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The map label for this gene is ydfJ [H]

Identifier: 15925542

GI number: 15925542

Start: 2696247

End: 2698736

Strand: Reverse

Name: ydfJ [H]

Synonym: SAV2552

Alternate gene names: 15925542

Gene position: 2698736-2696247 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15925544

Following gene: 15925541

Centisome position: 93.75

GC content: 33.94

Gene sequence:

>2490_bases
TTGGCAAAATTTTTATATAAGATGGGGACATTCATCGCAAAACATAAATGGTCCGCGGTCATTGCATGGATAGTGATTGT
AGCTGCAATATTGATACCACTTGCTACAAATGCACCGAAATTTGACAATGATATTAAAATGACAGGATTAGAGTCGTTAG
ATACGAATAAAAAGATTGAAAAACATTTTAATCAAGATAGTGAAAAGGCACAAATACGTGTTGTCTTTAAGACGACTAAA
GATGATGGTATTGTGCAACCGAACATTACAGAAGACATTAAGAAAACATTAGAGGATATAAAAAAAGATGACAAGCACAT
TGATAAAATATCAGATCCATATGAAAATAAGCAAATTAGTAAAGATAAAACAACTGCATTTGCAGATATCACATATGACG
TTAGTCAAACATCTTTAAAAGATGGCTCTAGAGATAATGTTAAAAGTCATTTGAAAGACTTACGTGACAATCATAATGTA
CAAACAGAGTTAACTGGTACAGGAATGACATCTACAGAAGTAGGCGGTAATTCTGAACTAGTTGGTATTATTGTTGCATT
TGTTGTACTGTTAATCACATTCGGTTCAGTCATTGCTGCAGGATTACCAATTATAAGTGCATTGATTGGTCTAGCCTCTG
GTGTAGGTATTATCAGTTTGTTAACTTATGCATTTGATATACCAAATGTCACATTGACATTAGCCGTAATGATTGGACTA
GCAGTTGGTATCGATTATGCTTTGTTTATTTTATTCAGGTATCGACAAGTTATGAAAACTGAAACAGATTACATTAAAGG
CATTGGTCTTGCAATAGGAACAGCAGGTAGTGCAGTTGTTTTTGCTGGTGTGACAGTTGTGATTGCCGTATGTGGTTTAT
CGCTAGTTGGCATAGATTTCTTAGCAGTGATGGGGTTTGCTTCGGCAATTAGTGTTATATTTGCTGTATTCAGTGCACTG
ACTTTATTACCTGCGTTAATTAGTATTTTCCATAAACGCATTAAAGTGAACAAATTGCAGTCTAATTTTAAAAAAGATAT
TGATACGCCGTGGTCTAAATTTATTACAGGAAATGCACTTGCGGCAGTATTACTAGGTTTAATCATATTAGTAGCAGCTG
CAATACCAGTTAGTCATATGCGACTTGGTATTCCAGATGACGGTGTTAAACCAGCAGATTCTACACAGAAAAAAGCTTAC
GATATAATCTCGGATAAATTTGGTGAAGGATTTAATGGCCAAATTCCGATGTTGATAAATGTTAAAGATAAAAAAGATGA
TCCACAAGGATTACAACAAGATTTACAGTCTGTATATAAAGATATTAAAGATAAGAAAAATGTAGATATCGTTACGCCGC
CACAAATGAGTAAAGATAATGATTATGCTTTGATGGTCGTGATACCTAAGCAAGGGCCTAATGCAGAGAGCACAAATGAT
TTAGTGCATGATTTACGAGATTATCATAAAGATGCACAAGATAAATATGGGTTCAAAACGGAGATTTCGGGACAAAGTGT
CATTAATATTGATATGTCTAAAAAGTTAAATGAGGCGATACCTTTATTTGCAACAGTAATTGTTGTATTGGCATTTTTCT
TATTAATGATTGTCTTCCGTTCAATTCTAATACCGTTAAAAGCAGTTTTAGGATTTGTCTTGTCATTAATGGCAACGCTA
GGATTTACAACATTAGTAATGCAAGATGGTTTTATGAAAGGTCTGTTTGGTATTGAAACGACAGGACCAATGCTAGCATT
TTTACCGGTTATTACTATAGGTATCTTATTTGGATTAGCGATGGATTATGAAGTCTTCCTTATGTCGCGAATTCATGAAG
AATATAGTAAAACAGGGGATAATGATTATTCTATCAAAGTAGGATTGAAAGAAAGCGGTCCTGTTATTGTAGCCGCTGCA
TTAATTATGTTTAGTGTCTTCTTTGCGTTTGTATTCCAAGAAGATGTCATGATTAAATCAATGGGTATGGCATTAGCGTT
TGGTGTACTCTTTGATGCCTTCGTAGTCAGAATGATGTTAATTCCTGCATTAACGAAATTGTTTGGAAAAGGTTCGTGGT
ATTTACCAGCATGGTTGAATCGCATTATTCCACGAGTTGATATTGAAGGACATGCACTTGAAAAATATAAAACGGTTGAA
TCACAGGAATCTGAAGCCAAAGATAGTAAGGAAACATACGACACAACCTTTAAAGTATATCCACAAGGTGCAACAAATGT
ATCGAAACATCAAGATGTACATGGGCAAGATGATGCACATTCAATAGTACTAGATGATAAAACGATGGCATTGTACCAAG
AAGTGAAACAGCAATCTGCAAGTTCATTGTTCTTATATGATGCTTTAATAGATTATCAAAACAAGCATCAACTAAATTCA
AAACAACAAGTAACGAATATAGAACAGTTGAATAAAAATATTGAAAAGCTCAATCAATTGTTAGAAAAAAATCTACGAAA
TAAATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGATTCTTTAAGAGGTCGGGGATAGATACTATAATCGAACAATAATCTACACTGTATATTTAAACTATAACGTTGATT
TTAAAAGGAGGCAATATACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAACATGTACATGCCTCCGCTTTAAATGTCTATCAATGACATTTGAAGCGGAGGTTTTTTGCATGGAAGTGATTATAC
AAAACATTTTTGCAATGTCG

Product: antibiotic ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 829; Mature: 828

Protein sequence:

>829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPNITEDIKKTLEDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNS
KQQVTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Sequences:

>Translated_829_residues
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTK
DDGIVQPNITEDIKKTLEDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNV
QTELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSAL
TLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAY
DIISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATL
GFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAA
LIMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNS
KQQVTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
>Mature_828_residues
AKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIEKHFNQDSEKAQIRVVFKTTKD
DGIVQPNITEDIKKTLEDIKKDDKHIDKISDPYENKQISKDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQ
TELTGTGMTSTEVGGNSELVGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGLA
VGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVIFAVFSALT
LLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNALAAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYD
IISDKFGEGFNGQIPMLINVKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTNDL
VHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFRSILIPLKAVLGFVLSLMATLG
FTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLAMDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAAL
IMFSVFFAFVFQEDVMIKSMGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVES
QESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSASSLFLYDALIDYQNKHQLNSK
QQVTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91412; Mature: 91280

Theoretical pI: Translated: 6.81; Mature: 6.81

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCHHCCCCHHHH
KHFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPNITEDIKKTLEDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVIFAVFSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALIDYQNKHQLNSKQQVTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
CHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AKFLYKMGTFIAKHKWSAVIAWIVIVAAILIPLATNAPKFDNDIKMTGLESLDTNKKIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCHHCCCCHHHH
KHFNQDSEKAQIRVVFKTTKDDGIVQPNITEDIKKTLEDIKKDDKHIDKISDPYENKQIS
HHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
KDKTTAFADITYDVSQTSLKDGSRDNVKSHLKDLRDNHNVQTELTGTGMTSTEVGGNSEL
CCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VGIIVAFVVLLITFGSVIAAGLPIISALIGLASGVGIISLLTYAFDIPNVTLTLAVMIGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
AVGIDYALFILFRYRQVMKTETDYIKGIGLAIGTAGSAVVFAGVTVVIAVCGLSLVGIDF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVMGFASAISVIFAVFSALTLLPALISIFHKRIKVNKLQSNFKKDIDTPWSKFITGNAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHH
AAVLLGLIILVAAAIPVSHMRLGIPDDGVKPADSTQKKAYDIISDKFGEGFNGQIPMLIN
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VKDKKDDPQGLQQDLQSVYKDIKDKKNVDIVTPPQMSKDNDYALMVVIPKQGPNAESTND
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHH
LVHDLRDYHKDAQDKYGFKTEISGQSVINIDMSKKLNEAIPLFATVIVVLAFFLLMIVFR
HHHHHHHHHHCHHHCCCCEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIPLKAVLGFVLSLMATLGFTTLVMQDGFMKGLFGIETTGPMLAFLPVITIGILFGLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDYEVFLMSRIHEEYSKTGDNDYSIKVGLKESGPVIVAAALIMFSVFFAFVFQEDVMIKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MGMALAFGVLFDAFVVRMMLIPALTKLFGKGSWYLPAWLNRIIPRVDIEGHALEKYKTVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
SQESEAKDSKETYDTTFKVYPQGATNVSKHQDVHGQDDAHSIVLDDKTMALYQEVKQQSA
HHHHHHHCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
SSLFLYDALIDYQNKHQLNSKQQVTNIEQLNKNIEKLNQLLEKNLRNKS
CHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]