Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is lptG [H]

Identifier: 15893122

GI number: 15893122

Start: 1094971

End: 1096059

Strand: Reverse

Name: lptG [H]

Synonym: RC1199

Alternate gene names: 15893122

Gene position: 1096059-1094971 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15893123

Following gene: 15893121

Centisome position: 86.39

GC content: 23.6

Gene sequence:

>1089_bases
ATGATTAATCTAAAAACACTTTCTTGGTATCTTACTAAATTATATTCTAAGTGTTTCTTTATTATATTATTTCTTTTAAT
CGGGCTATTAATTATCTCAAATGTTTTTGATCTTTTACAAAAATTCAAAAATATTTATGTTCCTTTTAGTTTTTTTTGGA
GACTTATCTTATATAAGATTCCTTATTTACTAGGTCAAGTATCTTCATTAATTAGTTTTACCGCTATGTTATTTTTTCTT
AGAAATCTAACAAAAAATAATGAATTAACGGCTATGTTATCTAGCGGTATTCATATTTGGCAAGTGCTTGTTATTCCATG
TATTGTAACTTTAATGTTAGGTATAGTTTTTACGACTATATTGAATCCTATCGGTACTATAGGCTTACAAAAATATGAGT
TATTAGAAGCAAAACTAACTAAAAAAGCCTTGAGTGAGGGTATAATATCTAAATCAGGCTTATTATTTTTTGAATCTTTA
AATGATGAAACTCAAATTATCCAAACACAATTTATTAATGTTGCCGAGAAAAAATTAAATAATATTACAATTTTATTTGT
TGATCATAATAATTCTTTTTTAAAGAGAATTGATGCATTATACGGTATTATTGAAAATAAAATGTTACATTTAAATAGAG
TTAAGGTTTTCACAAAAGAGGAAACTAAGGCTTACAATAATTTAACTATGCAGACAAATTTATCAATTAATAGTTTAGTA
AATAAATTTATTCGTCCTGAAATGGTTTCTATTTGGGCTTTACCTAAATTAATTAATGAATTATTAAATTCAGGTTTACC
GGCTATTAATTATCAAATTTATTATTACAAGCAATTATTTAAGCCTATAATGATGATGGCAACCGTAATTTTAGCAAGTT
GTTTTATTAGTCTTAAACAGCGTGATAATTCCCAAGAAAAAATACTGCTATTAGGTTTATTTTCAGGTTTTATAGCATAT
TCGTTATCAGAAATATTATTAAAAATACTTACTTATAATAATTTGTCTTTAATTGCTGCTATTTTATTACCTAGTATGCT
AATATTTTTTATTAGTAACTTTATTATGTTACATTATAAAGAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTAGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCACACAAATTCTTATTTAAATTC
GCATTAGCACTGAATTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAGACGAAGTTTAATTTGAAAAATTGGCATCGTCGCTTCTCATTGTTGATTCTCACGTAGTATTCTACGCTGCGGTCA
AAAATTCCGAGGCTTCTCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 362; Mature: 362

Protein sequence:

>362_residues
MINLKTLSWYLTKLYSKCFFIILFLLIGLLIISNVFDLLQKFKNIYVPFSFFWRLILYKIPYLLGQVSSLISFTAMLFFL
RNLTKNNELTAMLSSGIHIWQVLVIPCIVTLMLGIVFTTILNPIGTIGLQKYELLEAKLTKKALSEGIISKSGLLFFESL
NDETQIIQTQFINVAEKKLNNITILFVDHNNSFLKRIDALYGIIENKMLHLNRVKVFTKEETKAYNNLTMQTNLSINSLV
NKFIRPEMVSIWALPKLINELLNSGLPAINYQIYYYKQLFKPIMMMATVILASCFISLKQRDNSQEKILLLGLFSGFIAY
SLSEILLKILTYNNLSLIAAILLPSMLIFFISNFIMLHYKEI

Sequences:

>Translated_362_residues
MINLKTLSWYLTKLYSKCFFIILFLLIGLLIISNVFDLLQKFKNIYVPFSFFWRLILYKIPYLLGQVSSLISFTAMLFFL
RNLTKNNELTAMLSSGIHIWQVLVIPCIVTLMLGIVFTTILNPIGTIGLQKYELLEAKLTKKALSEGIISKSGLLFFESL
NDETQIIQTQFINVAEKKLNNITILFVDHNNSFLKRIDALYGIIENKMLHLNRVKVFTKEETKAYNNLTMQTNLSINSLV
NKFIRPEMVSIWALPKLINELLNSGLPAINYQIYYYKQLFKPIMMMATVILASCFISLKQRDNSQEKILLLGLFSGFIAY
SLSEILLKILTYNNLSLIAAILLPSMLIFFISNFIMLHYKEI
>Mature_362_residues
MINLKTLSWYLTKLYSKCFFIILFLLIGLLIISNVFDLLQKFKNIYVPFSFFWRLILYKIPYLLGQVSSLISFTAMLFFL
RNLTKNNELTAMLSSGIHIWQVLVIPCIVTLMLGIVFTTILNPIGTIGLQKYELLEAKLTKKALSEGIISKSGLLFFESL
NDETQIIQTQFINVAEKKLNNITILFVDHNNSFLKRIDALYGIIENKMLHLNRVKVFTKEETKAYNNLTMQTNLSINSLV
NKFIRPEMVSIWALPKLINELLNSGLPAINYQIYYYKQLFKPIMMMATVILASCFISLKQRDNSQEKILLLGLFSGFIAY
SLSEILLKILTYNNLSLIAAILLPSMLIFFISNFIMLHYKEI

Specific function: Part of the ABC transporter complex lptBFG involved in the translocation of lipopolysaccharide (LPS) from the inner membrane to the outer membrane [H]

COG id: COG0795

COG function: function code R; Predicted permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the lptF/lptG family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005495 [H]

Pfam domain/function: PF03739 YjgP_YjgQ [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41773; Mature: 41773

Theoretical pI: Translated: 9.92; Mature: 9.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINLKTLSWYLTKLYSKCFFIILFLLIGLLIISNVFDLLQKFKNIYVPFSFFWRLILYKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
PYLLGQVSSLISFTAMLFFLRNLTKNNELTAMLSSGIHIWQVLVIPCIVTLMLGIVFTTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNPIGTIGLQKYELLEAKLTKKALSEGIISKSGLLFFESLNDETQIIQTQFINVAEKKLN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NITILFVDHNNSFLKRIDALYGIIENKMLHLNRVKVFTKEETKAYNNLTMQTNLSINSLV
CEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHCCEEEECCCHHHHH
NKFIRPEMVSIWALPKLINELLNSGLPAINYQIYYYKQLFKPIMMMATVILASCFISLKQ
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDNSQEKILLLGLFSGFIAYSLSEILLKILTYNNLSLIAAILLPSMLIFFISNFIMLHYK
CCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EI
CC
>Mature Secondary Structure
MINLKTLSWYLTKLYSKCFFIILFLLIGLLIISNVFDLLQKFKNIYVPFSFFWRLILYKI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
PYLLGQVSSLISFTAMLFFLRNLTKNNELTAMLSSGIHIWQVLVIPCIVTLMLGIVFTTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNPIGTIGLQKYELLEAKLTKKALSEGIISKSGLLFFESLNDETQIIQTQFINVAEKKLN
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NITILFVDHNNSFLKRIDALYGIIENKMLHLNRVKVFTKEETKAYNNLTMQTNLSINSLV
CEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHCCEEEECCCHHHHH
NKFIRPEMVSIWALPKLINELLNSGLPAINYQIYYYKQLFKPIMMMATVILASCFISLKQ
HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RDNSQEKILLLGLFSGFIAYSLSEILLKILTYNNLSLIAAILLPSMLIFFISNFIMLHYK
CCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EI
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]