| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15921018
Identifier: 15921018
GI number: 15921018
Start: 764560
End: 765567
Strand: Direct
Name: 15921018
Synonym: ST0784
Alternate gene names: NA
Gene position: 764560-765567 (Clockwise)
Preceding gene: 15921016
Following gene: 15921019
Centisome position: 28.37
GC content: 33.93
Gene sequence:
>1008_bases ATGAATAGTGAAACTAAGCTGGCAAGCAGCTGGTTTATTTGGGGACTTTCATATTACCTTTATTATCCCTTTGTTTCACT ATTTGCTGTAAAATTTGTGAAAGACGTCACAATCCTCTATTTAATTTCTACTCTATTTGCAATTCCCATGCCACTTATCG GGAGTAAGTTAGCTAGAAAAATCGGTCTCGTAAAAACAATGATGTTAGGTGGTATACTTTCTGGGTTAGGACTAGTTCTG TTCTCCTTTTCAACATCCTTACCCTCTCTGATTATATCTTACGTAATTGCTTCAACGTTCTTCATATCTTTACCCAGTTA TTACTCCTACATGAATAACTTAGGTAAGGGAACCATTTCGAAAATATGGGCAATTTCCATTATACCTTCTCTTTTTACTC CCTCTATAGGTGGAGTAATAGCCTCGGTTCTTGGACTAAGGGCTGTTTTCCTTATAGGTGGTATCCTTATGGCTTTCACT GCCCTTCCTCTATTAAGACTTAAAGAGATTCAAATTATGCAAGACTCTCTAGTCTTTGATGTAAAACTATTAATTCCTAT CGTGGTTATTTTACCTATTGCACTAGCTTTTCCGTTTGTTTACTTAATCCTTAAACAGAATTATTCGATGAGTTATGAGA ATATCGGTGTTATAGCAACATTAGCTGAGGTTATGGGCGCATTCTTTACTTTTTTATATTCTAAGTTTACAAAGAGATTC TTTCTCTCTATCTATCTTATTCTTTTCTCTCTAATTTACCTTATTTACTTTAATCCAATGTTTACACTCTTTTTCGGACT TTGGGAAGCTATCATTCCAAGTGCTTTAGAAGAGAGTAAAGAGAAAAGCCCAGAAGCGTTTGGAATAATTAACTCATTTC AGCAAATAGGTTGGTTTACGGGTTATCTTTTCAGTTACCTTGAATTTTCCATTAAAACCTCTATTCTTATTTCCTCGATT ATTTCAGTTCTTTTAGGTCTTATATTTCTTGTATTAAATAAACTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTAAACAAGCATAAAAATCTTTTACCCTAACTATTAAGGTTATTATAAATAGAAAAAAATAAAAATAATCTTAAAAGG AAAGAAAAAATTTTTCATGC
Downstream 100 bases:
>100_bases AATATATTTATCCTTTAAGTAAACTGAGTTTTATTCGTCATAAAGGTGTTAAATCAAAAAGCTGATGAGTACTCCTTAAG TATATTATGTTCATTCTAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 335; Mature: 335
Protein sequence:
>335_residues MNSETKLASSWFIWGLSYYLYYPFVSLFAVKFVKDVTILYLISTLFAIPMPLIGSKLARKIGLVKTMMLGGILSGLGLVL FSFSTSLPSLIISYVIASTFFISLPSYYSYMNNLGKGTISKIWAISIIPSLFTPSIGGVIASVLGLRAVFLIGGILMAFT ALPLLRLKEIQIMQDSLVFDVKLLIPIVVILPIALAFPFVYLILKQNYSMSYENIGVIATLAEVMGAFFTFLYSKFTKRF FLSIYLILFSLIYLIYFNPMFTLFFGLWEAIIPSALEESKEKSPEAFGIINSFQQIGWFTGYLFSYLEFSIKTSILISSI ISVLLGLIFLVLNKL
Sequences:
>Translated_335_residues MNSETKLASSWFIWGLSYYLYYPFVSLFAVKFVKDVTILYLISTLFAIPMPLIGSKLARKIGLVKTMMLGGILSGLGLVL FSFSTSLPSLIISYVIASTFFISLPSYYSYMNNLGKGTISKIWAISIIPSLFTPSIGGVIASVLGLRAVFLIGGILMAFT ALPLLRLKEIQIMQDSLVFDVKLLIPIVVILPIALAFPFVYLILKQNYSMSYENIGVIATLAEVMGAFFTFLYSKFTKRF FLSIYLILFSLIYLIYFNPMFTLFFGLWEAIIPSALEESKEKSPEAFGIINSFQQIGWFTGYLFSYLEFSIKTSILISSI ISVLLGLIFLVLNKL >Mature_335_residues MNSETKLASSWFIWGLSYYLYYPFVSLFAVKFVKDVTILYLISTLFAIPMPLIGSKLARKIGLVKTMMLGGILSGLGLVL FSFSTSLPSLIISYVIASTFFISLPSYYSYMNNLGKGTISKIWAISIIPSLFTPSIGGVIASVLGLRAVFLIGGILMAFT ALPLLRLKEIQIMQDSLVFDVKLLIPIVVILPIALAFPFVYLILKQNYSMSYENIGVIATLAEVMGAFFTFLYSKFTKRF FLSIYLILFSLIYLIYFNPMFTLFFGLWEAIIPSALEESKEKSPEAFGIINSFQQIGWFTGYLFSYLEFSIKTSILISSI ISVLLGLIFLVLNKL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 37538; Mature: 37538
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNSETKLASSWFIWGLSYYLYYPFVSLFAVKFVKDVTILYLISTLFAIPMPLIGSKLARK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IGLVKTMMLGGILSGLGLVLFSFSTSLPSLIISYVIASTFFISLPSYYSYMNNLGKGTIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH KIWAISIIPSLFTPSIGGVIASVLGLRAVFLIGGILMAFTALPLLRLKEIQIMQDSLVFD HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKLLIPIVVILPIALAFPFVYLILKQNYSMSYENIGVIATLAEVMGAFFTFLYSKFTKRF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSIYLILFSLIYLIYFNPMFTLFFGLWEAIIPSALEESKEKSPEAFGIINSFQQIGWFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GYLFSYLEFSIKTSILISSIISVLLGLIFLVLNKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNSETKLASSWFIWGLSYYLYYPFVSLFAVKFVKDVTILYLISTLFAIPMPLIGSKLARK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IGLVKTMMLGGILSGLGLVLFSFSTSLPSLIISYVIASTFFISLPSYYSYMNNLGKGTIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH KIWAISIIPSLFTPSIGGVIASVLGLRAVFLIGGILMAFTALPLLRLKEIQIMQDSLVFD HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKLLIPIVVILPIALAFPFVYLILKQNYSMSYENIGVIATLAEVMGAFFTFLYSKFTKRF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLSIYLILFSLIYLIYFNPMFTLFFGLWEAIIPSALEESKEKSPEAFGIINSFQQIGWFT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GYLFSYLEFSIKTSILISSIISVLLGLIFLVLNKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA