Definition Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome.
Accession NC_009954
Length 2,077,567

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The map label for this gene is 159041761

Identifier: 159041761

GI number: 159041761

Start: 1256589

End: 1258445

Strand: Reverse

Name: 159041761

Synonym: Cmaq_1196

Alternate gene names: NA

Gene position: 1258445-1256589 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159041763

Following gene: 159041752

Centisome position: 60.57

GC content: 42.0

Gene sequence:

>1857_bases
ATGTCTCAAGAAAACTCCGTGTATAATGAACTTGGGGAATGCTTCCTAAAGAGGCTAAGTACTTGGGGTTCATCGGTGGA
TTGTGTATTTGATGCCTGTACTAAGTTGGGTATTAAGTGTGTTGTAGCATCTTCAGGTTCTGTGGAGAGTTACATTATGG
CTTACTCGGAGATTCAGGATACGTTAATAATTGATCCAAATGCCCTTGAGCAGTATGTTAGGAGTGAGGGCTTTGAGGAA
TTGATTAAGATTTTTAGACATGAGTTGATGCATAGGGAATTCGCCCATTATAGGCAAAGAAACTGCCCTGAACTTTGGCT
TAGGCCACAATCCAATGTAGCTAGGGCCCTGACCTTCGCTATTGAGGATGCCTATATAATGACGACTCTTAAGCAAAGAT
TTAACATTGATGAGATGAGTAAGAAGTATATTGATGCTGCAGTCCTCCATTGCATTGGTAATGATGGGTCCTTCTCAGAC
ACCTACCAATGTTTCTACTACCTGTATCACTCGCTCATTTATTTAATATACTCCATGAAGCATTTGCTAGGTGTTAAATC
CATAGATCCAACACTCAATAACCTGGCTAAACATGGGTACTATGTATTAGAGAAGCTATTCAATAATGAGTTAAATCCCT
GCAGCATGCTGAGTGAGATTTATGAAGGTGTGAAAAACATACGGGAAAACCCCATTAGCGTGGGTACATTGCCATCGCCG
GGTAATTGTGCACCTGGTTTAATTGTTGATAAGGATCATTTAATGAGGTTAAGGGGTGTTAGGGATCCTGGTATCATTAT
TAAGGAGACCATTGAAGTATTAACATCGGCATTAAACAAGGCAGAGTTAATGGGATGCATAGCGGTGGGCGAAGTCATTA
GTAATTACATTATTAATGAACTCGACGCCATAGGGGTAAACAGACTTGGGGTCACTGGATCATGCCCAGAGGATGCCTCC
CCAGGATTATGTATGATGCTGCATCATGTATTCCCTAACGTATTTATGCTACCTAATAAGTGTAGATTCATTAGGGGTGA
TGCTGAGCTCAGGAATTTCATAGCATTCTATGCAAGGAATAAACTAGGTTTCACGGAAAGTTCCCTTGTATCTGGGGTTA
GCCACATCATCAACACCTACCTAAACGAGGCTAGGGAAGGGGGTTGCCAGGTTAATGAGGAGTTAATCATGAGGATTAGT
GAAAGGATTAAAGATGCCTTGATTAGGGCTGGAATTGATGTTGAAAAACCCATTTATGGCAACCTACATGGATTGAACCC
AGACACCCGAAGGATCCTCACCATAGTATTCCCAGGAATAATCGATGCTAAAAATAAACCCATAGAGATGGCGACCCCAC
AGGGTACCTCCAAGACGTTACGCCACTTATCGAAACTTCACCCAATAAGTAACCCCATAACATTACGCCCCACACCTAGG
CGTTTCTCCGCTAGGGTTTTCTTGGCTGTTGTGTTTGGTTCTGTGTCTGTGTTTTATTGGTGTTTGGCTCAAGTGTTTGG
TGTTTTAACTATTCTTCGTTACTTCTACTTCCCAATGCACATGTATTATTACTTGGGTTTATCATTATTCTTCGCCCTAC
TCTACCTCGCATCAGCAGTGAAGAGGAGGATTGCCGGCGTCTGGATTACCGTGATCCTACTCACGTTAGTTAGTGCAGTG
ATCTTCAACCATTCACCCATACTAAGCCTCATCACCGAACTAACCACCCTAATAATAACCGGCTCACTAATACCTAAAGC
CATTAACGCATTAAGAGAATCTAAGACCAACACCATCCCCGGCATCCTACTAGGCTTAACCATAGCAATAATACTAATTA
TATACCTAGGTATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATAGAATATATATTTGACTCAATGAAAGAAGACAGGAATCACAAACAAGAATAAAACCACAAACCAACACAACCCCCGT
GTTCCCCAGGTGGTTGTGGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAATTTTATTTTAAAATTAAGATATTTCAGTGATTATCCATTGGTTCCTTAATAAACCTTAATGCATTACTAAACTAAT
CCCAGTAATTGCTTCTCATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 618; Mature: 617

Protein sequence:

>618_residues
MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEE
LIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSD
TYQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP
GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDAS
PGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRIS
ERIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR
RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAV
IFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI

Sequences:

>Translated_618_residues
MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEE
LIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSD
TYQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP
GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDAS
PGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRIS
ERIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR
RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAV
IFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI
>Mature_617_residues
SQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQDTLIIDPNALEQYVRSEGFEEL
IKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFAIEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSDT
YQCFYYLYHSLIYLIYSMKHLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSPG
NCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINELDAIGVNRLGVTGSCPEDASP
GLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARNKLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRISE
RIKDALIRAGIDVEKPIYGNLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPRR
FSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAVKRRIAGVWITVILLTLVSAVI
FNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIPGILLGLTIAIILIIYLGI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69442; Mature: 69311

Theoretical pI: Translated: 7.93; Mature: 7.93

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQD
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC
TLIIDPNALEQYVRSEGFEELIKIFRHELMHREFAHYRQRNCPELWLRPQSNVARALTFA
CEEECCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHH
IEDAYIMTTLKQRFNIDEMSKKYIDAAVLHCIGNDGSFSDTYQCFYYLYHSLIYLIYSMK
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLLGVKSIDPTLNNLAKHGYYVLEKLFNNELNPCSMLSEIYEGVKNIRENPISVGTLPSP
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
GNCAPGLIVDKDHLMRLRGVRDPGIIIKETIEVLTSALNKAELMGCIAVGEVISNYIINE
CCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDAIGVNRLGVTGSCPEDASPGLCMMLHHVFPNVFMLPNKCRFIRGDAELRNFIAFYARN
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHC
KLGFTESSLVSGVSHIINTYLNEAREGGCQVNEELIMRISERIKDALIRAGIDVEKPIYG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
NLHGLNPDTRRILTIVFPGIIDAKNKPIEMATPQGTSKTLRHLSKLHPISNPITLRPTPR
CCCCCCCHHHHEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCC
RFSARVFLAVVFGSVSVFYWCLAQVFGVLTILRYFYFPMHMYYYLGLSLFFALLYLASAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRRIAGVWITVILLTLVSAVIFNHSPILSLITELTTLIITGSLIPKAINALRESKTNTIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
GILLGLTIAIILIIYLGI
HHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SQENSVYNELGECFLKRLSTWGSSVDCVFDACTKLGIKCVVASSGSVESYIMAYSEIQD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC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HHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA