Definition Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome.
Accession NC_002754
Length 2,992,245

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The map label for this gene is 15897736

Identifier: 15897736

GI number: 15897736

Start: 717064

End: 718473

Strand: Direct

Name: 15897736

Synonym: SSO0837

Alternate gene names: NA

Gene position: 717064-718473 (Clockwise)

Preceding gene: 15897734

Following gene: 15897737

Centisome position: 23.96

GC content: 37.94

Gene sequence:

>1410_bases
ATGAATCCTATAAAGAACGCGTTGAAGAGCCTCAGCGTAATCACCACTAATGTCCTAATCGCCTTAATCTTCTTCATAGT
CACTGCAAAAATTTCTAATCCAGCGTTCTTTGGGAAAGTTGCAATAATTCAACTTCTTGAAGTAGTTACTTTTACGTTCT
TTTACTTTATCCCGGGACAAATAATAACAAGGGAAATATCTTACCTTTACGCAAAGAAGGAGGTAAATAAAGGGGTTGTG
GGAAAGTTCCTCTCATTCCCTTTCCTCGCTATACCAGTTTTTCTAATCTTCCTACTTTTCCCAAATTACGTTAAGTTAGC
GATCCCTTATCTCTTTCTCTACCTTCTGAATAATGTCCTAGTTGCTATAATGATAGGGATGGACATGTTTACTGAGACAG
CAATAACTGGGAACCTTTTTCTAATCATAAGATGGGGGATTTCAATTATCGCCGTCCTCTCTCACAATATTTACTTATTC
GTAGAAATATGGATTTTGGGAGGAGTACTCTCAGTCCTCCTTAACTACTCTTTTCTGTCTAGAAAAGTGGGGCTAGTCTT
ACCTTCTCTAGACTTTGCATTTCTGTTTAAGCACTTCAAGGAAGGCTTACCTCTCTACTTGTCTTCTTCAGCTAATTTCC
TCTCATCGCAAGGGGACAGAGTTACAACAGCCTATTTGTTAGGCTCTTACTATCTAGGTTTATACCAATTTTCTGCATTA
GTAGCTGGGGTTCCTGCAATGGTTTTAGGGGCGTTGAACAACGTTCTTTTACCTACTGCCTCATTCTATAAGGCTTTAGG
TAGTGACGAAAAGAAGATGTCTTCAATTTCTTTTCGCGTATTGGCTTTAATCTCCTTTCTGTCAGTAATTATTTCAATAC
CTATTGCTATCCTGGTCGTGGAAAGGTTTTTCCCAGACTACACTGAGGGTATAAGAGTTTTGATCCTACTACTTTTAGCT
ACAACCCTACCTTTTCCTATAAACTCTCTAACGAACTTCATAATAGCTGCTAAGAAGTCTTTAAGGCCCTTTTTATTCCT
TTCGCTGCTTAATGCTGGTGTAGTCTTACTGACTTCCTTCCTTCTAATTCCAAGAATTGGAATAATGGGGGGAGCAATTT
CCCAAGTAATAGTCACCGTTATCTCCTCTTCTTTTATCCTTGTGTACGCTTTAAGGACTTCAACATTTATTTTGGGCAAA
AGGGAGGGCATATTACTGACTGCAATGCCTTTAATAGCTCTTTATGAAGTTTTCGTAGATCCTCCATATCTCGACCTCCT
TTTGCTTCTCTCGGTTATTGTTCTTTTTAAGTTATTTAAGATAATTTCTACTGAAGAGGTGAGATTAATAGAGTCTTTTT
TACCTTCTAAGCTAAAATTCATAGCCTCGCTATTAAAGGTAATTAGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATTGAAAAGTCTGAAATTAACTAATTTTCTCTGCTTATAATCTGACTATTAATCACTATCAAAAGCTTTAATATTTT
TTCTCAAAGAACTAAATTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGAGGGGAGAGAAAGTTAATAAGTAACTGATAGTCGATTAAGGTGAGAATTTTATGCAGCGAGTTTTTCCGTCCACAGC
CTGATAATATTTATTAAAAG

Product: polysaccharide biosynthesis related protein

Products: NA

Alternate protein names: Polysaccharide Biosynthesis Related Protein

Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 469

Protein sequence:

>469_residues
MNPIKNALKSLSVITTNVLIALIFFIVTAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTFTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEVNKGVV
GKFLSFPFLAIPVFLIFLLFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLVAIMIGMDMFTETAITGNLFLIIRWGISIIAVLSHNIYLF
VEIWILGGVLSVLLNYSFLSRKVGLVLPSLDFAFLFKHFKEGLPLYLSSSANFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGLYQFSAL
VAGVPAMVLGALNNVLLPTASFYKALGSDEKKMSSISFRVLALISFLSVIISIPIAILVVERFFPDYTEGIRVLILLLLA
TTLPFPINSLTNFIIAAKKSLRPFLFLSLLNAGVVLLTSFLLIPRIGIMGGAISQVIVTVISSSFILVYALRTSTFILGK
REGILLTAMPLIALYEVFVDPPYLDLLLLLSVIVLFKLFKIISTEEVRLIESFLPSKLKFIASLLKVIS

Sequences:

>Translated_469_residues
MNPIKNALKSLSVITTNVLIALIFFIVTAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTFTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEVNKGVV
GKFLSFPFLAIPVFLIFLLFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLVAIMIGMDMFTETAITGNLFLIIRWGISIIAVLSHNIYLF
VEIWILGGVLSVLLNYSFLSRKVGLVLPSLDFAFLFKHFKEGLPLYLSSSANFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGLYQFSAL
VAGVPAMVLGALNNVLLPTASFYKALGSDEKKMSSISFRVLALISFLSVIISIPIAILVVERFFPDYTEGIRVLILLLLA
TTLPFPINSLTNFIIAAKKSLRPFLFLSLLNAGVVLLTSFLLIPRIGIMGGAISQVIVTVISSSFILVYALRTSTFILGK
REGILLTAMPLIALYEVFVDPPYLDLLLLLSVIVLFKLFKIISTEEVRLIESFLPSKLKFIASLLKVIS
>Mature_469_residues
MNPIKNALKSLSVITTNVLIALIFFIVTAKISNPAFFGKVAIIQLLEVVTFTFFYFIPGQIITREISYLYAKKEVNKGVV
GKFLSFPFLAIPVFLIFLLFPNYVKLAIPYLFLYLLNNVLVAIMIGMDMFTETAITGNLFLIIRWGISIIAVLSHNIYLF
VEIWILGGVLSVLLNYSFLSRKVGLVLPSLDFAFLFKHFKEGLPLYLSSSANFLSSQGDRVTTAYLLGSYYLGLYQFSAL
VAGVPAMVLGALNNVLLPTASFYKALGSDEKKMSSISFRVLALISFLSVIISIPIAILVVERFFPDYTEGIRVLILLLLA
TTLPFPINSLTNFIIAAKKSLRPFLFLSLLNAGVVLLTSFLLIPRIGIMGGAISQVIVTVISSSFILVYALRTSTFILGK
REGILLTAMPLIALYEVFVDPPYLDLLLLLSVIVLFKLFKIISTEEVRLIESFLPSKLKFIASLLKVIS

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52050; Mature: 52050

Theoretical pI: Translated: 10.11; Mature: 10.11

Prosite motif: PS00092 N6_MTASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA