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The map label for this gene is ybdA [C]

Identifier: 15927091

GI number: 15927091

Start: 1549029

End: 1550246

Strand: Reverse

Name: ybdA [C]

Synonym: SA1341

Alternate gene names: 15927091

Gene position: 1550246-1549029 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15927092

Following gene: 15927090

Centisome position: 55.07

GC content: 28.41

Gene sequence:

>1218_bases
ATGTCATATACTTCTGTATTGTTTAATAAGAACTTTACTTTTTATTTAATAGGGATAGCTTTTTCTAACATGGGCAGTGC
TTTTACTACGTTTGTTTTTCCATTAATGATTTTAAAGCTTACTGGATCTGCATTTCAAGTTGGCATAGTTTCTGCACTAA
GTTTTATACCTTATGCAATTTTAGGATTGCCAGCTGGTGCTTTAATTGACAGATTGAATAAGAAGACCATAATGAAATGT
GCTGATATAATTAGGTTCGTTTCATATTTAAGTATACCAGTATTAAGTTTTTTCAATATGTTAAGCATCTTTCAAATTTA
TGTAGTTGCAATCATTTCAGGTATTGGATTAGTATTTCACAGTATTTCTGAGGTTTCGATAATCCCAAGTATTGTAAAAG
AAGAAGATTTGGCGAGCGCAAACAGTTATATATACGCTACTCAAAATGTTTCGGAATTTTTGGGCCCTATAATTGGAGGT
TTACTTTATACATATATGGGATATTCAATATTGATTTTTATAGATTCTATGACTTTTTTACTCTCATTTTTCAGTTTGAT
ATTAATTAAAATTGAAACAAAGAGTATATTCAATCAAGAAAAGTTGAGTGGAAAAAATTTTTTGAGCGATGTTAAAGTTG
GATTTGATTATCTATTATCTAATTCAACTATTAGAGTAATGGCTGTTGTTGTAAGTTTATCCAATCTAATTATCTCACCT
TATTATATTTATATAGTAATGTTTGTAAAGGAAGACATGAATCAATCATCTCAAGCATTGGGGTTAGTTTTAGGTATCTC
ATCATTAGGTGCGCTAATCGGTTCATTATCTGCAAGTTTTCTCTTGAAATTATTTAATTTCGGAAAACTAATTGTAATTA
TATTATTTTTAGATACAATTTTTAGATTAATGTTACCATTTAGTACTTATATTTTTATACTCATCCCACTTTTAGGGTTG
ACATATATGACACAATCCATTTTAAATATAGCGATAATCACACTGAGGCAAAAGAAATGTTCAGAAAATATGTTAGGACG
TGTTAATAGTGTTTTTAAAACAATGGTTTTTGCATTCAGACCTATAGGCCTTTTTTTAGGCGGTATATTACTTGAAAATA
AAGGTGGATTTTATGCACTTACGATCAGTGCTGTGTTATTTATACCATTAGTGTTATATATACTGAAAAATAGATTTTAT
CAAGTTGAAGAATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGACGTTTTACTTACATACTATTAAGATAGCATTAGTAAATAATTTTAATATTTCGATAAATAGATTACGTTTTATTATT
TGATGAATAAGAGGGATAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGAAAATTAATAAAAATGGCTGCTATGTCAAATTGGACTGATGAATTCAATATAGGAAGTTAGGCAACTAAACATTGT
ATAACTTTCTTTTTAGTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Permease; Macrolide-Efflux Protein; Facilitator Superfamily Permease; H+ Antiporter Protein; Non-Ribosomal Peptide Synthetase-Like Protein; Facilitator Superfamily Transporter; Facilitator MFS1 Protein; Export Protein; Amino Acid Adenylation Domain Protein; MFS Family Permease; Spectinomycin-Efflux Protein; MFS-Type Transporter YfiS; Transporter Facilitator Family; Arabinose Efflux Permease Family Protein; Facilitator Superfamily Transporter Permease; ABC Transporter Permease; Facilitator Family Transporter; Multidrug ABC Transporter; Multidrug-Efflux Transporter; LOW QUALITY PROTEIN Protein; MFS Superfamily Transporter; Glucose-Dependent Multidrug Resistance Protein

Number of amino acids: Translated: 405; Mature: 404

Protein sequence:

>405_residues
MSYTSVLFNKNFTFYLIGIAFSNMGSAFTTFVFPLMILKLTGSAFQVGIVSALSFIPYAILGLPAGALIDRLNKKTIMKC
ADIIRFVSYLSIPVLSFFNMLSIFQIYVVAIISGIGLVFHSISEVSIIPSIVKEEDLASANSYIYATQNVSEFLGPIIGG
LLYTYMGYSILIFIDSMTFLLSFFSLILIKIETKSIFNQEKLSGKNFLSDVKVGFDYLLSNSTIRVMAVVVSLSNLIISP
YYIYIVMFVKEDMNQSSQALGLVLGISSLGALIGSLSASFLLKLFNFGKLIVIILFLDTIFRLMLPFSTYIFILIPLLGL
TYMTQSILNIAIITLRQKKCSENMLGRVNSVFKTMVFAFRPIGLFLGGILLENKGGFYALTISAVLFIPLVLYILKNRFY
QVEEY

Sequences:

>Translated_405_residues
MSYTSVLFNKNFTFYLIGIAFSNMGSAFTTFVFPLMILKLTGSAFQVGIVSALSFIPYAILGLPAGALIDRLNKKTIMKC
ADIIRFVSYLSIPVLSFFNMLSIFQIYVVAIISGIGLVFHSISEVSIIPSIVKEEDLASANSYIYATQNVSEFLGPIIGG
LLYTYMGYSILIFIDSMTFLLSFFSLILIKIETKSIFNQEKLSGKNFLSDVKVGFDYLLSNSTIRVMAVVVSLSNLIISP
YYIYIVMFVKEDMNQSSQALGLVLGISSLGALIGSLSASFLLKLFNFGKLIVIILFLDTIFRLMLPFSTYIFILIPLLGL
TYMTQSILNIAIITLRQKKCSENMLGRVNSVFKTMVFAFRPIGLFLGGILLENKGGFYALTISAVLFIPLVLYILKNRFY
QVEEY
>Mature_404_residues
SYTSVLFNKNFTFYLIGIAFSNMGSAFTTFVFPLMILKLTGSAFQVGIVSALSFIPYAILGLPAGALIDRLNKKTIMKCA
DIIRFVSYLSIPVLSFFNMLSIFQIYVVAIISGIGLVFHSISEVSIIPSIVKEEDLASANSYIYATQNVSEFLGPIIGGL
LYTYMGYSILIFIDSMTFLLSFFSLILIKIETKSIFNQEKLSGKNFLSDVKVGFDYLLSNSTIRVMAVVVSLSNLIISPY
YIYIVMFVKEDMNQSSQALGLVLGISSLGALIGSLSASFLLKLFNFGKLIVIILFLDTIFRLMLPFSTYIFILIPLLGLT
YMTQSILNIAIITLRQKKCSENMLGRVNSVFKTMVFAFRPIGLFLGGILLENKGGFYALTISAVLFIPLVLYILKNRFYQ
VEEY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45128; Mature: 44997

Theoretical pI: Translated: 9.54; Mature: 9.54

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCC
>Mature Secondary Structure 
SYTSVLFNKNFTFYLIGIAFSNMGSAFTTFVFPLMILKLTGSAFQVGIVSALSFIPYAI
CCHHEEECCCCEEEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGLPAGALIDRLNKKTIMKCADIIRFVSYLSIPVLSFFNMLSIFQIYVVAIISGIGLVFH
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SISEVSIIPSIVKEEDLASANSYIYATQNVSEFLGPIIGGLLYTYMGYSILIFIDSMTFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFFSLILIKIETKSIFNQEKLSGKNFLSDVKVGFDYLLSNSTIRVMAVVVSLSNLIISP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYIYIVMFVKEDMNQSSQALGLVLGISSLGALIGSLSASFLLKLFNFGKLIVIILFLDTI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
FRLMLPFSTYIFILIPLLGLTYMTQSILNIAIITLRQKKCSENMLGRVNSVFKTMVFAFR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PIGLFLGGILLENKGGFYALTISAVLFIPLVLYILKNRFYQVEEY
HHHHHHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA