Definition Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome.
Accession NC_002491
Length 1,226,565

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15835542

GI number: 15835542

Start: 7515

End: 10169

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CPj0007

Alternate gene names: NA

Gene position: 7515-10169 (Clockwise)

Preceding gene: 15835540

Following gene: 15835543

Centisome position: 0.61

GC content: 40.3

Gene sequence:

>2655_bases
ATTTTTTCCTTTCTTGTCGTGATACCGCTAACTGATAGCACTACAAGCTCTCTTTCAACGTCTCTCTTAGATGAAGGAAA
CCCACAATCCATGAGGAAACTTCGTATTCTTGCGATCGTTCTCATAGCTTTGAGCATTATTTTGATTGCAGGTGGTGTGG
TATTGCTTACTGTAGCGATCCCTGGATTAAGCTCAGTCATTTCTTCCCCGGCAGGGATGGGTGCCTGTGCTTTGGGATGT
GTGATGCTTGCTTTAGGGATCGATGTTCTTCTGAAGAAACGAGAAGTCCCTATAGTTCTCGCATCTGTAACTACGACACC
AGGAACTGTCAGCCCTAGAAGTGGTATTTCTATTTCAGGAGCTGATAGCACCATACGTTCTCTTCCTACGTATCTCTTGG
ACGAGGGACATCCACAATCCATGAGGAAACTTCGTATTCTTGCGATCGTTCTCATAGTTTTTAGCATTATTTTGATTGCA
AGTGGTGTGGTATTGCTTACTGTAGCGATCCCTGGATTAAGCTCGATCATTTCTTCCCCAGCGGAGATGGGTGCTTGTGC
TTTGGGATGTGTGATGCTTGCTTTGGGGATCGACGTTCTTCTGAAGAAACGAGAAGTCCCTATAGTAGTTCCCGCACCTA
TTCCTGAAGAAGTCGTCATAGATGATATAGATGAAGAGAGTATACGGCTGCAGCAGGAAGCTGAAGCCGCTTTAGCAAGA
CTTCCTGAGGAGATGAGTGCATTTGAAGGTTACATAAAAGTTGTCGAGAGTCATTTGGAGAACATGAAAAGCCTGCCTTA
TGATGGTCATGGGCTAGAAGAGAAAACGAAACATCAGATAAGAGTCGTCAGATCTTCTTTGAAGGCTATGGTTCCAGAAT
TTTTAGATATCAGAAGAATTTTTGAAGAAGAAGAGTTCTTTTTTCTCTCAGCTCGCAAACGACTTATAGATTTAGCTACT
ACTTTAGTAGAGAGAAAAATTTTAACAGAGCAACTTGAGCGCAATAATTTAAGGAAAGCGTTTTCTTATTTATATCAGGA
CTCAATTTTTAAAAAAATTATTGATAACTTCGAGAAGTTAGCATGGAAATTTATGATTTTGAGTAAATCAATTTGTCGAT
TTACAATTATTTTTGAAAATCATGAACATGGTGTAGCAAAGAGCCTGTTACACAAGAATGCAGTGTTACTGGAGAAGGTA
ATCTATAGGAGTTTGCAAAAAAGCTATAGAGATATAGGCATGTCATCTGCAAAGATGAAAATCTTGCACGGCAACCCTTT
TTTCTCTTTGGAAGATAATAAAAAGACGATAATGAAAGAACACGCAGAGATGCTTGAAAGTCTCAGTAGCTATAGGAAGG
TATTTTTAGCTCTATCTGATGAGAACGTTGTAGATACACCTAGCGATCCAAAGAAATGGGATTTGTCAGGAATCCCCTGT
AGGGACGCGTTGTCTGAGATTTCTCGTGATGAACAGTGGCAGAAGAAAGCACATCTAAAGCATCAAGAGTCCCTCTATAC
GCAAGCTAGGGATCGTTTAACAGACCAGAGCTCTAAAGAAAATCAGAAAGAGTTAGAGAAAGCTGAACAAGAGTACATAT
CTTCTTGGGAACGGGTTAAAAAATTTGAGATTGAGAGAGTACAGGAGAGGATACAGGCAATTCAAAAGCTTTATCCTAAT
ATCCTCGAGAGAGAAGAAGAAACCACAGGTCAGGAGACTGTGACTCCAACTGTTCAAGGGACGACGGCTTCATCCGATTT
AACAGATATTTTAGGAAGAATAGAGGTCTCCAGTAGGGAGGATAATCAGAATCAAGAGTCTTGTGTAAAAGTCTTAAGAA
GTCATGAGGTAGAAATGAGCTGGGAAGTCAAACAAGAGTATGGCCCTAAGAAAAAAGAATTTCAGGATCAAATGGGTTCT
TTAGAGAGGTTTTTTACAGAGCATATTGAAGAGTTAGAAGTATTACAGAAGGACTACTCTAAACACTTGTCTTATTTTAA
AAAAGTAAACAATAAGAAAGAGGTTCAATATGCGAAGTTTAGGTTGAAGGTTTTAGAGTCAGATTTAGAAGGGATTCTAG
CTCAGACTGAGAGTGCTGAGAGTCTGTTAACTCAAGAAGAACTTCCGATTCTTGCAACTCGGGGAGCCTTAGAGAAAGCT
GTTTTCAAAGGGAGTCTATGTTGCGCGCTAGCAAGCAAAGCAAAACCCTATTTTGAAGAGGATCCCAGATTCCAAGATTC
TGATACGCAATTGCGAGCTCTGACTCTAAGGTTACAGGAGGCTAAGGCAAGCCTGGAAGAAGAGATAAAGAGATTTTCAA
ATCTTGAGAACGATATTGCAGAGGAAAGACGCCTTCTTAAAGAGAGCAAGCAGACGTTCGAAAGAGCAGGTTTAGGGGTT
CTCCGAGAAATTGCAGTCGAGTCTACTTATGATTTGCGTTCCTTAACAAATACATGGGAAGGGACCCCAGAGAGTGAGAA
GGTCTATTTTAGCATGTATCTTAATTATTACAACGAAGAGAAACGTAGGGCTAAAACAAGATTGGTTGAAATGACACAGA
GGTATAGAGATTTTAAAATGGCCTTGGAAGCTATGCAGTTTAATGAAGAAGCCCTTTTGCAAGAGGAACTCTCTATTCAA
GCTCCCAGTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTCGCAATGAGCTTTTTGTCTTCTCACCTTATGATGTGCTTTCTATAAGTATTTAAATGAACTTTTATTAAAAGAGTT
TTCGCTATAACCTTTCGCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAGAATCCGAGGCAAGAGCTCGGCATGTCGCTCGCTATAGGCTACGAGTTGCCCAATCTCGTTTGGCTGATTTAGAAGC
TGGAGTCATCCAGAAACGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 884; Mature: 884

Protein sequence:

>884_residues
MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC
VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA
SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR
LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT
TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV
IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC
RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN
ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS
LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA
VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV
LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ
APSE

Sequences:

>Translated_884_residues
MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC
VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA
SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR
LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT
TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV
IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC
RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN
ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS
LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA
VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV
LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ
APSE
>Mature_884_residues
MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAIPGLSSVISSPAGMGACALGC
VMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISGADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIA
SGVVLLTVAIPGLSSIISSPAEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR
LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRIFEEEEFFFLSARKRLIDLAT
TLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKLAWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKV
IYRSLQKSYRDIGMSSAKMKILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC
RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVKKFEIERVQERIQAIQKLYPN
ILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSREDNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGS
LERFFTEHIEELEVLQKDYSKHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA
VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIAEERRLLKESKQTFERAGLGV
LREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEEKRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQ
APSE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100364; Mature: 100364

Theoretical pI: Translated: 5.45; Mature: 5.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAI
CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
PGLSSVISSPAGMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISG
CCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEECC
ADSTIRSLPTYLLDEGHPQSMRKLRILAIVLIVFSIILIASGVVLLTVAIPGLSSIISSP
CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHCCH
AEMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVVPAPIPEEVVIDDIDEESIRLQQEAEAALAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FEEEEFFFLSARKRLIDLATTLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKVIYRSLQKSYRDIGMSSAKMK
HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
ILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC
EEECCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
RDALSEISRDEQWQKKAHLKHQESLYTQARDRLTDQSSKENQKELEKAEQEYISSWERVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KFEIERVQERIQAIQKLYPNILEREEETTGQETVTPTVQGTTASSDLTDILGRIEVSSRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
DNQNQESCVKVLRSHEVEMSWEVKQEYGPKKKEFQDQMGSLERFFTEHIEELEVLQKDYS
CCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHLSYFKKVNNKKEVQYAKFRLKVLESDLEGILAQTESAESLLTQEELPILATRGALEKA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VFKGSLCCALASKAKPYFEEDPRFQDSDTQLRALTLRLQEAKASLEEEIKRFSNLENDIA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
EERRLLKESKQTFERAGLGVLREIAVESTYDLRSLTNTWEGTPESEKVYFSMYLNYYNEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
KRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQAPSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFSFLVVIPLTDSTTSSLSTSLLDEGNPQSMRKLRILAIVLIALSIILIAGGVVLLTVAI
CCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
PGLSSVISSPAGMGACALGCVMLALGIDVLLKKREVPIVLASVTTTPGTVSPRSGISISG
CCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEECC
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LPEEMSAFEGYIKVVESHLENMKSLPYDGHGLEEKTKHQIRVVRSSLKAMVPEFLDIRRI
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FEEEEFFFLSARKRLIDLATTLVERKILTEQLERNNLRKAFSYLYQDSIFKKIIDNFEKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AWKFMILSKSICRFTIIFENHEHGVAKSLLHKNAVLLEKVIYRSLQKSYRDIGMSSAKMK
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ILHGNPFFSLEDNKKTIMKEHAEMLESLSSYRKVFLALSDENVVDTPSDPKKWDLSGIPC
EEECCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH
KRRAKTRLVEMTQRYRDFKMALEAMQFNEEALLQEELSIQAPSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA