| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15922268
Identifier: 15922268
GI number: 15922268
Start: 1959506
End: 1960915
Strand: Reverse
Name: 15922268
Synonym: ST1951
Alternate gene names: NA
Gene position: 1960915-1959506 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15922270
Following gene: 15922267
Centisome position: 72.77
GC content: 35.04
Gene sequence:
>1410_bases ATGAATCCAATAAAGAATGCGTTAAAGAGCCTCAGCGTGACTACTACTAATGTCATAGTTGCTTTAATATTCTTTATTAT TACTGCTAAAATTTCTAACCCTGCATTCTTCGGAAAAGTTGCAATAATCCAACTCCTCGAAGTAGTTACGTCGGCCTTCT TTTACTTCATTCCTGGTGCAATAATAACAAGGGAAATATCATACCTTTACGCAAGAAAAGAAGTAAATAAGAGCATAATA GGAAAATTTCTCTCATTTCCCTTTCTGGCTATTCCATTTTTCCTCATTCTTCTCATTTTCCCAAATTACGTTAAGTTAGC AATACCTTATCTCTTCCTTTATCTCCTTAATAACGTATTAACAGCAATAATTATAGGGATGGACATGTTCACTGAATCAG CAATAACAGGAAATCTCTTTCTAATTATAAGGTGGGGAATATCAATAATCGCTGTACTTTTACATAATATCTATCTCTTC ATCGAGATTTGGACTTTAGGAGGGATAATTTCAGTCTCTATGAATTATGCATTTCTGAGCAGAAAAGTCGGATTAGTCTT TCCTTCTCCAGACTTTGCCTTTCTCTTTAAGCACTTCAGGGAAGGTCTACCTCTTTATCTCTCTTCTTTATCTGGTTTCT TTTCTTCTCAAGGGGATAGAGTAACCACAGCATACTTGTTGGGTTCTTATTACCTAGGCATTTATCAATTTTCTGCGTTA GTAGCCGGAGTACCTTCGATGATTTTAGGAGCTTTAGGAAACGTTTTACTACCAACAGCGTCTTTTTACAAAGCTTTAGG AAAAGACGAGAAAAAGATGTCTTCTCTTTCCTTTAGACTTCTATCGCTCTTAACTTTTCTTGCTGTAATAATTTCTATTC CCATAGGTGAGATAGTAATTAATCGCTTCTTTCCGGCATATAAGGCTGGACTTGAAGTATTTATAATACTTTTAATTTCA ACTACCATCCCGTTTTCTATTGGATCCTTAACTAATTTCATTATTGCGGCTAAGAAGGATTTGAGACCTTTTCTCATCCT CTCAGTTTTAAACGGTAGCCTAGTAGTGCTCACTTCCTATTTGTTGATTCCTAAAATAGGGATAATGGGAGGGGCTATAT CTCAGATTATTGTAGCTACTATTTCTTCTCTCTTTGTTCTGTTTTATGCAATTAGAACCTCAGTTTTCATTCCGGCTAAG AAAGAACTTATCCTCCTTTCAATTACTCCTCTTATCGGTGCTTATGAAATAATTGTTGACCCAGTTTTTATGGATTTCCT AATAGTAGTTGTTATCATCTCTGTCTTCAAATTATTTAAGATAATTAGTGAGGACGAGATTAGAATCATAGAAGGCTTTT TACCGCGTGGCTTAAAGTTCGTATCCACTATTTTAAGAGCTATAAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTACAGCTTAATGTTACACTATGAAACATAACTGACCTTAAAAAGCTAAGGCTACTAGAGAAAAGCTTTAATATTTTA CTTCTGAAGACCTAAACTGA
Downstream 100 bases:
>100_bases CAAACTTAGTGTGTCGAGACGAGGTTCTTTAATCATACAATAGTAAAAACATGGGGATCTAAATGCTCTACATACGCTGA GTGATATTTTACGTCAAATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Related Protein
Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 469
Protein sequence:
>469_residues MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS
Sequences:
>Translated_469_residues MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS >Mature_469_residues MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGAIITREISYLYARKEVNKSII GKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLTAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLF IEIWTLGGIISVSMNYAFLSRKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVINRFFPAYKAGLEVFIILLIS TTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSYLLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAK KELILLSITPLIGAYEIIVDPVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51966; Mature: 51966
Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH IITREISYLYARKEVNKSIIGKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLFIEIWTLGGIISVSMNYAFLS HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL CCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH NRFFPAYKAGLEVFIILLISTTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH LLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAKKELILLSITPLIGAYEIIVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHH PVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNPIKNALKSLSVTTTNVIVALIFFIITAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTSAFFYFIPGA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH IITREISYLYARKEVNKSIIGKFLSFPFLAIPFFLILLIFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAIIIGMDMFTESAITGNLFLIIRWGISIIAVLLHNIYLFIEIWTLGGIISVSMNYAFLS HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH RKVGLVFPSPDFAFLFKHFREGLPLYLSSLSGFFSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL CCCCEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAGVPSMILGALGNVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFRLLSLLTFLAVIISIPIGEIVI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH NRFFPAYKAGLEVFIILLISTTIPFSIGSLTNFIIAAKKDLRPFLILSVLNGSLVVLTSY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH LLIPKIGIMGGAISQIIVATISSLFVLFYAIRTSVFIPAKKELILLSITPLIGAYEIIVD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHH PVFMDFLIVVVIISVFKLFKIISEDEIRIIEGFLPRGLKFVSTILRAIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA