| Definition | Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002491 |
| Length | 1,226,565 |
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Identifier: 15835545
GI number: 15835545
Start: 13104
End: 15428
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: CPj0010
Alternate gene names: NA
Gene position: 13104-15428 (Clockwise)
Preceding gene: 15835544
Following gene: 15835546
Centisome position: 1.07
GC content: 44.65
Gene sequence:
>2325_bases ATGCTCTTACTGATTTCAGGAGCTCTCTTTCTGACGTTAGGGATTCCAGGATTGAGTGCAGCAATTTCTTTTGGATTAGG CATCGGTCTCTCCGCATTAGGAGGAGTGCTGATGATTTCGGGACTACTATGTCTTTTAGTAAAACGAGAGATTCCGACAG TACGACCAGAAGAAATTCCTGAAGGGGTTTCGCTGGCTCCTTCTGAGGAGCCAGCTCTACAGGCAGCTCAGAAGACTTTA GCTCAGCTGCCTAAGGAATTGGATCAGTTAGATACAGATATTCAGGAAGTGTTCGCATGTTTAAGAAAGCTGAAAGATTC TAAGTATGAAAGTCGAAGTTTTTTAAACGATGCTAAGAAGGAGCTTCGAGTTTTTGACTTTGTGGTTGAGGATACCCTCT CGGAGATTTTCGAGTTGCGGCAGATTGTGGCTCAAGAGGGATGGGATTTAAACTTTTTGATCAATGGGGGACGAAGCCTC ATGATGACTGCAGAATCTGAATCGCTTGATTTGTTTCATGTATCGAAGCGGCTAGGGTATTTACCTTCTGGGGATGTTCG AGGGGAGGGGTTAAAGAAATCTGCGAAGGAGATAGTCGCTCGTTTGATGAGCTTGCATTGCGAGATTCACAAGGTGGCGG TAGCGTTTGATAGGAATTCCTATGCGATGGCAGAAAAGGCGTTTGCGAAAGCGTTGGGAGCTTTAGAAGAGAGTGTGTAT CGGAGTCTGACGCAGAGTTATAGAGATAAATTTTTGGAGAGTGAGAGGGCGAAGATCCCATGGAATGGGCATATAACCTG GTTAAGAGATGATGCGAAGAGTGGGTGTGCTGAAAAGAAGCTTCGGGATGCCGAGGAACGTTGGAAGAAATTTAGGAAAG CAGTCTTTTGGGTAGAAGAAGACGGGGGCTTTGACATCAATAATCTCCTTGGAGACTGGGGGACAGTGCTTGATCCTTAT AGACAAGAGAGAATGGACGAGATAACGTTCCATGAGTTGTATGAAAAAACTACGTTTTTGAAAAGACTGCACAGAAAGTG TGCGTTAGCGAAAACAACCTTTGAAAAGAAGAGATCTAAAAAGAATTTGCAGGCAGTCGAGGAGGCGAATGCACGTAGGT TGAAATATGTAAGGGATTGGTATGATCAGGAGTTTCAGAAAGCAGGGGAGAGATTAGAGAAACTGCATGCTTTGTATCCT GAGGTTTCAGTCTCTATAAGAGAGAACAAAATACAAGAGACGCGCTCTAATTTAGAGAAAGCCTATGAGGCTATCGAAGA GAACTATCGTTGCTGTGTCCGAGAGCAAGAGGACTACTGGAAAGAAGAAGAGAAAAGGGAAGCGGAGTTTAGGGAGAGGG GAAACAAGATTCTTTCTCCTGAGGAGCTGGAAAGTTCTTTGGAGCAATTCGACCATGGTTTGAAAAATTTTTCTGAGAAA TTAATGGAATTGGAAGGGCATATCTTAAAACTTCAGAAAGAAGCCACAGCAGAGGTGGAGAATAAAATACTTTCAGATGC AGAGAGCCGCCTTGAGATTGTATTTGAAGATGTCAAGGAGATGCCCTGTCGAATTGAGGAGATAGAGAAGACGCTGCGTA TGGCGGAGCTGCCCCTACTTCCTACGAAGAAGGCGTTTGAGAAGGCCTGCTCACAATATAATAGCTGCGCAGAGATGTTG GAGAAGGTGAAGCCTTACTGCAAGGAGAGCCTCGCCTATGTGACTAGCAAAGAGCGTTTAGTGAGCTTGGATGAAGATTT ACGACGAGCCTACACAGAGTGTCAGAAGAGATTCCAGGGGGATTCGGGTTTGGAGTCGGAAGTAAGAGCCTGTCGAGAGC AACTGCGAGAGCGGATCCAAGAGTTTGAAACTCAAGGGCTGGACTTGGTGGAAAAAGAGTTGCTTTGTGTGAGTAGTAGA TTAAGAAATACAGAGTGCGATTGTGTATCTGGTGTTAAGAAAGAAGCACCTCCTGGTAAGAAGTTTTATGCCCAGTATTA TGATGAGATTTATCGAGTTAGAGTTCAATCCCGATGGATGACGATGTCTGAGAGATTGAGAGAGGGAGTTCAAGCATGCA ACAAGATGTTGAAGGCAGGCCTAAGCGAAGAAGATAAGGTTCTTAAAGAAGAAGAGTATTGGTTGTATCGAGAGGAGAGA AAGAATAAAGAGAAACGTTTGGTTGGTACTAAGATAGTAGCAACGCAGCAGCGAGTTGCAGCATTTGAATCCATAGAAGT TCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGAGGAGAAACCGAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGGACCATT CCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGA TTACTTTTTTAGTTTTTGGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AACTATTCTAGGAGTCTATGTGCACTATTTTTTAAGAGGTTTATTATTCCGTGGGTATGTCTGAGAGACTTTGATTAAAT GGGATATTATTATATCCTAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 774; Mature: 774
Protein sequence:
>774_residues MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS
Sequences:
>Translated_774_residues MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS >Mature_774_residues MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIPEGVSLAPSEEPALQAAQKTL AQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKKELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSL MMTAESESLDLFHVSKRLGYLPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEEDGGFDINNLLGDWGTVLDPY RQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSKKNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYP EVSVSIRENKIQETRSNLEKAYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLLPTKKAFEKACSQYNSCAEML EKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQGDSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSR LRNTECDCVSGVKKEAPPGKKFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89518; Mature: 89518
Theoretical pI: Translated: 5.43; Mature: 5.43
Prosite motif: PS00061 ADH_SHORT
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIP CEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCC EGVSLAPSEEPALQAAQKTLAQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKK CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH ELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSLMMTAESESLDLFHVSKRLGY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCC LPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEE HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC DGGFDINNLLGDWGTVLDPYRQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYPEVSVSIRENKIQETRSNLEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC PTKKAFEKACSQYNSCAEMLEKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSRLRNTECDCVSGVKKEAPPGK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCH KFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MLLLISGALFLTLGIPGLSAAISFGLGIGLSALGGVLMISGLLCLLVKREIPTVRPEEIP CEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCC EGVSLAPSEEPALQAAQKTLAQLPKELDQLDTDIQEVFACLRKLKDSKYESRSFLNDAKK CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH ELRVFDFVVEDTLSEIFELRQIVAQEGWDLNFLINGGRSLMMTAESESLDLFHVSKRLGY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCC LPSGDVRGEGLKKSAKEIVARLMSLHCEIHKVAVAFDRNSYAMAEKAFAKALGALEESVY CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSLTQSYRDKFLESERAKIPWNGHITWLRDDAKSGCAEKKLRDAEERWKKFRKAVFWVEE HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC DGGFDINNLLGDWGTVLDPYRQERMDEITFHELYEKTTFLKRLHRKCALAKTTFEKKRSK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNLQAVEEANARRLKYVRDWYDQEFQKAGERLEKLHALYPEVSVSIRENKIQETRSNLEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYEAIEENYRCCVREQEDYWKEEEKREAEFRERGNKILSPEELESSLEQFDHGLKNFSEK HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMELEGHILKLQKEATAEVENKILSDAESRLEIVFEDVKEMPCRIEEIEKTLRMAELPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC PTKKAFEKACSQYNSCAEMLEKVKPYCKESLAYVTSKERLVSLDEDLRRAYTECQKRFQG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DSGLESEVRACREQLRERIQEFETQGLDLVEKELLCVSSRLRNTECDCVSGVKKEAPPGK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCH KFYAQYYDEIYRVRVQSRWMTMSERLREGVQACNKMLKAGLSEEDKVLKEEEYWLYREER HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNKEKRLVGTKIVATQQRVAAFESIEVPEIPEAPEEKPSLLDKARSLFTREDHS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA