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The map label for this gene is 15920738

Identifier: 15920738

GI number: 15920738

Start: 516442

End: 518346

Strand: Direct

Name: 15920738

Synonym: ST0521

Alternate gene names: NA

Gene position: 516442-518346 (Clockwise)

Preceding gene: 15920737

Following gene: 15920739

Centisome position: 19.16

GC content: 31.76

Gene sequence:

>1905_bases
ATGTATAATGTTGAGATATATTATATGGCGGTTATTTCTAGTGGGAAGAAAAAACCATCAGATGAAAAGATTAATATATC
GCAAATAGATCTGTTATTTTATAGAACATCACTAGTAGAACCGCTTGCTAAATCCTTAGATAAAAAGCTTAAGCAAGCTG
GCTTGTCAGATGATCCAAGAATTTATGCTTCAAGGTTATTTTTCTTCTTGATTTTAGGTATAATTATTGGAGTAATGTTA
TTATTTGCAGGTTTTATATTTTTAAGAGAATTTGAATTAACTAAACTATCTAAATTTGCTGTAGGCGGAATTATGTTCAT
ATTGTTTGGTGTGATTATTCCAGTAGTAACATACCTAGTATTAATTTCTAACGTATCACAGAAAGTAGAAAGTAGAAGAA
TTGGAGTTGAGGCTGAAACTCTAGCATTTTCGGCTTTATTTTTAGTATTCCTTAGAAGTGGACTTTCTCCAAGATTACTC
TTTGAAAATCTCTCAAAAACTAAAGCATTTAATTATATGAATAGTATAGCAAAATATATTGTGAAAAGGATTAATTTTCT
AGGAGAATCAGTGGAAAAGGCAATAGATGAGTCAACTAAAATAGTTCCTTCTAAACTATATAATGATCTAATGGTAACAT
ATATTACAGCGATTAGAACTGGTGCCCCAGTTTTTGAGACAATGCAATCTAAAATTAAGGATATCCTAAAAAATATGGAA
TTGCAAGCATCAAAAGCTGCGGATAATTTATCGGGTGTTGGAGAAGGCTACGTTACATGGTTAGCTTCAGGTTTTATTAG
CTTTTTCTTAATATTAATTCTAGAAGCAGTTTTTCCCCAATTGCATGTATTACCAATTGGAATATTAGGGGCTTTTGCTG
TCCTAGGAATTCCAATTGTAAACATTTTATTTGTATGGGTAGTAGATCAAACACAGTATAAATTCCCAGAAAAACAATTG
CGAGCTGACAAGATTTTCTTAATGTTGTTCCCAGTAGGAATTATTCTTGGCATAATTTTAATGATAGTTCTAGAGCCTAT
AATAGCTAAGATCACTCATCAAATCCCTGTAGCTCCTAAATACATGTTGTTAGGCCTATTTACACTTTCTGGAAATTTAA
ATTATATTCCAGCTACTGTGATAGGATTAACAATAGGTCTTATACTGTCGCTTATTCCTCCGTATATTATAGCAAAAAGA
GAATTAAGTGAAGGTAGCGGATATGATATCTATGTAGCTAGATTCCTCAGAGCTATTGGCGAAGGTTCAAGAGCAGGATT
ATCTCCAGAAGCAGTAATTAAAAACCTTAAAGATTCTAAAGAATTAGGTAAACTACAAAACATATTAAGAAGAGTATATG
CATACATTAATCTAGGTATACCGATTAAGGATGCTTTTAGAAAGGCTTCAGATATTATCATTGATTTCTCCACAAAAATT
GCATTTACATCGTTAGCTGATATGATAGAGATAGGAAGTCTAACACCAGAATCAGTAGAAACTTTAGCAGATCAATTAGA
TGCACAAATAAGAATTAGACGTGAATATTATGCTAAAATAAAGATATTACTCTATATGCCTTACGTTGGCTCAATTCTAG
CTTTAATTGCAACAATTATATTATCATCAGCTATAATATCCTTATTAAGTTCCAGTAGTTTCATTACAAGTTATGGTCCA
CTAGCTGCTGCACAAGTTTTAGTTCCTAAAGCAGTATATATAGCGTCATTATCATCTGTGTTTAATGCATATACAGCTGG
GCTATTGGTGGGTAAATTAGCTAGTGGAAGAATAGCAAACGGATATTTACATGCTATAATTCTATTGATAATCACAATGA
TTCTAGTATTGCTAACACTAAGTATTAAATTCTCATTTACATCTCCAGTAGCTCCCACTCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTGGGGAAAGTCTGTAAAATTCCAAGGTCAAAAAGTTGGTGCTGATTATGTATTAGAAGATGGTGATATAGTAGAGATA
CATGTTAAATAAAAGCTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGCTTATATAGAAGAAAAGCATAATAAAAGGTGATATATAATGGACTTAAAACTTAATATATTCGGGAAAAATAATACT
AATAAAAAGAATGATAAAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Type II Secretion System F Domain-Containing Protein; Type II Secretion System F Domain Protein; Type II Secretion System F Domain

Number of amino acids: Translated: 634; Mature: 634

Protein sequence:

>634_residues
MYNVEIYYMAVISSGKKKPSDEKINISQIDLLFYRTSLVEPLAKSLDKKLKQAGLSDDPRIYASRLFFFLILGIIIGVML
LFAGFIFLREFELTKLSKFAVGGIMFILFGVIIPVVTYLVLISNVSQKVESRRIGVEAETLAFSALFLVFLRSGLSPRLL
FENLSKTKAFNYMNSIAKYIVKRINFLGESVEKAIDESTKIVPSKLYNDLMVTYITAIRTGAPVFETMQSKIKDILKNME
LQASKAADNLSGVGEGYVTWLASGFISFFLILILEAVFPQLHVLPIGILGAFAVLGIPIVNILFVWVVDQTQYKFPEKQL
RADKIFLMLFPVGIILGIILMIVLEPIIAKITHQIPVAPKYMLLGLFTLSGNLNYIPATVIGLTIGLILSLIPPYIIAKR
ELSEGSGYDIYVARFLRAIGEGSRAGLSPEAVIKNLKDSKELGKLQNILRRVYAYINLGIPIKDAFRKASDIIIDFSTKI
AFTSLADMIEIGSLTPESVETLADQLDAQIRIRREYYAKIKILLYMPYVGSILALIATIILSSAIISLLSSSSFITSYGP
LAAAQVLVPKAVYIASLSSVFNAYTAGLLVGKLASGRIANGYLHAIILLIITMILVLLTLSIKFSFTSPVAPTL

Sequences:

>Translated_634_residues
MYNVEIYYMAVISSGKKKPSDEKINISQIDLLFYRTSLVEPLAKSLDKKLKQAGLSDDPRIYASRLFFFLILGIIIGVML
LFAGFIFLREFELTKLSKFAVGGIMFILFGVIIPVVTYLVLISNVSQKVESRRIGVEAETLAFSALFLVFLRSGLSPRLL
FENLSKTKAFNYMNSIAKYIVKRINFLGESVEKAIDESTKIVPSKLYNDLMVTYITAIRTGAPVFETMQSKIKDILKNME
LQASKAADNLSGVGEGYVTWLASGFISFFLILILEAVFPQLHVLPIGILGAFAVLGIPIVNILFVWVVDQTQYKFPEKQL
RADKIFLMLFPVGIILGIILMIVLEPIIAKITHQIPVAPKYMLLGLFTLSGNLNYIPATVIGLTIGLILSLIPPYIIAKR
ELSEGSGYDIYVARFLRAIGEGSRAGLSPEAVIKNLKDSKELGKLQNILRRVYAYINLGIPIKDAFRKASDIIIDFSTKI
AFTSLADMIEIGSLTPESVETLADQLDAQIRIRREYYAKIKILLYMPYVGSILALIATIILSSAIISLLSSSSFITSYGP
LAAAQVLVPKAVYIASLSSVFNAYTAGLLVGKLASGRIANGYLHAIILLIITMILVLLTLSIKFSFTSPVAPTL
>Mature_634_residues
MYNVEIYYMAVISSGKKKPSDEKINISQIDLLFYRTSLVEPLAKSLDKKLKQAGLSDDPRIYASRLFFFLILGIIIGVML
LFAGFIFLREFELTKLSKFAVGGIMFILFGVIIPVVTYLVLISNVSQKVESRRIGVEAETLAFSALFLVFLRSGLSPRLL
FENLSKTKAFNYMNSIAKYIVKRINFLGESVEKAIDESTKIVPSKLYNDLMVTYITAIRTGAPVFETMQSKIKDILKNME
LQASKAADNLSGVGEGYVTWLASGFISFFLILILEAVFPQLHVLPIGILGAFAVLGIPIVNILFVWVVDQTQYKFPEKQL
RADKIFLMLFPVGIILGIILMIVLEPIIAKITHQIPVAPKYMLLGLFTLSGNLNYIPATVIGLTIGLILSLIPPYIIAKR
ELSEGSGYDIYVARFLRAIGEGSRAGLSPEAVIKNLKDSKELGKLQNILRRVYAYINLGIPIKDAFRKASDIIIDFSTKI
AFTSLADMIEIGSLTPESVETLADQLDAQIRIRREYYAKIKILLYMPYVGSILALIATIILSSAIISLLSSSSFITSYGP
LAAAQVLVPKAVYIASLSSVFNAYTAGLLVGKLASGRIANGYLHAIILLIITMILVLLTLSIKFSFTSPVAPTL

Specific function: Unknown

COG id: COG2064

COG function: function code NU; Flp pilus assembly protein TadC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69945; Mature: 69945

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYNVEIYYMAVISSGKKKPSDEKINISQIDLLFYRTSLVEPLAKSLDKKLKQAGLSDDPR
CCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
IYASRLFFFLILGIIIGVMLLFAGFIFLREFELTKLSKFAVGGIMFILFGVIIPVVTYLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISNVSQKVESRRIGVEAETLAFSALFLVFLRSGLSPRLLFENLSKTKAFNYMNSIAKYI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VKRINFLGESVEKAIDESTKIVPSKLYNDLMVTYITAIRTGAPVFETMQSKIKDILKNME
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LQASKAADNLSGVGEGYVTWLASGFISFFLILILEAVFPQLHVLPIGILGAFAVLGIPIV
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILFVWVVDQTQYKFPEKQLRADKIFLMLFPVGIILGIILMIVLEPIIAKITHQIPVAPK
HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
YMLLGLFTLSGNLNYIPATVIGLTIGLILSLIPPYIIAKRELSEGSGYDIYVARFLRAIG
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
EGSRAGLSPEAVIKNLKDSKELGKLQNILRRVYAYINLGIPIKDAFRKASDIIIDFSTKI
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCEEEEECHHH
AFTSLADMIEIGSLTPESVETLADQLDAQIRIRREYYAKIKILLYMPYVGSILALIATII
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LSSAIISLLSSSSFITSYGPLAAAQVLVPKAVYIASLSSVFNAYTAGLLVGKLASGRIAN
HHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
GYLHAIILLIITMILVLLTLSIKFSFTSPVAPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MYNVEIYYMAVISSGKKKPSDEKINISQIDLLFYRTSLVEPLAKSLDKKLKQAGLSDDPR
CCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
IYASRLFFFLILGIIIGVMLLFAGFIFLREFELTKLSKFAVGGIMFILFGVIIPVVTYLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISNVSQKVESRRIGVEAETLAFSALFLVFLRSGLSPRLLFENLSKTKAFNYMNSIAKYI
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VKRINFLGESVEKAIDESTKIVPSKLYNDLMVTYITAIRTGAPVFETMQSKIKDILKNME
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LQASKAADNLSGVGEGYVTWLASGFISFFLILILEAVFPQLHVLPIGILGAFAVLGIPIV
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HHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
YMLLGLFTLSGNLNYIPATVIGLTIGLILSLIPPYIIAKRELSEGSGYDIYVARFLRAIG
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
EGSRAGLSPEAVIKNLKDSKELGKLQNILRRVYAYINLGIPIKDAFRKASDIIIDFSTKI
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCEEEEECHHH
AFTSLADMIEIGSLTPESVETLADQLDAQIRIRREYYAKIKILLYMPYVGSILALIATII
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHH
LSSAIISLLSSSSFITSYGPLAAAQVLVPKAVYIASLSSVFNAYTAGLLVGKLASGRIAN
HHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
GYLHAIILLIITMILVLLTLSIKFSFTSPVAPTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA