Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15922268

Identifier: 15922268

GI number: 15922268

Start: 1959506

End: 1960915

Strand: Reverse

Name: 15922268

Synonym: ST1951

Alternate gene names: NA

Gene position: 1960915-1959506 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15922270

Following gene: 15922267

Centisome position: 72.77

GC content: 35.04

Gene sequence:

>1410_bases
ATGAATCCAATAAAGAATGCGTTAAAGAGCCTCAGCGTGACTACTACTAATGTCATAGTTGCTTTAATATTCTTTATTAT
TACTGCTAAAATTTCTAACCCTGCATTCTTCGGAAAAGTTGCAATAATCCAACTCCTCGAAGTAGTTACGTCGGCCTTCT
TTTACTTCATTCCTGGTGCAATAATAACAAGGGAAATATCATACCTTTACGCAAGAAAAGAAGTAAATAAGAGCATAATA
GGAAAATTTCTCTCATTTCCCTTTCTGGCTATTCCATTTTTCCTCATTCTTCTCATTTTCCCAAATTACGTTAAGTTAGC
AATACCTTATCTCTTCCTTTATCTCCTTAATAACGTATTAACAGCAATAATTATAGGGATGGACATGTTCACTGAATCAG
CAATAACAGGAAATCTCTTTCTAATTATAAGGTGGGGAATATCAATAATCGCTGTACTTTTACATAATATCTATCTCTTC
ATCGAGATTTGGACTTTAGGAGGGATAATTTCAGTCTCTATGAATTATGCATTTCTGAGCAGAAAAGTCGGATTAGTCTT
TCCTTCTCCAGACTTTGCCTTTCTCTTTAAGCACTTCAGGGAAGGTCTACCTCTTTATCTCTCTTCTTTATCTGGTTTCT
TTTCTTCTCAAGGGGATAGAGTAACCACAGCATACTTGTTGGGTTCTTATTACCTAGGCATTTATCAATTTTCTGCGTTA
GTAGCCGGAGTACCTTCGATGATTTTAGGAGCTTTAGGAAACGTTTTACTACCAACAGCGTCTTTTTACAAAGCTTTAGG
AAAAGACGAGAAAAAGATGTCTTCTCTTTCCTTTAGACTTCTATCGCTCTTAACTTTTCTTGCTGTAATAATTTCTATTC
CCATAGGTGAGATAGTAATTAATCGCTTCTTTCCGGCATATAAGGCTGGACTTGAAGTATTTATAATACTTTTAATTTCA
ACTACCATCCCGTTTTCTATTGGATCCTTAACTAATTTCATTATTGCGGCTAAGAAGGATTTGAGACCTTTTCTCATCCT
CTCAGTTTTAAACGGTAGCCTAGTAGTGCTCACTTCCTATTTGTTGATTCCTAAAATAGGGATAATGGGAGGGGCTATAT
CTCAGATTATTGTAGCTACTATTTCTTCTCTCTTTGTTCTGTTTTATGCAATTAGAACCTCAGTTTTCATTCCGGCTAAG
AAAGAACTTATCCTCCTTTCAATTACTCCTCTTATCGGTGCTTATGAAATAATTGTTGACCCAGTTTTTATGGATTTCCT
AATAGTAGTTGTTATCATCTCTGTCTTCAAATTATTTAAGATAATTAGTGAGGACGAGATTAGAATCATAGAAGGCTTTT
TACCGCGTGGCTTAAAGTTCGTATCCACTATTTTAAGAGCTATAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTACAGCTTAATGTTACACTATGAAACATAACTGACCTTAAAAAGCTAAGGCTACTAGAGAAAAGCTTTAATATTTTA
CTTCTGAAGACCTAAACTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAACTTAGTGTGTCGAGACGAGGTTCTTTAATCATACAATAGTAAAAACATGGGGATCTAAATGCTCTACATACGCTGA
GTGATATTTTACGTCAAATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Related Protein

Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 469

Protein sequence:

>469_residues
MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII
GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF
IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS
TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK
KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS

Sequences:

>Translated_469_residues
MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII
GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF
IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS
TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK
KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS
>Mature_469_residues
MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII
GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF
IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS
TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK
KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51966; Mature: 51966

Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA