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The map label for this gene is 15898686

Identifier: 15898686

GI number: 15898686

Start: 1705197

End: 1706417

Strand: Direct

Name: 15898686

Synonym: SSO1890

Alternate gene names: NA

Gene position: 1705197-1706417 (Clockwise)

Preceding gene: 15898682

Following gene: 15898687

Centisome position: 56.99

GC content: 34.15

Gene sequence:

>1221_bases
ATGTTTACTACTTTTGTAAGTAAGTTTAAATTTAAGTTGTCAACTACTTATATATCTACAATGGATAGCTCAAAACATTC
ATTAATTTACTCAGCCATAATCCTTGTACTGATGACGATCTCAGCTAGAGCTACAAATAACATGGTTACTACAACAGTTC
CACTCTTAGCGAAATATAGTCTTCAGCTATCTAACTCTATGGTAGGCCTTTTATCAGCCTTATTATTTACATTCAACTTC
ATTGCCACAACATTTATTAATCCTGAACTTAATTCGAAGCTAAGAAAAAGGGCGTTCGTTATATCGAATATTATAATTTT
ACTTTCCTTACCACTCTATTATCTGTCTAACGTAATATCAATATGGATAATCTCAATCTTCGCTGGGATTGCTTTTGGTT
TAGTAATGCCTAATCTAATAACAGCAGCGAGTTTAGCAAATGATAAGAAATCAGTTGAGAGACTACTATCCCTTTACTCA
ACTAGCCTTAGTACCAGTTTGATCCTAGGCCCTGCAATTGAAGTCTATTTACTAACTAGATATGACTATAGGGATGTATT
TCTATGGTTTATTCCGATAGCAGTTATAGGTGTTATAATTGCTTCAAGAATTAGATTCCCAGATGTTAAGAGAGAAAGTA
GTGGGATGTCAGTGATTAAAAATAAGGGTTTAATGGCAGCTTCCTTATCGATTACAACCTATAACGTGCCATTCGCTGCA
TTTACAACATTCTTGGCTATATTGGCTAAAGATAGATTCAACTTGCCGAGTTTTGATGCCTATTTTGTCTTTTTGCCATT
CTATATAATGTCGTTCTTAACCAGACTCACAATGACAATAAGGCCTTTTGAAAACCTCAGAATGCCCATGTTAATTTCAA
TTATTATAACGATTTTAGGATTGTTTGGACTACTATACGCTCCCAACTATTCTATTTTCTTAGCAGTTATTGCACTACTG
GGAATACCTCATGGTTCAATATTCCCCATGGCTACCATAATGATAAGTAGGGCTACGAGCATTGCTGAAAGGAATGCAGT
AAATTCCTATTTTTCGGCATATAACAACTTATTATTCTTAATAGTACCAGCTATAATTGGATTTGTATCAGAGATAATTG
GATTAACGTTCTCCATCTCAGCATTAGTAATACCAGTTGCCATTACTGCAGTAGTTTTCTTCAAGATGTTTTGGAATGAT
AATATTATGGTCAAGAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGCCTTTCTTAAATCCTCACTTAAATTTTCAAACATATTGGGTTAGTGATCGTGCTGGTCTAATAAAGCTATGCTTAT
CTGAGCAATAAAAAATTAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTAAATAACTTCAAGGCTTTCCATATCCACATGGATAAGAAAGTCTTGATTTTTATAGTATTAATAGTTATAATAT
CTTTTGCTTTAATAATGGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Multidrug Efflux Permease; Multidrug Resistance Protein

Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406

Protein sequence:

>406_residues
MFTTFVSKFKFKLSTTYISTMDSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSMVGLLSALLFTFNF
IATTFINPELNSKLRKRAFVISNIIILLSLPLYYLSNVISIWIISIFAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYS
TSLSTSLILGPAIEVYLLTRYDYRDVFLWFIPIAVIGVIIASRIRFPDVKRESSGMSVIKNKGLMAASLSITTYNVPFAA
FTTFLAILAKDRFNLPSFDAYFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGLLYAPNYSIFLAVIALL
GIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFSAYNNLLFLIVPAIIGFVSEIIGLTFSISALVIPVAITAVVFFKMFWND
NIMVKR

Sequences:

>Translated_406_residues
MFTTFVSKFKFKLSTTYISTMDSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSMVGLLSALLFTFNF
IATTFINPELNSKLRKRAFVISNIIILLSLPLYYLSNVISIWIISIFAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYS
TSLSTSLILGPAIEVYLLTRYDYRDVFLWFIPIAVIGVIIASRIRFPDVKRESSGMSVIKNKGLMAASLSITTYNVPFAA
FTTFLAILAKDRFNLPSFDAYFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGLLYAPNYSIFLAVIALL
GIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFSAYNNLLFLIVPAIIGFVSEIIGLTFSISALVIPVAITAVVFFKMFWND
NIMVKR
>Mature_406_residues
MFTTFVSKFKFKLSTTYISTMDSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSMVGLLSALLFTFNF
IATTFINPELNSKLRKRAFVISNIIILLSLPLYYLSNVISIWIISIFAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYS
TSLSTSLILGPAIEVYLLTRYDYRDVFLWFIPIAVIGVIIASRIRFPDVKRESSGMSVIKNKGLMAASLSITTYNVPFAA
FTTFLAILAKDRFNLPSFDAYFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGLLYAPNYSIFLAVIALL
GIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFSAYNNLLFLIVPAIIGFVSEIIGLTFSISALVIPVAITAVVFFKMFWND
NIMVKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45281; Mature: 45281

Theoretical pI: Translated: 10.40; Mature: 10.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFTTFVSKFKFKLSTTYISTMDSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LQLSNSMVGLLSALLFTFNFIATTFINPELNSKLRKRAFVISNIIILLSLPLYYLSNVIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWIISIFAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEE
YDYRDVFLWFIPIAVIGVIIASRIRFPDVKRESSGMSVIKNKGLMAASLSITTYNVPFAA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCHHH
FTTFLAILAKDRFNLPSFDAYFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LFGLLYAPNYSIFLAVIALLGIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFSAYNNLLFL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVPAIIGFVSEIIGLTFSISALVIPVAITAVVFFKMFWNDNIMVKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEC
>Mature Secondary Structure
MFTTFVSKFKFKLSTTYISTMDSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LQLSNSMVGLLSALLFTFNFIATTFINPELNSKLRKRAFVISNIIILLSLPLYYLSNVIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWIISIFAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEE
YDYRDVFLWFIPIAVIGVIIASRIRFPDVKRESSGMSVIKNKGLMAASLSITTYNVPFAA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCHHH
FTTFLAILAKDRFNLPSFDAYFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHH
LFGLLYAPNYSIFLAVIALLGIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFSAYNNLLFL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVPAIIGFVSEIIGLTFSISALVIPVAITAVVFFKMFWNDNIMVKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA