| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159896577
Identifier: 159896577
GI number: 159896577
Start: 53702
End: 57784
Strand: Direct
Name: 159896577
Synonym: Haur_0044
Alternate gene names: NA
Gene position: 53702-57784 (Clockwise)
Preceding gene: 159896574
Following gene: 159896578
Centisome position: 0.85
GC content: 50.87
Gene sequence:
>4083_bases ATGTCGATTCAGCCCCCATCGTCAGAATTTGCCTCATTGTTGCGTCAAGTTCAACAGGCCGAGGTAATGCCCACCCAAAC GCAGCTCGATGATGTGTATCGTCAGCTTGACCAACGGATTCAGCAATTGCAGCGCTACGTGCCCGACCCAATTGTGCAGC GCTTAAAACACGGCGAGTTGCCCATTCCCTATGGCGAACGTTGGTTAGGCTCGTTGCTCTTTGCCGATCTTTCGGGCTTT ACTGCGCTTTCCGAGAGCCTAACCCGTTTGGGCAAAGAGGGAGCCGAGCAAGTAACCAGCATTATCAACCGCTTGTTTAA TCAGTTGGTAGCTGATATCGAGGCTCATGGCGGTGCATTAATCAAATTTGGCGGCGATGCAGTCACCGCCTTTTTTGATC AAACCAAACTTGGCGAGCAGCATGCCTTGTATGCCGCCCACGCTGCCCAAGCTATGCAAACATCAATGGCAACCTTAGGC AAAATCCAGATTCGGGCTGGTCAATTTAATCTCACTTTGCGCATTGGCGTGCATAGCGGCGAGGCTTTTGCTGCTTTGCT GGGCGATCAACAGCATGCCGAGTTGATGCTGACTGGCATTGCGGTTAACTTGGTGGCGCGTGCTCAAGAGTTGGCGCGAC CTGGCGAGGTGGTTTGTTCCAAAGAAACCATGCGGTTGCTAGGCTTGCCGACCGATCCCATGAATCCATTTACGGCCTTA ACTACTGCGCTTGAACATCCGCCCTATCAATCAACCAGTCAAGCGCCAAGTATCCCGCAAACTATCACTTTAGCCGATGT TCAAGCCCTTGCCAGCATCTATGCAGGCATTCAGCGTTTGCTGCCCCAACGCATGAGCGAAGAACAACTGCTCAGCAACG CCGCCAGCAGAACTGGTGAAATTCGGCTGGTCACAATTGTTTTTGCCCATATTGCTCCCTTCAGCACGATTGTTGAATTG TGCAATGATGCTAGCGCAACTCAATTGCTCAACCACTACTACCAACGCATGCAGCAAATCGTCAATCACTATGGCGGGGT GGTCAATAAGCTCGATATGGCTGCCGATGGCGATAAATTGCTGGCGATCTTTGGCGCACCGATTGCCAACGAAAATGATA CTGAGTTGGCAGTACGAACTGGCCTTGATATGCAATCGGCCATGAACGAAATTAATGCCTTGATTCAGCAGCACGACCCA CGTTTGCCCTTGCTTGACCAACAAATTGGAATCAATCAAGGCCATGTGTTTGCGGGCATTGTCGGCAGCGAAACCCGTCG CGAATATACCGTGATGGGTGATCCAGTCAATACTGCTGTGCGTTTGATGAGCGTTTGTCGCTATGGCGAAGTGCTGGCCA GCCCCACGATCAAGCGGCTTACCAGTCATGCCTTTGCCTACGAAACCCTGCCAGCCTTACCACTCAAAGGCAAAAGCCAA CCAATCGAGCCAGCGCGGGTCGATCGGGCCTACAATGTGCGCCGCGAAACCATGCGAGCCGATTTGGTTGGGCGGGTGCA AGAACTCGAACAATTAGCCACAATCAGCATTCAAGCGCTGCAAGGCCAAGGCCAAATTATCAATATCTTCGGTGAGGCCG GCATTGGCAAATCGCGCTTGCTCGAAGAGTTGCTCAGCCGTTTGTCGTTGGCTTCGTTCGACCCAAACTTGAACGTGCCC GAATTTATGCCAATTACGATTGAATGCCAGTTGTATGAGCAAACGACTCCATTTGCTTCAGCCAGCGAAGTCTTGCGCCA AGTATTGCGCTTGAGCAGCAGCCTGAATGGCGAACGCTTGGTGCAAGTCATCAGCCAACGAGTCAATCGGCTTGTGCCCG AGCTAGAGCGCTTTTTGCCCTTGCTCAGCGATATTTTGCATGTAAGTTTGGATGAAAACGAACTAACCCAAGCCCTAGCG CCCGAACAACGCCATGATCAAACGATTGAATTGGTAGTAGCCTTGATGTTAGCCACTGCCAACACCACGCCACTGGTGAT TTTATGGGATGATGCCCACTGGATCGATGCCTCATCGCGCCAATTGCTTGAACGTTTGGCCAAGCATGCGGATCAGGCCG CGATCGCCTTACTGATTGGTTCGCGCACCAAGGGCTTAAGTGCCATGACGTGGCCTGAGCAAACAGTGCATCTTGAGTTA AGCGAATTGAGCATGCCCGAAAGCGAAGCCCTTGCCAGCGCGATTATTGGCCATGCACCGTTGCCAGCAGCCTTGCTCGA ACGCTGGCGACGCAGCGACGAACGCTTTTTCAACCCACAGGGCAATCCATTTTTTATCGAAGAAATGATGCGTAGCTTGA TTCAACAAGGTGTGATTGTTGAAACTGCGGCGGGCTGGGATTTACGTGGCGAACTCGATAGCTTGCCAACCACGATTGAA GGCGTGATCACCGCACGCTTGGATCGGCTGGATAATCGGATTCGCGAAACGGTGCAAGTTGCTTCAGTGGTTGGGCGACG CTTTGAACTGAATATTTTGCGGGGCATTACCAACGACGACGATTTAGTTAATCAAATGGATCGCTTGACCAATGCTGATG TGGTGTTGCCCGACCATATTGCTGCCGAACTAGCTTATTTATTCAAACATACATTAACTCGCGATGTGGCCTACGAAGGC ATTTTGTATGCCCGCCGCCGTGAGTTACATCGACGCGTAGCTGCGCGGATTCAAGAAGTGCATCGCCAAAATCTAGTTGA TGTTCTGCCGATTTTGGCTCGCCACTATGCCCGTGCAGAGGATTGGCACGAAGCAGTACGCTATTATCGCGAAGCTGGCA TCGCCTCGCAAAAACGTTATTACAATGCCGAAGCCTGCGCCCATTATCGTGATGCCCTTGAGCTATTGCCAAATCTGAGC GCCTTTGATCGCTCGTTGGAGCAAGAACTAACTGAACGCTTGGGCTATGTAATGATGCAAGCTGGTGATTATGCTGAAGC CCTGCCAATTCTCGCTCAAGCCCAAATTCAATTACGCCAAAGCAGCGTTTATAGCAGTAGCCGCGAAGCACGGATTTTGC GCCATATCACCACAATTTACGAGCGGCGCGGCGAATACGAACCAGCCTTCGAGCATCTGCAACAAGCACTCAATTTGTTA GGCGAAAGTCAATCGGCGGAGCGAGTACGGGCCTTGTTGCTTGGCTCAGGGCTGCATCAACGCCAAGGTCGTTATCATGA AACAATTACCTGGGCCGAGCAAGCCTTAGCCATTGCCGAACAATTAAATGCCCAACCAGAACAAGCCCGTGCCTATTTGC TAATTGGCGGAACCCATCGCGTGCTTGGCTCGCGTGAGCAGGCCGTCGGCTATTTGGCCAAATCGATCGAGCTGTATCAG GCGGTCAACGACATTTCGCGTTTGGCCGATGCCTACAACAATGCCGCGATCAACTTTAGCGATCTTGAACAATGGGAGGA ATCAATCGCCTTATATCAGGCTGCCTTGAACATCAAAAAGACCATCAACGATAGTTATGGTCAAGCGCTCGTTAGCCTCA ACCTTGGTGAGTTATATCGCAAGACTCAGCAATTTGACCAAGCTTTAGAGACCTTCAACCAAAGTTTACAGCTTTGGAAC AAGCTTAACTCCAAACTTGGAGCCGCCGTCACCCAGATGAATATGGGCAACACGCTGTTTGCTCAAGGCCAAAGCGCCAC CGCTGAATCCATGCTCGATCGCAGCCGCGCTATTTTTGATGAAATCCATGTCGATTCATTTTTACCCGAGCTGTATCGGA TTTATGCTGAACTTTTTTATAGCCGCCACAACTATGCCAAAGCTTTAGATTATTGTGATTTTGCCTTGGAACAGGCTCGC CAACATTCAGCCAAAGCCGATGAAGGCCTCGCCCAACTGACTCAAAGTAAGATTCTGCTGGCCTTAGACCATTATGATCC AGCTCTACATGCTGCGGAACAAGCACTCAAGTTGTTGCAAGAATGCGATAACCAAGCTGATGTTGAACGCTGTTTGGAGC AACTGATCGCTCTGACCCAGACTAACGATCCGCAACGCATGGCTGATTATCAGAATCAACTAGACCAGTTAACCAAGGCT TAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GATAAGAAATACCTGCTAGAGTCCCGTTGTTTTGTTGCCAGAACCCTCTATAATGCATTTGACAGTGATTGATGCTTGAT ACTTTGCTAAGGTTTATACC
Downstream 100 bases:
>100_bases CAACAGATTTTCGCGATGGAGGGTTTATGCGTCGTTTCAGTAAAGTCCGCTTACTGGGAATATGTGTTTTGCTGCTAAGT TTGACGGCTTATCAGCGAAC
Product: TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase
Products: 3',5'-cyclic AMP; diphosphate
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1360; Mature: 1359
Protein sequence:
>1360_residues MSIQPPSSEFASLLRQVQQAEVMPTQTQLDDVYRQLDQRIQQLQRYVPDPIVQRLKHGELPIPYGERWLGSLLFADLSGF TALSESLTRLGKEGAEQVTSIINRLFNQLVADIEAHGGALIKFGGDAVTAFFDQTKLGEQHALYAAHAAQAMQTSMATLG KIQIRAGQFNLTLRIGVHSGEAFAALLGDQQHAELMLTGIAVNLVARAQELARPGEVVCSKETMRLLGLPTDPMNPFTAL TTALEHPPYQSTSQAPSIPQTITLADVQALASIYAGIQRLLPQRMSEEQLLSNAASRTGEIRLVTIVFAHIAPFSTIVEL CNDASATQLLNHYYQRMQQIVNHYGGVVNKLDMAADGDKLLAIFGAPIANENDTELAVRTGLDMQSAMNEINALIQQHDP RLPLLDQQIGINQGHVFAGIVGSETRREYTVMGDPVNTAVRLMSVCRYGEVLASPTIKRLTSHAFAYETLPALPLKGKSQ PIEPARVDRAYNVRRETMRADLVGRVQELEQLATISIQALQGQGQIINIFGEAGIGKSRLLEELLSRLSLASFDPNLNVP EFMPITIECQLYEQTTPFASASEVLRQVLRLSSSLNGERLVQVISQRVNRLVPELERFLPLLSDILHVSLDENELTQALA PEQRHDQTIELVVALMLATANTTPLVILWDDAHWIDASSRQLLERLAKHADQAAIALLIGSRTKGLSAMTWPEQTVHLEL SELSMPESEALASAIIGHAPLPAALLERWRRSDERFFNPQGNPFFIEEMMRSLIQQGVIVETAAGWDLRGELDSLPTTIE GVITARLDRLDNRIRETVQVASVVGRRFELNILRGITNDDDLVNQMDRLTNADVVLPDHIAAELAYLFKHTLTRDVAYEG ILYARRRELHRRVAARIQEVHRQNLVDVLPILARHYARAEDWHEAVRYYREAGIASQKRYYNAEACAHYRDALELLPNLS AFDRSLEQELTERLGYVMMQAGDYAEALPILAQAQIQLRQSSVYSSSREARILRHITTIYERRGEYEPAFEHLQQALNLL GESQSAERVRALLLGSGLHQRQGRYHETITWAEQALAIAEQLNAQPEQARAYLLIGGTHRVLGSREQAVGYLAKSIELYQ AVNDISRLADAYNNAAINFSDLEQWEESIALYQAALNIKKTINDSYGQALVSLNLGELYRKTQQFDQALETFNQSLQLWN KLNSKLGAAVTQMNMGNTLFAQGQSATAESMLDRSRAIFDEIHVDSFLPELYRIYAELFYSRHNYAKALDYCDFALEQAR QHSAKADEGLAQLTQSKILLALDHYDPALHAAEQALKLLQECDNQADVERCLEQLIALTQTNDPQRMADYQNQLDQLTKA
Sequences:
>Translated_1360_residues MSIQPPSSEFASLLRQVQQAEVMPTQTQLDDVYRQLDQRIQQLQRYVPDPIVQRLKHGELPIPYGERWLGSLLFADLSGF TALSESLTRLGKEGAEQVTSIINRLFNQLVADIEAHGGALIKFGGDAVTAFFDQTKLGEQHALYAAHAAQAMQTSMATLG KIQIRAGQFNLTLRIGVHSGEAFAALLGDQQHAELMLTGIAVNLVARAQELARPGEVVCSKETMRLLGLPTDPMNPFTAL TTALEHPPYQSTSQAPSIPQTITLADVQALASIYAGIQRLLPQRMSEEQLLSNAASRTGEIRLVTIVFAHIAPFSTIVEL CNDASATQLLNHYYQRMQQIVNHYGGVVNKLDMAADGDKLLAIFGAPIANENDTELAVRTGLDMQSAMNEINALIQQHDP RLPLLDQQIGINQGHVFAGIVGSETRREYTVMGDPVNTAVRLMSVCRYGEVLASPTIKRLTSHAFAYETLPALPLKGKSQ PIEPARVDRAYNVRRETMRADLVGRVQELEQLATISIQALQGQGQIINIFGEAGIGKSRLLEELLSRLSLASFDPNLNVP EFMPITIECQLYEQTTPFASASEVLRQVLRLSSSLNGERLVQVISQRVNRLVPELERFLPLLSDILHVSLDENELTQALA PEQRHDQTIELVVALMLATANTTPLVILWDDAHWIDASSRQLLERLAKHADQAAIALLIGSRTKGLSAMTWPEQTVHLEL SELSMPESEALASAIIGHAPLPAALLERWRRSDERFFNPQGNPFFIEEMMRSLIQQGVIVETAAGWDLRGELDSLPTTIE GVITARLDRLDNRIRETVQVASVVGRRFELNILRGITNDDDLVNQMDRLTNADVVLPDHIAAELAYLFKHTLTRDVAYEG ILYARRRELHRRVAARIQEVHRQNLVDVLPILARHYARAEDWHEAVRYYREAGIASQKRYYNAEACAHYRDALELLPNLS AFDRSLEQELTERLGYVMMQAGDYAEALPILAQAQIQLRQSSVYSSSREARILRHITTIYERRGEYEPAFEHLQQALNLL GESQSAERVRALLLGSGLHQRQGRYHETITWAEQALAIAEQLNAQPEQARAYLLIGGTHRVLGSREQAVGYLAKSIELYQ AVNDISRLADAYNNAAINFSDLEQWEESIALYQAALNIKKTINDSYGQALVSLNLGELYRKTQQFDQALETFNQSLQLWN KLNSKLGAAVTQMNMGNTLFAQGQSATAESMLDRSRAIFDEIHVDSFLPELYRIYAELFYSRHNYAKALDYCDFALEQAR QHSAKADEGLAQLTQSKILLALDHYDPALHAAEQALKLLQECDNQADVERCLEQLIALTQTNDPQRMADYQNQLDQLTKA >Mature_1359_residues SIQPPSSEFASLLRQVQQAEVMPTQTQLDDVYRQLDQRIQQLQRYVPDPIVQRLKHGELPIPYGERWLGSLLFADLSGFT ALSESLTRLGKEGAEQVTSIINRLFNQLVADIEAHGGALIKFGGDAVTAFFDQTKLGEQHALYAAHAAQAMQTSMATLGK IQIRAGQFNLTLRIGVHSGEAFAALLGDQQHAELMLTGIAVNLVARAQELARPGEVVCSKETMRLLGLPTDPMNPFTALT TALEHPPYQSTSQAPSIPQTITLADVQALASIYAGIQRLLPQRMSEEQLLSNAASRTGEIRLVTIVFAHIAPFSTIVELC NDASATQLLNHYYQRMQQIVNHYGGVVNKLDMAADGDKLLAIFGAPIANENDTELAVRTGLDMQSAMNEINALIQQHDPR LPLLDQQIGINQGHVFAGIVGSETRREYTVMGDPVNTAVRLMSVCRYGEVLASPTIKRLTSHAFAYETLPALPLKGKSQP IEPARVDRAYNVRRETMRADLVGRVQELEQLATISIQALQGQGQIINIFGEAGIGKSRLLEELLSRLSLASFDPNLNVPE FMPITIECQLYEQTTPFASASEVLRQVLRLSSSLNGERLVQVISQRVNRLVPELERFLPLLSDILHVSLDENELTQALAP EQRHDQTIELVVALMLATANTTPLVILWDDAHWIDASSRQLLERLAKHADQAAIALLIGSRTKGLSAMTWPEQTVHLELS ELSMPESEALASAIIGHAPLPAALLERWRRSDERFFNPQGNPFFIEEMMRSLIQQGVIVETAAGWDLRGELDSLPTTIEG VITARLDRLDNRIRETVQVASVVGRRFELNILRGITNDDDLVNQMDRLTNADVVLPDHIAAELAYLFKHTLTRDVAYEGI LYARRRELHRRVAARIQEVHRQNLVDVLPILARHYARAEDWHEAVRYYREAGIASQKRYYNAEACAHYRDALELLPNLSA FDRSLEQELTERLGYVMMQAGDYAEALPILAQAQIQLRQSSVYSSSREARILRHITTIYERRGEYEPAFEHLQQALNLLG ESQSAERVRALLLGSGLHQRQGRYHETITWAEQALAIAEQLNAQPEQARAYLLIGGTHRVLGSREQAVGYLAKSIELYQA VNDISRLADAYNNAAINFSDLEQWEESIALYQAALNIKKTINDSYGQALVSLNLGELYRKTQQFDQALETFNQSLQLWNK LNSKLGAAVTQMNMGNTLFAQGQSATAESMLDRSRAIFDEIHVDSFLPELYRIYAELFYSRHNYAKALDYCDFALEQARQ HSAKADEGLAQLTQSKILLALDHYDPALHAAEQALKLLQECDNQADVERCLEQLIALTQTNDPQRMADYQNQLDQLTKA
Specific function: Unknown
COG id: COG3899
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 guanylate cyclase domain [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI209976994, Length=691, Percent_Identity=23.1548480463097, Blast_Score=139, Evalue=2e-32, Organism=Homo sapiens, GI268370055, Length=541, Percent_Identity=21.996303142329, Blast_Score=92, Evalue=3e-18, Organism=Homo sapiens, GI224028289, Length=401, Percent_Identity=25.4364089775561, Blast_Score=82, Evalue=5e-15, Organism=Caenorhabditis elegans, GI212645052, Length=206, Percent_Identity=30.5825242718447, Blast_Score=72, Evalue=2e-12, Organism=Drosophila melanogaster, GI161078020, Length=204, Percent_Identity=29.4117647058824, Blast_Score=70, Evalue=1e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001054 - InterPro: IPR011579 [H]
Pfam domain/function: PF01637 Arch_ATPase; PF00211 Guanylate_cyc [H]
EC number: 4.6.1.1
Molecular weight: Translated: 152064; Mature: 151933
Theoretical pI: Translated: 5.27; Mature: 5.27
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION ; PS50125 GUANYLATE_CYCLASES_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSIQPPSSEFASLLRQVQQAEVMPTQTQLDDVYRQLDQRIQQLQRYVPDPIVQRLKHGEL CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC PIPYGERWLGSLLFADLSGFTALSESLTRLGKEGAEQVTSIINRLFNQLVADIEAHGGAL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE IKFGGDAVTAFFDQTKLGEQHALYAAHAAQAMQTSMATLGKIQIRAGQFNLTLRIGVHSG EEECCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECEEEEEEEEEECCC EAFAALLGDQQHAELMLTGIAVNLVARAQELARPGEVVCSKETMRLLGLPTDPMNPFTAL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH TTALEHPPYQSTSQAPSIPQTITLADVQALASIYAGIQRLLPQRMSEEQLLSNAASRTGE HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCC IRLVTIVFAHIAPFSTIVELCNDASATQLLNHYYQRMQQIVNHYGGVVNKLDMAADGDKL EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCE LAIFGAPIANENDTELAVRTGLDMQSAMNEINALIQQHDPRLPLLDQQIGINQGHVFAGI EEEECCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCCCCCEEEEE VGSETRREYTVMGDPVNTAVRLMSVCRYGEVLASPTIKRLTSHAFAYETLPALPLKGKSQ 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP
Specific reaction: ATP = 3',5'-cyclic AMP + diphosphate
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11481430 [H]