Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15921907

Identifier: 15921907

GI number: 15921907

Start: 1603956

End: 1605497

Strand: Reverse

Name: 15921907

Synonym: ST1607

Alternate gene names: NA

Gene position: 1605497-1603956 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15921908

Following gene: 15921906

Centisome position: 59.58

GC content: 33.85

Gene sequence:

>1542_bases
ATGGCTGAGAAAAAATCACTTTTCATTAGAGAGAGCTCAGGTTTAATTAAGCAAGTAAATCTATTAGACGCTGTTATGTT
AAATCTAGGCAATATGTCTGCTGGAGAAGCGTTATTCCAGTCGATTTCTCCATATATTAGTAACGGTGCAATACTTTGGT
TAGCCAGTATATTGGGGTTTCTACTATCAATACCTCAGATTATAGTCTATACTTTCATGACATTAAAAATAAGAAGAACT
GGAGGGGATTATGTATGGATTTCTAGAATTATAGATGGTCGTTTAGGATCAATTCTAGCATTGTCATATTTAATTCAATC
AACTGCATTCTTTGCGATAATAGCATTCTTCTCAGCTTCCTCAGTTAACTCAGTACTCTGTACTATAGGTATAATGAATC
ATAACCATCAACTTATAAACTTAGCAAATTCAGTCTTTGTAAATCCTTACGGAAATGTAACACTTGACCAAAGATTAATA
TTCTATGCAATTTCGGCAATTTTCTTTGGAATAGTTATCGCTCTTAATATTAGAAAAGCAAAATGGGGTTTTACTTTAGT
TACCGTATTGGGAATATTTTCCATCTTTGCCTTATTACTGGCAATGATTGTTGTTGGTGTTAACTCTGGTGATTTCTTTG
CTAAATTACAACCATTCTTATCAGCATATAATATTTCAGCACCAGTTGGAAAAAGAGCGTTTTTACCCAGTAACTTTAGC
CTATTAGCAACCCTTTCATTACTTCCACTATTTGCATTATATACTTATCCATGGATAAATGCTGGTCCTTCAGTATCAGC
TGAGTTTAAGAATTCCGATAAAGTGGCTAAATTAAACATTATTATAGCCTCAGTAGTAACATTCCTTTTAGTAACATTAG
GATTTATGGAAATGGACTTAGTGGCAGGCTATAATTTTAACATTTCAGCCTATCCCACATTTGTTTATAACTTTTGGACT
GTCGCAATAGCATTGGCTGGAAATCAAGCATTACAATGGATTATAGGACTTGGACTTATACTATGGAACTTTTACACATT
GTCCTATGGCGTTGTTATGTTCTCCAGATACGTTTTCGCACTCTCATTTGATAGAATATTACCAGAAAAATTCACCGAAG
TAAATAGGTACGGCTCACCAGTATACGCCCACTTACTCGATTTAACAATCACACTTCTCCTCCTATTAATTCCAGTATTT
TCAATTAATGCTGCAGTATCATTATACGGAACTACAATTTTGGGTGCTATATATTTATTCTTTGGAGTTTTAGCTGGAAC
GCTGTATGGTTTTAAGAATAATGAGAAGATATTGAAAGTTTTCGGAATTTTAGCAAGTGGTTACTTAGCCTATTTAACAT
ACGAAGCCGCAACAAACCCATTAATAGGTTTCACAACAACACAAGGGATTAATATAACAACTCTATTGTTCGTTATATTA
GCATATGTGTTCGCTATTGGAGTATTCTCAGCATCTTATTTAAAGCATAAAAGAGAGGGTGTAGACTTAACTATTTTATT
TAAAGAGATACCCCCTGAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATCTGTTAAAGTATTTTTATAAGACTTCTAGCTTAAAAAAGAAGTTAAAAAATTAACTCAAAAGTAAGTTTTAAAAT
AAACAATTTTTAGTTTATAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGGTAAAAATTAAGATATTAATTTTTTATAACTACAACCCCCCTTTTAATCTCATGGACCTAGGAGTATTCTTTGCC
TCTTTAGGAATTTCTTTACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Amino Acid Transporter; Amino Acid Permease-Associated Protein

Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 512

Protein sequence:

>513_residues
MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRT
GGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLI
FYAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS
LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWT
VAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVF
SINAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL
AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE

Sequences:

>Translated_513_residues
MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRT
GGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLI
FYAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS
LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWT
VAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVF
SINAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL
AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE
>Mature_512_residues
AEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGFLLSIPQIIVYTFMTLKIRRTG
GDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSASSVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIF
YAISAIFFGIVIALNIRKAKWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFSL
LATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDLVAGYNFNISAYPTFVYNFWTV
AIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFALSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFS
INAAVSLYGTTILGAIYLFFGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVILA
YVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56517; Mature: 56385

Theoretical pI: Translated: 9.53; Mature: 9.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGF
CCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LLSIPQIIVYTFMTLKIRRTGGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSAS
HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIFYAISAIFFGIVIALNIRKA
CCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC
KWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH
LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAGYNFNISAYPTFVYNFWTVAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFA
HCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFSINAAVSLYGTTILGAIYLF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure 
AEKKSLFIRESSGLIKQVNLLDAVMLNLGNMSAGEALFQSISPYISNGAILWLASILGF
CCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LLSIPQIIVYTFMTLKIRRTGGDYVWISRIIDGRLGSILALSYLIQSTAFFAIIAFFSAS
HHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SVNSVLCTIGIMNHNHQLINLANSVFVNPYGNVTLDQRLIFYAISAIFFGIVIALNIRKA
CCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC
KWGFTLVTVLGIFSIFALLLAMIVVGVNSGDFFAKLQPFLSAYNISAPVGKRAFLPSNFS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHH
LLATLSLLPLFALYTYPWINAGPSVSAEFKNSDKVAKLNIIIASVVTFLLVTLGFMEMDL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAGYNFNISAYPTFVYNFWTVAIALAGNQALQWIIGLGLILWNFYTLSYGVVMFSRYVFA
HCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFDRILPEKFTEVNRYGSPVYAHLLDLTITLLLLLIPVFSINAAVSLYGTTILGAIYLF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGVLAGTLYGFKNNEKILKVFGILASGYLAYLTYEAATNPLIGFTTTQGINITTLLFVIL
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
AYVFAIGVFSASYLKHKREGVDLTILFKEIPPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA