Definition Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome.
Accession NC_002754
Length 2,992,245

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15899083

Identifier: 15899083

GI number: 15899083

Start: 2125249

End: 2126718

Strand: Direct

Name: 15899083

Synonym: SSO2325

Alternate gene names: NA

Gene position: 2125249-2126718 (Clockwise)

Preceding gene: 15899082

Following gene: 15899084

Centisome position: 71.03

GC content: 31.63

Gene sequence:

>1470_bases
ATGATAAGGTTAGATAAACGTAACTTCATTCCTTGGATTTCTATAGTTCTTTTATTATGTGCCTACTCCATAGGGACTGG
CCTGTATATAACTATACAGCGTGTTACGTATTATCCTATATTTGAATCTAAAATTGTTTCAGTATTTCTTACAATATTCT
CATCATCCTTGATTACTTTTTACAATTATAAGAAATATGTCTTTCTACTTCCGTTATCTCTATTGTCTTTCTTCTCTGTG
TCGTTAACTCCCCTTATAATATCTATATTTATTTTATATGAGTTAAAGAAAGTTGACCGAACAGTTAGTATTATATTGCT
AATAATAAATGCTTCCATGATATCATGGCTTATTCTACGTTTACTATTAGGCATTAATACTTACTTTTCTATTCCTCTAA
TGATTTTAGAAGCGGGAGCACCTACGGTAATTCCATTTATATGGTTTGTTGGAATAATATTATCTGCTTATAAAAGAAAT
TTAAGTAGTAAAAGCCAACTATTTATCAATCCCTTAATTCCATTCATTGTGGTACTACTTATTTCTCTAATCCCTTACCT
TCCTTTTATAAATCCTTACAAGTTTCCAGAAACTGTTGATTTCAAATATTACTATTCATGGCTTTTGGCACCCACTTTCA
GTGGATGGTTCTTCGACTCCAGGCCTGTGTATTTGATGCTTTTATATGCGTTGTCACTCATTTTTAAACCGTATACAGTA
GCGTACTATGAATTTATATTTCTCTCACTTCTTTATACATATTCTGCATATAAACTAGCCTCAGCAATAGATAAATCTAT
AGCTTCCTTATCTGCCTTATTAGCTTCGGTATCTCCTATGCTAATGACCTTCCTCTATTCTGGTTTGGAAGCCAATTTAT
TTTCAATATCATTGATGTTTATCTCAATGTCGTATCTTTTCAAAAAAGAGAAATTAAGTTTAGCGATACTATTTTCTTTA
TTATCAATGTTCTCTCACATATACGCTTGGGCTCAATTATCAACTGGAATAACTCTATATTATCTTCTTAAATCAATTAT
ACATAGATCCAGACCAGACAACTATACATTAACGTATTTGTCCTTCTCAATTCCTTTTATAGCAATTGGACTCTTTCTTA
TATTAAGTGGCGTTTTTCCTCTACCTATGGAATTATTAAATTATACTCAACTTATATACCAGATAGCGGTAGTGAGTTGG
GGATCCAACAACGCCTTGCTTTACTTTTTGTTATCGTCTTTTGGAAATAGGTATGTTAAGGAAGGAGTTCTAAATTTCGT
TTATTCAATTTCGGTATTTGGTATTATCTTTGTATCATCAGCAACCAATTTAATTATCGACTTACCTCTTTTCATTCCAG
CTGCATATACCATAAGAAACGTTAATAGGCGAAGTACTTCTATACTATTGGTCTTAAGTTTAATATTGTGGGGTATCTAT
ATGAGCATTAACAGCGTTCCTATGCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTGAAATCTCCATTTTTGATTCTAATATAAGGGTCCTAGTTTTAGGGGTTTTACTAACTATTTTGTCATCCTTCATCCT
AAAGGTTATGGTGGGACGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATGCTTAACATTATCTCGTTGCTTACATAAAAATTTTGTAAGACGATGCTTTGTTAGCTTGTCAAGAGTGTTCTCAGG
GAGTGTTCTCATGCAGTCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 489

Protein sequence:

>489_residues
MIRLDKRNFIPWISIVLLLCAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVFLTIFSSSLITFYNYKKYVFLLPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILYELKKVDRTVSIILLIINASMISWLILRLLLGINTYFSIPLMILEAGAPTVIPFIWFVGIILSAYKRN
LSSKSQLFINPLIPFIVVLLISLIPYLPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLAPTFSGWFFDSRPVYLMLLYALSLIFKPYTV
AYYEFIFLSLLYTYSAYKLASAIDKSIASLSALLASVSPMLMTFLYSGLEANLFSISLMFISMSYLFKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSTGITLYYLLKSIIHRSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGLFLILSGVFPLPMELLNYTQLIYQIAVVSW
GSNNALLYFLLSSFGNRYVKEGVLNFVYSISVFGIIFVSSATNLIIDLPLFIPAAYTIRNVNRRSTSILLVLSLILWGIY
MSINSVPML

Sequences:

>Translated_489_residues
MIRLDKRNFIPWISIVLLLCAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVFLTIFSSSLITFYNYKKYVFLLPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILYELKKVDRTVSIILLIINASMISWLILRLLLGINTYFSIPLMILEAGAPTVIPFIWFVGIILSAYKRN
LSSKSQLFINPLIPFIVVLLISLIPYLPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLAPTFSGWFFDSRPVYLMLLYALSLIFKPYTV
AYYEFIFLSLLYTYSAYKLASAIDKSIASLSALLASVSPMLMTFLYSGLEANLFSISLMFISMSYLFKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSTGITLYYLLKSIIHRSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGLFLILSGVFPLPMELLNYTQLIYQIAVVSW
GSNNALLYFLLSSFGNRYVKEGVLNFVYSISVFGIIFVSSATNLIIDLPLFIPAAYTIRNVNRRSTSILLVLSLILWGIY
MSINSVPML
>Mature_489_residues
MIRLDKRNFIPWISIVLLLCAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVFLTIFSSSLITFYNYKKYVFLLPLSLLSFFSV
SLTPLIISIFILYELKKVDRTVSIILLIINASMISWLILRLLLGINTYFSIPLMILEAGAPTVIPFIWFVGIILSAYKRN
LSSKSQLFINPLIPFIVVLLISLIPYLPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLAPTFSGWFFDSRPVYLMLLYALSLIFKPYTV
AYYEFIFLSLLYTYSAYKLASAIDKSIASLSALLASVSPMLMTFLYSGLEANLFSISLMFISMSYLFKKEKLSLAILFSL
LSMFSHIYAWAQLSTGITLYYLLKSIIHRSRPDNYTLTYLSFSIPFIAIGLFLILSGVFPLPMELLNYTQLIYQIAVVSW
GSNNALLYFLLSSFGNRYVKEGVLNFVYSISVFGIIFVSSATNLIIDLPLFIPAAYTIRNVNRRSTSILLVLSLILWGIY
MSINSVPML

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55977; Mature: 55977

Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIRLDKRNFIPWISIVLLLCAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVFLTIFSSSLITF
CCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNYKKYVFLLPLSLLSFFSVSLTPLIISIFILYELKKVDRTVSIILLIINASMISWLILR
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGINTYFSIPLMILEAGAPTVIPFIWFVGIILSAYKRNLSSKSQLFINPLIPFIVVLL
HHHCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
ISLIPYLPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLAPTFSGWFFDSRPVYLMLLYALSLIFKPYTV
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AYYEFIFLSLLYTYSAYKLASAIDKSIASLSALLASVSPMLMTFLYSGLEANLFSISLMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ISMSYLFKKEKLSLAILFSLLSMFSHIYAWAQLSTGITLYYLLKSIIHRSRPDNYTLTYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE
SFSIPFIAIGLFLILSGVFPLPMELLNYTQLIYQIAVVSWGSNNALLYFLLSSFGNRYVK
EHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCHHHHH
EGVLNFVYSISVFGIIFVSSATNLIIDLPLFIPAAYTIRNVNRRSTSILLVLSLILWGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSINSVPML
HHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIRLDKRNFIPWISIVLLLCAYSIGTGLYITIQRVTYYPIFESKIVSVFLTIFSSSLITF
CCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNYKKYVFLLPLSLLSFFSVSLTPLIISIFILYELKKVDRTVSIILLIINASMISWLILR
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLGINTYFSIPLMILEAGAPTVIPFIWFVGIILSAYKRNLSSKSQLFINPLIPFIVVLL
HHHCCCHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
ISLIPYLPFINPYKFPETVDFKYYYSWLLAPTFSGWFFDSRPVYLMLLYALSLIFKPYTV
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
AYYEFIFLSLLYTYSAYKLASAIDKSIASLSALLASVSPMLMTFLYSGLEANLFSISLMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ISMSYLFKKEKLSLAILFSLLSMFSHIYAWAQLSTGITLYYLLKSIIHRSRPDNYTLTYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE
SFSIPFIAIGLFLILSGVFPLPMELLNYTQLIYQIAVVSWGSNNALLYFLLSSFGNRYVK
EHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCHHHHH
EGVLNFVYSISVFGIIFVSSATNLIIDLPLFIPAAYTIRNVNRRSTSILLVLSLILWGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MSINSVPML
HHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA