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The map label for this gene is 15898577

Identifier: 15898577

GI number: 15898577

Start: 1611934

End: 1613340

Strand: Direct

Name: 15898577

Synonym: SSO1780

Alternate gene names: NA

Gene position: 1611934-1613340 (Clockwise)

Preceding gene: 15898575

Following gene: 15898581

Centisome position: 53.87

GC content: 33.97

Gene sequence:

>1407_bases
ATGAATCCCATTAAGAATGCATTGAAGAACCTAAGCGTCACAACAACTAATGTAATAATTGCTTTAATTTTCTTCGTTAT
TACAGCTAAGATTTCTAGTCCAGCATTCTTCGGAAAAGTTGCGATAGTTCAATTACTTGAGATAGTAACGTCGACTTTCT
TTTACTTTATTCCAGGCCAAATAATAACTAGGGAAATATCTTATCTTTACGCTAAAAAAGAGATAACTAAAGAGGTAGTA
GGAAAATTCCTTTCATTTCCTTTTCTAGTTTTACCGATTTTCCTCATCCTTCTTATTTTTCCAGATTACGTTAAGTTAGC
AATACCTTATCTTTTCCTTTACCTCCTTAATGGCGTAATGACAGCAGTGATGATAGGAATGGATATGTTTACAGAATCTG
CAATTACTGGAAACTTCTTTCTAGTCATAAGATGGGGGATAGCAATAATCGCTGTTCTCTACCACAATATATATCTCTTC
GTTAAAATTTGGACTTTGGGAGGAATTCTCTCAGTATCTATGAATTACGCATTTATTAGCAAAAAGGTTGGGTTAGTACT
TCCTACGCCAGACTTTGCCTTTCTCTTTAGGCATTTTAGGGAAGGTTTACCTGTTTATTTATCTTCTTTTGCTGGTTTTC
TTTCCTCCCAAGGGGATAGGGTAACTACTGCGTATTTGCTAGGTTCTTATTATCTGGGCATTTATCAGTTTTCAGCTTTA
GTTGCTGGTGTTCCCTCAATGATTTTAGGTGCCTTAGGTGGGGTTTTGTTACCTACCGCGTCATTTTATAAGGCTTTAGG
GAAGGATGAAAAGAAGATGTCGTCTCTTTCTTTTATATTCCTCTCGCTTTTAACTTTTCTAACAGTAATAATTTCTATTC
CGATAGGTGAGATCATAATTATTCATTTCTTTCCTAATTATAAAGAGGGATTAGAAGTATTCGTGTTACTCTTGATTTCG
GCTACTCTTCCGTTTCCTATAGGTTCTCTTACGAATTTTATTGTAGCGTTCAAGAGAAACTTAAGACCTTTCCTTATCCT
TTCAATTTTAAACGGAAGTTTAGTCTTACTTACTTCCTATTTATTAATTCCGAGGATAGGAATAATGGGTGGTGCTATAT
CTCAAGTTATAGTAGCTACAATTTCTTCTCTCTTTATCATATTTTACTCTATAAGAACATCGGTATTTTCAACTGGAAGG
AAAGAAATAATTTTACTTTTCCTCATACCCGTAGTAGGAATTTATGAGGCTATAGATCCTCCGTTTCTAGATTTTCTCCT
AATTCTTCTTATACTTTTAGTGTTTAAACTGTTTAAAATAATCACTGAAGAGGACGTTAAAATAATTGAAGGTTTCTTGC
CACATGGGTTAAAATTCGTGTCGAAAATTTTAAGTAAACTAACGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTTGAAGTAATCCATAAAGTAGTAATACCTTTGACCAATCCATAAAGTAAGGCTATAAGAAAAGCTTTAATATTTT
TCTCTTAAGAACTAAACTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAGTGTCTTCTTATATTTCTGTTAACTTCAAAATTTTTGGAATATTTTAGGCTAACTAAAGGAAGTTAATACATAAAA
TGTTTTGGTTAAAGGGAGTG

Product: polysaccharide biosynthesis related protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Related Protein

Number of amino acids: Translated: 468; Mature: 468

Protein sequence:

>468_residues
MNPIKNALKNLSVTTTNVIIALIFFVITAKISSPAFFGKVAIVQLLEIVTSTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEITKEVV
GKFLSFPFLVLPIFLILLIFPDYVKLAIPYLFLYLLNGVMTAVMIGMDMFTESAITGNFFLVIRWGIAIIAVLYHNIYLF
VKIWTLGGILSVSMNYAFISKKVGLVLPTPDFAFLFRHFREGLPVYLSSFAGFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGGVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFIFLSLLTFLTVIISIPIGEIIIIHFFPNYKEGLEVFVLLLIS
ATLPFPIGSLTNFIVAFKRNLRPFLILSILNGSLVLLTSYLLIPRIGIMGGAISQVIVATISSLFIIFYSIRTSVFSTGR
KEIILLFLIPVVGIYEAIDPPFLDFLLILLILLVFKLFKIITEEDVKIIEGFLPHGLKFVSKILSKLT

Sequences:

>Translated_468_residues
MNPIKNALKNLSVTTTNVIIALIFFVITAKISSPAFFGKVAIVQLLEIVTSTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEITKEVV
GKFLSFPFLVLPIFLILLIFPDYVKLAIPYLFLYLLNGVMTAVMIGMDMFTESAITGNFFLVIRWGIAIIAVLYHNIYLF
VKIWTLGGILSVSMNYAFISKKVGLVLPTPDFAFLFRHFREGLPVYLSSFAGFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGGVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFIFLSLLTFLTVIISIPIGEIIIIHFFPNYKEGLEVFVLLLIS
ATLPFPIGSLTNFIVAFKRNLRPFLILSILNGSLVLLTSYLLIPRIGIMGGAISQVIVATISSLFIIFYSIRTSVFSTGR
KEIILLFLIPVVGIYEAIDPPFLDFLLILLILLVFKLFKIITEEDVKIIEGFLPHGLKFVSKILSKLT
>Mature_468_residues
MNPIKNALKNLSVTTTNVIIALIFFVITAKISSPAFFGKVAIVQLLEIVTSTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEITKEVV
GKFLSFPFLVLPIFLILLIFPDYVKLAIPYLFLYLLNGVMTAVMIGMDMFTESAITGNFFLVIRWGIAIIAVLYHNIYLF
VKIWTLGGILSVSMNYAFISKKVGLVLPTPDFAFLFRHFREGLPVYLSSFAGFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGIYQFSAL
VAGVPSMILGALGGVLLPTASFYKALGKDEKKMSSLSFIFLSLLTFLTVIISIPIGEIIIIHFFPNYKEGLEVFVLLLIS
ATLPFPIGSLTNFIVAFKRNLRPFLILSILNGSLVLLTSYLLIPRIGIMGGAISQVIVATISSLFIIFYSIRTSVFSTGR
KEIILLFLIPVVGIYEAIDPPFLDFLLILLILLVFKLFKIITEEDVKIIEGFLPHGLKFVSKILSKLT

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52142; Mature: 52142

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA