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The map label for this gene is 15898533

Identifier: 15898533

GI number: 15898533

Start: 1566444

End: 1569419

Strand: Direct

Name: 15898533

Synonym: SSO1729

Alternate gene names: NA

Gene position: 1566444-1569419 (Clockwise)

Preceding gene: 15898532

Following gene: 15898534

Centisome position: 52.35

GC content: 33.33

Gene sequence:

>2976_bases
GTGAGGCGGGTGGGATCAAAAAACTGTTCAAGAGGAGGAGAAAACCGTAAAGTGCTACTCTATTATTTACTCATTAATAA
ACTTCTAAAATACAAAGAACTGAGAAGATTTTTCGAAAATTTTTACAGTATATATAAGAAGAGTGGAAGCAGAGCAAAAG
CACGAAAGAAAGTAAGTGCTGCTGACGTACTAGCCTCAGAGTATAATCGATGGGTATTAAACTATCTATATTCGACTTCA
CAGAGAAAACGTTCATTTAAATATTTCAAGTCTAGCTATATATTTAGATATTTCAGGTTTCACAATATATTCAACCCGGA
ATACAGTGTCGACACAGGTTACGATATCGACTATAATAAAATGGGCCGTTTTATGGAAAAATTCCGTGAAATAATTGATA
AATTTATTGAAAAACAAACAGGAAATACACTAGACAAAACGAAAATATTTAAACTAATTAAATCTGTATATTTTCTAATT
TACACTATATATGAACCTTTATGGATTTATTTTGGCCTTCCAGTAGAAGTAGAAGATTCCAGATCTCCATTTTATACAAT
CTTTGACCATTTATATGCTTCAGCTTCAATGATTAACTGGGTATATTACGATGATAGATCTGACCCTAAAGGCAAGAAGG
GGAAGAAAACACAGCAAGATACTTATTCTAAAAATGCACCTAACCCTAAAGGGTTTTACGTTGTGATAGATATTCCCGGT
GTTCAAGAAATAATTAATTCGGCAAGAAAGGCTAGCGATTACTGGGCTGGAAGTTGGATGTTATCTATGATAATATGGTT
AACCGTTTGGCAGTTAATTAAAGAGTACGGACCTGATGTGTTGTTAGCACCAACAACTAGGTTTAACCCTATTTACTACG
CAATGACTTTAAACTATTTGGAAAAAGAATTCGGAATGGATGACGGGCTAAAGAAAGAAATTGAGGAGATTCTTAATACG
ATCCTAGGCAAGCTTAGTGGAATTTACGATTATACTCAGTTCCTTAAAGAAGCAATAATCCCCGCGACAGCAAGTTTAAT
CTTACCTAAAGAACAAAATACTTGTAGTATAAAGCTCGAGCAAGAGATATTCGAGTACTATAAGAATGCATATAATTGTA
TAGTGAAGGAAATTCCGACCGGGAATGTTCAGAGTGACATTTGTAAAGAATTTGTAGAGGCGTTTAACATTATCTATCAG
TCGAATTCAACATTAGATAATTTAATGAATGTGATAATTAACGAGGCTGAAAAATATGCAGATAAAATTTTAATTAGACC
TGCAATTTACATCGTAGATATTGATGATATAAGAGATGAGGTAGAGAGTGATTTAAGGAATAAAAATGTGAATGCGATTT
TAAATAACAAGCAATTCAATCAACTTGTACCACAATACATCTTTCATTATATTTCCACTAAGTTATTTAGAGAGAAAGTT
AAGGAAAAATATAAGCGAGAGATTCTTCCTAAACCTAACTGGTTTACTTCGTTTAATAAAGAGTTTGATTACATAAATGG
TGGTAAAAATTGGGAATATTGTACCGTTTGTGGTAATGAGCCTGCGATAATTAACTTTGGTAAGGAAAACGATGATTACT
CTGCTTCTACTAAATGTGAAATTTTAAGGTTAGCATACCAGAATAGGTACAAGGTAACTGATGACGACTTAAAAGACCTA
AAGGTGTGGTTTAAGCCTGGTGAAAAGTTAGGTCCTTTATGTATAATTAAAAGAGGATTATATTTCAGATTACGTAAAAA
TTTAGAGAAAGTGTTTAAGAGTACTGATGATATCGCTTACAGCTATTATAAGAATGTTATACAACCTAGAATTAAGGATC
TAGATGAGTGTGAGAAACTGAAGAATTTCTTAAATGCTGAAGAGTTAGACGTTTATGAGACTTTCGGAAACCCGGTAATA
GCTAGAAGATTGTTCAGTAAATGTACTGAAGTTGAGGACAAAAAGTTACCTTGTATACAAAAGGAATATGGGGTAAGTGA
CGTTAATAATGCGTTTATAGATGCTCTTAAAGGTTATAGAGAGTTTTATGCTATAGTTAAGGCTGACGCTGATGATATGA
CAGAATTAGCTAGGGGTGAGATAGATGCGGAGAAATACTTTGAAGTTTTGCCTCGATTAATAAAAGAAGGAGAGTTTGAA
GAAAAAGAGTCTAAAAATCCTAAAAACAGAGCATGCAAATTTCTAATTTACACCTACTCTAATATGACCTCAATTGCTAA
AGTCATTAACGACGGTAATATCTTAATGTCGCCCACCTATAGGGTTGCATTATCACTAGCTATGATGATTACATTACTTA
GAGATATAAAGACTGTAGAAGTTGAGAATTATGGACAAATCATTTATGCTGGAGGAGATGACGTGGTTGCGCTTGTCCCT
ATTGATAGGCTAATTGATACTTTAATAGGTTTGGAGAGGAACTTCGTAGGCGAGAACGGGTTCTTTAAAGTTAGACAATG
GTATATCCCGACATTCTATCCTCACGGTAGATCGTTTTCTGTTAGAATAGCTAATATAGCGGACTTCATGACTAATGAGA
TACAAATGGCTACAGAATTACTTAATAGAGTGAAGAAGGTTAAATGGGAGTTTCCAAACGGAGAAGAGAAGAGAAGTAAA
TTCTCTGCTATTCTTTCTACTTCGAGGACAAGTTATGAGAGTGTATTACCCATGTGGGATTTTAAGTACTTGATTCTGCT
AAAGAAGATGTGGCTACTTAATTTAAGTAATAAGTTGAGTTCTTCCGTATTCGAAGATTATGAAAGCGCTTTTAAGGAGT
TCATCACGTCGGAAAGGAAATTAACGAAACGGTTAATCAATTACGTCTTACTTAAAAATAATGGTAAAGAATTAGTTGAG
GATTTCAATAAATTAGATTTCTTGTCATTAAATAAGAAAAGTAACGTTTATAATGAAATATTTAAAGCATTTAGAATAAT
GAGGGGAGTAATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGAAGGCTCTCTCCCTCCTCGTTGTCCAATACTTCAAGTACTCCACGGGTCTGGTACTCGGGGCCAAAAGGTTGGCCAG
ATTGATAAAAAGCATTTACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAGATGAGGATTAAGCCATTAGAGGAATACAGAATTGGATTGAGACAAAGTAGTGGAATTGTTATTGAGAACGTTGAC
GTAATATCGGCTTTTCCATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: CRISPR-Associated RAMP Crm2 Family Protein; CRISPR-Associated Cmr2 Family Protein; HD Superfamily Hydrolase

Number of amino acids: Translated: 991; Mature: 991

Protein sequence:

>991_residues
MRRVGSKNCSRGGENRKVLLYYLLINKLLKYKELRRFFENFYSIYKKSGSRAKARKKVSAADVLASEYNRWVLNYLYSTS
QRKRSFKYFKSSYIFRYFRFHNIFNPEYSVDTGYDIDYNKMGRFMEKFREIIDKFIEKQTGNTLDKTKIFKLIKSVYFLI
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KEKYKREILPKPNWFTSFNKEFDYINGGKNWEYCTVCGNEPAIINFGKENDDYSASTKCEILRLAYQNRYKVTDDDLKDL
KVWFKPGEKLGPLCIIKRGLYFRLRKNLEKVFKSTDDIAYSYYKNVIQPRIKDLDECEKLKNFLNAEELDVYETFGNPVI
ARRLFSKCTEVEDKKLPCIQKEYGVSDVNNAFIDALKGYREFYAIVKADADDMTELARGEIDAEKYFEVLPRLIKEGEFE
EKESKNPKNRACKFLIYTYSNMTSIAKVINDGNILMSPTYRVALSLAMMITLLRDIKTVEVENYGQIIYAGGDDVVALVP
IDRLIDTLIGLERNFVGENGFFKVRQWYIPTFYPHGRSFSVRIANIADFMTNEIQMATELLNRVKKVKWEFPNGEEKRSK
FSAILSTSRTSYESVLPMWDFKYLILLKKMWLLNLSNKLSSSVFEDYESAFKEFITSERKLTKRLINYVLLKNNGKELVE
DFNKLDFLSLNKKSNVYNEIFKAFRIMRGVI

Sequences:

>Translated_991_residues
MRRVGSKNCSRGGENRKVLLYYLLINKLLKYKELRRFFENFYSIYKKSGSRAKARKKVSAADVLASEYNRWVLNYLYSTS
QRKRSFKYFKSSYIFRYFRFHNIFNPEYSVDTGYDIDYNKMGRFMEKFREIIDKFIEKQTGNTLDKTKIFKLIKSVYFLI
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VQEIINSARKASDYWAGSWMLSMIIWLTVWQLIKEYGPDVLLAPTTRFNPIYYAMTLNYLEKEFGMDDGLKKEIEEILNT
ILGKLSGIYDYTQFLKEAIIPATASLILPKEQNTCSIKLEQEIFEYYKNAYNCIVKEIPTGNVQSDICKEFVEAFNIIYQ
SNSTLDNLMNVIINEAEKYADKILIRPAIYIVDIDDIRDEVESDLRNKNVNAILNNKQFNQLVPQYIFHYISTKLFREKV
KEKYKREILPKPNWFTSFNKEFDYINGGKNWEYCTVCGNEPAIINFGKENDDYSASTKCEILRLAYQNRYKVTDDDLKDL
KVWFKPGEKLGPLCIIKRGLYFRLRKNLEKVFKSTDDIAYSYYKNVIQPRIKDLDECEKLKNFLNAEELDVYETFGNPVI
ARRLFSKCTEVEDKKLPCIQKEYGVSDVNNAFIDALKGYREFYAIVKADADDMTELARGEIDAEKYFEVLPRLIKEGEFE
EKESKNPKNRACKFLIYTYSNMTSIAKVINDGNILMSPTYRVALSLAMMITLLRDIKTVEVENYGQIIYAGGDDVVALVP
IDRLIDTLIGLERNFVGENGFFKVRQWYIPTFYPHGRSFSVRIANIADFMTNEIQMATELLNRVKKVKWEFPNGEEKRSK
FSAILSTSRTSYESVLPMWDFKYLILLKKMWLLNLSNKLSSSVFEDYESAFKEFITSERKLTKRLINYVLLKNNGKELVE
DFNKLDFLSLNKKSNVYNEIFKAFRIMRGVI
>Mature_991_residues
MRRVGSKNCSRGGENRKVLLYYLLINKLLKYKELRRFFENFYSIYKKSGSRAKARKKVSAADVLASEYNRWVLNYLYSTS
QRKRSFKYFKSSYIFRYFRFHNIFNPEYSVDTGYDIDYNKMGRFMEKFREIIDKFIEKQTGNTLDKTKIFKLIKSVYFLI
YTIYEPLWIYFGLPVEVEDSRSPFYTIFDHLYASASMINWVYYDDRSDPKGKKGKKTQQDTYSKNAPNPKGFYVVIDIPG
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ILGKLSGIYDYTQFLKEAIIPATASLILPKEQNTCSIKLEQEIFEYYKNAYNCIVKEIPTGNVQSDICKEFVEAFNIIYQ
SNSTLDNLMNVIINEAEKYADKILIRPAIYIVDIDDIRDEVESDLRNKNVNAILNNKQFNQLVPQYIFHYISTKLFREKV
KEKYKREILPKPNWFTSFNKEFDYINGGKNWEYCTVCGNEPAIINFGKENDDYSASTKCEILRLAYQNRYKVTDDDLKDL
KVWFKPGEKLGPLCIIKRGLYFRLRKNLEKVFKSTDDIAYSYYKNVIQPRIKDLDECEKLKNFLNAEELDVYETFGNPVI
ARRLFSKCTEVEDKKLPCIQKEYGVSDVNNAFIDALKGYREFYAIVKADADDMTELARGEIDAEKYFEVLPRLIKEGEFE
EKESKNPKNRACKFLIYTYSNMTSIAKVINDGNILMSPTYRVALSLAMMITLLRDIKTVEVENYGQIIYAGGDDVVALVP
IDRLIDTLIGLERNFVGENGFFKVRQWYIPTFYPHGRSFSVRIANIADFMTNEIQMATELLNRVKKVKWEFPNGEEKRSK
FSAILSTSRTSYESVLPMWDFKYLILLKKMWLLNLSNKLSSSVFEDYESAFKEFITSERKLTKRLINYVLLKNNGKELVE
DFNKLDFLSLNKKSNVYNEIFKAFRIMRGVI

Specific function: Unknown

COG id: COG1353

COG function: function code R; Predicted hydrolase of the HD superfamily (permuted catalytic motifs)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 116432; Mature: 116432

Theoretical pI: Translated: 9.13; Mature: 9.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRRVGSKNCSRGGENRKVLLYYLLINKLLKYKELRRFFENFYSIYKKSGSRAKARKKVSA
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
ADVLASEYNRWVLNYLYSTSQRKRSFKYFKSSYIFRYFRFHNIFNPEYSVDTGYDIDYNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
MGRFMEKFREIIDKFIEKQTGNTLDKTKIFKLIKSVYFLIYTIYEPLWIYFGLPVEVEDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
RSPFYTIFDHLYASASMINWVYYDDRSDPKGKKGKKTQQDTYSKNAPNPKGFYVVIDIPG
CCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCC
VQEIINSARKASDYWAGSWMLSMIIWLTVWQLIKEYGPDVLLAPTTRFNPIYYAMTLNYL
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEHHHHHH
EKEFGMDDGLKKEIEEILNTILGKLSGIYDYTQFLKEAIIPATASLILPKEQNTCSIKLE
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEECCCCCCEEEEEH
QEIFEYYKNAYNCIVKEIPTGNVQSDICKEFVEAFNIIYQSNSTLDNLMNVIINEAEKYA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHEEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEKYKREILPKPNWFTSFNKEFDYINGGKNWEYCTVCGNEPAIINFGKENDDYSASTKCE
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHH
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HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
SYYKNVIQPRIKDLDECEKLKNFLNAEELDVYETFGNPVIARRLFSKCTEVEDKKLPCIQ
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
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HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCC
EKESKNPKNRACKFLIYTYSNMTSIAKVINDGNILMSPTYRVALSLAMMITLLRDIKTVE
HHHCCCCHHHCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
VENYGQIIYAGGDDVVALVPIDRLIDTLIGLERNFVGENGFFKVRQWYIPTFYPHGRSFS
ECCCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCEE
VRIANIADFMTNEIQMATELLNRVKKVKWEFPNGEEKRSKFSAILSTSRTSYESVLPMWD
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHH
FKYLILLKKMWLLNLSNKLSSSVFEDYESAFKEFITSERKLTKRLINYVLLKNNGKELVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
DFNKLDFLSLNKKSNVYNEIFKAFRIMRGVI
HHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MRRVGSKNCSRGGENRKVLLYYLLINKLLKYKELRRFFENFYSIYKKSGSRAKARKKVSA
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
ADVLASEYNRWVLNYLYSTSQRKRSFKYFKSSYIFRYFRFHNIFNPEYSVDTGYDIDYNK
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MGRFMEKFREIIDKFIEKQTGNTLDKTKIFKLIKSVYFLIYTIYEPLWIYFGLPVEVEDS
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QEIFEYYKNAYNCIVKEIPTGNVQSDICKEFVEAFNIIYQSNSTLDNLMNVIINEAEKYA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DKILIRPAIYIVDIDDIRDEVESDLRNKNVNAILNNKQFNQLVPQYIFHYISTKLFREKV
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VENYGQIIYAGGDDVVALVPIDRLIDTLIGLERNFVGENGFFKVRQWYIPTFYPHGRSFS
ECCCCEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCEE
VRIANIADFMTNEIQMATELLNRVKKVKWEFPNGEEKRSKFSAILSTSRTSYESVLPMWD
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHH
FKYLILLKKMWLLNLSNKLSSSVFEDYESAFKEFITSERKLTKRLINYVLLKNNGKELVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
DFNKLDFLSLNKKSNVYNEIFKAFRIMRGVI
HHHHCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA