| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921890
Identifier: 15921890
GI number: 15921890
Start: 1586112
End: 1587566
Strand: Direct
Name: 15921890
Synonym: ST1591
Alternate gene names: NA
Gene position: 1586112-1587566 (Clockwise)
Preceding gene: 15921889
Following gene: 15921896
Centisome position: 58.86
GC content: 30.72
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ACATCACCATCACAATTATTTAGTGCTACAAACTCTAACATGGTATTATTCTTTAGCGATCCAGATATATATCCATATCC TATTTAGGAAGTGATAAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTATATGCTAAATATGCTGAAATATATTCAAAGATATAATGGTAAAATAATTTTTTATTCTTTGATTTTCTTCTCATA ATTATTGAAACATTTTAGTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 484; Mature: 484
Protein sequence:
>484_residues MNKINKLIFSFPSKILNKSYILALIIVPITIFFPIPSVIFTLIFVGLLFQGLYLQRLMSTNKPYMVIEILAILSFIYAML FFKELYNLTNLIFLSYLIPVSLCIFRLRREIRIKISYLENSKVAFLLLLSAFVLVWFASGFLDLVTTTISLFGQFGSSFI LLDALSAFASVTASSWFMISMGIWLGILGIFRVIEYNKLENKIRYLLMMFAYAFYSIYLPSFSPISNEVQYIPYMWFNGL GTYGPVEPSYLFDGIIGTFVVTAVLSFMFGSRQICSVTCTAPYMLQGTFLDSMKKYNRSSKIGRKTLTSRLSSWYKWVMI LTWSSLLVFAVLSYLDYEGIITFSILGNDPTVFYASLYFNVIWYIQFMLMPFLGNYACVNNGICAWGSFNQLFGYLGFFK LKIKDPKQCLNCKTVDCANACPVGLTDMRASFIKKGEFKSFKCIGVGDCIEACPYNNIMFYDFRSWIRSKLNKKGIIKDS VELH
Sequences:
>Translated_484_residues MNKINKLIFSFPSKILNKSYILALIIVPITIFFPIPSVIFTLIFVGLLFQGLYLQRLMSTNKPYMVIEILAILSFIYAML FFKELYNLTNLIFLSYLIPVSLCIFRLRREIRIKISYLENSKVAFLLLLSAFVLVWFASGFLDLVTTTISLFGQFGSSFI LLDALSAFASVTASSWFMISMGIWLGILGIFRVIEYNKLENKIRYLLMMFAYAFYSIYLPSFSPISNEVQYIPYMWFNGL GTYGPVEPSYLFDGIIGTFVVTAVLSFMFGSRQICSVTCTAPYMLQGTFLDSMKKYNRSSKIGRKTLTSRLSSWYKWVMI LTWSSLLVFAVLSYLDYEGIITFSILGNDPTVFYASLYFNVIWYIQFMLMPFLGNYACVNNGICAWGSFNQLFGYLGFFK LKIKDPKQCLNCKTVDCANACPVGLTDMRASFIKKGEFKSFKCIGVGDCIEACPYNNIMFYDFRSWIRSKLNKKGIIKDS VELH >Mature_484_residues MNKINKLIFSFPSKILNKSYILALIIVPITIFFPIPSVIFTLIFVGLLFQGLYLQRLMSTNKPYMVIEILAILSFIYAML FFKELYNLTNLIFLSYLIPVSLCIFRLRREIRIKISYLENSKVAFLLLLSAFVLVWFASGFLDLVTTTISLFGQFGSSFI LLDALSAFASVTASSWFMISMGIWLGILGIFRVIEYNKLENKIRYLLMMFAYAFYSIYLPSFSPISNEVQYIPYMWFNGL GTYGPVEPSYLFDGIIGTFVVTAVLSFMFGSRQICSVTCTAPYMLQGTFLDSMKKYNRSSKIGRKTLTSRLSSWYKWVMI LTWSSLLVFAVLSYLDYEGIITFSILGNDPTVFYASLYFNVIWYIQFMLMPFLGNYACVNNGICAWGSFNQLFGYLGFFK LKIKDPKQCLNCKTVDCANACPVGLTDMRASFIKKGEFKSFKCIGVGDCIEACPYNNIMFYDFRSWIRSKLNKKGIIKDS VELH
Specific function: Unknown
COG id: COG0348
COG function: function code C; Polyferredoxin
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55513; Mature: 55513
Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.5 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 6.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.5 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 6.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKINKLIFSFPSKILNKSYILALIIVPITIFFPIPSVIFTLIFVGLLFQGLYLQRLMST CCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NKPYMVIEILAILSFIYAMLFFKELYNLTNLIFLSYLIPVSLCIFRLRREIRIKISYLEN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC SKVAFLLLLSAFVLVWFASGFLDLVTTTISLFGQFGSSFILLDALSAFASVTASSWFMIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIWLGILGIFRVIEYNKLENKIRYLLMMFAYAFYSIYLPSFSPISNEVQYIPYMWFNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECHHHHCCC GTYGPVEPSYLFDGIIGTFVVTAVLSFMFGSRQICSVTCTAPYMLQGTFLDSMKKYNRSS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCHHH KIGRKTLTSRLSSWYKWVMILTWSSLLVFAVLSYLDYEGIITFSILGNDPTVFYASLYFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH VIWYIQFMLMPFLGNYACVNNGICAWGSFNQLFGYLGFFKLKIKDPKQCLNCKTVDCANA HHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCEECCCCHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCC CPVGLTDMRASFIKKGEFKSFKCIGVGDCIEACPYNNIMFYDFRSWIRSKLNKKGIIKDS CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VELH CCCC >Mature Secondary Structure MNKINKLIFSFPSKILNKSYILALIIVPITIFFPIPSVIFTLIFVGLLFQGLYLQRLMST CCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NKPYMVIEILAILSFIYAMLFFKELYNLTNLIFLSYLIPVSLCIFRLRREIRIKISYLEN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECC SKVAFLLLLSAFVLVWFASGFLDLVTTTISLFGQFGSSFILLDALSAFASVTASSWFMIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MGIWLGILGIFRVIEYNKLENKIRYLLMMFAYAFYSIYLPSFSPISNEVQYIPYMWFNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECHHHHCCC GTYGPVEPSYLFDGIIGTFVVTAVLSFMFGSRQICSVTCTAPYMLQGTFLDSMKKYNRSS CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCHHH KIGRKTLTSRLSSWYKWVMILTWSSLLVFAVLSYLDYEGIITFSILGNDPTVFYASLYFN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH VIWYIQFMLMPFLGNYACVNNGICAWGSFNQLFGYLGFFKLKIKDPKQCLNCKTVDCANA HHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCEECCCCHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCCC CPVGLTDMRASFIKKGEFKSFKCIGVGDCIEACPYNNIMFYDFRSWIRSKLNKKGIIKDS CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VELH CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA