| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15922347
Identifier: 15922347
GI number: 15922347
Start: 2043337
End: 2044902
Strand: Direct
Name: 15922347
Synonym: ST2027
Alternate gene names: NA
Gene position: 2043337-2044902 (Clockwise)
Preceding gene: 15922345
Following gene: 15922349
Centisome position: 75.83
GC content: 28.22
Gene sequence:
>1566_bases GTGAGTGAATTTACTAGTTTAGCTGAAGTACTTGTTATTGCTAGCTTCTTAGGACTTTTGCTTAGAAGAATAAACGTTTC TCCAGTTATTGCTTATCTTGTATCTGGAATAATAGGAGTAGAATTAGGATTAAATTATAGTAGTTCAATATTTCAGTTTC TAACTTTTCTTGCGGTAAATTTGCTTTCATTTGAAATGGGTGTATCTGTTAATTTGGTTGATTTAAAGAAAATATTTAAG AGAGCTTTATTCATAGTTCTAACAGAATTTCTAGTCGTTACTACAGTAGTTATGCTAATTTCCCTATTCATAAGACTTAA TTTCATAAGTACGATCCTTCTCGTAGTAATAGGATTTAACACCAGTACTTCAATCGCATATAAATTAGCTGAGAAAACAC TTGACCAGAATGATTTAAAAATAGTACTCTCAGTTTCATCTTTAGAGGACACAGTAGCTTTTATAGTTCTTGGTGTAATT TCATCTAATTCCTTTAACCTTGTAGAAATAATAGTTTCAGCATTTATTTCTATTACTTTAGGATACCTAATATCAAAATT GTTAATAAATCCTACCATAAACTTCTCTGAAGACTCAATAATTTTATCTGGTGTAGCTTCCGTATTTCTTTTTAATATCT TAAGTCAGTTACTTAATATACCTTCTACTTTAGCATCTTTTCTCCTAGGGATAGGAACTTCTTATGCTTCTTCAGATAGT GAAAAAATTGTGAAAAGCATTAAGCCTTTAACAGATTTTACTCTAATCCTATTCTTCTTTGTTGCAGGAAGTTATATTAA AGTTTCAACTTACTTACTTTATGCTCTACCTATTTCTATAGTTTTAGTACTTACAAAATATATAGCATTTAGCACTGCAT ATTGGATGTCTGGCATAGAGTTCATCAGAGCATTTAGAACCGGACTTTTCATGAGCTCTCTTAGTGAATTTGGAATTGTA ATTTCATTAACAGCTTTACAAGAAGGGTTACCGGTATTATCAGTTTATAATATTTCTAGCATTGTAGTAGCAATATCATC TACAATCGCAAGTATAGTAACAACTAGGAATAAGGCAATAATTTCTATTCTAAATAAAATTTACTATAAATTAAGTTTAA ATAAAGTAGATAATATTGTAAGGAGAGCTTCTTCTCACCAATTAAAAATTCCAGAAATAGTAATAGTAATGGTGAGGTAC ATAATTACAAGTGTAACTATAACTTTTTCTGGAGCTTATATAATTTATTTATTATATACAATAAGTCCTTTCTTGATTTA TGTTTCTTACATATTAATCGTAGTAATTCCAGCTATGCTTTTCACTCTCCTTGTAACTACAACAAATAACATTAGAGGGA AGTATGGAGAAGCTGAATTTATAGTAGAATTATTCTTTATAATAATTTTTATAATAAATGTCTTCGAATTTGAAATATTT TTCCTAAAGCTAATCTCATTTAACATAATAGTTTTTATACTTTCGATAGTAATAGGTAGCATAATCACTATCTTATCTTT TTCAAGAATTAGGAAACTTCTTGAAGATATTGAGAAATTATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTTTTAAAGGATTATCTTTTAATATATTACTCTCGATTGCAAAGCTTTTGATTAACATCTACAAAAATAGTTATATTGA CAAGGAAATAATTAATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AACATTTATCACTAATTTTATTTATTTTAATTATTTCTGGAGGTAAAATATATATACTTCCATCAATGGACGAAATCTCC ATTGTTTTTCTTATGAAGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 520
Protein sequence:
>521_residues MSEFTSLAEVLVIASFLGLLLRRINVSPVIAYLVSGIIGVELGLNYSSSIFQFLTFLAVNLLSFEMGVSVNLVDLKKIFK RALFIVLTEFLVVTTVVMLISLFIRLNFISTILLVVIGFNTSTSIAYKLAEKTLDQNDLKIVLSVSSLEDTVAFIVLGVI SSNSFNLVEIIVSAFISITLGYLISKLLINPTINFSEDSIILSGVASVFLFNILSQLLNIPSTLASFLLGIGTSYASSDS EKIVKSIKPLTDFTLILFFFVAGSYIKVSTYLLYALPISIVLVLTKYIAFSTAYWMSGIEFIRAFRTGLFMSSLSEFGIV ISLTALQEGLPVLSVYNISSIVVAISSTIASIVTTRNKAIISILNKIYYKLSLNKVDNIVRRASSHQLKIPEIVIVMVRY IITSVTITFSGAYIIYLLYTISPFLIYVSYILIVVIPAMLFTLLVTTTNNIRGKYGEAEFIVELFFIIIFIINVFEFEIF FLKLISFNIIVFILSIVIGSIITILSFSRIRKLLEDIEKLF
Sequences:
>Translated_521_residues MSEFTSLAEVLVIASFLGLLLRRINVSPVIAYLVSGIIGVELGLNYSSSIFQFLTFLAVNLLSFEMGVSVNLVDLKKIFK RALFIVLTEFLVVTTVVMLISLFIRLNFISTILLVVIGFNTSTSIAYKLAEKTLDQNDLKIVLSVSSLEDTVAFIVLGVI SSNSFNLVEIIVSAFISITLGYLISKLLINPTINFSEDSIILSGVASVFLFNILSQLLNIPSTLASFLLGIGTSYASSDS EKIVKSIKPLTDFTLILFFFVAGSYIKVSTYLLYALPISIVLVLTKYIAFSTAYWMSGIEFIRAFRTGLFMSSLSEFGIV ISLTALQEGLPVLSVYNISSIVVAISSTIASIVTTRNKAIISILNKIYYKLSLNKVDNIVRRASSHQLKIPEIVIVMVRY IITSVTITFSGAYIIYLLYTISPFLIYVSYILIVVIPAMLFTLLVTTTNNIRGKYGEAEFIVELFFIIIFIINVFEFEIF FLKLISFNIIVFILSIVIGSIITILSFSRIRKLLEDIEKLF >Mature_520_residues SEFTSLAEVLVIASFLGLLLRRINVSPVIAYLVSGIIGVELGLNYSSSIFQFLTFLAVNLLSFEMGVSVNLVDLKKIFKR ALFIVLTEFLVVTTVVMLISLFIRLNFISTILLVVIGFNTSTSIAYKLAEKTLDQNDLKIVLSVSSLEDTVAFIVLGVIS SNSFNLVEIIVSAFISITLGYLISKLLINPTINFSEDSIILSGVASVFLFNILSQLLNIPSTLASFLLGIGTSYASSDSE KIVKSIKPLTDFTLILFFFVAGSYIKVSTYLLYALPISIVLVLTKYIAFSTAYWMSGIEFIRAFRTGLFMSSLSEFGIVI SLTALQEGLPVLSVYNISSIVVAISSTIASIVTTRNKAIISILNKIYYKLSLNKVDNIVRRASSHQLKIPEIVIVMVRYI ITSVTITFSGAYIIYLLYTISPFLIYVSYILIVVIPAMLFTLLVTTTNNIRGKYGEAEFIVELFFIIIFIINVFEFEIFF LKLISFNIIVFILSIVIGSIITILSFSRIRKLLEDIEKLF
Specific function: Unknown
COG id: COG0475
COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57909; Mature: 57778
Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSEFTSLAEVLVIASFLGLLLRRINVSPVIAYLVSGIIGVELGLNYSSSIFQFLTFLAVN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLSFEMGVSVNLVDLKKIFKRALFIVLTEFLVVTTVVMLISLFIRLNFISTILLVVIGFN HHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TSTSIAYKLAEKTLDQNDLKIVLSVSSLEDTVAFIVLGVISSNSFNLVEIIVSAFISITL CCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GYLISKLLINPTINFSEDSIILSGVASVFLFNILSQLLNIPSTLASFLLGIGTSYASSDS HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EKIVKSIKPLTDFTLILFFFVAGSYIKVSTYLLYALPISIVLVLTKYIAFSTAYWMSGIE HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIRAFRTGLFMSSLSEFGIVISLTALQEGLPVLSVYNISSIVVAISSTIASIVTTRNKAI HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH ISILNKIYYKLSLNKVDNIVRRASSHQLKIPEIVIVMVRYIITSVTITFSGAYIIYLLYT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH ISPFLIYVSYILIVVIPAMLFTLLVTTTNNIRGKYGEAEFIVELFFIIIFIINVFEFEIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLKLISFNIIVFILSIVIGSIITILSFSRIRKLLEDIEKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure SEFTSLAEVLVIASFLGLLLRRINVSPVIAYLVSGIIGVELGLNYSSSIFQFLTFLAVN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LLSFEMGVSVNLVDLKKIFKRALFIVLTEFLVVTTVVMLISLFIRLNFISTILLVVIGFN HHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TSTSIAYKLAEKTLDQNDLKIVLSVSSLEDTVAFIVLGVISSNSFNLVEIIVSAFISITL CCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH GYLISKLLINPTINFSEDSIILSGVASVFLFNILSQLLNIPSTLASFLLGIGTSYASSDS HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EKIVKSIKPLTDFTLILFFFVAGSYIKVSTYLLYALPISIVLVLTKYIAFSTAYWMSGIE HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIRAFRTGLFMSSLSEFGIVISLTALQEGLPVLSVYNISSIVVAISSTIASIVTTRNKAI HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH ISILNKIYYKLSLNKVDNIVRRASSHQLKIPEIVIVMVRYIITSVTITFSGAYIIYLLYT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH ISPFLIYVSYILIVVIPAMLFTLLVTTTNNIRGKYGEAEFIVELFFIIIFIINVFEFEIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLKLISFNIIVFILSIVIGSIITILSFSRIRKLLEDIEKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA