| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921242
Identifier: 15921242
GI number: 15921242
Start: 974447
End: 975877
Strand: Reverse
Name: 15921242
Synonym: ST0996
Alternate gene names: NA
Gene position: 975877-974447 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921243
Following gene: 15921241
Centisome position: 36.21
GC content: 31.38
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATTGTTAAAAGAATTTAATTGGAAGGATATAGTAAAAATTTACCTTACATTTTGGTTAGGCCTCTTTGGAGGAGGCTTA ATAGATTACTTCAAAGGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476
Protein sequence:
>476_residues MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV
Sequences:
>Translated_476_residues MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV >Mature_476_residues MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53663; Mature: 53663
Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKAPFKGGLQKSVQESKSYSKNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITS HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVKIIRVPKFGHNGLTTGVLALS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH HRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS CCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYGKNIKSTEEAPLFSRITHTSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSI HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCE IIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSMNFSFLLAGLYIISSMSALNG EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKAPFKGGLQKSVQESKSYSKNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITS HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC ITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVKIIRVPKFGHNGLTTGVLALS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH HRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS CCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYGKNIKSTEEAPLFSRITHTSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSI HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCE IIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSMNFSFLLAGLYIISSMSALNG EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC YPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
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Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA