| Definition | Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002491 |
| Length | 1,226,565 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is Not Available
Identifier: 15835542
GI number: 15835542
Start: 7515
End: 10169
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: CPj0007
Alternate gene names: NA
Gene position: 7515-10169 (Clockwise)
Preceding gene: 15835540
Following gene: 15835543
Centisome position: 0.61
GC content: 40.3
Gene sequence:
>2655_bases ATTTTTTCCTTTCTTGTCGTGATACCGCTAACTGATAGCACTACAAGCTCTCTTTCAACGTCTCTCTTAGATGAAGGAAA CCCACAATCCATGAGGAAACTTCGTATTCTTGCGATCGTTCTCATAGCTTTGAGCATTATTTTGATTGCAGGTGGTGTGG TATTGCTTACTGTAGCGATCCCTGGATTAAGCTCAGTCATTTCTTCCCCGGCAGGGATGGGTGCCTGTGCTTTGGGATGT GTGATGCTTGCTTTAGGGATCGATGTTCTTCTGAAGAAACGAGAAGTCCCTATAGTTCTCGCATCTGTAACTACGACACC AGGAACTGTCAGCCCTAGAAGTGGTATTTCTATTTCAGGAGCTGATAGCACCATACGTTCTCTTCCTACGTATCTCTTGG ACGAGGGACATCCACAATCCATGAGGAAACTTCGTATTCTTGCGATCGTTCTCATAGTTTTTAGCATTATTTTGATTGCA AGTGGTGTGGTATTGCTTACTGTAGCGATCCCTGGATTAAGCTCGATCATTTCTTCCCCAGCGGAGATGGGTGCTTGTGC TTTGGGATGTGTGATGCTTGCTTTGGGGATCGACGTTCTTCTGAAGAAACGAGAAGTCCCTATAGTAGTTCCCGCACCTA TTCCTGAAGAAGTCGTCATAGATGATATAGATGAAGAGAGTATACGGCTGCAGCAGGAAGCTGAAGCCGCTTTAGCAAGA CTTCCTGAGGAGATGAGTGCATTTGAAGGTTACATAAAAGTTGTCGAGAGTCATTTGGAGAACATGAAAAGCCTGCCTTA TGATGGTCATGGGCTAGAAGAGAAAACGAAACATCAGATAAGAGTCGTCAGATCTTCTTTGAAGGCTATGGTTCCAGAAT TTTTAGATATCAGAAGAATTTTTGAAGAAGAAGAGTTCTTTTTTCTCTCAGCTCGCAAACGACTTATAGATTTAGCTACT ACTTTAGTAGAGAGAAAAATTTTAACAGAGCAACTTGAGCGCAATAATTTAAGGAAAGCGTTTTCTTATTTATATCAGGA CTCAATTTTTAAAAAAATTATTGATAACTTCGAGAAGTTAGCATGGAAATTTATGATTTTGAGTAAATCAATTTGTCGAT TTACAATTATTTTTGAAAATCATGAACATGGTGTAGCAAAGAGCCTGTTACACAAGAATGCAGTGTTACTGGAGAAGGTA ATCTATAGGAGTTTGCAAAAAAGCTATAGAGATATAGGCATGTCATCTGCAAAGATGAAAATCTTGCACGGCAACCCTTT TTTCTCTTTGGAAGATAATAAAAAGACGATAATGAAAGAACACGCAGAGATGCTTGAAAGTCTCAGTAGCTATAGGAAGG TATTTTTAGCTCTATCTGATGAGAACGTTGTAGATACACCTAGCGATCCAAAGAAATGGGATTTGTCAGGAATCCCCTGT AGGGACGCGTTGTCTGAGATTTCTCGTGATGAACAGTGGCAGAAGAAAGCACATCTAAAGCATCAAGAGTCCCTCTATAC GCAAGCTAGGGATCGTTTAACAGACCAGAGCTCTAAAGAAAATCAGAAAGAGTTAGAGAAAGCTGAACAAGAGTACATAT CTTCTTGGGAACGGGTTAAAAAATTTGAGATTGAGAGAGTACAGGAGAGGATACAGGCAATTCAAAAGCTTTATCCTAAT ATCCTCGAGAGAGAAGAAGAAACCACAGGTCAGGAGACTGTGACTCCAACTGTTCAAGGGACGACGGCTTCATCCGATTT AACAGATATTTTAGGAAGAATAGAGGTCTCCAGTAGGGAGGATAATCAGAATCAAGAGTCTTGTGTAAAAGTCTTAAGAA GTCATGAGGTAGAAATGAGCTGGGAAGTCAAACAAGAGTATGGCCCTAAGAAAAAAGAATTTCAGGATCAAATGGGTTCT TTAGAGAGGTTTTTTACAGAGCATATTGAAGAGTTAGAAGTATTACAGAAGGACTACTCTAAACACTTGTCTTATTTTAA AAAAGTAAACAATAAGAAAGAGGTTCAATATGCGAAGTTTAGGTTGAAGGTTTTAGAGTCAGATTTAGAAGGGATTCTAG CTCAGACTGAGAGTGCTGAGAGTCTGTTAACTCAAGAAGAACTTCCGATTCTTGCAACTCGGGGAGCCTTAGAGAAAGCT GTTTTCAAAGGGAGTCTATGTTGCGCGCTAGCAAGCAAAGCAAAACCCTATTTTGAAGAGGATCCCAGATTCCAAGATTC TGATACGCAATTGCGAGCTCTGACTCTAAGGTTACAGGAGGCTAAGGCAAGCCTGGAAGAAGAGATAAAGAGATTTTCAA ATCTTGAGAACGATATTGCAGAGGAAAGACGCCTTCTTAAAGAGAGCAAGCAGACGTTCGAAAGAGCAGGTTTAGGGGTT CTCCGAGAAATTGCAGTCGAGTCTACTTATGATTTGCGTTCCTTAACAAATACATGGGAAGGGACCCCAGAGAGTGAGAA GGTCTATTTTAGCATGTATCTTAATTATTACAACGAAGAGAAACGTAGGGCTAAAACAAGATTGGTTGAAATGACACAGA GGTATAGAGATTTTAAAATGGCCTTGGAAGCTATGCAGTTTAATGAAGAAGCCCTTTTGCAAGAGGAACTCTCTATTCAA GCTCCCAGTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCCTCGCAATGAGCTTTTTGTCTTCTCACCTTATGATGTGCTTTCTATAAGTATTTAAATGAACTTTTATTAAAAGAGTT TTCGCTATAACCTTTCGCTC
Downstream 100 bases:
>100_bases CAAGAATCCGAGGCAAGAGCTCGGCATGTCGCTCGCTATAGGCTACGAGTTGCCCAATCTCGTTTGGCTGATTTAGAAGC TGGAGTCATCCAGAAACGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 884; Mature: 884
Protein sequence:
>884_residues MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ APSE
Sequences:
>Translated_884_residues MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ APSE >Mature_884_residues MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ APSE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 100364; Mature: 100364
Theoretical pI: Translated: 5.45; Mature: 5.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAI CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH PGLSSVISSPAGMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISG CCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEECC ADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIASGVVLLTVAIPGLSSIISSP CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHCCH AEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FEEEEFFFLSARKRLIDLATTLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKVIYRSLQKSYRDIGMSSAKMK HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE ILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC EEECCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KFEIERVQERIQAIQKLYPNILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC DNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGSLERFFTEHIEELEVLQKDYS CCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIA HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH EERRLLKESKQTFERAGLGVLREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH KRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQAPSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAI CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH PGLSSVISSPAGMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISG CCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEECC ADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIASGVVLLTVAIPGLSSIISSP CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHCCH AEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FEEEEFFFLSARKRLIDLATTLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKVIYRSLQKSYRDIGMSSAKMK HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE ILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC EEECCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KFEIERVQERIQAIQKLYPNILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC DNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGSLERFFTEHIEELEVLQKDYS CCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIA HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH EERRLLKESKQTFERAGLGVLREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH KRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQAPSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA