Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15921242

Identifier: 15921242

GI number: 15921242

Start: 974447

End: 975877

Strand: Reverse

Name: 15921242

Synonym: ST0996

Alternate gene names: NA

Gene position: 975877-974447 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15921243

Following gene: 15921241

Centisome position: 36.21

GC content: 31.38

Gene sequence:

>1431_bases
GTGATAAAATTGAATAAAAAAAAGTCAGCATTTTTCTTTTATCTCCTTTCCATATTGAGTTCTATCTTTTCATTTTTTAC
ATATAAAATCAATCCTTTTTTAGCGCGAATAATCCTTTTTATGGGTATCGGATTTGTAAGCATAGGAATATTTTTCACAG
TCCTTACTATAATAGTCCTTCTTAAAGCCCCTTTTAAAGGGGGTTTACAGAAGTCTGTGCAAGAATCGAAATCATATAGT
AAAAACGTTTATAATCCTTTTATTTCAATCGTGAAAATGTCTTTGCTTCTCTCTTTCTCATTAATACTTTTTTCATTTTT
TATTTTTGCTTGTTTTGTTTGGATTCTTCACATAACTTCTATTACCCCTATGGATTTATTTGTTTCGATTGCCTTAAACT
TCTTATTTCAGATTTTATTTTCAATGATAGTATTGTCTAGGGTTAATTTATTTAAAGAGGTTAAACCTGGAGAAGTTAAA
ATTATTAGGGTTCCTAAATTTGGGCATAATGGTTTGACTACGGGTGTTCTTGCATTATCACATCGTTCACCTTTTAAGGA
AATAATATTTATATCTGATACTGTAGATGAATCGCTTGTAAAGATAGTTGAGGCGCATGAGTTAGCCCATGCAAAGGAAT
ATCATCCAATTTTACTTCAATTAGCAGGAATATTGCTAGTATCTATTATTGACTCTTTAATATTTTTTACAGCTTTTTCA
TATATTATTCCTCTCGTAAATATTACTATACTTCTTGTAATTAAAACACTTTTAGTAGTGTTGTCTATAGGAGTTGCAAG
TCTCCTCTTCTTGAGGGTTGCGGAATCGAGGGCTGACGCTTTCGCATTTAAGATAATTGGTGAAAAAGCGTATGAGAATT
TACTGGAGATACTTAGAATAAAATATGGTAAAAATATAAAGAGTACTGAGGAAGCCCCTCTATTTAGTAGAATTACTCAC
ACCTCATCAAGGAATGCTTTAAAAACTGGAGATCCTTTATCCTCCTTAGGCTTTTGGGAGTTTCCAACAATCCTCTCTTT
TGTAGCAGCAACAATTACAATAATGCGTACAAACTCAATTATTATAATAGAACTCTTCCCTTTCCTTTATATAGGTATTC
TTGTAATATTATTTCTAGTAGGGCTAGTTTTCTTACCCGTTGTGAAGAAGTACTATGGAATGACTGAAAGGGGAAGTATG
AACTTCTCCTTCCTACTTGCCGGACTTTATATAATTTCAAGTATGAGTGCACTAAATGGCTACCCTAACATATACTTAAT
TATTTTACTATTCTTAGTTGGGATAGCTTTAACATATATGATTGCTAGAGTGTTTCTAAAATCTAAAAAGGTTATTATAT
ACACTTTCCTAATATATCTAGGCATAAACGTTCTCATTAGCGTAGTCAGAATATTTCTATATGGTGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTGCCGCTGTAGCTCACTATATGGGTTATAACACGCTAGCATTAGTACTTCTAATTGTAGGCATAGGGCTTGCATTCA
CCGGTCTAGGCTTCGGTTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTGTTAAAAGAATTTAATTGGAAGGATATAGTAAAAATTTACCTTACATTTTGGTTAGGCCTCTTTGGAGGAGGCTTA
ATAGATTACTTCAAAGGTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 476

Protein sequence:

>476_residues
MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS
KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK
IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS
YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH
TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM
NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV

Sequences:

>Translated_476_residues
MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS
KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK
IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS
YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH
TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM
NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV
>Mature_476_residues
MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVLLKAPFKGGLQKSVQESKSYS
KNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITSITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVK
IIRVPKFGHNGLTTGVLALSHRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS
YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRIKYGKNIKSTEEAPLFSRITH
TSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSIIIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSM
NFSFLLAGLYIISSMSALNGYPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53663; Mature: 53663

Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKAPFKGGLQKSVQESKSYSKNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITS
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVKIIRVPKFGHNGLTTGVLALS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
HRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS
CCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYGKNIKSTEEAPLFSRITHTSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSI
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCE
IIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSMNFSFLLAGLYIISSMSALNG
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
YPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIKLNKKKSAFFFYLLSILSSIFSFFTYKINPFLARIILFMGIGFVSIGIFFTVLTIIVL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKAPFKGGLQKSVQESKSYSKNVYNPFISIVKMSLLLSFSLILFSFFIFACFVWILHITS
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
ITPMDLFVSIALNFLFQILFSMIVLSRVNLFKEVKPGEVKIIRVPKFGHNGLTTGVLALS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHH
HRSPFKEIIFISDTVDESLVKIVEAHELAHAKEYHPILLQLAGILLVSIIDSLIFFTAFS
CCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIIPLVNITILLVIKTLLVVLSIGVASLLFLRVAESRADAFAFKIIGEKAYENLLEILRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KYGKNIKSTEEAPLFSRITHTSSRNALKTGDPLSSLGFWEFPTILSFVAATITIMRTNSI
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCE
IIIELFPFLYIGILVILFLVGLVFLPVVKKYYGMTERGSMNFSFLLAGLYIISSMSALNG
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
YPNIYLIILLFLVGIALTYMIARVFLKSKKVIIYTFLIYLGINVLISVVRIFLYGV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA