| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921907
Identifier: 15921907
GI number: 15921907
Start: 1603956
End: 1605497
Strand: Reverse
Name: 15921907
Synonym: ST1607
Alternate gene names: NA
Gene position: 1605497-1603956 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921908
Following gene: 15921906
Centisome position: 59.58
GC content: 33.85
Gene sequence:
>1542_bases ATGGCTGAGAAAAAATCACTTTTCATTAGAGAGAGCTCAGGTTTAATTAAGCAAGTAAATCTATTAGACGCTGTTATGTT AAATCTAGGCAATATGTCTGCTGGAGAAGCGTTATTCCAGTCGATTTCTCCATATATTAGTAACGGTGCAATACTTTGGT TAGCCAGTATATTGGGGTTTCTACTATCAATACCTCAGATTATAGTCTATACTTTCATGACATTAAAAATAAGAAGAACT GGAGGGGATTATGTATGGATTTCTAGAATTATAGATGGTCGTTTAGGATCAATTCTAGCATTGTCATATTTAATTCAATC AACTGCATTCTTTGCGATAATAGCATTCTTCTCAGCTTCCTCAGTTAACTCAGTACTCTGTACTATAGGTATAATGAATC ATAACCATCAACTTATAAACTTAGCAAATTCAGTCTTTGTAAATCCTTACGGAAATGTAACACTTGACCAAAGATTAATA TTCTATGCAATTTCGGCAATTTTCTTTGGAATAGTTATCGCTCTTAATATTAGAAAAGCAAAATGGGGTTTTACTTTAGT TACCGTATTGGGAATATTTTCCATCTTTGCCTTATTACTGGCAATGATTGTTGTTGGTGTTAACTCTGGTGATTTCTTTG CTAAATTACAACCATTCTTATCAGCATATAATATTTCAGCACCAGTTGGAAAAAGAGCGTTTTTACCCAGTAACTTTAGC CTATTAGCAACCCTTTCATTACTTCCACTATTTGCATTATATACTTATCCATGGATAAATGCTGGTCCTTCAGTATCAGC TGAGTTTAAGAATTCCGATAAAGTGGCTAAATTAAACATTATTATAGCCTCAGTAGTAACATTCCTTTTAGTAACATTAG GATTTATGGAAATGGACTTAGTGGCAGGCTATAATTTTAACATTTCAGCCTATCCCACATTTGTTTATAACTTTTGGACT GTCGCAATAGCATTGGCTGGAAATCAAGCATTACAATGGATTATAGGACTTGGACTTATACTATGGAACTTTTACACATT GTCCTATGGCGTTGTTATGTTCTCCAGATACGTTTTCGCACTCTCATTTGATAGAATATTACCAGAAAAATTCACCGAAG TAAATAGGTACGGCTCACCAGTATACGCCCACTTACTCGATTTAACAATCACACTTCTCCTCCTATTAATTCCAGTATTT TCAATTAATGCTGCAGTATCATTATACGGAACTACAATTTTGGGTGCTATATATTTATTCTTTGGAGTTTTAGCTGGAAC GCTGTATGGTTTTAAGAATAATGAGAAGATATTGAAAGTTTTCGGAATTTTAGCAAGTGGTTACTTAGCCTATTTAACAT ACGAAGCCGCAACAAACCCATTAATAGGTTTCACAACAACACAAGGGATTAATATAACAACTCTATTGTTCGTTATATTA GCATATGTGTTCGCTATTGGAGTATTCTCAGCATCTTATTTAAAGCATAAAAGAGAGGGTGTAGACTTAACTATTTTATT TAAAGAGATACCCCCTGAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAATCTGTTAAAGTATTTTTATAAGACTTCTAGCTTAAAAAAGAAGTTAAAAAATTAACTCAAAAGTAAGTTTTAAAAT AAACAATTTTTAGTTTATAC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAGGTAAAAATTAAGATATTAATTTTTTATAACTACAACCCCCCTTTTAATCTCATGGACCTAGGAGTATTCTTTGCC TCTTTAGGAATTTCTTTACT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Amino Acid Transporter; Amino Acid Permease-Associated Protein
Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 512
Protein sequence:
>513_residues MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRT GGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLI FYAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWT VAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVF SINAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE
Sequences:
>Translated_513_residues MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRT GGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLI FYAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWT VAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVF SINAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE >Mature_512_residues AEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRTG GDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIF YAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFSL LATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWTV AIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFS INAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVILA YVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56517; Mature: 56385
Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGF CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LLSIPQIIVYTFMTLKIRRTGGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSAS HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIFYAISAIFFGIVIALNIRKA CCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC KWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAGYNFNISAYPTFVYNFWTVAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFA HCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFSINAAVSLYGTTILGAIYLF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHH AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCC >Mature Secondary Structure AEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGF CCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LLSIPQIIVYTFMTLKIRRTGGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSAS HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIFYAISAIFFGIVIALNIRKA CCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC KWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDL HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAGYNFNISAYPTFVYNFWTVAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFA HCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFSINAAVSLYGTTILGAIYLF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHH AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA