Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is actII-3 [H]

Identifier: 159040748

GI number: 159040748

Start: 187830

End: 190634

Strand: Reverse

Name: actII-3 [H]

Synonym: Cmaq_0161

Alternate gene names: 159040748

Gene position: 190634-187830 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159040749

Following gene: 159040747

Centisome position: 9.18

GC content: 40.0

Gene sequence:

>2805_bases
ATGAGGGAAAACTATTTATTAGCGATGCATTACAAGCGCTGGTGTTTCAATACTCATAGAATTGCATTAAGCGTAGTGAT
TGTGACGGCTTGGATTACGCTCATACTAGCTCTAGCTCCCTATGCTCCATCCGCATTTAAGATACTGGTTTACAGTGATA
GTAAGGTGCTTCCACCTTGGACGGAGGCGTCATTAGCCTCCAGTATAGTTAATAGGTATTTAGGGAACCAAGTAGGCTTA
GTTGTGATACCGGTTTACGTAGGTAATATTAATAATTCACGTTACGTACTCAGCACTATTGATGATGAATTAAGGTCTCT
TAACTTAACTTACTATGATTTAAACAGTATTTATGATAAAGTTATCAACCGTTACTACGCCATTACCAATGAGACAGTGA
AGGAGTATTTAAGCAACTACACCGGTATTATACGAGGAATTTACGCTAATGAATCATTATTATGCAGTGAACTGTATAGT
ATTAGTAATGAATACTACTCCACACTTAATAATTACACATTAACAATAAGGGAATTCAGCGGCTTCTTCACATTATTCAT
GAAGGCCTTCTTCACAAACTTATCCACCGTGGATTACTCATACTCAGTATGGCAGGTTATAAATGAGACCGGGCAAAGCC
TACTTAATAATGGTAATTACTCAAGTTGGCTTAAGCCATACTTACTATACTTCATTAAGTCATTGAACGACTCAGTGGGT
AGCCTGCCTATTTACGGCTTAAACATAAGCTTGATTAAGGAGTCTCTCTCATCATCATACTACTCAACGCTGATTAAGAT
AAATAATACCTATGTACCAATATTGAGGAATTTAACTAAGAGTAATCCACTGGCTTTACCCATGATTGCCCTGGGTCCTA
ATCCCCCAAGAACCCTTACCGCTAAGTTAGTGGCTTCATGGTTCATTAACTCAACACCACCACTGCTTAAACCATACCTA
ATTCAATTAGCGTGCACCAATGAGTCTCAGGTAAACACGACAATTAGTGAGCTTAACTCATCATTAAGCTTCGTGGTCTC
ATCAATATACAAGAAGCCAGCCTACTCTTATGCAAATAACATTACCAATGGTTCACTATACTCAAATGGATATGCCTTGG
TTATAGTTAACTCCACTAATGATTTAGAGATTAATAACTTATTCACTAATTATGATTATGTTTACCCATTCTCAACCAAC
ATAGTTCTAAGTCAATTATCGGAAATAATAGAGAAGGATGTGCCGATGATTGATGAAGTCAGTGGCGCCTCAGTACTATT
AATGCTACTCTTCGTATTAGGTACATTAGTGGCGCCTATAATCATATTAATAATGCTCATCCTATCCTACGGTGCGGTAC
TTGGGGTCGTTTACTTCCTTGGTAAAATGGGGTTAACGGTATACTACCTAACAGTCTACATGATATCACCCATAGTTTTC
GGCATTGGGGTTGACTACAGCCTACTTGTTATTGGAAGATACCTAGAGGAGAGGAGAAAAGGTTTCAATACGTCACAGGC
CTTAGAGACTATAATGCGTTTCACGATACCAACCATACTAACCTCAGGTAGCGTTGTAGCAGCTGGCTTAGGCTCATTCG
TAGTCTCCAATTACCAGTATATTCAAGTAATTGGCTTATCATACATAGTTACGGTCGCCTTCGTCATACTTGCAACAACA
GTGGTTTTACCATCATTAATAACGTTAATGAATGATAGGATTCTATGGCCAATGGGCCTTAAATCATCTACGAGGGAATT
AAGCACAAGGGTAATTATTAAATTAACCAGGTTCTCACTGAGGAGACCTTGGTTAATCATTGCAATTGCCCTAATACCTA
CTGTCCTCTCGGTTCTCTTCATTATTAGGAACCCAGTTACCTCGAACCCCCTCCTACTGATGCCTAACGTTAAGTCAGTT
TACGCATACAGGATCCTGCAGCATTACTTCCCTAATTACGTTAAATCAACGCAATACGTGATCCTTGAACCTAATAATGC
TGAAGCCTTACAATCATTGGAAAACGCCATTAGTTCCCTCAACTTCACCATGAGCGTTAACTTGGCTTATAATTCATCAT
CAATCGCCATACTTAAGGTAACCACAAGCTACAATGCCCTCTCAGACAAGTTGATACCAGTTTACGTGAGGCTCACAAGC
CTAGCGAACCAGGTAGCTAGTGAATACGGTGTTAAGGTAATTGTTGGTGGTGATGCTGCAAATAAGTACTACTTCGTTAA
GGTTTTTGAGGATCAATTCTACTATAAGATAAGTATACTGATAATAGCATTAAACATACTACTGCTCTCCCTAGCCTTAA
GGAGCCTGGTGGTTCCCTTAAGGCTACTGGCCACGGTAATGATTAGCATCTCCTGGTCACTTGCAGTAAGTCAATTAATA
TTCTATAAGCTACTTGGAGTTGAGACCTACTGGCTACTGCCGATAATACTCTTCGCGCTCCTTACAAGCGTCGGCACTGA
TTACGACATATTCATAGTAACGAGGGTTAGGGAGGAGGTTATTAAGGGTAAGAGTGACCCGGAGGCAATATTGACTGCTA
TTGAGAATACTGGCCCAATAGTTACTGGGGCAGCCTTAGTGTTGGCGATAGCCTTCATGAGCCTCATGGTTTCGCAACTA
TATATACTTAGGGAAATAGGGTTCACGGTTGGTTTAAGTGTCTTAATGGACGCATTCCTAATAAGGCCAGCTGTAATGCC
TGCAATAATGGTTCTAGCGGGTAAGTATAATTGGTGGCCATCAAGGATAAGCAGTGATCAAAGGGCAGTAATACCAGTTC
AATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTACTCATTAAGGGGATTAATTGAGATTGCTAAGGCAGTATCAATGGTTCAATTGAATCATGGCTTAAATTAAGAATCAT
TAACCAGGAATTAACGTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCTGCATTAACGCGCATTTAATTCATTAGCCACGTTAAGTTAATAATTAAGTACCCTAAATGAACCACTGGTAGTTGAT
TAATGATTACTTGGGTTGGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 934; Mature: 934

Protein sequence:

>934_residues
MRENYLLAMHYKRWCFNTHRIALSVVIVTAWITLILALAPYAPSAFKILVYSDSKVLPPWTEASLASSIVNRYLGNQVGL
VVIPVYVGNINNSRYVLSTIDDELRSLNLTYYDLNSIYDKVINRYYAITNETVKEYLSNYTGIIRGIYANESLLCSELYS
ISNEYYSTLNNYTLTIREFSGFFTLFMKAFFTNLSTVDYSYSVWQVINETGQSLLNNGNYSSWLKPYLLYFIKSLNDSVG
SLPIYGLNISLIKESLSSSYYSTLIKINNTYVPILRNLTKSNPLALPMIALGPNPPRTLTAKLVASWFINSTPPLLKPYL
IQLACTNESQVNTTISELNSSLSFVVSSIYKKPAYSYANNITNGSLYSNGYALVIVNSTNDLEINNLFTNYDYVYPFSTN
IVLSQLSEIIEKDVPMIDEVSGASVLLMLLFVLGTLVAPIIILIMLILSYGAVLGVVYFLGKMGLTVYYLTVYMISPIVF
GIGVDYSLLVIGRYLEERRKGFNTSQALETIMRFTIPTILTSGSVVAAGLGSFVVSNYQYIQVIGLSYIVTVAFVILATT
VVLPSLITLMNDRILWPMGLKSSTRELSTRVIIKLTRFSLRRPWLIIAIALIPTVLSVLFIIRNPVTSNPLLLMPNVKSV
YAYRILQHYFPNYVKSTQYVILEPNNAEALQSLENAISSLNFTMSVNLAYNSSSIAILKVTTSYNALSDKLIPVYVRLTS
LANQVASEYGVKVIVGGDAANKYYFVKVFEDQFYYKISILIIALNILLLSLALRSLVVPLRLLATVMISISWSLAVSQLI
FYKLLGVETYWLLPIILFALLTSVGTDYDIFIVTRVREEVIKGKSDPEAILTAIENTGPIVTGAALVLAIAFMSLMVSQL
YILREIGFTVGLSVLMDAFLIRPAVMPAIMVLAGKYNWWPSRISSDQRAVIPVQ

Sequences:

>Translated_934_residues
MRENYLLAMHYKRWCFNTHRIALSVVIVTAWITLILALAPYAPSAFKILVYSDSKVLPPWTEASLASSIVNRYLGNQVGL
VVIPVYVGNINNSRYVLSTIDDELRSLNLTYYDLNSIYDKVINRYYAITNETVKEYLSNYTGIIRGIYANESLLCSELYS
ISNEYYSTLNNYTLTIREFSGFFTLFMKAFFTNLSTVDYSYSVWQVINETGQSLLNNGNYSSWLKPYLLYFIKSLNDSVG
SLPIYGLNISLIKESLSSSYYSTLIKINNTYVPILRNLTKSNPLALPMIALGPNPPRTLTAKLVASWFINSTPPLLKPYL
IQLACTNESQVNTTISELNSSLSFVVSSIYKKPAYSYANNITNGSLYSNGYALVIVNSTNDLEINNLFTNYDYVYPFSTN
IVLSQLSEIIEKDVPMIDEVSGASVLLMLLFVLGTLVAPIIILIMLILSYGAVLGVVYFLGKMGLTVYYLTVYMISPIVF
GIGVDYSLLVIGRYLEERRKGFNTSQALETIMRFTIPTILTSGSVVAAGLGSFVVSNYQYIQVIGLSYIVTVAFVILATT
VVLPSLITLMNDRILWPMGLKSSTRELSTRVIIKLTRFSLRRPWLIIAIALIPTVLSVLFIIRNPVTSNPLLLMPNVKSV
YAYRILQHYFPNYVKSTQYVILEPNNAEALQSLENAISSLNFTMSVNLAYNSSSIAILKVTTSYNALSDKLIPVYVRLTS
LANQVASEYGVKVIVGGDAANKYYFVKVFEDQFYYKISILIIALNILLLSLALRSLVVPLRLLATVMISISWSLAVSQLI
FYKLLGVETYWLLPIILFALLTSVGTDYDIFIVTRVREEVIKGKSDPEAILTAIENTGPIVTGAALVLAIAFMSLMVSQL
YILREIGFTVGLSVLMDAFLIRPAVMPAIMVLAGKYNWWPSRISSDQRAVIPVQ
>Mature_934_residues
MRENYLLAMHYKRWCFNTHRIALSVVIVTAWITLILALAPYAPSAFKILVYSDSKVLPPWTEASLASSIVNRYLGNQVGL
VVIPVYVGNINNSRYVLSTIDDELRSLNLTYYDLNSIYDKVINRYYAITNETVKEYLSNYTGIIRGIYANESLLCSELYS
ISNEYYSTLNNYTLTIREFSGFFTLFMKAFFTNLSTVDYSYSVWQVINETGQSLLNNGNYSSWLKPYLLYFIKSLNDSVG
SLPIYGLNISLIKESLSSSYYSTLIKINNTYVPILRNLTKSNPLALPMIALGPNPPRTLTAKLVASWFINSTPPLLKPYL
IQLACTNESQVNTTISELNSSLSFVVSSIYKKPAYSYANNITNGSLYSNGYALVIVNSTNDLEINNLFTNYDYVYPFSTN
IVLSQLSEIIEKDVPMIDEVSGASVLLMLLFVLGTLVAPIIILIMLILSYGAVLGVVYFLGKMGLTVYYLTVYMISPIVF
GIGVDYSLLVIGRYLEERRKGFNTSQALETIMRFTIPTILTSGSVVAAGLGSFVVSNYQYIQVIGLSYIVTVAFVILATT
VVLPSLITLMNDRILWPMGLKSSTRELSTRVIIKLTRFSLRRPWLIIAIALIPTVLSVLFIIRNPVTSNPLLLMPNVKSV
YAYRILQHYFPNYVKSTQYVILEPNNAEALQSLENAISSLNFTMSVNLAYNSSSIAILKVTTSYNALSDKLIPVYVRLTS
LANQVASEYGVKVIVGGDAANKYYFVKVFEDQFYYKISILIIALNILLLSLALRSLVVPLRLLATVMISISWSLAVSQLI
FYKLLGVETYWLLPIILFALLTSVGTDYDIFIVTRVREEVIKGKSDPEAILTAIENTGPIVTGAALVLAIAFMSLMVSQL
YILREIGFTVGLSVLMDAFLIRPAVMPAIMVLAGKYNWWPSRISSDQRAVIPVQ

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004707
- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104437; Mature: 104437

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRENYLLAMHYKRWCFNTHRIALSVVIVTAWITLILALAPYAPSAFKILVYSDSKVLPPW
CCCCEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCC
TEASLASSIVNRYLGNQVGLVVIPVYVGNINNSRYVLSTIDDELRSLNLTYYDLNSIYDK
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHH
VINRYYAITNETVKEYLSNYTGIIRGIYANESLLCSELYSISNEYYSTLNNYTLTIREFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHH
GFFTLFMKAFFTNLSTVDYSYSVWQVINETGQSLLNNGNYSSWLKPYLLYFIKSLNDSVG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SLPIYGLNISLIKESLSSSYYSTLIKINNTYVPILRNLTKSNPLALPMIALGPNPPRTLT
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHH
AKLVASWFINSTPPLLKPYLIQLACTNESQVNTTISELNSSLSFVVSSIYKKPAYSYANN
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
ITNGSLYSNGYALVIVNSTNDLEINNLFTNYDYVYPFSTNIVLSQLSEIIEKDVPMIDEV
CCCCCEECCCEEEEEEECCCCEEECEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCC
SGASVLLMLLFVLGTLVAPIIILIMLILSYGAVLGVVYFLGKMGLTVYYLTVYMISPIVF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGVDYSLLVIGRYLEERRKGFNTSQALETIMRFTIPTILTSGSVVAAGLGSFVVSNYQY
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
IQVIGLSYIVTVAFVILATTVVLPSLITLMNDRILWPMGLKSSTRELSTRVIIKLTRFSL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHHC
RRPWLIIAIALIPTVLSVLFIIRNPVTSNPLLLMPNVKSVYAYRILQHYFPNYVKSTQYV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEE
ILEPNNAEALQSLENAISSLNFTMSVNLAYNSSSIAILKVTTSYNALSDKLIPVYVRLTS
EECCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHH
LANQVASEYGVKVIVGGDAANKYYFVKVFEDQFYYKISILIIALNILLLSLALRSLVVPL
HHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLLATVMISISWSLAVSQLIFYKLLGVETYWLLPIILFALLTSVGTDYDIFIVTRVREEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHH
IKGKSDPEAILTAIENTGPIVTGAALVLAIAFMSLMVSQLYILREIGFTVGLSVLMDAFL
HCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPAVMPAIMVLAGKYNWWPSRISSDQRAVIPVQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCEEECCC
>Mature Secondary Structure
MRENYLLAMHYKRWCFNTHRIALSVVIVTAWITLILALAPYAPSAFKILVYSDSKVLPPW
CCCCEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCC
TEASLASSIVNRYLGNQVGLVVIPVYVGNINNSRYVLSTIDDELRSLNLTYYDLNSIYDK
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHH
VINRYYAITNETVKEYLSNYTGIIRGIYANESLLCSELYSISNEYYSTLNNYTLTIREFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHH
GFFTLFMKAFFTNLSTVDYSYSVWQVINETGQSLLNNGNYSSWLKPYLLYFIKSLNDSVG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SLPIYGLNISLIKESLSSSYYSTLIKINNTYVPILRNLTKSNPLALPMIALGPNPPRTLT
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHH
AKLVASWFINSTPPLLKPYLIQLACTNESQVNTTISELNSSLSFVVSSIYKKPAYSYANN
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
ITNGSLYSNGYALVIVNSTNDLEINNLFTNYDYVYPFSTNIVLSQLSEIIEKDVPMIDEV
CCCCCEECCCEEEEEEECCCCEEECEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCC
SGASVLLMLLFVLGTLVAPIIILIMLILSYGAVLGVVYFLGKMGLTVYYLTVYMISPIVF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIGVDYSLLVIGRYLEERRKGFNTSQALETIMRFTIPTILTSGSVVAAGLGSFVVSNYQY
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
IQVIGLSYIVTVAFVILATTVVLPSLITLMNDRILWPMGLKSSTRELSTRVIIKLTRFSL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHEEHHHHC
RRPWLIIAIALIPTVLSVLFIIRNPVTSNPLLLMPNVKSVYAYRILQHYFPNYVKSTQYV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCEE
ILEPNNAEALQSLENAISSLNFTMSVNLAYNSSSIAILKVTTSYNALSDKLIPVYVRLTS
EECCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHH
LANQVASEYGVKVIVGGDAANKYYFVKVFEDQFYYKISILIIALNILLLSLALRSLVVPL
HHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLLATVMISISWSLAVSQLIFYKLLGVETYWLLPIILFALLTSVGTDYDIFIVTRVREEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHH
IKGKSDPEAILTAIENTGPIVTGAALVLAIAFMSLMVSQLYILREIGFTVGLSVLMDAFL
HCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRPAVMPAIMVLAGKYNWWPSRISSDQRAVIPVQ
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1878971; 12000953 [H]