Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15922296

Identifier: 15922296

GI number: 15922296

Start: 1989362

End: 1992358

Strand: Direct

Name: 15922296

Synonym: ST1979

Alternate gene names: NA

Gene position: 1989362-1992358 (Clockwise)

Preceding gene: 15922295

Following gene: 15922297

Centisome position: 73.82

GC content: 32.8

Gene sequence:

>2997_bases
GTGAGTAAAATGAGTCTCAAACCCATGAGTGAAATAATTAAAGAGAAATTTGCAGCATTATTACATGATCCTCCTAATAA
ACCGTTTATATTTAGCCTTAATGCTTTTAATGAGGAAAAAAGAATTAGCCACGTAAAAGTGGCAAAAACATTAATATCTC
ATCTAGATTTTTTAGGAAAAAATGAATTAGATGAGATAAGCTCAAAGATTTATAGTAAAAAAGAGAAGGGCTGTAATAGT
AAAGTATCTGATGCTGATAGTCTAGCTAGTAAGTTTGATAGGTATTTAACCACTTTGATATACCAAGAACGAGGAAGAAA
ACAACAAGCAATGTTTGCGAATTTTAAGGAGATTGTAATGAAAAATTTTCTAGCACCAGAGTTAGAAGTGAACTTATCTG
CTATTCCTAGTGACGCTTATCATGACCCCTCTGGTAAGGATATTAAGGAATTCTTTAATTATCTGTCAGAGGTATTTAAA
AAGCTAGGTTTAACTGGCGTTAGCATAGAAACTTATAACGTCTTCTATTTCTTTTACGAATTTCTTTGGGTTGCTAAAGG
TTACACTGTAGGTCCTGCAGACACTAGAGTTCCTACTCACTCAATCTTTGATCATTTATATGCTACTGCCTCAATAATAA
ACTGGTTCTTAGGATCAACAGATCTTCTTTTAGGCTTAGATATAGTGGGTGTTGCGGACTATATTAACAAGTCCAGAAAG
CTCAGAGATTTATGGGCATCAAGTTATCTAGTATCGGCTCTAATCTGGTATGTCTTAATTAGTTTCGTTGAAAAATTTGG
AGCAGATTCTGTGTTATTTCCGTCTTTGAGGTTTAATCCGTTCTTCGCAACTTATATTTATCATAAATATCTCAAAAATA
AAGAGAAAGACGAATTAATTAAAGAGATTGTAAACTATATTACAACATATATATTTAACGGTGATGAGACCTACAAAAAA
CTTGGAATACCACCATATCCTATTATCCCCGCTAGAGCTACACTAATATTGCTTGGAGTAAAATACGTTAGTAGAGAACT
AGGTCTCAAAAAATCGGATATATCATGTATTGAAAAATATGTAATTACTAGGTTTAATGAGGGCTGGGGTAGACTTATTG
ATCATCTAATTACGTATGCACTATCTCATACTGATAATCCCTTCTGGGCATTATTTAATAAAGTCATAGAGAAAGAGAGT
GTAAAAAACGCCGTCAAGATTCCTCCTGTGCAATTACGAGTAATTACTTTAAAAAAAGAAAACGAAGTGTCGAATTATGA
AGAGTTTGATAATAGATATAGAGAGCTAGTCTCAAACTTTAAGAGAAAGAAACTTTCTAAAGTATCTCCTCACACTCAAC
TTTCAAACTATAATTATTATATTGATTCAATCGGTGAGACTAAAAGAGGATTTGAATACTGTAGTATTTGCGGAGTCCTT
CCTGCAATGCTTATTCTACCAAAGGACGAAAATGAGTATAAAAAATTCGTAGAAGAGCACACTGGAAAGCAGTTTAACGA
TGATCAAATCGAAGCTCTCAAGGCTATACTATCTCCTGGAGAAAAGCTTTGTCCTTGGTGTTTAATAAAACGTGCTATAG
GAGTAAGACCGGAATTCCTCAGAGTACTCATAACCAGTGAGGACTTAAGAAGTTTTGAAGAGAAAGATGTTTTTATACCC
TCTGTCAGCCATGTGGCATTTTACAAAAAATTTGAAAAACTTAAAGAAGATAATATAATAAATCCAGATAAAGAAAACAC
TATATCTCTTTGGAAGTATTATGAAACCTACCCTATTGAGAAAAGAGGTCTATTAAGAGAAAACCCAGAAGAAAAGGGAT
GGAAAGATGTATCGCCTTATTATGCTCTTGTAAGGGCTGATACTGATTACTTAGGTGACTTGCTTGAAGGAAAAGTGACT
CCATATCTAGCTGGAATTATAGACTCAAGTTTTTACGGAGGTGAAAGAGAAAATGAGAGTAAAGTCAAAAACGCTATTAC
AAGGTACTTACGAAATGCTGCAAAAGGTCTATATCAAGAAGTGATTAATGATGTTCTTAAAGAAGATATAAATCAAGCAA
AAGAGTTAATAAAAAATGCCGCTGTAACTGCTGAAATTGAGATTAATGATAACGATATAGAAAGAATAATCAGTGATCTG
AAAGACTTTCTCAATAAAAACGTAGATCGTGATAGACTTCTATTGTTTCCATCATGGCATGTAAGTATTAGTAGTATGCT
TAATAGAATTCTCCTTAAGGAAATTCAGCTTGTAAACGCTTTAGGAGGATTTGTAGTGTATGCTGGTGGTGATGATTTAC
TCGCAATACTTCCAGTAGAAAACGCCTTACAGTTTGTTGAGAACAGTCGCAAAATAGTAGCTGGCATTGAGGATGCCTCA
AGCTATAAAGGCTTTATTAAGATTAACAATTCGTACTTTAGTCAACTACCACTAGTTGGACGTAGTTATATACTATACTT
CTCCCACGTCAAATATCCTCTTCAGTTAGCTCTTGAAGAGTCTTATAACTTATTAGAAGAAGGGAAAGAGAGAGTAAAAT
ATGATAAGTACAAAAAGGATATTGTAATATTTAAATATAGAAATTCTGTCAGTTTTATCCCTTTATCACTTATAAGACCA
TATGAAGAGAATAATGATAATTCCATAAAAAGATATCTCGATAACTTAGGTAAAAGCCTAGAGTTATTACGTATTCTCTA
TGATGCTATTAGGCAAAAGAAATTGTCTAAGAGTCTGATCTATGATGCGTTAGCAGATACAATTCTTAAAAGCAGAGAGC
TAGAAAGTGAAATATTAGTAAAATATTTAGATTATTTGGTCGATAAAAATAAGATAGATAAATCCTTCTCACTAAGCTTT
GTAAATTATCAAGATATCCTTAAGATTTCGATCATAAATGGAGAAACATCTGAACCCTTAACTTATAATTTATTTAAAGC
TCTAAGCATTATATTAGGGGCTGAAAAAATTGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGAGCAATTAATTATTAAAATGATAAAAGAGGGTATAGGTAGTAAGACGTCTCTAGGTTATTCCTTGTTTACAGTAGT
TTACATAGACTGGACTTACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAACTCTGGTTATTAAGCCTTTAGAACCTTTAATGTTGCGGTCTTCTGGAGAATTTGACATAGAAACTAAAGGTCCAG
CTTCTTATGCAAAATCCTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: CRISPR-Associated RAMP Crm2 Family Protein; CRISPR-Associated Cmr2 Family Protein; Hydrolase; HD Superfamily Hydrolase; HD Family Hydrolase

Number of amino acids: Translated: 998; Mature: 997

Protein sequence:

>998_residues
MSKMSLKPMSEIIKEKFAALLHDPPNKPFIFSLNAFNEEKRISHVKVAKTLISHLDFLGKNELDEISSKIYSKKEKGCNS
KVSDADSLASKFDRYLTTLIYQERGRKQQAMFANFKEIVMKNFLAPELEVNLSAIPSDAYHDPSGKDIKEFFNYLSEVFK
KLGLTGVSIETYNVFYFFYEFLWVAKGYTVGPADTRVPTHSIFDHLYATASIINWFLGSTDLLLGLDIVGVADYINKSRK
LRDLWASSYLVSALIWYVLISFVEKFGADSVLFPSLRFNPFFATYIYHKYLKNKEKDELIKEIVNYITTYIFNGDETYKK
LGIPPYPIIPARATLILLGVKYVSRELGLKKSDISCIEKYVITRFNEGWGRLIDHLITYALSHTDNPFWALFNKVIEKES
VKNAVKIPPVQLRVITLKKENEVSNYEEFDNRYRELVSNFKRKKLSKVSPHTQLSNYNYYIDSIGETKRGFEYCSICGVL
PAMLILPKDENEYKKFVEEHTGKQFNDDQIEALKAILSPGEKLCPWCLIKRAIGVRPEFLRVLITSEDLRSFEEKDVFIP
SVSHVAFYKKFEKLKEDNIINPDKENTISLWKYYETYPIEKRGLLRENPEEKGWKDVSPYYALVRADTDYLGDLLEGKVT
PYLAGIIDSSFYGGERENESKVKNAITRYLRNAAKGLYQEVINDVLKEDINQAKELIKNAAVTAEIEINDNDIERIISDL
KDFLNKNVDRDRLLLFPSWHVSISSMLNRILLKEIQLVNALGGFVVYAGGDDLLAILPVENALQFVENSRKIVAGIEDAS
SYKGFIKINNSYFSQLPLVGRSYILYFSHVKYPLQLALEESYNLLEEGKERVKYDKYKKDIVIFKYRNSVSFIPLSLIRP
YEENNDNSIKRYLDNLGKSLELLRILYDAIRQKKLSKSLIYDALADTILKSRELESEILVKYLDYLVDKNKIDKSFSLSF
VNYQDILKISIINGETSEPLTYNLFKALSIILGAEKIE

Sequences:

>Translated_998_residues
MSKMSLKPMSEIIKEKFAALLHDPPNKPFIFSLNAFNEEKRISHVKVAKTLISHLDFLGKNELDEISSKIYSKKEKGCNS
KVSDADSLASKFDRYLTTLIYQERGRKQQAMFANFKEIVMKNFLAPELEVNLSAIPSDAYHDPSGKDIKEFFNYLSEVFK
KLGLTGVSIETYNVFYFFYEFLWVAKGYTVGPADTRVPTHSIFDHLYATASIINWFLGSTDLLLGLDIVGVADYINKSRK
LRDLWASSYLVSALIWYVLISFVEKFGADSVLFPSLRFNPFFATYIYHKYLKNKEKDELIKEIVNYITTYIFNGDETYKK
LGIPPYPIIPARATLILLGVKYVSRELGLKKSDISCIEKYVITRFNEGWGRLIDHLITYALSHTDNPFWALFNKVIEKES
VKNAVKIPPVQLRVITLKKENEVSNYEEFDNRYRELVSNFKRKKLSKVSPHTQLSNYNYYIDSIGETKRGFEYCSICGVL
PAMLILPKDENEYKKFVEEHTGKQFNDDQIEALKAILSPGEKLCPWCLIKRAIGVRPEFLRVLITSEDLRSFEEKDVFIP
SVSHVAFYKKFEKLKEDNIINPDKENTISLWKYYETYPIEKRGLLRENPEEKGWKDVSPYYALVRADTDYLGDLLEGKVT
PYLAGIIDSSFYGGERENESKVKNAITRYLRNAAKGLYQEVINDVLKEDINQAKELIKNAAVTAEIEINDNDIERIISDL
KDFLNKNVDRDRLLLFPSWHVSISSMLNRILLKEIQLVNALGGFVVYAGGDDLLAILPVENALQFVENSRKIVAGIEDAS
SYKGFIKINNSYFSQLPLVGRSYILYFSHVKYPLQLALEESYNLLEEGKERVKYDKYKKDIVIFKYRNSVSFIPLSLIRP
YEENNDNSIKRYLDNLGKSLELLRILYDAIRQKKLSKSLIYDALADTILKSRELESEILVKYLDYLVDKNKIDKSFSLSF
VNYQDILKISIINGETSEPLTYNLFKALSIILGAEKIE
>Mature_997_residues
SKMSLKPMSEIIKEKFAALLHDPPNKPFIFSLNAFNEEKRISHVKVAKTLISHLDFLGKNELDEISSKIYSKKEKGCNSK
VSDADSLASKFDRYLTTLIYQERGRKQQAMFANFKEIVMKNFLAPELEVNLSAIPSDAYHDPSGKDIKEFFNYLSEVFKK
LGLTGVSIETYNVFYFFYEFLWVAKGYTVGPADTRVPTHSIFDHLYATASIINWFLGSTDLLLGLDIVGVADYINKSRKL
RDLWASSYLVSALIWYVLISFVEKFGADSVLFPSLRFNPFFATYIYHKYLKNKEKDELIKEIVNYITTYIFNGDETYKKL
GIPPYPIIPARATLILLGVKYVSRELGLKKSDISCIEKYVITRFNEGWGRLIDHLITYALSHTDNPFWALFNKVIEKESV
KNAVKIPPVQLRVITLKKENEVSNYEEFDNRYRELVSNFKRKKLSKVSPHTQLSNYNYYIDSIGETKRGFEYCSICGVLP
AMLILPKDENEYKKFVEEHTGKQFNDDQIEALKAILSPGEKLCPWCLIKRAIGVRPEFLRVLITSEDLRSFEEKDVFIPS
VSHVAFYKKFEKLKEDNIINPDKENTISLWKYYETYPIEKRGLLRENPEEKGWKDVSPYYALVRADTDYLGDLLEGKVTP
YLAGIIDSSFYGGERENESKVKNAITRYLRNAAKGLYQEVINDVLKEDINQAKELIKNAAVTAEIEINDNDIERIISDLK
DFLNKNVDRDRLLLFPSWHVSISSMLNRILLKEIQLVNALGGFVVYAGGDDLLAILPVENALQFVENSRKIVAGIEDASS
YKGFIKINNSYFSQLPLVGRSYILYFSHVKYPLQLALEESYNLLEEGKERVKYDKYKKDIVIFKYRNSVSFIPLSLIRPY
EENNDNSIKRYLDNLGKSLELLRILYDAIRQKKLSKSLIYDALADTILKSRELESEILVKYLDYLVDKNKIDKSFSLSFV
NYQDILKISIINGETSEPLTYNLFKALSIILGAEKIE

Specific function: Unknown

COG id: COG1353

COG function: function code R; Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 115171; Mature: 115040

Theoretical pI: Translated: 8.03; Mature: 8.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKMSLKPMSEIIKEKFAALLHDPPNKPFIFSLNAFNEEKRISHVKVAKTLISHLDFLGK
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NELDEISSKIYSKKEKGCNSKVSDADSLASKFDRYLTTLIYQERGRKQQAMFANFKEIVM
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
KNFLAPELEVNLSAIPSDAYHDPSGKDIKEFFNYLSEVFKKLGLTGVSIETYNVFYFFYE
HHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHH
FLWVAKGYTVGPADTRVPTHSIFDHLYATASIINWFLGSTDLLLGLDIVGVADYINKSRK
HHHHHCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRDLWASSYLVSALIWYVLISFVEKFGADSVLFPSLRFNPFFATYIYHKYLKNKEKDELI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
KEIVNYITTYIFNGDETYKKLGIPPYPIIPARATLILLGVKYVSRELGLKKSDISCIEKY
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VITRFNEGWGRLIDHLITYALSHTDNPFWALFNKVIEKESVKNAVKIPPVQLRVITLKKE
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECC
NEVSNYEEFDNRYRELVSNFKRKKLSKVSPHTQLSNYNYYIDSIGETKRGFEYCSICGVL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
PAMLILPKDENEYKKFVEEHTGKQFNDDQIEALKAILSPGEKLCPWCLIKRAIGVRPEFL
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RVLITSEDLRSFEEKDVFIPSVSHVAFYKKFEKLKEDNIINPDKENTISLWKYYETYPIE
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KDFLNKNVDRDRLLLFPSWHVSISSMLNRILLKEIQLVNALGGFVVYAGGDDLLAILPVE
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NALQFVENSRKIVAGIEDASSYKGFIKINNSYFSQLPLVGRSYILYFSHVKYPLQLALEE
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SYNLLEEGKERVKYDKYKKDIVIFKYRNSVSFIPLSLIRPYEENNDNSIKRYLDNLGKSL
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>Mature Secondary Structure 
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NELDEISSKIYSKKEKGCNSKVSDADSLASKFDRYLTTLIYQERGRKQQAMFANFKEIVM
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KNFLAPELEVNLSAIPSDAYHDPSGKDIKEFFNYLSEVFKKLGLTGVSIETYNVFYFFYE
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HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCHHHHHCCHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCEEEE
VNYQDILKISIINGETSEPLTYNLFKALSIILGAEKIE
ECHHHEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA