| Definition | Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009954 |
| Length | 2,077,567 |
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The map label for this gene is 159041761
Identifier: 159041761
GI number: 159041761
Start: 1256589
End: 1258445
Strand: Reverse
Name: 159041761
Synonym: Cmaq_1196
Alternate gene names: NA
Gene position: 1258445-1256589 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159041763
Following gene: 159041752
Centisome position: 60.57
GC content: 42.0
Gene sequence:
>1857_bases ATGTCTCAAGAAAACTCCGTGTATAATGAACTTGGGGAATGCTTCCTAAAGAGGCTAAGTACTTGGGGTTCATCGGTGGA TTGTGTATTTGATGCCTGTACTAAGTTGGGTATTAAGTGTGTTGTAGCATCTTCAGGTTCTGTGGAGAGTTACATTATGG CTTACTCGGAGATTCAGGATACGTTAATAATTGATCCAAATGCCCTTGAGCAGTATGTTAGGAGTGAGGGCTTTGAGGAA TTGATTAAGATTTTTAGACATGAGTTGATGCATAGGGAATTCGCCCATTATAGGCAAAGAAACTGCCCTGAACTTTGGCT TAGGCCACAATCCAATGTAGCTAGGGCCCTGACCTTCGCTATTGAGGATGCCTATATAATGACGACTCTTAAGCAAAGAT TTAACATTGATGAGATGAGTAAGAAGTATATTGATGCTGCAGTCCTCCATTGCATTGGTAATGATGGGTCCTTCTCAGAC ACCTACCAATGTTTCTACTACCTGTATCACTCGCTCATTTATTTAATATACTCCATGAAGCATTTGCTAGGTGTTAAATC CATAGATCCAACACTCAATAACCTGGCTAAACATGGGTACTATGTATTAGAGAAGCTATTCAATAATGAGTTAAATCCCT GCAGCATGCTGAGTGAGATTTATGAAGGTGTGAAAAACATACGGGAAAACCCCATTAGCGTGGGTACATTGCCATCGCCG GGTAATTGTGCACCTGGTTTAATTGTTGATAAGGATCATTTAATGAGGTTAAGGGGTGTTAGGGATCCTGGTATCATTAT TAAGGAGACCATTGAAGTATTAACATCGGCATTAAACAAGGCAGAGTTAATGGGATGCATAGCGGTGGGCGAAGTCATTA GTAATTACATTATTAATGAACTCGACGCCATAGGGGTAAACAGACTTGGGGTCACTGGATCATGCCCAGAGGATGCCTCC CCAGGATTATGTATGATGCTGCATCATGTATTCCCTAACGTATTTATGCTACCTAATAAGTGTAGATTCATTAGGGGTGA TGCTGAGCTCAGGAATTTCATAGCATTCTATGCAAGGAATAAACTAGGTTTCACGGAAAGTTCCCTTGTATCTGGGGTTA GCCACATCATCAACACCTACCTAAACGAGGCTAGGGAAGGGGGTTGCCAGGTTAATGAGGAGTTAATCATGAGGATTAGT GAAAGGATTAAAGATGCCTTGATTAGGGCTGGAATTGATGTTGAAAAACCCATTTATGGCAACCTACATGGATTGAACCC AGACACCCGAAGGATCCTCACCATAGTATTCCCAGGAATAATCGATGCTAAAAATAAACCCATAGAGATGGCGACCCCAC AGGGTACCTCCAAGACGTTACGCCACTTATCGAAACTTCACCCAATAAGTAACCCCATAACATTACGCCCCACACCTAGG CGTTTCTCCGCTAGGGTTTTCTTGGCTGTTGTGTTTGGTTCTGTGTCTGTGTTTTATTGGTGTTTGGCTCAAGTGTTTGG TGTTTTAACTATTCTTCGTTACTTCTACTTCCCAATGCACATGTATTATTACTTGGGTTTATCATTATTCTTCGCCCTAC TCTACCTCGCATCAGCAGTGAAGAGGAGGATTGCCGGCGTCTGGATTACCGTGATCCTACTCACGTTAGTTAGTGCAGTG ATCTTCAACCATTCACCCATACTAAGCCTCATCACCGAACTAACCACCCTAATAATAACCGGCTCACTAATACCTAAAGC CATTAACGCATTAAGAGAATCTAAGACCAACACCATCCCCGGCATCCTACTAGGCTTAACCATAGCAATAATACTAATTA TATACCTAGGTATTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATAGAATATATATTTGACTCAATGAAAGAAGACAGGAATCACAAACAAGAATAAAACCACAAACCAACACAACCCCCGT GTTCCCCAGGTGGTTGTGGG
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAATTTTATTTTAAAATTAAGATATTTCAGTGATTATCCATTGGTTCCTTAATAAACCTTAATGCATTACTAAACTAAT CCCAGTAATTGCTTCTCATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 618; Mature: 617
Protein sequence:
>618_residues MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEE LIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSD TYQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDAS PGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRIS ERIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAV IFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI
Sequences:
>Translated_618_residues MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEE LIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSD TYQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDAS PGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRIS ERIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAV IFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI >Mature_617_residues SQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEEL IKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSDT YQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSPG NCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDASP GLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRISE RIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPRR FSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAVI FNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69442; Mature: 69311
Theoretical pI: Translated: 7.93; Mature: 7.93
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQD CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC TLIIDPNALEQYVRSEGFEELIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFA CEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHH IEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSDTYQCFYYLYHSLIYLIYSMK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINE CCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDAIGVNRLGVTGSCPEDASPGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARN HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHC KLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRISERIKDALIRAGIDVEKPIYG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC NLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR CCCCCCCHHHHEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCC RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRRIAGVWITVILLTLVSAVIFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH GILLGLTIAIILIIYLGI HHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQD CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC TLIIDPNALEQYVRSEGFEELIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFA CEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHH IEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSDTYQCFYYLYHSLIYLIYSMK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINE CCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDAIGVNRLGVTGSCPEDASPGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARN HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHC KLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRISERIKDALIRAGIDVEKPIYG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC NLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR CCCCCCCHHHHEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCC RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRRIAGVWITVILLTLVSAVIFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH GILLGLTIAIILIIYLGI HHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA