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The map label for this gene is mmpL10 [H]

Identifier: 15897394

GI number: 15897394

Start: 399141

End: 401654

Strand: Direct

Name: mmpL10 [H]

Synonym: SSO0466

Alternate gene names: 15897394

Gene position: 399141-401654 (Clockwise)

Preceding gene: 15897387

Following gene: 15897396

Centisome position: 13.34

GC content: 31.42

Gene sequence:

>2514_bases
ATGGTTACCAATGTAAAATTGGTATTTCCACAATACTTTTTACTGTATATAAAGTCTAGGAATAATGTGAAGAATGGCCT
TGTATCGTTGGTATTATGGTTATTACTGATTATGATATTATTGCATTTTGCAATTAAAACTCCTAGTTTATTTACGTATT
CGGATTCCCCATTCTTGTCAAGCAGCGTACAAAGTGTAAGGGCTGATAAGATAGTAACCAATTACTTTCACATTGGCAAC
GTTGATAATCTGTATATTATTATCAATTCCTCGTCTTATAACCAAGCTTTACAAGAAATTTATTCTAATTTATATCTCCT
TAATAACGCTACGGTGATAACTCCCAACGGTTACGTTAGCATGCTTAAGACAGAGTATCTCAGCTACCTTGGCTTAAATG
AGAAGAATTTCTCATCTACGATAAGCCAGTTGTATGAGAATTTGACTCGTTTGAAACTTTATTTAATTTCAAATTTTCAA
TACTTTGAATATCAGTTAAATATTACATTTGGTCTTCCACTTCATAATTTCACTAGTAACATATGCCCTACCTATAAGGA
AAATTTTGATAAAGTTAATGGAAGTTTACTAGAGAAAGCTAGATATGCGGGATACTTAACCTTTAAAGATCCATTTCTTT
TCTACTTTGGATTTAATAATTACACTAATTACACTTTGGCATTAAAGTTTTTGATACAGTTTAATAACTACACTAGTCTA
ATCGAAAGGATACTTAAAACTCAAAACATAACGTCTGTTAATGAAAGCAATGTGATTTTTAATAATATAACTACAGCCTT
TAACTCATCCTTTCATAAGGGTACTTTATGGCTTTTCATTATAAATGTTCCTAGCAATGAAAGCCTAACAAATATTAATC
AATTTACTGAAAGTCTCAGAAACGCCTATGTAATAGGTCACCTAGCGTATTATGCACAATCCGCATATTATACTCAAAGT
AACGTTGAAATTATAGATATAACTACAATTATTCTTGTAATGATATTACTAATACTGTTAGTTAGATCAATTGTTCCAAT
TCTGATTTTAATATCTAGTGCTGGTACTAGTCTTTTATTAGCTTATGGTCTCATGTACATGGAAACGCTTCTAGGTTATA
AGATATATTATATTTCGGGTTTGGTTGCACCTCCAATTGTATTTGGTCTTAACATTGACTATGGCATATTACTCATATAT
AGATATTTTGAAGAAATTAATAAAAATAATTTAGATGCTCTCCTATATGCGCTTAAAAATTCAATAAAAGGTATACTATT
AAGTGGTATTAGTATCACGATTGGGTTCTCCAGTTTTATCCTTTCCCCTTCTGCACTACTTCAAAACATAGGAATAGCGT
TAGTGACATCTTCCATTTCAGCATTAATACCAGCAGTTTTCTTTACGTACACGTTATTGCTCTTAATCCCTCAAAGATAT
CTTAGTTTTCCTAGACGAAAATTACCGAGTATTACGGATATAAGGCAAAGGTACTTATATAAGCTTTCCAACTTTGCAGT
AAGGCACAATAAGTTATTAGTAATTCTTATGCTAGTTTCTATCGTTATCTTTATCTTTTATTTTCCTTCTATACACACCA
ACGTTAATATAGATGAAATATTACCTCCCCATGCAAATTCACTTGTAGGTACAAAGGTTCTTAATCAACTTTACAATTAT
AGTATAGACTATATTATATTGTATGGAAGCCCTAAGGCTAACTACACTCTCATTTATAATTTAACTAAAACTCTTATAGA
TCAAGGTAACTTAGTTTATGGACCAATGTCCTTAGGTTCTCAGATCATTGTCAATAATAGCAACTTATATGATCACTTTC
ATCAAGGAAATTACACCTTGTTGATAATTTACCTAAAGTACCCTGTATTTAGCAATGGCGCTATAAATTTAACAAATTGG
CTCATAAGCAAGGGATTCCTAGTTGGAGGGGATAACGCACAAAGAATAGATATCGTTAATAATACCGTTAGTACTTATTT
TAGCTATACTTTACCACTTACTATAATTTTAATTGTCATTTACCTCTTCATGATTCTCGGATCTATTCTACTTCCCTTGA
GGTTATCCTTAACTGTAGGTCTAAGCTCATTATTGGGAGCATTTACAGTGGCATTAGTATATAACTCGCCATATTGGCTA
TCCCCACTTGTAATTTTTGCCCTTCTTTTCAGTTTAGGTATAGACTATGATATGTTCATAATCATAAGATTATTTGATGA
GATGAAAAACGACGATGACATAAATAGTGCTATAGTAAGATCGGTAGAAAATACTGGATTAGTAGTAACTACTTGTGGTT
TGATTTTAGCCGGAGCCTTTTTCTCATTGATGGTGGCAAATATGAGATTCTTACAAGAAATAGGTCTAGGTGTAGGAGTC
TCAATACTGTTTGATACTTTTGTAGTTAGGCCTATTCTAGTACCTGCAATTATTTCAATTCTGAAAAAATATAATTTTTG
GCCATTTAAGGCGAGAAAATTTCTTTATACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGGATGGATTATAATTCTTTATGATAGATTCGATTTGTTCCAACAGCCTTAATACATCTTGTATACTTTCCATGATTTTA
CTTTATGCTTAATCTAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTGATATATTTATAATCTTTTTTACAACATCTAATGGATCTCTGCCAAAAACATAAGTGTTGGCCTCAATACCAGTACCG
CCCAAATGTATTACCACATC

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837

Protein sequence:

>837_residues
MVTNVKLVFPQYFLLYIKSRNNVKNGLVSLVLWLLLIMILLHFAIKTPSLFTYSDSPFLSSSVQSVRADKIVTNYFHIGN
VDNLYIIINSSSYNQALQEIYSNLYLLNNATVITPNGYVSMLKTEYLSYLGLNEKNFSSTISQLYENLTRLKLYLISNFQ
YFEYQLNITFGLPLHNFTSNICPTYKENFDKVNGSLLEKARYAGYLTFKDPFLFYFGFNNYTNYTLALKFLIQFNNYTSL
IERILKTQNITSVNESNVIFNNITTAFNSSFHKGTLWLFIINVPSNESLTNINQFTESLRNAYVIGHLAYYAQSAYYTQS
NVEIIDITTIILVMILLILLVRSIVPILILISSAGTSLLLAYGLMYMETLLGYKIYYISGLVAPPIVFGLNIDYGILLIY
RYFEEINKNNLDALLYALKNSIKGILLSGISITIGFSSFILSPSALLQNIGIALVTSSISALIPAVFFTYTLLLLIPQRY
LSFPRRKLPSITDIRQRYLYKLSNFAVRHNKLLVILMLVSIVIFIFYFPSIHTNVNIDEILPPHANSLVGTKVLNQLYNY
SIDYIILYGSPKANYTLIYNLTKTLIDQGNLVYGPMSLGSQIIVNNSNLYDHFHQGNYTLLIIYLKYPVFSNGAINLTNW
LISKGFLVGGDNAQRIDIVNNTVSTYFSYTLPLTIILIVIYLFMILGSILLPLRLSLTVGLSSLLGAFTVALVYNSPYWL
SPLVIFALLFSLGIDYDMFIIIRLFDEMKNDDDINSAIVRSVENTGLVVTTCGLILAGAFFSLMVANMRFLQEIGLGVGV
SILFDTFVVRPILVPAIISILKKYNFWPFKARKFLYT

Sequences:

>Translated_837_residues
MVTNVKLVFPQYFLLYIKSRNNVKNGLVSLVLWLLLIMILLHFAIKTPSLFTYSDSPFLSSSVQSVRADKIVTNYFHIGN
VDNLYIIINSSSYNQALQEIYSNLYLLNNATVITPNGYVSMLKTEYLSYLGLNEKNFSSTISQLYENLTRLKLYLISNFQ
YFEYQLNITFGLPLHNFTSNICPTYKENFDKVNGSLLEKARYAGYLTFKDPFLFYFGFNNYTNYTLALKFLIQFNNYTSL
IERILKTQNITSVNESNVIFNNITTAFNSSFHKGTLWLFIINVPSNESLTNINQFTESLRNAYVIGHLAYYAQSAYYTQS
NVEIIDITTIILVMILLILLVRSIVPILILISSAGTSLLLAYGLMYMETLLGYKIYYISGLVAPPIVFGLNIDYGILLIY
RYFEEINKNNLDALLYALKNSIKGILLSGISITIGFSSFILSPSALLQNIGIALVTSSISALIPAVFFTYTLLLLIPQRY
LSFPRRKLPSITDIRQRYLYKLSNFAVRHNKLLVILMLVSIVIFIFYFPSIHTNVNIDEILPPHANSLVGTKVLNQLYNY
SIDYIILYGSPKANYTLIYNLTKTLIDQGNLVYGPMSLGSQIIVNNSNLYDHFHQGNYTLLIIYLKYPVFSNGAINLTNW
LISKGFLVGGDNAQRIDIVNNTVSTYFSYTLPLTIILIVIYLFMILGSILLPLRLSLTVGLSSLLGAFTVALVYNSPYWL
SPLVIFALLFSLGIDYDMFIIIRLFDEMKNDDDINSAIVRSVENTGLVVTTCGLILAGAFFSLMVANMRFLQEIGLGVGV
SILFDTFVVRPILVPAIISILKKYNFWPFKARKFLYT
>Mature_837_residues
MVTNVKLVFPQYFLLYIKSRNNVKNGLVSLVLWLLLIMILLHFAIKTPSLFTYSDSPFLSSSVQSVRADKIVTNYFHIGN
VDNLYIIINSSSYNQALQEIYSNLYLLNNATVITPNGYVSMLKTEYLSYLGLNEKNFSSTISQLYENLTRLKLYLISNFQ
YFEYQLNITFGLPLHNFTSNICPTYKENFDKVNGSLLEKARYAGYLTFKDPFLFYFGFNNYTNYTLALKFLIQFNNYTSL
IERILKTQNITSVNESNVIFNNITTAFNSSFHKGTLWLFIINVPSNESLTNINQFTESLRNAYVIGHLAYYAQSAYYTQS
NVEIIDITTIILVMILLILLVRSIVPILILISSAGTSLLLAYGLMYMETLLGYKIYYISGLVAPPIVFGLNIDYGILLIY
RYFEEINKNNLDALLYALKNSIKGILLSGISITIGFSSFILSPSALLQNIGIALVTSSISALIPAVFFTYTLLLLIPQRY
LSFPRRKLPSITDIRQRYLYKLSNFAVRHNKLLVILMLVSIVIFIFYFPSIHTNVNIDEILPPHANSLVGTKVLNQLYNY
SIDYIILYGSPKANYTLIYNLTKTLIDQGNLVYGPMSLGSQIIVNNSNLYDHFHQGNYTLLIIYLKYPVFSNGAINLTNW
LISKGFLVGGDNAQRIDIVNNTVSTYFSYTLPLTIILIVIYLFMILGSILLPLRLSLTVGLSSLLGAFTVALVYNSPYWL
SPLVIFALLFSLGIDYDMFIIIRLFDEMKNDDDINSAIVRSVENTGLVVTTCGLILAGAFFSLMVANMRFLQEIGLGVGV
SILFDTFVVRPILVPAIISILKKYNFWPFKARKFLYT

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004707
- InterPro:   IPR004869 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95024; Mature: 95024

Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVTNVKLVFPQYFLLYIKSRNNVKNGLVSLVLWLLLIMILLHFAIKTPSLFTYSDSPFLS
CCCEEEEHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHH
SSVQSVRADKIVTNYFHIGNVDNLYIIINSSSYNQALQEIYSNLYLLNNATVITPNGYVS
HHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCHHH
MLKTEYLSYLGLNEKNFSSTISQLYENLTRLKLYLISNFQYFEYQLNITFGLPLHNFTSN
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEHHEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHCC
ICPTYKENFDKVNGSLLEKARYAGYLTFKDPFLFYFGFNNYTNYTLALKFLIQFNNYTSL
CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHEEEHHHHHCCHHHH
IERILKTQNITSVNESNVIFNNITTAFNSSFHKGTLWLFIINVPSNESLTNINQFTESLR
HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
NAYVIGHLAYYAQSAYYTQSNVEIIDITTIILVMILLILLVRSIVPILILISSAGTSLLL
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
AYGLMYMETLLGYKIYYISGLVAPPIVFGLNIDYGILLIYRYFEEINKNNLDALLYALKN
HHHHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
SIKGILLSGISITIGFSSFILSPSALLQNIGIALVTSSISALIPAVFFTYTLLLLIPQRY
HHCCEEEECEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFPRRKLPSITDIRQRYLYKLSNFAVRHNKLLVILMLVSIVIFIFYFPSIHTNVNIDEI
HCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHC
LPPHANSLVGTKVLNQLYNYSIDYIILYGSPKANYTLIYNLTKTLIDQGNLVYGPMSLGS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCEEEECCCCCC
QIIVNNSNLYDHFHQGNYTLLIIYLKYPVFSNGAINLTNWLISKGFLVGGDNAQRIDIVN
EEEEECCCHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEH
NTVSTYFSYTLPLTIILIVIYLFMILGSILLPLRLSLTVGLSSLLGAFTVALVYNSPYWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
SPLVIFALLFSLGIDYDMFIIIRLFDEMKNDDDINSAIVRSVENTGLVVTTCGLILAGAF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHH
FSLMVANMRFLQEIGLGVGVSILFDTFVVRPILVPAIISILKKYNFWPFKARKFLYT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MVTNVKLVFPQYFLLYIKSRNNVKNGLVSLVLWLLLIMILLHFAIKTPSLFTYSDSPFLS
CCCEEEEHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHH
SSVQSVRADKIVTNYFHIGNVDNLYIIINSSSYNQALQEIYSNLYLLNNATVITPNGYVS
HHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCEEEECCCEEECCCCHHH
MLKTEYLSYLGLNEKNFSSTISQLYENLTRLKLYLISNFQYFEYQLNITFGLPLHNFTSN
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEHHEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHCC
ICPTYKENFDKVNGSLLEKARYAGYLTFKDPFLFYFGFNNYTNYTLALKFLIQFNNYTSL
CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHEEEHHHHHCCHHHH
IERILKTQNITSVNESNVIFNNITTAFNSSFHKGTLWLFIINVPSNESLTNINQFTESLR
HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
NAYVIGHLAYYAQSAYYTQSNVEIIDITTIILVMILLILLVRSIVPILILISSAGTSLLL
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
AYGLMYMETLLGYKIYYISGLVAPPIVFGLNIDYGILLIYRYFEEINKNNLDALLYALKN
HHHHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
SIKGILLSGISITIGFSSFILSPSALLQNIGIALVTSSISALIPAVFFTYTLLLLIPQRY
HHCCEEEECEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFPRRKLPSITDIRQRYLYKLSNFAVRHNKLLVILMLVSIVIFIFYFPSIHTNVNIDEI
HCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHC
LPPHANSLVGTKVLNQLYNYSIDYIILYGSPKANYTLIYNLTKTLIDQGNLVYGPMSLGS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCEEEECCCCCC
QIIVNNSNLYDHFHQGNYTLLIIYLKYPVFSNGAINLTNWLISKGFLVGGDNAQRIDIVN
EEEEECCCHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEH
NTVSTYFSYTLPLTIILIVIYLFMILGSILLPLRLSLTVGLSSLLGAFTVALVYNSPYWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
SPLVIFALLFSLGIDYDMFIIIRLFDEMKNDDDINSAIVRSVENTGLVVTTCGLILAGAF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHH
FSLMVANMRFLQEIGLGVGVSILFDTFVVRPILVPAIISILKKYNFWPFKARKFLYT
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11234002 [H]