Definition Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome.
Accession NC_002491
Length 1,226,565

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15835545

GI number: 15835545

Start: 13104

End: 15428

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CPj0010

Alternate gene names: NA

Gene position: 13104-15428 (Clockwise)

Preceding gene: 15835544

Following gene: 15835546

Centisome position: 1.07

GC content: 44.65

Gene sequence:

>2325_bases
ATGCTCTTACTGATTTCAGGAGCTCTCTTTCTGACGTTAGGGATTCCAGGATTGAGTGCAGCAATTTCTTTTGGATTAGG
CATCGGTCTCTCCGCATTAGGAGGAGTGCTGATGATTTCGGGACTACTATGTCTTTTAGTAAAACGAGAGATTCCGACAG
TACGACCAGAAGAAATTCCTGAAGGGGTTTCGCTGGCTCCTTCTGAGGAGCCAGCTCTACAGGCAGCTCAGAAGACTTTA
GCTCAGCTGCCTAAGGAATTGGATCAGTTAGATACAGATATTCAGGAAGTGTTCGCATGTTTAAGAAAGCTGAAAGATTC
TAAGTATGAAAGTCGAAGTTTTTTAAACGATGCTAAGAAGGAGCTTCGAGTTTTTGACTTTGTGGTTGAGGATACCCTCT
CGGAGATTTTCGAGTTGCGGCAGATTGTGGCTCAAGAGGGATGGGATTTAAACTTTTTGATCAATGGGGGACGAAGCCTC
ATGATGACTGCAGAATCTGAATCGCTTGATTTGTTTCATGTATCGAAGCGGCTAGGGTATTTACCTTCTGGGGATGTTCG
AGGGGAGGGGTTAAAGAAATCTGCGAAGGAGATAGTCGCTCGTTTGATGAGCTTGCATTGCGAGATTCACAAGGTGGCGG
TAGCGTTTGATAGGAATTCCTATGCGATGGCAGAAAAGGCGTTTGCGAAAGCGTTGGGAGCTTTAGAAGAGAGTGTGTAT
CGGAGTCTGACGCAGAGTTATAGAGATAAATTTTTGGAGAGTGAGAGGGCGAAGATCCCATGGAATGGGCATATAACCTG
GTTAAGAGATGATGCGAAGAGTGGGTGTGCTGAAAAGAAGCTTCGGGATGCCGAGGAACGTTGGAAGAAATTTAGGAAAG
CAGTCTTTTGGGTAGAAGAAGACGGGGGCTTTGACATCAATAATCTCCTTGGAGACTGGGGGACAGTGCTTGATCCTTAT
AGACAAGAGAGAATGGACGAGATAACGTTCCATGAGTTGTATGAAAAAACTACGTTTTTGAAAAGACTGCACAGAAAGTG
TGCGTTAGCGAAAACAACCTTTGAAAAGAAGAGATCTAAAAAGAATTTGCAGGCAGTCGAGGAGGCGAATGCACGTAGGT
TGAAATATGTAAGGGATTGGTATGATCAGGAGTTTCAGAAAGCAGGGGAGAGATTAGAGAAACTGCATGCTTTGTATCCT
GAGGTTTCAGTCTCTATAAGAGAGAACAAAATACAAGAGACGCGCTCTAATTTAGAGAAAGCCTATGAGGCTATCGAAGA
GAACTATCGTTGCTGTGTCCGAGAGCAAGAGGACTACTGGAAAGAAGAAGAGAAAAGGGAAGCGGAGTTTAGGGAGAGGG
GAAACAAGATTCTTTCTCCTGAGGAGCTGGAAAGTTCTTTGGAGCAATTCGACCATGGTTTGAAAAATTTTTCTGAGAAA
TTAATGGAATTGGAAGGGCATATCTTAAAACTTCAGAAAGAAGCCACAGCAGAGGTGGAGAATAAAATACTTTCAGATGC
AGAGAGCCGCCTTGAGATTGTATTTGAAGATGTCAAGGAGATGCCCTGTCGAATTGAGGAGATAGAGAAGACGCTGCGTA
TGGCGGAGCTGCCCCTACTTCCTACGAAGAAGGCGTTTGAGAAGGCCTGCTCACAATATAATAGCTGCGCAGAGATGTTG
GAGAAGGTGAAGCCTTACTGCAAGGAGAGCCTCGCCTATGTGACTAGCAAAGAGCGTTTAGTGAGCTTGGATGAAGATTT
ACGACGAGCCTACACAGAGTGTCAGAAGAGATTCCAGGGGGATTCGGGTTTGGAGTCGGAAGTAAGAGCCTGTCGAGAGC
AACTGCGAGAGCGGATCCAAGAGTTTGAAACTCAAGGGCTGGACTTGGTGGAAAAAGAGTTGCTTTGTGTGAGTAGTAGA
TTAAGAAATACAGAGTGCGATTGTGTATCTGGTGTTAAGAAAGAAGCACCTCCTGGTAAGAAGTTTTATGCCCAGTATTA
TGATGAGATTTATCGAGTTAGAGTTCAATCCCGATGGATGACGATGTCTGAGAGATTGAGAGAGGGAGTTCAAGCATGCA
ACAAGATGTTGAAGGCAGGCCTAAGCGAAGAAGATAAGGTTCTTAAAGAAGAAGAGTATTGGTTGTATCGAGAGGAGAGA
AAGAATAAAGAGAAACGTTTGGTTGGTACTAAGATAGTAGCAACGCAGCAGCGAGTTGCAGCATTTGAATCCATAGAAGT
TCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGAGGAGAAACCGAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGGACCATT
CCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGA
TTACTTTTTTAGTTTTTGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACTATTCTAGGAGTCTATGTGCACTATTTTTTAAGAGGTTTATTATTCCGTGGGTATGTCTGAGAGACTTTGATTAAAT
GGGATATTATTATATCCTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774

Protein sequence:

>774_residues
MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL
AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL
MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY
RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY
RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP
EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK
LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML
EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR
LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER
KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS

Sequences:

>Translated_774_residues
MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL
AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL
MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY
RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY
RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP
EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK
LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML
EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR
LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER
KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS
>Mature_774_residues
MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL
AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL
MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY
RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY
RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP
EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK
LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML
EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR
LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER
KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89518; Mature: 89518

Theoretical pI: Translated: 5.43; Mature: 5.43

Prosite motif: PS00061 ADH_SHORT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIP
CEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCC
EGVSLAPSEEPALQAAQKTLAQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKK
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSLMMTAESESLDLFHVSKRLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCC
LPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC
DGGFDINNLLGDWGTVLDPYRQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYPEVSVSIRENKIQETRSNLEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
PTKKAFEKACSQYNSCAEMLEKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSRLRNTECDCVSGVKKEAPPGK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCH
KFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIP
CEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCC
EGVSLAPSEEPALQAAQKTLAQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKK
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSLMMTAESESLDLFHVSKRLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCC
LPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEE
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DGGFDINNLLGDWGTVLDPYRQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYPEVSVSIRENKIQETRSNLEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLL
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA