Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15899282

Identifier: 15899282

GI number: 15899282

Start: 2318128

End: 2319645

Strand: Direct

Name: 15899282

Synonym: SSO2549

Alternate gene names: NA

Gene position: 2318128-2319645 (Clockwise)

Preceding gene: 15899281

Following gene: 15899284

Centisome position: 77.47

GC content: 36.1

Gene sequence:

>1518_bases
TTGGTCGGAATTAGGATTATGACTAAGCTGTTTGTTAGGGAAACTTCTGGTCTTACTAAAAACGTCTCTTTGCTAGATGT
TACAATGTTAAATGTAGCTAACATGGGTGCTGGGTTAGCAATTTTTATCGGGATAAGTCCTTACATAGTCGAGGGTGCGG
TATTATGGATAGCTTCGTTGTTGACTTTCCTATTTACTTTACCTCTTGTATTCCTTTATACATACTTTATTTCTAGGATT
CCTAGGACAGGAGGCGACTATATTTGGCTATCTAGAAAACTTAATGGTCCTTTAGGTGCTATAATGGGTGTTGCGTTAGC
GTTTAATATGCCTCCGTTCTTTGCATTGTCAGCTTTCTTTTCTGTTTCAGCAATAAACAGCGTACTGTTAACTATTGGTA
CTTTGAATTCCCAGCCCTATCTGGTTAATCTAGCTAATAATGTGTTTACAACTAGTAATGCCGTTCTAGCTTATGGTTTA
GCAGCAGTTGCATTTCTAATAATAATTCTTATTAACATCCTCAGACCAAGATGGGGTTATACTTTAACGTCAGCACTAGG
AATGTTTTCACTTTTAGGCACTTTAGTTGCAATTCTTGTATTAACACTTAATATTTCGGATTTTCATACTGTAATCCAAC
CTTTTATAAAGGACTTTAATTTAACTGTTCAACTCTATAAGGGACCAACATTCAGTTTATCTTCAACGTTTTATATGATT
CCTTACTTTGCATCATTTGCTTATATTTGGTTATATGCAGGGCCAGCTGTTGCTTCTGAGATAAAGAATAAGAGCGGGAT
AAGATATAATTTAATTTTAGGTAGTTTGTTAACGCTTATCTTTATAACTGTCCCATTCTTGCTAATGGATGTTGCGGCAG
GATATGGGTTTAATTACTCTTTATATCTATCAGGCACCTATAATTTCTGGACTGTCGCTATTGCCTTATCTCGTAATTAT
GCTTTAGAGTGGTTTATAGGGATTAGTTTGATAGCCTGGGAGTTCTTTGTTATGGCTTTCGGTGTTGTTGTTTTCGCCAG
GTACGTTTTCGCCTTTTCCTTTGATAGGTTATTCCCAGAGGTATTTTCGAGGTTAAATAAGCAAGGTTCGCCTGCTTATG
CCCATCTCTTAGATTTTGTGGTAACTTTAGTGTTCTTAGCAGTACCAATAATAAGTCCTAACGGATACGAGGCCTTATAC
AGTTATACTCCTTTAGCTATTGCCTACTTAGTTTTAGTATCAATAGCTGGTATTAGGCAGGCTTTAAGTGAGAGAAATTT
GGGTATGTTAATATCAGCTTTACTTTCTATTGGGTTTTTAGGTTTTATGGGCTATGAGGCTTTTACTAATCCTTACTTCG
GTGTTATATCTGATAACGGTGTACCTTACTGGCCGGGAATAGCCTATATAACTAGCTTAATAGGATTAGGCGTTATTACT
TTTGTATCATCATACTATTATAGGAAGAAGAGTGGTATAGATTTAAGGTTAGTGTATAAGGAGATACCACCAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAATAGTGATCAATTTAATTACTCTTTCGATTGCCGTAATTTTATTTATATCTATACAATATGGCCGAACATATTTTCG
TAAGATAAATTTAAAAATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCCTTATACTTAATTTATGCTCTCTGAAAACGTGAGTGTAAAAGTCATATGCTGACGGGAATGTTCTTCCACATACGCA
ATAGTATTTATCCTTAGCGT

Product: amino acid transporter, putative

Products: NA

Alternate protein names: Amino Acid Transporter; Amino Acid Permease-Associated Protein

Number of amino acids: Translated: 505; Mature: 505

Protein sequence:

>505_residues
MVGIRIMTKLFVRETSGLTKNVSLLDVTMLNVANMGAGLAIFIGISPYIVEGAVLWIASLLTFLFTLPLVFLYTYFISRI
PRTGGDYIWLSRKLNGPLGAIMGVALAFNMPPFFALSAFFSVSAINSVLLTIGTLNSQPYLVNLANNVFTTSNAVLAYGL
AAVAFLIIILINILRPRWGYTLTSALGMFSLLGTLVAILVLTLNISDFHTVIQPFIKDFNLTVQLYKGPTFSLSSTFYMI
PYFASFAYIWLYAGPAVASEIKNKSGIRYNLILGSLLTLIFITVPFLLMDVAAGYGFNYSLYLSGTYNFWTVAIALSRNY
ALEWFIGISLIAWEFFVMAFGVVVFARYVFAFSFDRLFPEVFSRLNKQGSPAYAHLLDFVVTLVFLAVPIISPNGYEALY
SYTPLAIAYLVLVSIAGIRQALSERNLGMLISALLSIGFLGFMGYEAFTNPYFGVISDNGVPYWPGIAYITSLIGLGVIT
FVSSYYYRKKSGIDLRLVYKEIPPD

Sequences:

>Translated_505_residues
MVGIRIMTKLFVRETSGLTKNVSLLDVTMLNVANMGAGLAIFIGISPYIVEGAVLWIASLLTFLFTLPLVFLYTYFISRI
PRTGGDYIWLSRKLNGPLGAIMGVALAFNMPPFFALSAFFSVSAINSVLLTIGTLNSQPYLVNLANNVFTTSNAVLAYGL
AAVAFLIIILINILRPRWGYTLTSALGMFSLLGTLVAILVLTLNISDFHTVIQPFIKDFNLTVQLYKGPTFSLSSTFYMI
PYFASFAYIWLYAGPAVASEIKNKSGIRYNLILGSLLTLIFITVPFLLMDVAAGYGFNYSLYLSGTYNFWTVAIALSRNY
ALEWFIGISLIAWEFFVMAFGVVVFARYVFAFSFDRLFPEVFSRLNKQGSPAYAHLLDFVVTLVFLAVPIISPNGYEALY
SYTPLAIAYLVLVSIAGIRQALSERNLGMLISALLSIGFLGFMGYEAFTNPYFGVISDNGVPYWPGIAYITSLIGLGVIT
FVSSYYYRKKSGIDLRLVYKEIPPD
>Mature_505_residues
MVGIRIMTKLFVRETSGLTKNVSLLDVTMLNVANMGAGLAIFIGISPYIVEGAVLWIASLLTFLFTLPLVFLYTYFISRI
PRTGGDYIWLSRKLNGPLGAIMGVALAFNMPPFFALSAFFSVSAINSVLLTIGTLNSQPYLVNLANNVFTTSNAVLAYGL
AAVAFLIIILINILRPRWGYTLTSALGMFSLLGTLVAILVLTLNISDFHTVIQPFIKDFNLTVQLYKGPTFSLSSTFYMI
PYFASFAYIWLYAGPAVASEIKNKSGIRYNLILGSLLTLIFITVPFLLMDVAAGYGFNYSLYLSGTYNFWTVAIALSRNY
ALEWFIGISLIAWEFFVMAFGVVVFARYVFAFSFDRLFPEVFSRLNKQGSPAYAHLLDFVVTLVFLAVPIISPNGYEALY
SYTPLAIAYLVLVSIAGIRQALSERNLGMLISALLSIGFLGFMGYEAFTNPYFGVISDNGVPYWPGIAYITSLIGLGVIT
FVSSYYYRKKSGIDLRLVYKEIPPD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55866; Mature: 55866

Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVGIRIMTKLFVRETSGLTKNVSLLDVTMLNVANMGAGLAIFIGISPYIVEGAVLWIASL
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
LTFLFTLPLVFLYTYFISRIPRTGGDYIWLSRKLNGPLGAIMGVALAFNMPPFFALSAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
SVSAINSVLLTIGTLNSQPYLVNLANNVFTTSNAVLAYGLAAVAFLIIILINILRPRWGY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
TLTSALGMFSLLGTLVAILVLTLNISDFHTVIQPFIKDFNLTVQLYKGPTFSLSSTFYMI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEECCCHHHHH
PYFASFAYIWLYAGPAVASEIKNKSGIRYNLILGSLLTLIFITVPFLLMDVAAGYGFNYS
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
LYLSGTYNFWTVAIALSRNYALEWFIGISLIAWEFFVMAFGVVVFARYVFAFSFDRLFPE
EEEECCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSRLNKQGSPAYAHLLDFVVTLVFLAVPIISPNGYEALYSYTPLAIAYLVLVSIAGIRQ
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSERNLGMLISALLSIGFLGFMGYEAFTNPYFGVISDNGVPYWPGIAYITSLIGLGVIT
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FVSSYYYRKKSGIDLRLVYKEIPPD
HHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure
MVGIRIMTKLFVRETSGLTKNVSLLDVTMLNVANMGAGLAIFIGISPYIVEGAVLWIASL
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
LTFLFTLPLVFLYTYFISRIPRTGGDYIWLSRKLNGPLGAIMGVALAFNMPPFFALSAFF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
SVSAINSVLLTIGTLNSQPYLVNLANNVFTTSNAVLAYGLAAVAFLIIILINILRPRWGY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
TLTSALGMFSLLGTLVAILVLTLNISDFHTVIQPFIKDFNLTVQLYKGPTFSLSSTFYMI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEECCCHHHHH
PYFASFAYIWLYAGPAVASEIKNKSGIRYNLILGSLLTLIFITVPFLLMDVAAGYGFNYS
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
LYLSGTYNFWTVAIALSRNYALEWFIGISLIAWEFFVMAFGVVVFARYVFAFSFDRLFPE
EEEECCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFSRLNKQGSPAYAHLLDFVVTLVFLAVPIISPNGYEALYSYTPLAIAYLVLVSIAGIRQ
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALSERNLGMLISALLSIGFLGFMGYEAFTNPYFGVISDNGVPYWPGIAYITSLIGLGVIT
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FVSSYYYRKKSGIDLRLVYKEIPPD
HHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA