Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15897421

Identifier: 15897421

GI number: 15897421

Start: 427181

End: 429337

Strand: Direct

Name: 15897421

Synonym: SSO0496

Alternate gene names: NA

Gene position: 427181-429337 (Clockwise)

Preceding gene: 15897420

Following gene: 15897422

Centisome position: 14.28

GC content: 30.97

Gene sequence:

>2157_bases
ATGGATAAGCGTATAGCGACAATCATATTGAGTATAGTAAATATTATAGGTATATTTGAATTTCCATTATACGAATCGTT
CATAGGGTTCTTCTTTATTTCCTCCGCCTTGTCTATCCTTTATGAATCTCAACTGTCCTTGATTGTACCAACAGTTCTAT
TCGCATCATTAGTTTTATTACATATTATTACTATCCAATTACAAAAACTGATTATATTATCTATTCTGATGTTGATCTCG
ATTATTGGGAAAAATAATAAATGGATTTATTCAATTCTTATAACCCTTGCGCCGGGTTTAATTATAAATAATCTCTACCT
CTTATTAATTGTATTGGCATTACTGATTCCCCTATTAATAAAACTTGGAGGTGAACCAAGGGCTATAATCATTTCGGGTA
TTTTATATTTAATCTATTCCGGTATAATATTTCCAAATAATGAAGCACTAGCTAATCAGATTTCACAGATATCATACTTT
TATCTAATGTTTGGAATAATAGGGATAATTGTTGAAGACAAAAGAATTACTAGAATTACGTTAAGAAAAATTCTCCCATA
TTTGTCTTTCATTCCCGCATCTTTTGCATCAATAATGTTAGGATACCCAAGCGATTCTTCCTTTATTTATTGGTCAGCAA
GCTCATTTTATTTCTCCCACTTATACTTACCTTGGATATACGAAATAGGTTATAATTCAAATCAGCACTTAATAGCAAGT
TGGTTTTTGGCTTATCTTTTAACACTTATCATAAAGAACCCTTTGATAACAGCAGAAGTGTTTCTGGGAATTTTTACATT
CTTATCCGGTTTAATATCATATTATGTCTTTAAGAGGCTTAATTTGAAATATCCACTACTTTTCTCATTGCTATATCAGA
TTAATATATTTAATCCTATAATATCTCACTCAATTTCGGTTTTTTCATACGCATTTCTACCTTTAGTCCTATTCTTTGCA
TATAATAAGAATAAAGTACTCTATTCAATTCTAACGCTAACTGCAGCATCTTCTATCCCGATCTTCATATCTACTCTGGT
AATTCCATTAGTATACCGTAGGTATTACTTCCTATTATATGCTCTAGGTGTTAATGCGTTTTGGCTAATTCCCTTCTTAA
TCTTTGGTTACGATAAATTCACATTTAACGTATCTAACATAGAAATTCTCATCTCAATTATCTTAGTTTCAATATCTGTT
CTTTTATATCAACTGAGATTTAAAAATATCGAAATACTATATATGATTTTTATATCATTTGTTCTATTAATATTAGGAAT
AAATACTGGACCATTAATTCTTCTTGCTACTATTTTAACATTAGGAAGTTTAAGGGATATTAGTATCCTTTACCTGACCT
TGTTGAGTGGTCTAATTATTTTATCCGCTACTAGTTTTTCATACGGCGTAATTTCGGGTTATGCAAATACTACGTTTTAC
ACATACAATCTGCCTAATTTACCCAAACCCGGAGAGTATGGGTTTGGAATTACGACGTTAGTTAATGATCTTAATCTCAC
CGCTAGTGGAATGCCCACCGAATCAATATCCTACAACGTTAGGTACTTTATATATAACTCACGTGTTATTGAGAATCCCC
TATACTTTGGATTTCCAATTCCAGCGATACCTAACTACACTCCACAATTAACATTTTCATACATTTACTCAAATTCTTCA
GTTAAGGTAATTTACTCACCTTTTAATAAACCATTAGGCCTTATGGTTTACTCTAACGTGACACCATCAAAAATTTCAAT
AGTGTTTCCAACGCGGATTGAGAACATTAGTGGAATAAAAGGTTTAGTAAAGAACTATACAATTCAGATTATTACCAATA
CTTCCTTAACCATAATAGGAGGTAAAGTAACTGTAGATAATAAGTCAATCTTTTCATCCTACTATAAGCCTAAAATAGTA
ACAAGTATCATGATTGGTGAAATTACTGAAGTTATAGATTCAAATTATTCAATTTACCTTCCGATACATGAGAGCTTAAC
TATTAACGGAAAAGTAGTAAATCACCCAATAATTCTCCCTCCAGGTAAGTATACCATAGTGATTTCTGATGAAAAGATTG
AATATGTGAGCTATGCTTCAATATTCCTAACTATAGTATCTTTAGTGCTATTAATAAGAAGGGGGATGAAAGTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAGGCAATGAGATTGACAAGAGTATTAGGAATAATAGCAAATAAGGAGGTGATGATTAAGCTTAATAATAACATGCGA
AAATAATTATTGCGCTCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGCACTACTAGCATTCATCGTATTATTACTTTCCCTTTCTGCACTGATAACCTCATCTTTCTCGATAGTGATAATATCA
CCTAACATAGTAAAGATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718

Protein sequence:

>718_residues
MDKRIATIILSIVNIIGIFEFPLYESFIGFFFISSALSILYESQLSLIVPTVLFASLVLLHIITIQLQKLIILSILMLIS
IIGKNNKWIYSILITLAPGLIINNLYLLLIVLALLIPLLIKLGGEPRAIIISGILYLIYSGIIFPNNEALANQISQISYF
YLMFGIIGIIVEDKRITRITLRKILPYLSFIPASFASIMLGYPSDSSFIYWSASSFYFSHLYLPWIYEIGYNSNQHLIAS
WFLAYLLTLIIKNPLITAEVFLGIFTFLSGLISYYVFKRLNLKYPLLFSLLYQINIFNPIISHSISVFSYAFLPLVLFFA
YNKNKVLYSILTLTAASSIPIFISTLVIPLVYRRYYFLLYALGVNAFWLIPFLIFGYDKFTFNVSNIEILISIILVSISV
LLYQLRFKNIEILYMIFISFVLLILGINTGPLILLATILTLGSLRDISILYLTLLSGLIILSATSFSYGVISGYANTTFY
TYNLPNLPKPGEYGFGITTLVNDLNLTASGMPTESISYNVRYFIYNSRVIENPLYFGFPIPAIPNYTPQLTFSYIYSNSS
VKVIYSPFNKPLGLMVYSNVTPSKISIVFPTRIENISGIKGLVKNYTIQIITNTSLTIIGGKVTVDNKSIFSSYYKPKIV
TSIMIGEITEVIDSNYSIYLPIHESLTINGKVVNHPIILPPGKYTIVISDEKIEYVSYASIFLTIVSLVLLIRRGMKV

Sequences:

>Translated_718_residues
MDKRIATIILSIVNIIGIFEFPLYESFIGFFFISSALSILYESQLSLIVPTVLFASLVLLHIITIQLQKLIILSILMLIS
IIGKNNKWIYSILITLAPGLIINNLYLLLIVLALLIPLLIKLGGEPRAIIISGILYLIYSGIIFPNNEALANQISQISYF
YLMFGIIGIIVEDKRITRITLRKILPYLSFIPASFASIMLGYPSDSSFIYWSASSFYFSHLYLPWIYEIGYNSNQHLIAS
WFLAYLLTLIIKNPLITAEVFLGIFTFLSGLISYYVFKRLNLKYPLLFSLLYQINIFNPIISHSISVFSYAFLPLVLFFA
YNKNKVLYSILTLTAASSIPIFISTLVIPLVYRRYYFLLYALGVNAFWLIPFLIFGYDKFTFNVSNIEILISIILVSISV
LLYQLRFKNIEILYMIFISFVLLILGINTGPLILLATILTLGSLRDISILYLTLLSGLIILSATSFSYGVISGYANTTFY
TYNLPNLPKPGEYGFGITTLVNDLNLTASGMPTESISYNVRYFIYNSRVIENPLYFGFPIPAIPNYTPQLTFSYIYSNSS
VKVIYSPFNKPLGLMVYSNVTPSKISIVFPTRIENISGIKGLVKNYTIQIITNTSLTIIGGKVTVDNKSIFSSYYKPKIV
TSIMIGEITEVIDSNYSIYLPIHESLTINGKVVNHPIILPPGKYTIVISDEKIEYVSYASIFLTIVSLVLLIRRGMKV
>Mature_718_residues
MDKRIATIILSIVNIIGIFEFPLYESFIGFFFISSALSILYESQLSLIVPTVLFASLVLLHIITIQLQKLIILSILMLIS
IIGKNNKWIYSILITLAPGLIINNLYLLLIVLALLIPLLIKLGGEPRAIIISGILYLIYSGIIFPNNEALANQISQISYF
YLMFGIIGIIVEDKRITRITLRKILPYLSFIPASFASIMLGYPSDSSFIYWSASSFYFSHLYLPWIYEIGYNSNQHLIAS
WFLAYLLTLIIKNPLITAEVFLGIFTFLSGLISYYVFKRLNLKYPLLFSLLYQINIFNPIISHSISVFSYAFLPLVLFFA
YNKNKVLYSILTLTAASSIPIFISTLVIPLVYRRYYFLLYALGVNAFWLIPFLIFGYDKFTFNVSNIEILISIILVSISV
LLYQLRFKNIEILYMIFISFVLLILGINTGPLILLATILTLGSLRDISILYLTLLSGLIILSATSFSYGVISGYANTTFY
TYNLPNLPKPGEYGFGITTLVNDLNLTASGMPTESISYNVRYFIYNSRVIENPLYFGFPIPAIPNYTPQLTFSYIYSNSS
VKVIYSPFNKPLGLMVYSNVTPSKISIVFPTRIENISGIKGLVKNYTIQIITNTSLTIIGGKVTVDNKSIFSSYYKPKIV
TSIMIGEITEVIDSNYSIYLPIHESLTINGKVVNHPIILPPGKYTIVISDEKIEYVSYASIFLTIVSLVLLIRRGMKV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81098; Mature: 81098

Theoretical pI: Translated: 9.59; Mature: 9.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKRIATIILSIVNIIGIFEFPLYESFIGFFFISSALSILYESQLSLIVPTVLFASLVLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIITIQLQKLIILSILMLISIIGKNNKWIYSILITLAPGLIINNLYLLLIVLALLIPLLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLGGEPRAIIISGILYLIYSGIIFPNNEALANQISQISYFYLMFGIIGIIVEDKRITRIT
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHH
LRKILPYLSFIPASFASIMLGYPSDSSFIYWSASSFYFSHLYLPWIYEIGYNSNQHLIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHH
WFLAYLLTLIIKNPLITAEVFLGIFTFLSGLISYYVFKRLNLKYPLLFSLLYQINIFNPI
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
ISHSISVFSYAFLPLVLFFAYNKNKVLYSILTLTAASSIPIFISTLVIPLVYRRYYFLLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGVNAFWLIPFLIFGYDKFTFNVSNIEILISIILVSISVLLYQLRFKNIEILYMIFISF
HHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VLLILGINTGPLILLATILTLGSLRDISILYLTLLSGLIILSATSFSYGVISGYANTTFY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCEEE
TYNLPNLPKPGEYGFGITTLVNDLNLTASGMPTESISYNVRYFIYNSRVIENPLYFGFPI
EECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEECCCCCCCCEEEEEEEEEECEEECCCCEECCCC
PAIPNYTPQLTFSYIYSNSSVKVIYSPFNKPLGLMVYSNVTPSKISIVFPTRIENISGIK
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHH
GLVKNYTIQIITNTSLTIIGGKVTVDNKSIFSSYYKPKIVTSIMIGEITEVIDSNYSIYL
HHHCCEEEEEEECCEEEEEECEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
PIHESLTINGKVVNHPIILPPGKYTIVISDEKIEYVSYASIFLTIVSLVLLIRRGMKV
EEECCEEECCEEECCCEEECCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDKRIATIILSIVNIIGIFEFPLYESFIGFFFISSALSILYESQLSLIVPTVLFASLVLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIITIQLQKLIILSILMLISIIGKNNKWIYSILITLAPGLIINNLYLLLIVLALLIPLLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLGGEPRAIIISGILYLIYSGIIFPNNEALANQISQISYFYLMFGIIGIIVEDKRITRIT
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHH
LRKILPYLSFIPASFASIMLGYPSDSSFIYWSASSFYFSHLYLPWIYEIGYNSNQHLIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHH
WFLAYLLTLIIKNPLITAEVFLGIFTFLSGLISYYVFKRLNLKYPLLFSLLYQINIFNPI
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
ISHSISVFSYAFLPLVLFFAYNKNKVLYSILTLTAASSIPIFISTLVIPLVYRRYYFLLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGVNAFWLIPFLIFGYDKFTFNVSNIEILISIILVSISVLLYQLRFKNIEILYMIFISF
HHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VLLILGINTGPLILLATILTLGSLRDISILYLTLLSGLIILSATSFSYGVISGYANTTFY
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCCEEE
TYNLPNLPKPGEYGFGITTLVNDLNLTASGMPTESISYNVRYFIYNSRVIENPLYFGFPI
EECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCEECCCCCCCCEEEEEEEEEECEEECCCCEECCCC
PAIPNYTPQLTFSYIYSNSSVKVIYSPFNKPLGLMVYSNVTPSKISIVFPTRIENISGIK
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHH
GLVKNYTIQIITNTSLTIIGGKVTVDNKSIFSSYYKPKIVTSIMIGEITEVIDSNYSIYL
HHHCCEEEEEEECCEEEEEECEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
PIHESLTINGKVVNHPIILPPGKYTIVISDEKIEYVSYASIFLTIVSLVLLIRRGMKV
EEECCEEECCEEECCCEEECCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA