Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15898218

Identifier: 15898218

GI number: 15898218

Start: 1216914

End: 1219409

Strand: Direct

Name: 15898218

Synonym: SSO1379

Alternate gene names: NA

Gene position: 1216914-1219409 (Clockwise)

Preceding gene: 15898217

Following gene: 15898219

Centisome position: 40.67

GC content: 31.29

Gene sequence:

>2496_bases
TTGTCCTCCTCATTCGATCCTGAGAGATCCCTACTAGATTTTTTCAAATCCAATAACAGCGAGCAAACGTTCTATATTTT
GAAGGGACTTTATGAAATATATAAAAGTAAAGGTTATACTGAGTTCCTTAAGGATATTACTGGTCTAATTAATTTAGTAG
CGAAATATGAGACTATGCTATCCATAAGTTCTAACACTAAAGGTAATTTAAAGAAAATAAAGGATATGTTGGAGAGGTTA
AATATAGACGTGAAAGAACTGGAGAGATTATCAAAAAGTATTGCCTCTGACCTCATTAATAACATAAACGATGTTTGTAT
TTCAATTCAAGGTTACTATAATGATAAGAAACTACCCATGGTTTTCAAATATAGCTGCCATGAAATGTTACCAGATCCTT
ATAATGCTGACCATAACTACCCCGCTAGGTTAAAGTATTTCTTGACAACAGTTCTTAGAATGAGGAATTCTTACGAATCA
ACAGTTAGATTCTCTACAGATTTAATAGATTACTATTCTAAAAAATTGGGATATGATATATCAAATATAAAGGACTTTTC
CGAGAAATTAAGATTCGTAACTAACTCCCTTCTGGATCCTTCTTTCATATCAACCCTTCAAGGAATTACTAAAGTTCTGA
TGGATTCAACCGAGTATTTATGTGTAATATCTTATTACTTAACACCTCAAAAAATTAGAGGCAAGAAACCCTCAACAATT
ATAGAATACGAGCCATTAATAGATAATATTATTAAATACTCATCATACTTCCTAAGATTTATTTTCGAAAAAACTGACAG
ATTTCTAAATTTTATTCCATCAGCTGGCCTAAACTTAACTGAATTAAGGAATATAGCCAATCAAATGCTCGAAATACTCT
CTAAAATTAACCTAAATGTTTTAGAATCTTATCTTACAAATCAAGGAGAGTTGAAACTATCTCAAATTTATACTGGAGAC
CTACTATTCTTTACCTTCTTTAATTTAGCTGATGCATTAAATATTTATGATGATTACATATATAAAATCAGAAACGCAGT
ACTTTCCGTACCTTTAGAAAATAGGATCGCAATAACTAGAAGTATTCTCGGATTAAAAGATGTTGAGGATATTAATATGA
GCTGTAGAGATGTACATAATTTTATTCTAAATATGAATGAAATCTCAAATGAAATTTATTCTGGTGGAAATATTGCAGAA
TTAATAGATAGTCTGCGAAAGTACGTTTTCATAAGGGATTCTATAAATTATGCTTTTAAAGATGTAGCACTATTAATGCA
GAACGTACTATACTCTAAAGAAATCACGTATTTAAGTATGTCCCTTCACGTAGAAAACTACATACATAATACCTCAGCCA
TAGAATTACTTGATAGAATTAGAATAGATTATAATGATTATAACCGATTAATTAATAATTTACATGAGTTTAGGGACTGG
ATTAACGTACTCAAAAAGCTCGATTTAGATCAAAAGTTGTCTGAATCTCTAGTCAAGGTAGTGAGCGGGGATCCTCCAAC
TAATAGTAAAATGAGTTTGGATGAAGTAATAGGAAAGATAATTAAGAGAGAACAAGCTAACGTTGAGGAAGTTAAAGGAA
CTGGAATATACGAATTTAGAACAGACAATAGGGTAATAAGAGCCATGCCCGTTATATACGATATGTGGAAGGAAATAGGA
GATGACGGGATAGAATATTCCCATTTAGTAAATTGGTTAAGTAAGAGATTAGATATTGATGATGATAGAAAAGTTAATGA
GATAGCAATAAAATACTTAAATGCGTCATATTATGCAGGGTTAATAAAACTTGAAGAAAAACCGACAACTAAGCCTCCAG
ATACTGAACAAACTCGTAAAAGAGAAATCACGATTAACGCAATAGGTATCCCTACTGGAGCAAGATGGAAATTCATACTC
GCACGGGAAAATAAATATCTTAATTTCGATACAAACGAAAGTTCGATAAGGATTAAAGCGCAAGAAAAAGATAATCTAAC
TTTCTATGATGTTACGATAGGCAATGTTATATATGTACCCTATCCTAGGACGTATACCATTAGATCTAGTGATTTATCAA
AAGGCGTGTTAGACGTAAAATATAATGTATCTTCCCCTCAATCAAGTCAAAGGACTGGAAAAACTAATGTGCAAACTAAT
GTAAAGATTTCCAAACCCAAGGGAACTGCAACCGCAGGTGTTATATTATCAATAGTATATATTATCGAACTAATAGTAAT
TGCAAGTGGATTCCAATACTCTAACATTCTATTTGAAGCATTAACAGTAATGGACATATTCTTTCAGTTAGCAATAATGG
GATTACTAGTATCCGCTGTAACTAACCCCTATAACTCCCATAAAAAAGGTTCATATATTATCATAATATCGATAATAATG
TTCTTCTTTTCAATCCCCATAATAGAATATGTGATATTCTTCATTATATTTGATATTGCAGTTGGAATTTCATTAGCAAG
ATTTAAACGTAGGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACCCTTATAAATCACACTGATACGTTAATTACTAAATCAGAGAGTTTAAGTGAAGATCTCAATAAATTCGTGGAATCCA
TAACCTTAGAGTGAACTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGTATGGAAAAGAAAAACTCAATAAATATATCATTATTAGAAAATTTAGCAAATTTTTTCTCCATAGGGGAAATAGAA
AAGGGAGAACTAAGAGCAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 830

Protein sequence:

>831_residues
MSSSFDPERSLLDFFKSNNSEQTFYILKGLYEIYKSKGYTEFLKDITGLINLVAKYETMLSISSNTKGNLKKIKDMLERL
NIDVKELERLSKSIASDLINNINDVCISIQGYYNDKKLPMVFKYSCHEMLPDPYNADHNYPARLKYFLTTVLRMRNSYES
TVRFSTDLIDYYSKKLGYDISNIKDFSEKLRFVTNSLLDPSFISTLQGITKVLMDSTEYLCVISYYLTPQKIRGKKPSTI
IEYEPLIDNIIKYSSYFLRFIFEKTDRFLNFIPSAGLNLTELRNIANQMLEILSKINLNVLESYLTNQGELKLSQIYTGD
LLFFTFFNLADALNIYDDYIYKIRNAVLSVPLENRIAITRSILGLKDVEDINMSCRDVHNFILNMNEISNEIYSGGNIAE
LIDSLRKYVFIRDSINYAFKDVALLMQNVLYSKEITYLSMSLHVENYIHNTSAIELLDRIRIDYNDYNRLINNLHEFRDW
INVLKKLDLDQKLSESLVKVVSGDPPTNSKMSLDEVIGKIIKREQANVEEVKGTGIYEFRTDNRVIRAMPVIYDMWKEIG
DDGIEYSHLVNWLSKRLDIDDDRKVNEIAIKYLNASYYAGLIKLEEKPTTKPPDTEQTRKREITINAIGIPTGARWKFIL
ARENKYLNFDTNESSIRIKAQEKDNLTFYDVTIGNVIYVPYPRTYTIRSSDLSKGVLDVKYNVSSPQSSQRTGKTNVQTN
VKISKPKGTATAGVILSIVYIIELIVIASGFQYSNILFEALTVMDIFFQLAIMGLLVSAVTNPYNSHKKGSYIIIISIIM
FFFSIPIIEYVIFFIIFDIAVGISLARFKRR

Sequences:

>Translated_831_residues
MSSSFDPERSLLDFFKSNNSEQTFYILKGLYEIYKSKGYTEFLKDITGLINLVAKYETMLSISSNTKGNLKKIKDMLERL
NIDVKELERLSKSIASDLINNINDVCISIQGYYNDKKLPMVFKYSCHEMLPDPYNADHNYPARLKYFLTTVLRMRNSYES
TVRFSTDLIDYYSKKLGYDISNIKDFSEKLRFVTNSLLDPSFISTLQGITKVLMDSTEYLCVISYYLTPQKIRGKKPSTI
IEYEPLIDNIIKYSSYFLRFIFEKTDRFLNFIPSAGLNLTELRNIANQMLEILSKINLNVLESYLTNQGELKLSQIYTGD
LLFFTFFNLADALNIYDDYIYKIRNAVLSVPLENRIAITRSILGLKDVEDINMSCRDVHNFILNMNEISNEIYSGGNIAE
LIDSLRKYVFIRDSINYAFKDVALLMQNVLYSKEITYLSMSLHVENYIHNTSAIELLDRIRIDYNDYNRLINNLHEFRDW
INVLKKLDLDQKLSESLVKVVSGDPPTNSKMSLDEVIGKIIKREQANVEEVKGTGIYEFRTDNRVIRAMPVIYDMWKEIG
DDGIEYSHLVNWLSKRLDIDDDRKVNEIAIKYLNASYYAGLIKLEEKPTTKPPDTEQTRKREITINAIGIPTGARWKFIL
ARENKYLNFDTNESSIRIKAQEKDNLTFYDVTIGNVIYVPYPRTYTIRSSDLSKGVLDVKYNVSSPQSSQRTGKTNVQTN
VKISKPKGTATAGVILSIVYIIELIVIASGFQYSNILFEALTVMDIFFQLAIMGLLVSAVTNPYNSHKKGSYIIIISIIM
FFFSIPIIEYVIFFIIFDIAVGISLARFKRR
>Mature_830_residues
SSSFDPERSLLDFFKSNNSEQTFYILKGLYEIYKSKGYTEFLKDITGLINLVAKYETMLSISSNTKGNLKKIKDMLERLN
IDVKELERLSKSIASDLINNINDVCISIQGYYNDKKLPMVFKYSCHEMLPDPYNADHNYPARLKYFLTTVLRMRNSYEST
VRFSTDLIDYYSKKLGYDISNIKDFSEKLRFVTNSLLDPSFISTLQGITKVLMDSTEYLCVISYYLTPQKIRGKKPSTII
EYEPLIDNIIKYSSYFLRFIFEKTDRFLNFIPSAGLNLTELRNIANQMLEILSKINLNVLESYLTNQGELKLSQIYTGDL
LFFTFFNLADALNIYDDYIYKIRNAVLSVPLENRIAITRSILGLKDVEDINMSCRDVHNFILNMNEISNEIYSGGNIAEL
IDSLRKYVFIRDSINYAFKDVALLMQNVLYSKEITYLSMSLHVENYIHNTSAIELLDRIRIDYNDYNRLINNLHEFRDWI
NVLKKLDLDQKLSESLVKVVSGDPPTNSKMSLDEVIGKIIKREQANVEEVKGTGIYEFRTDNRVIRAMPVIYDMWKEIGD
DGIEYSHLVNWLSKRLDIDDDRKVNEIAIKYLNASYYAGLIKLEEKPTTKPPDTEQTRKREITINAIGIPTGARWKFILA
RENKYLNFDTNESSIRIKAQEKDNLTFYDVTIGNVIYVPYPRTYTIRSSDLSKGVLDVKYNVSSPQSSQRTGKTNVQTNV
KISKPKGTATAGVILSIVYIIELIVIASGFQYSNILFEALTVMDIFFQLAIMGLLVSAVTNPYNSHKKGSYIIIISIIMF
FFSIPIIEYVIFFIIFDIAVGISLARFKRR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95973; Mature: 95842

Theoretical pI: Translated: 8.15; Mature: 8.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSSFDPERSLLDFFKSNNSEQTFYILKGLYEIYKSKGYTEFLKDITGLINLVAKYETML
CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SISSNTKGNLKKIKDMLERLNIDVKELERLSKSIASDLINNINDVCISIQGYYNDKKLPM
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEEEECCCCCCE
VFKYSCHEMLPDPYNADHNYPARLKYFLTTVLRMRNSYESTVRFSTDLIDYYSKKLGYDI
EEECCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SNIKDFSEKLRFVTNSLLDPSFISTLQGITKVLMDSTEYLCVISYYLTPQKIRGKKPSTI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCCEE
IEYEPLIDNIIKYSSYFLRFIFEKTDRFLNFIPSAGLNLTELRNIANQMLEILSKINLNV
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
LESYLTNQGELKLSQIYTGDLLFFTFFNLADALNIYDDYIYKIRNAVLSVPLENRIAITR
HHHHHCCCCCEEEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
SILGLKDVEDINMSCRDVHNFILNMNEISNEIYSGGNIAELIDSLRKYVFIRDSINYAFK
HHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHH
DVALLMQNVLYSKEITYLSMSLHVENYIHNTSAIELLDRIRIDYNDYNRLINNLHEFRDW
HHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
INVLKKLDLDQKLSESLVKVVSGDPPTNSKMSLDEVIGKIIKREQANVEEVKGTGIYEFR
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEE
TDNRVIRAMPVIYDMWKEIGDDGIEYSHLVNWLSKRLDIDDDRKVNEIAIKYLNASYYAG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHEE
LIKLEEKPTTKPPDTEQTRKREITINAIGIPTGARWKFILARENKYLNFDTNESSIRIKA
EEEECCCCCCCCCCCHHHHCEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEE
QEKDNLTFYDVTIGNVIYVPYPRTYTIRSSDLSKGVLDVKYNVSSPQSSQRTGKTNVQTN
ECCCCEEEEEEEECCEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEE
VKISKPKGTATAGVILSIVYIIELIVIASGFQYSNILFEALTVMDIFFQLAIMGLLVSAV
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNPYNSHKKGSYIIIISIIMFFFSIPIIEYVIFFIIFDIAVGISLARFKRR
CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SSSFDPERSLLDFFKSNNSEQTFYILKGLYEIYKSKGYTEFLKDITGLINLVAKYETML
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SISSNTKGNLKKIKDMLERLNIDVKELERLSKSIASDLINNINDVCISIQGYYNDKKLPM
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEEEEEEECCCCCCE
VFKYSCHEMLPDPYNADHNYPARLKYFLTTVLRMRNSYESTVRFSTDLIDYYSKKLGYDI
EEECCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SNIKDFSEKLRFVTNSLLDPSFISTLQGITKVLMDSTEYLCVISYYLTPQKIRGKKPSTI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHCCCCCCEE
IEYEPLIDNIIKYSSYFLRFIFEKTDRFLNFIPSAGLNLTELRNIANQMLEILSKINLNV
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
LESYLTNQGELKLSQIYTGDLLFFTFFNLADALNIYDDYIYKIRNAVLSVPLENRIAITR
HHHHHCCCCCEEEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
SILGLKDVEDINMSCRDVHNFILNMNEISNEIYSGGNIAELIDSLRKYVFIRDSINYAFK
HHHCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHH
DVALLMQNVLYSKEITYLSMSLHVENYIHNTSAIELLDRIRIDYNDYNRLINNLHEFRDW
HHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
INVLKKLDLDQKLSESLVKVVSGDPPTNSKMSLDEVIGKIIKREQANVEEVKGTGIYEFR
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEEE
TDNRVIRAMPVIYDMWKEIGDDGIEYSHLVNWLSKRLDIDDDRKVNEIAIKYLNASYYAG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHEE
LIKLEEKPTTKPPDTEQTRKREITINAIGIPTGARWKFILARENKYLNFDTNESSIRIKA
EEEECCCCCCCCCCCHHHHCEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCEEEECCCCCEEEEEE
QEKDNLTFYDVTIGNVIYVPYPRTYTIRSSDLSKGVLDVKYNVSSPQSSQRTGKTNVQTN
ECCCCEEEEEEEECCEEEECCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEE
VKISKPKGTATAGVILSIVYIIELIVIASGFQYSNILFEALTVMDIFFQLAIMGLLVSAV
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNPYNSHKKGSYIIIISIIMFFFSIPIIEYVIFFIIFDIAVGISLARFKRR
CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA