| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is pknB [H]
Identifier: 15921012
GI number: 15921012
Start: 755751
End: 757856
Strand: Reverse
Name: pknB [H]
Synonym: ST0778
Alternate gene names: 15921012
Gene position: 757856-755751 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921013
Following gene: 15921011
Centisome position: 28.12
GC content: 30.63
Gene sequence:
>2106_bases GTGGATTACTATAAGCTTAACAGATTATTATCCTTAGGCAATTTAGCTGTAGTATCATATTTCATACTAGAAAACGGGAT AGAAGCTTCATTTCTTCCCTTATTATCTTTTGCAGTAAGTACTTCTATTTCTTCTTCTCCGTTTATTCTGGGTTTATCAC TAATTGTAGGTAGTGCATTATTACCATTATTCTTTTTAAAAGAGATAAGTATACAACTCTTAGTTTTCGCTTTAGTAATA ACTTTACTTTCTATATTCTCAATTAAATTTGATTATCTAAAATTTGTTCCATTCCCACTTTCCTTAATTTTCTATTTTTT TCTCCATCCTATTTCATCCTACTTTTTCTCATTTATAGTCTTAGGTTCTATTTTACTTATAATTAAAAAGAAGATAGTCC CTAGTTTAATCTTCACTGTTGCAATACCTTTCTTCTTAGTTCAAATCTTTTTCTTATACTCAATTTCTCTAACAAAAGTA GGTGTTTCATTATTCGCATTAAATGAAATGGCAAGTATGTCAAAATTTATGCTCCCAGCTGATATTATCGTTATATTGGT TTCTTACTTAAAGAGAGAGTCTTTATACAGCATAATAACCACGTTAGTAATTGTAGTATCTCTTGGTATTTCGGTTCTCT TTCTATATGTTAATCCACCTTTTTCATTGATGTACTCCTCCTCATCAGCAATTGTGTCTTCATCCTTATTATCAGATAGT GAGATAGAAAAGTCTATTTTAGAGAATTTAAACGATGAAAAAAAGATAAAGAACTTATTATTTTTATATAGGGGAGATAT AACTTCATTTTGTCAAAAACTAGTATATAAAGGAAATTGCGAAGCTCTTGTTAAAATCTCAGAAATTATACCGTATAAAA TTAATTATTCCCTTTGTGATTTACATAAGATTGCTGATTGTTATGAGAAGCTTAAAAAAGTACCTTCAAGAGATATAATA TCATTTCTTAGCATAGTAAAGGAGAAAGATATTGAATTAGCTGAAAGGATTGGAAGATTAGCACTAAGTATTTCCCCGTC ACCTAAGCTGATGAAATTAATGGAGGAAATAGAAGTTCTCAGGATGGAATCACTAAAATATAATTGGGATCCAAAAGTTT GGGTTAATAGGATAATTCATGGTTACAGAATTATTGATTATCTGGGTAAAGGAGGTTCCGCATACGTTCTTATTGGTGAG AAGGATAATAAAAAGTATGCTATAAAAATTCCCATATTAATACCTTTGTCCAACGTAGTAGAGAGCTACTACGATTTTAT AAACGAATATTCACAGCTTAGAGAGCTCTCACTGAGTTCTGATAGTATTGTAAGATTTGTTGATGCTATCATTGATGTTT CTGCAATAAAAAGAATTAAAGATGGAGATGTTTTAGCTTATTTAAATGAACCACCAATTTTGGTCATGGAATTTATGGAA GGGAAGAGTGTAAAAGAGCTTATACAGAACGATAACGTATACTACTCCGATGAATGGGAGAAAATTGTTTTATTAATAGC TTTAGAAGTAGTGAAATCGTTAGAAGATATTCACAAGGCCGGGTTTGTTCATTTAGACATTAAGCCTTCAAATATATTAT TCTCCTCTTTACCTGGTAAAACGGGAAAAGAAGTCCTAGATAATCTGACACAGAAAAAAGTAAAAATAAAAATTAGTGAT TTAGGATCAGCTAGAAAAATAGGTGAAAAATTCTCTCAATATACACCAGAATATTGTTCAGTTGATCAAGTAGAGGCAAT AGTTGAAGGAAAAGGAGCAGATCCATCGATGGATATCTATTCTTTGGGAGCCACTATATATAAAATGTTAACAAGAAAGG ATTTTAATCCACCGGAATTGATTAGGTTGTTTAATGAAGCATCTATAATTTATTCAAATGGTGGAGATCCTAAACCCATA TTGCAGAAGGCAAAAGAAGTATATAAGGAGTACTATATGAAGCTTGAAATTCCGGATGTAGATCAACGGTTTAAAGATTT AGTTAAAGAGCTTGTAAATCCAGAGAAGAGACCCACAGCTAGTGAAGTATATAATAAACTTAAAGAGATATTAAATAATG ATGAAAGAAATAGTAATCCCAGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAAAGAATATGATAGATAGGTTAAAGAGAAAATTGGAGTGGTTTGATAAATATCTGAAGTCTTGATAAGCTTTAAATAAA AATTCAAATTTATTTTATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTTTATGAATACTTAGAAAATCAAGGAATTACTAGAAGGCTTACTCCCTCCGATATTGTAGTAGAGCTTATTCTCAATA ATATGGATATAAAAGAGAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701
Protein sequence:
>701_residues MDYYKLNRLLSLGNLAVVSYFILENGIEASFLPLLSFAVSTSISSSPFILGLSLIVGSALLPLFFLKEISIQLLVFALVI TLLSIFSIKFDYLKFVPFPLSLIFYFFLHPISSYFFSFIVLGSILLIIKKKIVPSLIFTVAIPFFLVQIFFLYSISLTKV GVSLFALNEMASMSKFMLPADIIVILVSYLKRESLYSIITTLVIVVSLGISVLFLYVNPPFSLMYSSSSAIVSSSLLSDS EIEKSILENLNDEKKIKNLLFLYRGDITSFCQKLVYKGNCEALVKISEIIPYKINYSLCDLHKIADCYEKLKKVPSRDII SFLSIVKEKDIELAERIGRLALSISPSPKLMKLMEEIEVLRMESLKYNWDPKVWVNRIIHGYRIIDYLGKGGSAYVLIGE KDNKKYAIKIPILIPLSNVVESYYDFINEYSQLRELSLSSDSIVRFVDAIIDVSAIKRIKDGDVLAYLNEPPILVMEFME GKSVKELIQNDNVYYSDEWEKIVLLIALEVVKSLEDIHKAGFVHLDIKPSNILFSSLPGKTGKEVLDNLTQKKVKIKISD LGSARKIGEKFSQYTPEYCSVDQVEAIVEGKGADPSMDIYSLGATIYKMLTRKDFNPPELIRLFNEASIIYSNGGDPKPI LQKAKEVYKEYYMKLEIPDVDQRFKDLVKELVNPEKRPTASEVYNKLKEILNNDERNSNPR
Sequences:
>Translated_701_residues MDYYKLNRLLSLGNLAVVSYFILENGIEASFLPLLSFAVSTSISSSPFILGLSLIVGSALLPLFFLKEISIQLLVFALVI TLLSIFSIKFDYLKFVPFPLSLIFYFFLHPISSYFFSFIVLGSILLIIKKKIVPSLIFTVAIPFFLVQIFFLYSISLTKV GVSLFALNEMASMSKFMLPADIIVILVSYLKRESLYSIITTLVIVVSLGISVLFLYVNPPFSLMYSSSSAIVSSSLLSDS EIEKSILENLNDEKKIKNLLFLYRGDITSFCQKLVYKGNCEALVKISEIIPYKINYSLCDLHKIADCYEKLKKVPSRDII SFLSIVKEKDIELAERIGRLALSISPSPKLMKLMEEIEVLRMESLKYNWDPKVWVNRIIHGYRIIDYLGKGGSAYVLIGE KDNKKYAIKIPILIPLSNVVESYYDFINEYSQLRELSLSSDSIVRFVDAIIDVSAIKRIKDGDVLAYLNEPPILVMEFME GKSVKELIQNDNVYYSDEWEKIVLLIALEVVKSLEDIHKAGFVHLDIKPSNILFSSLPGKTGKEVLDNLTQKKVKIKISD LGSARKIGEKFSQYTPEYCSVDQVEAIVEGKGADPSMDIYSLGATIYKMLTRKDFNPPELIRLFNEASIIYSNGGDPKPI LQKAKEVYKEYYMKLEIPDVDQRFKDLVKELVNPEKRPTASEVYNKLKEILNNDERNSNPR >Mature_701_residues MDYYKLNRLLSLGNLAVVSYFILENGIEASFLPLLSFAVSTSISSSPFILGLSLIVGSALLPLFFLKEISIQLLVFALVI TLLSIFSIKFDYLKFVPFPLSLIFYFFLHPISSYFFSFIVLGSILLIIKKKIVPSLIFTVAIPFFLVQIFFLYSISLTKV GVSLFALNEMASMSKFMLPADIIVILVSYLKRESLYSIITTLVIVVSLGISVLFLYVNPPFSLMYSSSSAIVSSSLLSDS EIEKSILENLNDEKKIKNLLFLYRGDITSFCQKLVYKGNCEALVKISEIIPYKINYSLCDLHKIADCYEKLKKVPSRDII SFLSIVKEKDIELAERIGRLALSISPSPKLMKLMEEIEVLRMESLKYNWDPKVWVNRIIHGYRIIDYLGKGGSAYVLIGE KDNKKYAIKIPILIPLSNVVESYYDFINEYSQLRELSLSSDSIVRFVDAIIDVSAIKRIKDGDVLAYLNEPPILVMEFME GKSVKELIQNDNVYYSDEWEKIVLLIALEVVKSLEDIHKAGFVHLDIKPSNILFSSLPGKTGKEVLDNLTQKKVKIKISD LGSARKIGEKFSQYTPEYCSVDQVEAIVEGKGADPSMDIYSLGATIYKMLTRKDFNPPELIRLFNEASIIYSNGGDPKPI LQKAKEVYKEYYMKLEIPDVDQRFKDLVKELVNPEKRPTASEVYNKLKEILNNDERNSNPR
Specific function: Unknown
COG id: COG0515
COG function: function code RTKL; Serine/threonine protein kinase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011009 - InterPro: IPR005543 - InterPro: IPR000719 - InterPro: IPR017441 - InterPro: IPR017442 - InterPro: IPR008271 [H]
Pfam domain/function: PF03793 PASTA; PF00069 Pkinase [H]
EC number: =2.7.11.1 [H]
Molecular weight: Translated: 79611; Mature: 79611
Theoretical pI: Translated: 7.81; Mature: 7.81
Prosite motif: PS00092 N6_MTASE ; PS00107 PROTEIN_KINASE_ATP ; PS00108 PROTEIN_KINASE_ST ; PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM ; PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDYYKLNRLLSLGNLAVVSYFILENGIEASFLPLLSFAVSTSISSSPFILGLSLIVGSAL CCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LPLFFLKEISIQLLVFALVITLLSIFSIKFDYLKFVPFPLSLIFYFFLHPISSYFFSFIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGSILLIIKKKIVPSLIFTVAIPFFLVQIFFLYSISLTKVGVSLFALNEMASMSKFMLPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH DIIVILVSYLKRESLYSIITTLVIVVSLGISVLFLYVNPPFSLMYSSSSAIVSSSLLSDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHEEECCCHHHHHHHHCCHH EIEKSILENLNDEKKIKNLLFLYRGDITSFCQKLVYKGNCEALVKISEIIPYKINYSLCD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEECCHHHH LHKIADCYEKLKKVPSRDIISFLSIVKEKDIELAERIGRLALSISPSPKLMKLMEEIEVL HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHH RMESLKYNWDPKVWVNRIIHGYRIIDYLGKGGSAYVLIGEKDNKKYAIKIPILIPLSNVV HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECHHHHH ESYYDFINEYSQLRELSLSSDSIVRFVDAIIDVSAIKRIKDGDVLAYLNEPPILVMEFME HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHC GKSVKELIQNDNVYYSDEWEKIVLLIALEVVKSLEDIHKAGFVHLDIKPSNILFSSLPGK CCHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHCCCCCC TGKEVLDNLTQKKVKIKISDLGSARKIGEKFSQYTPEYCSVDQVEAIVEGKGADPSMDIY CHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH SLGATIYKMLTRKDFNPPELIRLFNEASIIYSNGGDPKPILQKAKEVYKEYYMKLEIPDV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH DQRFKDLVKELVNPEKRPTASEVYNKLKEILNNDERNSNPR HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDYYKLNRLLSLGNLAVVSYFILENGIEASFLPLLSFAVSTSISSSPFILGLSLIVGSAL CCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LPLFFLKEISIQLLVFALVITLLSIFSIKFDYLKFVPFPLSLIFYFFLHPISSYFFSFIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGSILLIIKKKIVPSLIFTVAIPFFLVQIFFLYSISLTKVGVSLFALNEMASMSKFMLPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH DIIVILVSYLKRESLYSIITTLVIVVSLGISVLFLYVNPPFSLMYSSSSAIVSSSLLSDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHEEECCCHHHHHHHHCCHH EIEKSILENLNDEKKIKNLLFLYRGDITSFCQKLVYKGNCEALVKISEIIPYKINYSLCD HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEECCHHHH LHKIADCYEKLKKVPSRDIISFLSIVKEKDIELAERIGRLALSISPSPKLMKLMEEIEVL HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHH RMESLKYNWDPKVWVNRIIHGYRIIDYLGKGGSAYVLIGEKDNKKYAIKIPILIPLSNVV HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECHHHHH ESYYDFINEYSQLRELSLSSDSIVRFVDAIIDVSAIKRIKDGDVLAYLNEPPILVMEFME HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHC GKSVKELIQNDNVYYSDEWEKIVLLIALEVVKSLEDIHKAGFVHLDIKPSNILFSSLPGK CCHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHCCCCCC TGKEVLDNLTQKKVKIKISDLGSARKIGEKFSQYTPEYCSVDQVEAIVEGKGADPSMDIY CHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH SLGATIYKMLTRKDFNPPELIRLFNEASIIYSNGGDPKPILQKAKEVYKEYYMKLEIPDV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH DQRFKDLVKELVNPEKRPTASEVYNKLKEILNNDERNSNPR HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12948626 [H]