSLPLATRAALHEQVGDYLVETYGVEGAADLLAHHYGMSNNLDKQRNYFRKAGDAAAARYATDVA LSYYERCLPLLAAHETIDIFFAMGEIYKHTGRWHEADAIYRRLLNQAQQQQQLSALARVWCEIADVQSSQGLHNDALQSI QPALEYAKQAHDQPTHCKILMRMSWIASYQGQLQQAWQTSHAAVAIAREANDAHSLALALKTHGYMNVLQGQFALAEQLF SEGLALHRQLGQREDEGRMLNVMGEAARHRGDFQHAVELYQQALVIGRELRNPERLIMFLSNLGGALVGLGTYETAIATL NEAFELARSTTWYGIAETYRFRAEAAIGLGYPDEAIRHIIQAHHAARERQQTLELCAALRVLGSALSQLNVPILLPPSLP TTPLNCFEQALSMAEASGSQAEVAAIQLALAEHWQRQQQPTKAQAAWQQAYTIYGQLGMDALQQRVAQWLS >Mature_1271_residues MQARWFAYVPPYLVPRLLDQRASSATQTTKHGQAVVLFADIAGFTPLSEALGQHDSHGTETLTRLLNRCFAPLIDVIERF GGMISTFGGDAITALFPINQPQRTQRVAARAVRCALEMQSLMEQLGAIEIQATKWRLTLKIGIAAGHVLYTTVGDPTKRC VAVVGGSALLRSAEAENQARSGDVIIDYASLDCEQFKRETLDQRFAKVLGLEQSVRAQPIRWPEPITPHPPAQFDAYLHP TIAQQVREGRTAFINERRSVTLLFVNFDAPDYDRDPFAAERLNHYFREVLRIVERYDGYLNKVEIGDKGSSFLVLFGAPV AHENDSDRAAHCALELRALPEFEARIGINTGFVFCGLIGSERRQEYTVIGDTVNLAARLMQQAGQGQILLTEATQETLSS TFLTAPLPAVRVKGRSELVELHELTDLRQTAIRGQEPIYALPMVGRSQELQSVGELLSRIKQGHGQVLGITGEAGMGKSR LVAEIRRIARAQRVAVYSGECLSYGTTISYLLWHNLWRSFFNVDPEWPLDLQMLQLRAQLALIDQDLLDWMPLLASALRL PIPDQSLTKLLDIKSRKMLLESLLVDCLRYRANETPLLLVLEDCHWIDSLSNDLLARITKAIRDVPVLIVLAYRPSAERD QTMWHELRQLEHWHEIELQEFTLDETAELVRLKIKQLLGNRQAPSEQLVSKLTDRAQGNPFYIEELINLVVERQPDLSDP KAVAQLELPDSLHRLIISRIDQLEEATKHTLKVASVIGRLFKANWLWGAYPQLGSAEQVKQQLNTLSRMDLTPLDRDEPE LEYLFKHVVTQEVAYQSLPLATRAALHEQVGDYLVETYGVEGAADLLAHHYGMSNNLDKQRNYFRKAGDAAAARYATDVA LSYYERCLPLLAAHETIDIFFAMGEIYKHTGRWHEADAIYRRLLNQAQQQQQLSALARVWCEIADVQSSQGLHNDALQSI QPALEYAKQAHDQPTHCKILMRMSWIASYQGQLQQAWQTSHAAVAIAREANDAHSLALALKTHGYMNVLQGQFALAEQLF SEGLALHRQLGQREDEGRMLNVMGEAARHRGDFQHAVELYQQALVIGRELRNPERLIMFLSNLGGALVGLGTYETAIATL NEAFELARSTTWYGIAETYRFRAEAAIGLGYPDEAIRHIIQAHHAARERQQTLELCAALRVLGSALSQLNVPILLPPSLP TTPLNCFEQALSMAEASGSQAEVAAIQLALAEHWQRQQQPTKAQAAWQQAYTIYGQLGMDALQQRVAQWLS
Specific function: Unknown
COG id: COG3899
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 guanylate cyclase domain [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI209976994, Length=889, Percent_Identity=23.1721034870641, Blast_Score=181, Evalue=5e-45, Organism=Homo sapiens, GI268370055, Length=668, Percent_Identity=22.1556886227545, Blast_Score=121, Evalue=4e-27,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001054 - InterPro: IPR011579 [H]
Pfam domain/function: PF01637 Arch_ATPase; PF00211 Guanylate_cyc [H]
EC number: 4.6.1.1
Molecular weight: Translated: 142669; Mature: 142669
Theoretical pI: Translated: 6.30; Mature: 6.30
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION ; PS50125 GUANYLATE_CYCLASES_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQARWFAYVPPYLVPRLLDQRASSATQTTKHGQAVVLFADIAGFTPLSEALGQHDSHGTE CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCHH TLTRLLNRCFAPLIDVIERFGGMISTFGGDAITALFPINQPQRTQRVAARAVRCALEMQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMEQLGAIEIQATKWRLTLKIGIAAGHVLYTTVGDPTKRCVAVVGGSALLRSAEAENQAR HHHHHCCEEEEEEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCC SGDVIIDYASLDCEQFKRETLDQRFAKVLGLEQSVRAQPIRWPEPITPHPPAQFDAYLHP CCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH TIAQQVREGRTAFINERRSVTLLFVNFDAPDYDRDPFAAERLNHYFREVLRIVERYDGYL HHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NKVEIGDKGSSFLVLFGAPVAHENDSDRAAHCALELRALPEFEARIGINTGFVFCGLIGS CEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHEEEHHCC ERRQEYTVIGDTVNLAARLMQQAGQGQILLTEATQETLSSTFLTAPLPAVRVKGRSELVE CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEECCHHHHHH LHELTDLRQTAIRGQEPIYALPMVGRSQELQSVGELLSRIKQGHGQVLGITGEAGMGKSR 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP
Specific reaction: ATP = 3',5'-cyclic AMP + diphosphate
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11481430 [H]