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The map label for this gene is norB-1 [H]

Identifier: 15898389

GI number: 15898389

Start: 1417062

End: 1418666

Strand: Reverse

Name: norB-1 [H]

Synonym: SSO1571

Alternate gene names: 15898389

Gene position: 1418666-1417062 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15898391

Following gene: 15898383

Centisome position: 47.41

GC content: 40.19

Gene sequence:

>1605_bases
ATGATTTCTCTCCTAGGCTATACTAATGGTTTTCCCTACATACCTCAACAAACTCAACCATCCGTAAACGTTAGTCTATC
AACGTGGATAATGGTAATCGTCCTTTTAGCGGTCTTAGTTTCAATGGTGAGCTACGTTAGTCTAAAAATACTTGACCATT
GGAGAGATCCTAGAATATCTGTCCCCCTTCCTCCACCATCTGCATCACAAAGGATAGGTTTAATAGGAGTATTCTTCGCC
TCAGTCCTCGCGGGTATACAAGGTTTGTTAGGATATTTGGCTATGCATTATTACGTAGACCCAGAGGGAATATTAGGTTT
AATAAACTTCCTACCTTTTAACATTACTAGGGCCTTACACTTAAACATGGCAGTGGTGTGGATAGCACTTACATGGATTG
CCTTTTCAATCTTTGCGTTACCATATCTGGGTGTTCCCTTATCCAGAAAGCTCTCATTTGCAATTTTAGGCTTAACGCTA
TTTGCCGGAGTAGGTCTGCTTCTAGGAATATTGCTCTCCTATAATGAATTGATCCCATCACCCTATTGGTTCATTTTCGG
TGCTCAAGGAAGGCCAAATGACGCTGATCAAGGTACCTTCTGGTTGCTCCTAGTTGCGCTAATACTCCTTCTAGCCTCTT
CATTATTCTTCAAAGCTTCAAAGTCAACCGCGGAACCTTTAAGACCATTAACGAGAATTACTGCAATAGGTCTCTTGGGA
TCTGGAATAGGTGCAATCTTCGGATCATTACCAATAATTGCTCCATGGCCTAACTTCACCGAAGACCAGTTCTTCTTATG
GATTATGATACACTCGTTCGTTGAGGGATTCTGGCCCTCTATAGTAATACCAGTAGTATTAATACTTTTAGTTGTCAACA
ATTTAGTACCACCAAGTCTAGCTACGATGGCAGCGAGTATAGATTCCGCTAGCGAAATACTTTCAGGTATGATAGGTACT
GCGCATCACTATTATTTTGGAGGTGAACCAGTATTCTGGATGTATTTGGGAGCATCAGCAGCCATATTAGAGGTTGTCCC
TATTCTTTTCTTAACTTATTACGCATTTTTGCTGTGGAGAAGAGGTGAAGCTAAGACCGAATTTCAAAAGACGTTAGTAG
CTACAACTTTAATTTCAGCCATTGGAGGGGGATTTGTAGGTGCGATTATCGGCGGAGCTTCAATATTGAACGCTCCAATA
ATAAACTATTATGTCCATGGGTTACAATTTACCATGGCCCATGCGCATCTTGCGTTCCCATTAGTGTGGGGTTTAACTGC
TATTCTAATGTGGATTGCAGCATTATATCTCTCCAATGGGATTAAAGAAAACGAGCTAAAGACGTTAAGAATTATGATAT
TAATTTACGCTATCGGTTTCATACTTCAAGGAATAGACTTATGGGCCTTGGGCGCGGTTCAATTAGCTACAGTTTTAAGG
GTAGGTTATTGGGCGGCTAAAGGTACACTATTCTATCTACAACCTATTCTAAATTTGATAGTTTGGCTTAGAATAGTTGG
CGATATAGTCGCAGGTTTCGCTGCTACTGTAATTATAATTTACACGCTCAAGGGTGTAATTAAATCTTACAAGATCAAAA
TATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATAAGCCGATTTTTCTAACTCCGCTCTGATATTTTTCTCTTCCATAGAAATTGTATCATTTTGAGTAAAATTGGTGAA
ACACCACTGCATGGGGTGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGATAAATTACTTCTTTTTTAAACTCTTTTAATCCATATTTTGAGTTATTACCTTCCGTAAGGTAATTCCCAGTTAAGT
TAAATCGGGTGATTCAGATA

Product: nitric oxide reductase, subunit I (cytochrome B) (norB-1)

Products: NA

Alternate protein names: NOR large subunit; Nitric oxide reductase cytochrome b subunit [H]

Number of amino acids: Translated: 534; Mature: 534

Protein sequence:

>534_residues
MISLLGYTNGFPYIPQQTQPSVNVSLSTWIMVIVLLAVLVSMVSYVSLKILDHWRDPRISVPLPPPSASQRIGLIGVFFA
SVLAGIQGLLGYLAMHYYVDPEGILGLINFLPFNITRALHLNMAVVWIALTWIAFSIFALPYLGVPLSRKLSFAILGLTL
FAGVGLLLGILLSYNELIPSPYWFIFGAQGRPNDADQGTFWLLLVALILLLASSLFFKASKSTAEPLRPLTRITAIGLLG
SGIGAIFGSLPIIAPWPNFTEDQFFLWIMIHSFVEGFWPSIVIPVVLILLVVNNLVPPSLATMAASIDSASEILSGMIGT
AHHYYFGGEPVFWMYLGASAAILEVVPILFLTYYAFLLWRRGEAKTEFQKTLVATTLISAIGGGFVGAIIGGASILNAPI
INYYVHGLQFTMAHAHLAFPLVWGLTAILMWIAALYLSNGIKENELKTLRIMILIYAIGFILQGIDLWALGAVQLATVLR
VGYWAAKGTLFYLQPILNLIVWLRIVGDIVAGFAATVIIIYTLKGVIKSYKIKI

Sequences:

>Translated_534_residues
MISLLGYTNGFPYIPQQTQPSVNVSLSTWIMVIVLLAVLVSMVSYVSLKILDHWRDPRISVPLPPPSASQRIGLIGVFFA
SVLAGIQGLLGYLAMHYYVDPEGILGLINFLPFNITRALHLNMAVVWIALTWIAFSIFALPYLGVPLSRKLSFAILGLTL
FAGVGLLLGILLSYNELIPSPYWFIFGAQGRPNDADQGTFWLLLVALILLLASSLFFKASKSTAEPLRPLTRITAIGLLG
SGIGAIFGSLPIIAPWPNFTEDQFFLWIMIHSFVEGFWPSIVIPVVLILLVVNNLVPPSLATMAASIDSASEILSGMIGT
AHHYYFGGEPVFWMYLGASAAILEVVPILFLTYYAFLLWRRGEAKTEFQKTLVATTLISAIGGGFVGAIIGGASILNAPI
INYYVHGLQFTMAHAHLAFPLVWGLTAILMWIAALYLSNGIKENELKTLRIMILIYAIGFILQGIDLWALGAVQLATVLR
VGYWAAKGTLFYLQPILNLIVWLRIVGDIVAGFAATVIIIYTLKGVIKSYKIKI
>Mature_534_residues
MISLLGYTNGFPYIPQQTQPSVNVSLSTWIMVIVLLAVLVSMVSYVSLKILDHWRDPRISVPLPPPSASQRIGLIGVFFA
SVLAGIQGLLGYLAMHYYVDPEGILGLINFLPFNITRALHLNMAVVWIALTWIAFSIFALPYLGVPLSRKLSFAILGLTL
FAGVGLLLGILLSYNELIPSPYWFIFGAQGRPNDADQGTFWLLLVALILLLASSLFFKASKSTAEPLRPLTRITAIGLLG
SGIGAIFGSLPIIAPWPNFTEDQFFLWIMIHSFVEGFWPSIVIPVVLILLVVNNLVPPSLATMAASIDSASEILSGMIGT
AHHYYFGGEPVFWMYLGASAAILEVVPILFLTYYAFLLWRRGEAKTEFQKTLVATTLISAIGGGFVGAIIGGASILNAPI
INYYVHGLQFTMAHAHLAFPLVWGLTAILMWIAALYLSNGIKENELKTLRIMILIYAIGFILQGIDLWALGAVQLATVLR
VGYWAAKGTLFYLQPILNLIVWLRIVGDIVAGFAATVIIIYTLKGVIKSYKIKI

Specific function: Component of the anaerobic respiratory chain that transforms nitrate to dinitrogen (denitrification). NorB is the catalytic subunit of the enzyme complex. Shows proton pump activity across the membrane in denitrifying bacterial cells. The mononitrogen red

COG id: COG3256

COG function: function code P; Nitric oxide reductase large subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: =1.7.99.7 [H]

Molecular weight: Translated: 58447; Mature: 58447

Theoretical pI: Translated: 9.40; Mature: 9.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MISLLGYTNGFPYIPQQTQPSVNVSLSTWIMVIVLLAVLVSMVSYVSLKILDHWRDPRIS
CEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
VPLPPPSASQRIGLIGVFFASVLAGIQGLLGYLAMHYYVDPEGILGLINFLPFNITRALH
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNMAVVWIALTWIAFSIFALPYLGVPLSRKLSFAILGLTLFAGVGLLLGILLSYNELIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PYWFIFGAQGRPNDADQGTFWLLLVALILLLASSLFFKASKSTAEPLRPLTRITAIGLLG
CEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIGAIFGSLPIIAPWPNFTEDQFFLWIMIHSFVEGFWPSIVIPVVLILLVVNNLVPPSL
HHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ATMAASIDSASEILSGMIGTAHHYYFGGEPVFWMYLGASAAILEVVPILFLTYYAFLLWR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RGEAKTEFQKTLVATTLISAIGGGFVGAIIGGASILNAPIINYYVHGLQFTMAHAHLAFP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVWGLTAILMWIAALYLSNGIKENELKTLRIMILIYAIGFILQGIDLWALGAVQLATVLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
VGYWAAKGTLFYLQPILNLIVWLRIVGDIVAGFAATVIIIYTLKGVIKSYKIKI
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MISLLGYTNGFPYIPQQTQPSVNVSLSTWIMVIVLLAVLVSMVSYVSLKILDHWRDPRIS
CEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
VPLPPPSASQRIGLIGVFFASVLAGIQGLLGYLAMHYYVDPEGILGLINFLPFNITRALH
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNMAVVWIALTWIAFSIFALPYLGVPLSRKLSFAILGLTLFAGVGLLLGILLSYNELIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PYWFIFGAQGRPNDADQGTFWLLLVALILLLASSLFFKASKSTAEPLRPLTRITAIGLLG
CEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIGAIFGSLPIIAPWPNFTEDQFFLWIMIHSFVEGFWPSIVIPVVLILLVVNNLVPPSL
HHHHHHHCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ATMAASIDSASEILSGMIGTAHHYYFGGEPVFWMYLGASAAILEVVPILFLTYYAFLLWR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RGEAKTEFQKTLVATTLISAIGGGFVGAIIGGASILNAPIINYYVHGLQFTMAHAHLAFP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVWGLTAILMWIAALYLSNGIKENELKTLRIMILIYAIGFILQGIDLWALGAVQLATVLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
VGYWAAKGTLFYLQPILNLIVWLRIVGDIVAGFAATVIIIYTLKGVIKSYKIKI
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7711073; 10984043 [H]